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趨化性細胞因子CCL3L1基因拷貝數與HIV-1易感性研究

2012-11-05 09:23:16何佳麗魏琳琳陳德喜
中國實驗診斷學 2012年12期
關鍵詞:檢測

徐 斌,石 英,惠 威,何佳麗,魏琳琳,王 征,陳德喜

(首都醫科大學附屬北京佑安醫院 肝病內分泌科,北京100069)

獲得性免疫缺陷綜合征(Acquired Immunodeficiency Syndrome,AIDS)簡稱艾滋病,是由 HIV(Human Immunodeficiency Virus)病毒引起的一種傳染性疾病。HIV病毒侵入人體后破壞機體的免疫系統,引起一系列嚴重疾病,病后無特效療法,病死率高。人類第17號染色體的16個基因組由兩對親緣關系很近的基因組構成,即CCL3L—CCL3L1和CCL4—CCL4L1。CCL3和CCL3L1蛋白93個氨基酸中有88個相同,這兩個蛋白均是CCR5受體的配體,在體外試驗中均可抑制 HIV-1病毒復制[1]。影響HIV-1易感性的宿主因素很多,人們由早期對HLAⅠ等位基因、CCR5和CCR2基因變異的關注,轉向CCR5結合細胞因子水平的不同。本研究探討CCL3L1基因拷貝數不同對HIV-1易感性的影響,有助于監測個體對HIV-1的易感性,對監測疫苗的有效性具有重要意義。

1 資料與方法

1.1 健康人群 2005年5月至2006年10月間,北京佑安醫院血庫,采集97例健康獻血原的抗凝全血。其中男66例,女31例,平均年齡36±18歲。

1.2 HIV/AIDS患者 2005年5月至2006年10月間,北京佑安醫院門診或住院的HIV/AIDS患者81例,男性54例,女性27例,平均年齡37±1.2歲。所有患者均為血液傳播感染并未經高效抗逆轉錄病毒治療,病程平均6.2±0.3年。

1.3 實驗方法

1.3.1 基因組DNA提取 按QIAamp DNA Mini Kit基因組提取試劑盒說明書步驟進行。

1.3.2 實時定量PCR檢測CCL3L1基因拷貝數引物選擇:(1)CCL3L1引物:sense primer:5’-tctccacagcttcctaaccaaga 3’;antisense primer:5’-ctggacccactcctcactgg 3’。(2)管家基因β-globin引物:sense primer:5’-ggcaaccctaaggtgaaggc 3’;antisense:5-ggtgagccaggccatcacta 3’。

以上引物由寶生物公司合成。SYBR反應體系:5×SYBR Green 25μl,引物(25μmol/L)2.5 μl,dNTP(10mmol/L)4.0μl,Mg2+4.0μl,cDNA1.0μl,Taq酶0.25μl,H2O 5μl,10×buffer 5.0μl。反應條件:92℃2min預變性,92℃30s變性,55℃30s退火,72℃30s延伸,35個循環,72℃7min。反應結束后,由電腦自動分析并計算結果。

1.3.3 HIV/AIDS患者血漿中 HIV RNA水平的定量檢測 采用bDNA法進行檢測。使用德國Bayer公司的System 340bDNA分析儀,試劑采用廠家配套試劑。

1.3.4 HIV/AIDS患者流式細胞儀檢測 CD4+T細胞數量 采用BD公司FACS Calibur Flow Cytometry System,試劑采用BD公司試劑TriTEST CD4/CD8/CD3with TruCOUNT tubes,檢測分析軟件使用MultiSET自動軟件。

1.4 統計學分析

采用SPSS14.0統計軟件,以是否患HIV-1感染作為因變量,以CCL3L1基因拷貝數作為自變量經logistic回歸分析評估其與HIV-1易感性的關系。采用Speraman相關分析和cubic回歸分析,評估HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與病毒載量的相關性。采用直線回歸分析HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數和CD4+T細胞計數。檢驗水準取α=0.05,P<0.05有顯著性差異。

2 結果

2.1 中國漢族健康人群和 HIV/AIDS患者CCL3L1拷貝數分布

中國漢族健康人群的CCL3L1基因拷貝數呈poisson分布,中位數為0.943329。百份位數25%和75%分別為0.395930和1.986504。見圖1。

圖1 漢族健康人群和HIV/AIDS患者CCL3L1拷貝數分布

2.2 CCL3L1基因拷貝數對HIV易感性的影響

以健康中國漢族人群CCL3L1基因拷貝數的中位數1為截斷值,應用Logist回歸分析。結果表明:-2對數似然值為221.965,Cox和Snell的R2為0123,Nagellerke的R2為0.164,Hosmer和 Lemeshow的擬合優度檢驗統計量Chi-square為10.563,df為8,p為0.228;Wald統計量:P 值為0.001<0.05,OR為0.501,95%可信區間(0.33~0.761),自變量CCL3L1基因拷貝數入選,方程分類能力達57.90%。Logistic回歸的分類概率方程為:

根據該方程,中國漢族健康人群CCL3L1平均基因拷貝數為1,若個體CCL3L1基因拷貝數(X)高于漢族健康人群平均基因拷貝數,這意味著該人不易發生HIV-1感染,低于漢族健康人群平均拷貝數者有較高的易感性。

2.3 HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與病毒載量的相關性

應用Spearman相關分析,HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與病毒載量呈負相關性(correlation coefficient=-0.804,P=0.000)。

應用曲線回歸分析:將病毒載量取Log值后,做曲線評估,應用cubic三次函數曲線模型R2=0.639,P 值=0.000,回歸方程:LogHIV RNA=5.656-1.397 X-0.988 X2+0.585 X3(X 代 表CCL3L1基因拷貝數)。見圖2、3。

2.4 HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與CD4+T細胞計數的相關性

應用Spearman相關分析,HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與CD4T細胞計數密切正相關(correlation coefficient=-0.893,P=0.000)。

應用直線回歸分析得到回歸方程:CD4+T細胞數=140.805+423.063×CCL3L1拷貝數,R值0.869,P值0.000,得到相同結論。見圖4。

圖2 CCL3L1基因拷貝數和LogVL Cubic曲線圖

圖3 HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與病毒載量分布

圖4 HIV/AIDS人群CCL3L1基因拷貝數與CD4T細胞計數分布

3 討論

CCL3L1又稱LD78β,是CD4+T細胞的趨化因子,一種93氨基酸的小蛋白,是趨化因子受體CCR5的天然配體之一,CCR5是HIV-1R5株進入CD4+T細胞的主要輔助受體[2]。

β-趨化因子受體CCR5可以在多種免疫細胞表面表達,包括T淋巴細胞和巨噬細胞,主要表達于記憶性T細胞。既往研究表明CCR5基因變異影響HIV-1的易感性,32堿基的缺失(△-32)如為純合子則對HIV-1不易感,如為雜合子則宿主的病毒載量很低而且疾病進展緩慢[3]。Townson等報道CCL3L1基因拷貝數高的個體,CCL3L1蛋白產物會更多,并推斷CCL3L1基因拷貝數目不同會影響HIV-1的易感性和疾病的進展[4]。Gonzalez及其同事在1999年研究也發現CCR5配體的水平不同也影響HIV-1的易感性和疾病進程,從此人們開始關注CCR5的配體研究,這些配體絕大部分都是細胞因子[5,6]。高拷貝量CCL3L1可以抑制 HIV感染和疾病進程的直接原因:游離細胞因子可引發炎癥反應,同時在空間結構上抑制HIVgp120與CCR5結合。CCL3L1可以影響CCR5的表達,隨著CCL3L1基因拷貝數的增加,CCL3LI蛋白激活粒細胞數目也會增加[7]。CCL3L1拷貝數與T細胞表達CCR5的量成反比關系,體外試驗表明,高拷貝CCL3L1作為CCR5調節信號,引起CCR5受體分子內陷,造成HIV-1的gp120蛋白不能與CCR5結合,從而不能進入宿主細胞[8]。

Bugeja等研究268名澳大利亞HIV-1感染者和260名未感染者,以發現他們所含有的細胞因子CCL3L1基因水平。研究結果表明,HIV-1未感染者中CCL3L1陰性率2.3%,CCL3L1水平的高低與 HIV-1 易 感 性 以 及 疾 病 進 程 無 相 關 性[9]。Gonzales等調查來自57個民族的1064名健康人的CCL3L1復制水平,同時檢測4308名HIV-1陽性非洲裔美國人、歐洲人、西班牙裔美國人中CCL3L1基因水平,以發現不同種族人群CCL3L1基因數目不同是否影響HIV-1易感性和疾病進程。低于同種族CCL3L1平均基因拷貝數者,對 HIV-1更易感,感染風險率達39%,感染后疾病進展到艾滋病期發生率增長26%。高于同種族CCL3L1平均基因拷貝數者,對HIV-1不易感,降低風險率4.5%-10.5%[10]。 本 研 究 發 現 中 國 漢 族 健 康 人 群 的CCL3L1基因拷貝數中位數為1,與歐美種族和非洲裔種族的CCL3L1不同,比他們的CCL3L1平均基因拷貝數都低。本研究檢測中國漢族健康人群97例和HIV/AIDS人群81例CCL3L1基因拷貝數,發現低于同種族CCL3L1平均基因拷貝數者,對HIV-1更易感,感染風險率達34.3%。初步探討CCL3L1基因拷貝數和病毒載量及CD4+T細胞數的相關性發現,CCL3L1基因拷貝數和病毒載量呈負相關(P=0.000),CCL3L1基因拷貝數和CD4+T細胞數呈正相關(P=0.000),為探討CCL3L1基因拷貝數對HIV/AIDS疾病進程的影響奠定基礎。

本研究采用SYBR Green實時定量PCR檢測CCL3L1基因拷貝數,實時熒光定量 PCR(Real time fluorescent quantitative PCR)是在PCR技術基礎上發展起來的一種高度靈敏的核酸定量技術,實時定量PCR能夠實時監測產物擴增,在對數線性擴增期能夠迅速、簡便地檢測PCR產物的擴增情況。本研究根據引物二聚體的CT值、產物及引物二聚體的熔解曲線分析和凝膠電泳對條件進行優化,確定了CCL3L1的最佳檢測體系。通過優化反應條件我們發現,將讀板溫度設定在低于T值2-4℃可以提高擴增產物的特異性。就CCL3L1而言,讀板溫度設定為75℃,低于Tm值溫度3℃,可以促使引物二聚體的雙鏈變性,釋放出結合的SYBR Green I,降低引物二聚體的熒光信號的同時,特異性擴增的PCR產物仍保持復性狀態,其數量直接反映于熒光強度,從而增加檢測的特異性。

當我們知道每個種族的平均CCL3L1平均拷貝數后,可以通過細胞因子CCL3L1基因拷貝數的不同,判斷個體HIV-1易感性和疾病進展程度。通過對病人易感性的檢測,可以幫助臨床醫生制訂針對個體的治療計劃。并且通過CCL3L1基因拷貝數的不同,可以判定每個個體對疫苗的應答率。這也意味著CCR5配體基因產物對于HIV-1感染個體具保護性,CCL3L1基因拷貝數高者對HIV-1感染者的保護性越大。這項研究揭示了CCL3L1基因拷貝數個體的不同影響著HIV-1的感染過程,CCL3L1基因產物與HIV-1易感性密切相關。

[1]Modi WS.CCL3L1and CCL4L1chemokine genes are located in a segmental duplication at chromosome 17q12[J].Genomics,2004,83(4):735.

[2]Hoffman TL,Stephens EB,NarayanO,et al.HIV-1envelope determinants for use of the CCR2b,CCR3,STRL33and APJ coreceptors[J].Proc Natl Acad Sci USA,1998,95(19):11360.

[3]Nolan D,Gaudieri S,John M,et al.Impact of host genetics on HIV disease progression and treatment:new conflicts on an ancient battleground[J].AIDS,2004,(18):1231.

[4]Townson JR,Barcellos LF,Robert JB,et al.Gene copy number regulates the production of the human chemokine CCL3-L1[J].Eur J Immunol,2002,32:3016.

[5]Arenzana-Seisdedos F,Parmentier M.Genetics of resistance to HIV infection:Role of co-receptors and co-receptor ligands[J].Semin Immunol,2006,18 (6):387.

[6]Gonzalez E,Bamshad M,Sato N,et al.Race-specific HIV-1disease-modifying effects associated with CCR5haplotypes[J].Proc Natl Acad Sci U S A,1999,96(21):12004.

[7]Cohen JV.Chemokine gene number tied to HIV susceptibility,but with a twist[J].Science,2005,307(5706):23.

[8]Lederman MM,Veazey RS,Offord R,et al.Prevention of vaginal SHIV transmission in rhesus macaques through inhibition of CCR5[J].Science,2004,306:485.

[9]Bugeja MJ,,Booth DR,Bennetts BH,et al.Analysis of the CCL3-L1gene for association with HIV-1susceptibility and disease progression[J].AIDS,2004,(18):1069.

[10]Mackay CR.CCL3L1dose and HIV-1susceptibility[J].Trends Mol Med,2005,11(5):203.

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