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豬鏈球菌2型安徽分離株毒力基因cps2J、mrp、epf、sly的檢測及其序列分析

2012-08-14 08:01:26許大文魏建忠殷宗俊趙洪武
動物醫學進展 2012年12期
關鍵詞:檢測

許大文,魏建忠,孫 裴,殷宗俊,趙洪武,李 郁

(安徽農業大學動物科技學院,安徽合肥230036)

豬鏈球菌病是鏈球菌屬中豬鏈球菌(Streptococcus suis)、馬鏈球菌獸疫亞種、馬鏈球菌類馬亞種以及Lancefield分群中D、E、L群鏈球菌引致豬的傳染病的總稱,臨床上主要表現為淋巴結膿腫、腦膜炎、關節炎、心內膜炎以及敗血癥等癥狀[1]。我國農業部將其列為二類動物疫病。豬鏈球菌是世界范圍內引致豬鏈球菌病最主要的病原。根據莢膜多糖可將豬鏈球菌分為35個血清型,即1型~34型和1/2型。其中1型、2型、7型和9型對豬的致病性較強,豬鏈球菌2型(Streptococcus suis serotype 2,S.suis 2)在世界范圍內流行最廣,屬于人獸共患傳染病病原[2]。

S.suis 2的致病性與其攜帶的毒力因子密切相關,目前公認的主要毒力因子有莢膜多糖(capsular polysaccharide,CPS)、溶菌酶釋放蛋白(muramidase-released protein,MRP)、胞外因子(extracellular protein factor,EPF)和溶血素(suilysin,SLY)等[3]。S.suis 2毒力基因表型的分布具有地域性的差異,某些地區以mrp或epf基因為主,而另一些地區則以sly基因為主[4]。本研究針對cps2J、mrp、epf和sly 4種毒力基因,對19株S.suis 2安徽分離株進行PCR檢測及其擴增片段序列測定與比較,旨在了解S.suis 2安徽分離株毒力基因的分布特征,以及與國內外分離株之間的遺傳關系,從而為S.suis 2安徽分離株的致病性研究奠定基礎,為安徽省豬鏈球菌病的防控提供科學依據。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 受試菌株 19株S.suis 2安徽分離株均由安徽農業大學動物科技學院傳染病研究室于2008年-2012年分離、鑒定及保存。菌株代號以分離地區和先后命名。

1.1.2 主要試劑 胰酪胨大豆酵母浸膏肉湯(TSB-YE)、胰酪胨大豆酵母浸膏瓊脂(TSA-YE)均為紹興天恒生物科技有限公司產品;胎牛血清為北京元亨金馬生物技術開發有限公司產品;DNA Marker DL 2 000、r Taq DNA聚合酶、DNA膠回收試劑盒均為上海生工生物工程技術服務有限公司產品。

1.1.3 引物合成 參照文獻[5-8]分別針對cps2J、mrp、epf、sly合成引物,引物均由上海生工生物工 程技術服務有限公司合成(表1)。

表1 本試驗所用PCR引物Table 1 PCR primers used in this experiment

1.2 方法

1.2.1 基因組DNA制備與毒力基因的擴增 參照文獻[9]提取細菌基因組DNA。PCR反應體系總體積為25μL:10×buffer MIX(MgCl2contained)2.5μL,dNTPs(2.5mmol/L)2μL,TaqDNA聚合酶(2.5U/μL)0.3μL,上游引物1μL,下游引物1μL,滅菌ddH2O 13.2μL,模板5μL。反應條件為:95℃5min;94℃1min,退火1min(cps2J、mrp、epf、sly檢測的退火溫度分別為56、55、60、58℃),72℃2min,循環40次;72℃10min。PCR產物經瓊脂糖凝膠電泳檢測。

1.2.2 PCR擴增產物的純化與測序 PCR產物的回收與純化按照DNA膠回收試劑盒的說明進行,將純化的PCR產物送上海生工生物工程技術服務有限公司進行測序。

1.2.3 基因序列分析 將cps2J、mrp、epf和sly基因測序結果與GenBank登錄的國內外豬鏈球菌參考菌株的同源基因序列進行比對(表2),并用DNA Star軟件進行基因變異分析。

表2 GenBank登錄的國內外豬鏈球菌參考菌株Table 2 Domestic and international reference strains of Streptococcus suis accessioned in GenBank

2 結果

2.1 毒力基因鑒定

cps2J、mrp、epf和sly基因在19株S.suis2安徽分離株中的檢出率分別為100%(19/19)、68.4%(13/19)、68.4%(13/19)、78.9%(15/19)。19個受試菌株共分為7個基因型:cps2J+/mrp+/epf+/sly+(11/19),cps2J+/mrp+/epf-/sly+ (1/19),cps2J+/mrp+/epf-/sly-(1/19),cps2J+/mrp-/epf+/sly+(1/19),cps2J+/mrp-/epf+/sly-(1/19),cps2J+/mrp-/epf-/sly+ (2/19),cps2J+/mrp-/epf-/sly-(2/19);其中cps2J+/mrp+/epf+/sly+為優勢基因型(表3)。

表3 19株S.suis 2安徽分離株毒力基因檢測結果Table 3 The test results of virulent genes of S.suis 2strains isolated from Anhui province

2.2 毒力基因序列分析

將19株S.suis2安徽分離株的cps2J及其中13個菌株的mrp基因、13個菌株的epf基因和15個菌株的sly基因部分序列與GenBank登錄的同源基因進行同源性、基因變異分析。

2.2.1 同源性分析 19株S.suis2安徽分離株之間cps2J基因部分序列之間及其與國內、國外S.suis2參考菌株的同源性分別為99.7%~100%、99.4%~100%和98.3%~100%;13個S.suis2安徽分離株之間mrp基因部分序列之間及其與國內、國外S.suis2參考菌株的同源性的分別為99.1%~100%、99.1%~100%和99.2%~100%;13個S.suis2安徽分離株之間epf基因部分序列之間及其與國內、國外S.suis2參考菌株的同源性分別為100%、99.8%~100%和87.8%~100%;15個S.suis2安徽分離株之間sly基因部分序列之間及其與國內、國外S.suis2參考菌株的同源性分別為100%、100%和99.0%~100%。

2.2.2 基因變異分析S.suis2安徽分離株中僅菌株FD12在cps2J基因的比對序列中第548~549位存在GA插入突變,第550位由A突變為G(圖1)。菌株HJ6和HJ3的mrp基因序列完全一致,在比對序列的第37~41位存在TGAAG 2個堿基插入突變,第47位A缺失,第64~65位有TA插入突變,第91位由G突變為C,第94~95位由GC突變為TT,第97位有T插入突變,第347位由G突變為T,第808位存在A插入突變,第814位由T突變為G;菌株FD12在比對序列的第1位由C突變為A,第349~356存在AATTGCTC的缺失突變;菌株HJ14在比對序列的第24位由G突變為C;菌株HJ15、HJ17在比對序列的第820位存在A插入突變(圖2)。epf基因和sly基因的檢測序列未檢測出變異。

圖1 cps2J基因部分序列的變異位點Fig.1 Variation site of cps2Jgene nucleotide sequence

圖2 mrp基因部分序列的變異位點Fig.2 Variation site of mrpgene nucleotide sequence

3 討 論

根據毒力不同,S.suis2分為強毒株、弱毒株和無毒株,其致病機理目前還不很清楚,但普遍認為其致病性與其毒力因子有關[10]。S.suis2的4種毒力因子(CPS、MRP、EPF和SLY)在不同毒力菌株中的分布有較大差異,臨床分離株常存在一種乃至全部毒力基因的缺失現象,而典型的強毒株常帶有這4種 毒 力 基 因[8,11-12]。1999 年,Staats J J 等[13]報道,5株S.suis2強毒株的毒力基因型均為cps2J/mrp+/ef+/sly+。Wei Z等[14]報道,我國16個省份在2003年-2007年分離176株S.suis2,有54%的毒力基因型為cps2J+/mrp+/epf+/sly+。張九州等[12]報道,2007年-2008年從河南省分離的8株S.suis2,有4株毒力基因型為cps2J+/mrp+/epf+/sly+。王花茹等[15]檢測四川資陽豬2型鏈球菌病的12株臨床分離株的毒力基因,結果均為cps2J/mrp+/ef+/sly+。趙戰勤等[16]將毒力基因型為cps2J/mrp+/ef+/sly+的16株S.suis2進行小鼠致病性試驗,結果均能致死全部小鼠。本試驗針對這4種毒力基因進行了19株S.suis2安徽分離株的檢測,結果顯示,57.9%(11/19)菌株的毒力基因型為cps2J+/mrp+/epf+/sly+,為優勢基因型,表明安徽省豬群中流行的S.suis2毒力基因的分布特征與國內外報道的相似,CPS、MRP、EPF和SLY是安徽省流行的S.suis2的重要毒力因子。

序列同源性分析顯示,S.suis2安徽分離株4種毒力基因的檢測序列之間及其與國內其他地區S.suis2分離株的相應序列同源性很高(均在99.1%以上),與國外S.suis2分離株的相應序列同源性相對較低(87.8%~100%)。基因序列變異分析表明S.suis2安徽分離株的mrp基因存在相對較大的變異,13株mrp+菌株中有6株發生了序列變異,其中HJ3和HJ6序列的變異最大。參考菌株中僅浙江GQ352520在比對序列的第657位存在由T突變為C的點突變,其他序列完全一致。表明S.suis 2安徽分離株的mrp基因具有不同程度的分化,與國內外其他地區S.suis 2分離株序列存在較大差異。S.suis 2的MRP存在多種突變體,MRP*表示分子質量大于136ku的MRP突變體,MRPS用來表示分子質量小于136ku的MRP突變體[8]。S.suis 2安徽分離株中可能存在 MRP*或MRPS,但由于檢測序列不是基因全序列,這些堿基突變是否是有義突變,是否存在移碼突變,及其對S.suis 2的致病性的影響還有待進一步研究。

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