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灰飛虱體內Wolbachia的檢測及三種稻飛虱Wolbachia的wsp基因差異分析

2012-09-28 01:44:00許存賓王錫鋒
植物保護 2012年6期
關鍵詞:水稻

許存賓, 劉 艷, 王錫鋒

(中國農業科學院植物保護研究所,植物病蟲害生物學國家重點實驗室,北京 100193)

Wolbachia是一類細胞內共生菌,是屬于α-變形菌門的立克次氏體。最早于1924年在尖音庫蚊(Culex pipiens Linnaeus)的生殖器官內發現,命名為 Wolbachia pipienti[1]。Wolbachia 普遍寄生于昆蟲、甲殼動物、螨蟲和絲狀線蟲類動物體內,據估計66%的昆蟲都感染有Wolbachia[2]。Wolbachia隨母系遺傳,參與調控寄主的誘導細胞質不親和(cyto-plasmic incompatibility,CI)、雄性致死(male-killing)、雌性化(feminization)、孤雌生殖(parthenogenesis inducing)等多種生殖活動[3-7],從而有利于自身的生存與傳播,并影響寄主的生殖行為。此外也有研究表明Wolbachia能保護寄主抵御病原菌和寄生蟲等的侵害[8]。Wolbachia還能依靠寄主的捕食、寄生等行為在昆蟲的個體、群體間進行橫向傳播[9-10]。

早期的研究多用DAPI染色法和電鏡觀察昆蟲體內的 Wolbachia[11-12]。隨著分子生物學方法的快速發展,主要利用其16S/23SrDNA、groEL、ftsZ和wsp等基因進行PCR檢測與序列分析[13]。編碼表面蛋白的Wolbachia outer surface protein(wsp)基因是已知的Wolbachia基因中進化最快的基因,因而被廣泛地用于Wolbachia的PCR檢測與分子鑒別[14]。根據分子系統發生,Wolbachia的不同種屬被劃分為11個超群(supergroups A~K),節肢動物中的Wolbachia主要劃分在A和B超群,并在兩超群下又細分為12個組[14]。

水稻是我國最重要的糧食作物之一,水稻生產的豐歉直接影響我國的糧食安全。自20世紀60年代中期起,稻田3種飛虱(褐飛虱、白背飛虱和灰飛虱)陸續成為影響我國水稻生產的重要生物災害。同時灰飛虱還可以在水稻、小麥、玉米上傳播水稻條紋病毒和水稻黑條矮縮病毒,引起的病毒病造成更為嚴重的損失[15]。長期以來國內外把研究重點放在與應急防治密切相關的技術研發上,而對與稻飛虱災變和持續治理相關的生物學和生態學基礎研究較少。特別是灰飛虱與內共生菌、病毒三者之間的相互關系的相關研究還未見報道。本研究的主要目的是檢測我國主要水稻產區灰飛虱攜帶的共生細菌Wolbachia比例,對其wsp基因進行序列測定與比較,為深入研究稻飛虱與其體內共生物的關系,揭示Wolbachia對共生昆蟲的作用機制奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 蟲源材料

本試驗所采用的灰飛虱(Laodelphax striatellus Fallen)采集于我國12個省(自治區)21個水稻生產地區(見表1),采集時間為2010-2011年。田間活體采集并進行種類鑒定后,取部分樣品按采集地區隔離飼養,剩余樣品經液氮冷凍后-80℃冰箱保存備用。

1.2 DNA的提取

灰飛虱總DNA的提取采用Promega公司的Wizard Genomic DNA提取試劑盒,提取方法參考說明書略作改動。取冷凍保存單頭灰飛虱經乙醇消毒清洗后,切取腹部組織于1.5mL離心管,加入液氮后用玻璃研棒充分研磨并加入50μL核酸裂解液(nuclei lysis solution)勻漿,直至組織完全破裂,再用100μL核酸裂解液沖洗研棒,混勻后65℃溫浴20min。室溫冷卻,加入1μL RNase,37℃溫浴20min,加入80μL蛋白質沉淀劑(protein precipi-tation solution),振蕩混勻后冰浴5min,13 000~16 000r/min常溫離心6min。取上清于1.5mL離心管中,加入300mL常溫異丙醇,輕柔顛倒混勻,13 000~16 000r/min常溫離心3min,棄上清,加入75%乙醇,13 000~16 000r/min常溫離心2min,再加75%乙醇重復1次,超凈臺干燥后加入25μL ddH2O,65℃溫浴溶解1h,-20℃保存備用。

1.3 PCR擴增

參照Zhou等方法[14]進行Wolbachia的wsp基因的PCR擴增,采取通用引物 wsp-81F:5′-TGG TCC AAT AAG TGA TGA AGA AAC-3′;wsp-691R:5′-AAA AAT TAA ACG CTA CTC A-3′,引物由華大基因公司合成。擴增反應液(25μL體系):模板DNA 1μL,10μmol/L正反向引物各0.5μL,2.5mmol/L dNTP 2μL,5Ur Taq 酶0.25μL,10×buffer 2.5μL,加ddH2O至25μL。在Eppendorf PCR儀中按下列擴增程序進行:95℃預變性5min;95℃變性0.5min,55℃復性0.5min,72℃延伸1min,36次循環;最后在72℃延伸10min;4℃下保存備用。

根據灰飛虱線粒體基因序列(GenBank登錄號:FJ360695),設計引物COI-F:5′-ATT TAC CCA CCA CTA TCT-3′;COI-R:5′-TGG AAA TGA GCC ACT ACA-3′用于PCR擴增灰飛虱的COI基因,片段長度為752bp。擴增反應液(25μL體系):模板DNA 1μL,10μmol/L正反向引物各0.5μL,2.5mmol/L dNTP 2μL,5Ur Taq 酶0.25μL,10×buffer 2.5μL,加ddH2O至25μL。在Eppendorf PCR儀中按下列擴增程序進行:94℃預變性3min;94℃變性1min,51℃復性0.5min;72℃延伸1min,36次循環;最后在72℃延伸10min,4℃下保存備用。

1.4 擴增產物的電泳檢測

取PCR特異性擴增產物5μL,在1%的瓊脂糖膠上進行電泳檢測(電壓100V,30min),紫外燈下觀察結果并保存,明確Wolbachia的wsp基因與灰飛虱的COI基因是否存在以及擴增片段的大小。

1.5 Wolbachia的wsp基因片段克隆和測序分析

PCR產物純化后,連接至pMD-18T載體上,轉化到DH 5α大腸桿菌感受態中。每個樣品選取3個陽性克隆由華大基因公司進行序列測定。

2 結果與分析

2.1 DNA提取與PCR檢測

對采集自全國12個省份(自治區)21個地區共167頭灰飛虱樣品進行Wolbachia測定,以灰飛虱COI為對照。其中16個地區的灰飛虱都100%感染有Wolbachia,5個地區出現非陽性個體,四川遂寧地區感染率最低,平均陽性率為96.41%(見表1)。

表1 不同地區灰飛虱感染Wolbachia情況統計表

2.2 序列測定與分析

對167頭灰飛虱中的102頭的Wolbachia wsp進行了序列測定,獲得的wsp基因的序列長度均為599bp,各地理種群間序列僅存在極小的差異。21個地區群體中都具有相同的wsp序列個體,其中只有3個地區的個體中存在變異。云南大理(YNDL-1)樣品的46位存在突變T→C;四川郫縣(SCPX-2)樣品的231位存在突變A→G,云南保山(YNBS-6)樣品的584位存在一個gap。將全國大部分地區Wolbachia一樣的wsp序列命名為National-wsp,參照Zhou等[11]Wolbachia的分類,結合NCBI的blast工具,用MEGA v.5對上述序列進行聚類構建系統進化樹(圖1)。

圖1 灰飛虱體內Wolbachia的wsp基因的PCR產物電泳圖

從系統發育樹可以得出,灰飛虱體內Wolbachia在系統進化上屬于B超群(supergroup B)內Con組(Group Con)[14]。在地理區域上,國內各地區以及日本、泰國等地的灰飛虱Wolbachia處于同一分支,不存在地理種群的分化。

圖2 灰飛虱COI基因的PCR產物電泳圖

2.3 三種稻飛虱體內Wolbachia的wsp序列分析

利用NCBI數據庫,對比褐飛虱體內Wolbachia的wsp基因(GenBank登錄號:GU289775,FJ713754,FJ713760,GU289751)序列和白背飛虱體內Wolbachia的wsp基因(GenBank登錄號:GU361730,GU361731,GU361731,FJ713766)序列。其中白背飛虱與灰飛虱的序列完全一致,但兩者與褐飛虱存在較大差異,序列相似性只有83.39%。由此我們假設白背飛虱與灰飛虱可能感染有相同的Wolbachia(圖3所示,B超群下Con組),而褐飛虱可能感染另外一個株系的Wolbachia(圖3所示,B超群下Cau組)。系統進化樹中與灰飛虱和白背飛虱處于同一分支的還有寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)、寄生螯蜂(Dryinid wasp),與之相近的還有一種寄生絨繭蜂[Cotesia glomerata(L.)],這些寄生昆蟲可能幫助了灰飛虱與白背飛虱體內Wolbachia在其種群內和種群間進行水平傳播。但是3種稻飛虱在自然界具有密切交匯,那么三者體內應該攜帶相似的Wolbachia,然而三者中兩者一樣而另一種存在差異。

圖3 灰飛虱體內Wolbachia與已報道的wsp基因構建系統發育樹

3 討論

通過設計Wolbachia的wsp基因的特異引物,對采集自我國12個省21個地區的灰飛虱進行鑒定,發現我國絕大部分地區灰飛虱都帶有Wolbachia,且感染率高。不同地區灰飛虱Wolbachia的感染率存在一定的差異,四川地區的感染率較其他地方相對低,這與甘波誼等[16]的報道相一致。從群體分化來看,灰飛虱體內的Wolbachia為同一群體,不存在明顯的地理種群分化,這可能與不同地區的灰飛虱群體可以經常進行基因交流有關。

三種稻飛虱體內的Wolbachia比較發現:灰飛虱與白背飛虱的wsp基因序列完全一致,而與褐飛虱存在較大差異。再次引起我們對Wolbachia如何在自然界進行傳播的思考。有報道推測可能與灰飛虱和白背飛虱的寄生蜂(Dryinid wasp)、寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)有關[10],這兩種寄生昆蟲可能協助了Wolbachia在兩種飛虱之間的水平傳播。

三種稻飛虱在自然界具有極其相似的生活環境,寄生螯蜂(Dryinid wasp)和寄生捻翅蟲(Elenchus japonicus Esaki & Hashimoto)同為三種稻飛虱的寄生昆蟲[16-17],而從本研究得出的系統發育樹可以明顯看出Wolbachia在三者之間產生了種群分化。此外,從系統發育樹中還發現與灰飛虱、白背飛虱處于同一分支的還有雜擬谷盜(Tribolium confusumJacquelin du Val),一種鞘翅目擬步行蟲科昆蟲。與褐飛虱處于同一分支的還有鱗翅目的赤松毛蟲(Dendrolimus spectabilis Butler),寄生于赤松,與褐飛虱的生活習性及分布區域相差很大。怎樣的遺傳事件使不同的昆蟲具有相類似的Wolbachia,而相類似的昆蟲群體卻具有不同的Wolbachia?當然,僅僅用wsp一個基因是不足以全面反映各宿主的Wolbachia種群的關系的,這只是一方面的推測。Wolbachia在自然界中真實的傳播方式還需要從多方位、多角度進一步探索。

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