李 輝 曹 晴 古冬冬 賈 芳 鄭 丹 李 聰,*
(1.河南農業大學理學院,河南 鄭州 450002;2.黃河科技學院信息工程學院數理部,河南 鄭州 450063)
目前,我們激光制備的生物芯片是由上下兩片PMMA(英文名稱:Polymethyl Methacrylate;中文名:聚甲基丙烯酸甲酯)有機玻璃材料制成,每片有機玻璃厚度為2mm左右。采用準分子激光直寫方法在下片PMMA有機玻璃材料上制備20到40個微通道,再采用熱壓鍵合方式將生物芯片上下兩片永久封閉,然后將芯片粘貼在生物PCR(英文名稱:Polymerase Chain Reaction;中文名:聚合酶鏈式反應)反應裝置的三溫區上。用進樣器控制一定的生物PCR試劑流動速度注入生物芯片,該生物PCR試劑在生物芯片中進行聚合酶鏈式反應(PCR),從而用微量樣品獲取較多的目的基因,以便使生物信息轉化為人能識別的信息量。
本文針對自己刻寫的40個微通道的生物芯片,設計了進樣裝置,研究了進樣壓力與微流控PCR基因芯片各微通道中流體流速之間的關系,為實現微流控PCR芯片中實時測速提供關鍵技術基礎。
PCR微流控生物芯片是在一個芯片上設計了擴增周期的三個溫區,利用外部注射器控制壓力和驅動液體流動。實驗液體進入微通道后,反應物在微通道通過三個溫區流動,實現一個擴增周期循環。多次循環流動實現多次擴增周期循環。即管內反應物處于周期循環的變化動態,而溫度擴增周期循環處于靜態。
流體動力學進樣具體辦法:一是在進口加壓;二是在出口加壓。在流體動力學進樣中,進樣量取決于進樣區帶的長度l,而l=υti,這里的υ是進樣速度,ti是進樣時間,根據管內流體的伯努利方程:式中△p是通過毛細管截面的壓差,r是毛細管經,η是溶液的粘度,L是毛細管長度。PCR微通道毛細管的長度L=40x90mm和直徑D=1mm是一個定值,使用的試驗試劑η也是一個定值,因此上式可以簡化為,其中c為一個定值。
我在芯片的進口和液體的出口分別設計了一個進樣的注射器,注射器和電子壓力計,拉力計連接,可以讀出推力和拉力的大小F,然后根據壓強的公式計算出壓強的大小。
在生物芯片的進口和出口分別安裝上注射器(見下圖2),

圖1 40微通道的生物芯片
1-生物PCR試劑進樣口;2–微流控芯片的微通道;3–風冷隔溫孔;4 -生物PCR試劑出樣口。根據上面設計的壓力和拉力計,我們開始我們的實驗。

圖2 進口和出口設計了注射器連接壓力計和推力計
因為微流控PCR芯片中試劑的擴增時間一般是在一個循環30~60秒左右,對于我刻寫的40個微通道的芯片,設計如下方案:
1.3.1 用注射器在進口加壓力,出口不用任何裝置,為大氣壓力;
具體操作:進口1注射器作為進樣的壓力,出口4至于大氣壓力之下
當進樣壓強差為ΔPB=4.48×104帕,ΔPC=5.6×104帕,ΔPD=6.96×104帕,ΔPE=7.6×104帕時,每個微通道循環中流體流過該微通道循環時間(見下圖3);

圖3 不同壓強40個微通道不同的循環時間
結論如下:
進樣開始的幾個循環液體流速忽快忽慢不太平穩,中間幾個循環以后時間趨于穩定。當芯片進口和出口壓強差在4×104~8 ×104帕時,流體在微通道中每個循環的時間大致在30~40秒左右,基本符合PCR擴增時間。
1.3.2 在進口用注射器加壓力和出口加抽氣壓力時,不同恒壓下,每個微通道循環中流體流過該微通道循環時間(共40個循環)
具體操作如下:進口的注射器施加推力,同時出口的注射器施加拉力
當進樣壓強差 ΔPB=2.0× 104,Δ PC=4.0× 104,Δ PD=4.8× 104,Δ PE= 5.84×104每個微通道循環中流體流過該微通道循環時間(圖 4);
結論如下:
當壓強差ΔP在 4~6× 104帕時,流體4的循環時間有一定的平穩期,但是當壓強差ΔP在 2~4× 10 帕時,循環時間上下跳躍很大,沒有什么很好的規律。進口和出口用兩個注射器容易造成壓力差的變化幅度大,不好掌握好這個壓力范圍,從而導致微流體的流速沒有規律,無法滿足PCR擴增的需要,因此不建議使用兩端注射器。
生物芯片的發展趨勢是把所有的功能集成到一個很小的芯片范圍內,在很短的時間內可以檢測出結果,應用在現代化的戰場上。本次試驗的芯片,采用一端進樣的方式,另一端是大氣壓,當壓強差在 4×104~8×104帕時,每個循環的時間大致在30~40秒左右,符合PCR擴增的要求。當然這只是個初步的實驗結果,我在很多次的試驗數據中截取的一部分數據,但是這些數據可以充分說明芯片兩端進樣壓強的合適值。當然,不管是激光還是掩膜制造的芯片,在制造過程中可能有很多的不均勻,導致流體流速的變化不穩定,這個問題值得再深入的研究。
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