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rs2233678和rs2233679多態性與福建漢族人群肺癌易感性及臨床病理學特征的關系

2014-11-18 10:14:34黃建新黃建平張旸張黎仙楊坤榮
中國當代醫藥 2014年30期
關鍵詞:肺癌研究

黃建新+黃建平+張旸+張黎仙+楊坤榮+陳清泉

[摘要] 目的 了解福建漢族人群肽酰脯氨酰基順反異構酶1(Pin1)基因rs2233678(-842G/C)和rs2233679(-667T/C)多態性分布規律及其與肺癌發生、發展的關系。 方法 采用聚合酶鏈反應(PCR)技術,對80例漢族肺癌患者和135例健康對照的Pin1基因啟動子進行擴增并對PCR產物直接測序,分析Pin1基因啟動子多態性與肺癌易感性及其臨床病理學特征的關系。 結果 rs2233678位點只檢測到GG和GC兩種基因型,沒有檢測到CC基因型。rs2233678和rs2233679位點的等位基因和基因型分布在肺癌組和健康對照組中比較差異無統計學意義(P>0.05);其組成的單體型C-C、G-C和G-T均與肺癌發生風險無相關性(P>0.05),rs2233678的基因型分布與肺癌的臨床病理學特征無相關性(P>0.05),rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型呈弱相關(r=0.285,P=0.010)。 結論 rs2233678和rs2233679多態性可能與福建漢族人群肺癌易感性無關,rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關性。

[關鍵詞] 肺癌;肽酰脯氨酰基順反異構酶1;多態性;易感性

[中圖分類號] R734.2 [文獻標識碼] A [文章編號] 1674-4721(2014)10(c)-0004-04

肽酰脯氨酰基順反異構酶1(peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1,Pin1)是一種高度保守、特異的肽脯氨酰基順反異構酶,能特異性地催化磷酸化絲/蘇-脯氨酸基序發生順反異構,影響許多癌基因信號通路中β-catenin[1]、NF-кB[2]等關鍵蛋白的活性和穩定性,在細胞增殖和腫瘤發生、發展中起重要作用[3],被認為是一種新的腫瘤預后因子和抗癌治療的靶標[3-6]。Pin1基因多態性的研究主要集中在啟動子區的-842G/C(rs2233678)和-667T/C(rs2233679)兩個多態性位點上。流行病學研究顯示,Pin1基因多態性與乳腺癌、肝癌、肺癌、食管癌、頭頸部鱗癌及喉部鱗癌等多種腫瘤易感性密切相關,但研究結果存在明顯的分歧:有些研究者認為,-842G/C的C基因變異是腫瘤發生的保護因子,可以降低亞洲人和白種人群頭頸部鱗癌、肺癌和乳腺癌的發病風險[7-11];有些研究顯示,-667T基因可以明顯降低亞洲人群的腫瘤易感性[8];還有研究認為-842G/C[12]和-667T/C[7,10-12]與腫瘤的易感性無關。至今仍未見Pin1基因多態性與福建地區漢族人群肺癌易感性的報道,因此,為明確Pin1基因多態性與肺癌易感性和臨床病理特征的關系,本研究對福建漢族肺癌患者Pin1基因的rs2233678(-842G/C)和rs2233679(-667T/C)多態性位點進行分析。

1 資料與方法

1.1 一般資料

收集2013年7~12月在本院住院并手術確診的80例肺癌患者作為肺癌組,其中男性52例(65.0%),女性28例(35.0%);平均年齡為(59.1±11.8)歲;腺癌54例(67.5%),鱗癌17例(21.3%),其他類型肺癌9例(11.2%)。同時選取同期135例體檢正常者作為健康對照組,其中男性79例(58.5%),女性56例(41.5%);平均年齡為(57.6±11.3)歲。兩組的年齡、性別比較差異無統計學意義(P>0.05),具有可比性。所有研究對象均為出生并長期生活在福建地區的漢族人。

1.2 檢測方法

1.2.1 基因組DNA抽提 知情同意后,取患者及健康對照外周靜脈血2 ml,EDTA抗凝。所有標本置入-20℃保存備用或立即按試劑盒操作步驟進行DNA提取。全血基因組DNA抽提試劑盒由北京康為世紀生物科技有限公司提供。

1.2.2 PCR引物及PCR反應 應用Primer 5.0軟件自行設計引物,上游引物:5′-AGGGTTCTATGCTAGGTGAACTG-3′;下游引物:5′-TATTGGCTAGACGCGCTCTG-3′(生工生物工程上海股份有限公司合成),該引物擴增產物為919 bp,包含Pin1基因啟動子區-842G/C(rs2233678)和-667T/C(rs2233679)區域。根據文獻[13]配制PCR反應體系,在ABI 2720型PCR儀上95℃預變性5 min后,進行95℃ 30 s→55℃ 30 s→72℃ 1 min,循環35次,72℃再延伸10 min。1.5%的瓊脂糖凝膠電泳觀察結果。

1.2.3 PCR產物純化和回收 使用普通瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(天根生化科技有限公司),按使用說明操作,進行PCR產物的純化和回收。

1.2.4 測序 純化后的PCR產物用全自動測序儀(ABI377型,Applied Biosystems公司)進行測序。

1.2.5 臨床病理資料收集 收集所有肺癌患者的病理組織類型及TNM分期等資料,并記錄所有研究對象的年齡、性別等一般資料。

1.3 統計學處理

采用SPSS 18.0統計軟件對數據進行分析和處理,計量資料以x±s表示,采用t檢驗,計數資料采用χ2檢驗,相關性強度采用Spearman相關分析,以P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 Pin1基因rs2233678和rs2233679位點的各基因型

對80例肺癌組和135例健康對照組的Pin1基因rs2233678和rs2233679位點進行測序分析,rs2233678位點只檢測到GG和GC兩種基因型,未檢測到CC基因型;rs2233679位點TT、TC和TT三種基因型均可檢測到。rs2233678和rs2233679位點的各基因型見圖1。

2.2 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型頻率、單體型頻率及其與肺癌易感性的關系

肺癌組和健康對照組中Pin1基因rs2233678和rs2233679位點基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律;rs2233678和rs2233679等位基因、基因型和單體型頻率在肺癌組和健康對照組中比較差異無統計學意義(P>0.05)(表1)。

2.3 Pin1基因rs2233678和rs2233679基因型與肺癌臨床病理學特征的關系

Pin1基因rs2233678基因型頻率與病理類型、TNM分期無關(P>0.05);rs2233679基因型頻率與病理類型呈弱相關(r=0.285,P=0.010)(表2、表3)。

3 討論

Pin1基因定位于19p13,編碼含163個氨基酸殘基的核蛋白Pin1,相對分子量為18,包含兩個功能結構域:N端的WW區和C端的肽基脯氨酰異構酶活性區[3]。Pin1在許多腫瘤中高表達[14-15],不僅可以引起多條腫瘤信號通路關鍵蛋白的構象變化[2],而且影響DNA的損傷修復[16],在腫瘤的發生、發展中起重要作用。

本研究首次描述了福建漢族人群Pin1基因rs2233678和rs2233679位點的多態性分布規律,發現rs2233678和rs2233679位點的等位基因、基因型分布及其單體型均與肺癌風險無關,rs2233679基因型分布與肺癌的病理類型僅呈弱相關,與Naidu等[12]對乳腺癌的研究基本一致。與本研究結果不一致的是Lu等[11]發現rs2233678的C基因變異明顯降低患肺癌的風險,進一步的功能研究發現C基因變異可以降低轉錄活性;Zhu等[8]發現rs2233679的T基因型明顯降低亞洲人的患癌易感性。相關研究發現rs2233679多態性與患癌風險無關[7,11]。研究結果不一致,一方面可能是樣本量的大小不同所致,另一方面可能是不同地區的患者可能有不同的種族或遺傳背景所致[11,17]。這些差異可能會改變多態性位點的等位基因和基因型頻率在病例組和對照組中的分布,進而影響多態性位點與患癌風險的統計效力,因此,有必要進行多地區、多種族的大樣本量研究來進一步證實Pin1基因多態性與肺癌易感性的關系。

綜上所述,Pin1基因rs2233678和rs2233679位點多態性可能與福建漢族肺癌風險無關,rs2233679的基因型分布與肺癌病理類型有一定的相關性,這為Pin1多態性與腫瘤易感性的研究豐富了數據,也為無法手術的肺癌患者的病理類型推測提供了思路。當然,由于本研究的樣本量有限,也沒有進行rs2233678和rs2233679基因型與Pin1表達量及活性的研究,因此,有關Pin1基因多態性與肺癌易感性仍有待于進一步深入研究。

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(收稿日期:2014-08-11 本文編輯:李亞聰)

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(收稿日期:2014-08-11 本文編輯:李亞聰)

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