1 引言
基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學的快速進展不僅體現(xiàn)在各種技術(shù)和分析軟件的進步,也反映在其不斷地參與解決深層次的生物學問題,例如蛋白質(zhì)的絕對和相對定量、蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡和在整體水平上參與研究各種分子生物學解毒機制中的相關(guān)蛋白等\[1~6\]。盡管如此,蛋白質(zhì)的鑒定仍是上述研究的基礎(chǔ),生物信息學仍然是組學研究中的瓶頸問題之一\[7,8\]。隨著大規(guī)模基因組測序技術(shù)的出現(xiàn),越來越多生物的基因組被測序,因此,數(shù)據(jù)庫搜索,即利用串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)匹配現(xiàn)有的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫并依據(jù)結(jié)果打分是目前最主要的蛋白質(zhì)鑒定方式,而從頭測序算法則是直接利用串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)推導肽段和蛋白結(jié)構(gòu),適用于分析新物種或者基因組未測序生物。