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結直腸癌組織KRAS和BRAF基因突變情況及意義

2014-12-02 04:34:02孫亞瓊
山東醫藥 2014年32期
關鍵詞:基因突變檢測研究

宋 敏,孫亞瓊,張 莉,潘 瓊

(鄭州大學第一附屬醫院,鄭州450052)

結直腸癌是三大常見的惡性腫瘤之一,多數患者就診時已經處于晚期,失去了手術治療的最佳機會。臨床試驗證明,西妥昔單抗、帕尼單抗等表皮生長因子受體(EGFR)拮抗劑治療轉移性結直腸癌的療效較常規化療顯著提高,但只有KRAS野生型患者從中受益[1,2]。KRAS對抗 EGFR 治療的預測作用已經明確,但其與臨床特征、預后之間的關系無明確結論。而關于BRAF基因的研究相對較少,雖被報道與抗 EGFR 耐藥相關[1,3],但其突變狀態與病情及預后的關系尚無定論。2010年1月~2013年12月,我們觀察了結直腸癌組織KRAS和BRAF基因突變情況,并探討其意義。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選擇結直腸癌組織477例,均經甲醛固定、石蠟包埋,患者均未行抗EGFR(西妥昔單抗/帕尼單抗)治療。其中男295例,女182例;年齡27~81歲,平均51歲;結腸癌316例,直腸癌161例;具有分化程度、腫瘤大小、淋巴結轉移情況、浸潤深度、TNM 分期等資料者分別為 473、209、373、366、362例。

1.2 方法

1.2.1 指標觀察方法 記錄腫瘤原發部位、大小、分化程度、淋巴結轉移、浸潤深度、TNM分期,并隨訪至疾病進展或死亡,記錄無進展生存期(PFS)。

1.2.2 基因突變檢測 采用實時熒光PCR及多重PCR-STR法檢測KRAS基因外顯子2第12、13位密碼子的基因突變情況,其中315例同時檢測BRAF基因外顯子15的突變情況,并對擴增產物進行測序。按照DNA試劑盒(QIAGEN)說明提取石蠟標本基因組DNA,KEAS上游引物:5'-GGTACTGGTGGAGTATTTGATAG-3',下游引物:5'-TGGTCCTGCACCAGTAATATG-3',擴增長度248 bp;BRAF上游引物:5'-CTCTTCATAATGCTTGCTCTGATAGG-3',下游引物:5'-GTGGAAAAATAGCCTCAATTCTT-3',擴增長度211 bp。反應條件:初始變性95℃、5 min,95 ℃、30 s,56 ℃、30 s,72 ℃、20 s,共 45 個循環,72℃延伸10 min,4℃結束反應。PCR產物經3%瓊脂糖凝膠電泳確定后,采用ABI Sequence Analyzer測序分析。

1.2.3 統計學方法 采用SPSS17.0統計軟件。率的比較采用χ2檢驗,PFS的比較采用t檢驗。P≤0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 KRAS、BRAF 基因突變情況 KRAS 基因突變率為24.5%(117/477),其中單純 G12D突變50例、G12V突變29例、G12A突變11例、G13D突變17例、G13A突變9例,G12D聯合G12V突變1例。BRAF基因突變率為11.4%(36/315),均為V600E突變。未檢測到同時發生KRAS與BRAF基因突變者,BRAF基因在KRAS基因野生型患者中的突變率為 14.2%(36/252),KRAS基因在BRAR基因野生型患者中的突變率為22.6%(63/279)。

2.2 KRAS、BRAF基因突變與結直腸癌臨床因素的關系 左、右側結腸癌患者KRAS基因突變率分別為13.3%、36.4%,P=0.05。KRAS 基因突變型和野生型分別有69.2%、30.0%出現肝轉移(P<0.01),有 30.8%、32.5% 出現肺轉移(P > 0.05)。KRAS基因在≥65歲患者中的突變率高于<65歲者,P<0.01。BRAF基因在男性、高分化、TNM 分期Ⅲ~Ⅳ期的突變率分別高于女性、中低分化、Ⅰ~Ⅱ期,P 均 <0.05。

表1 KRAS、BRAF基因突變與結直腸癌患者臨床因素的關系[例(%)]

2.3 KRAS、BRAF基因突變與PFS的關系 KRAS基因突變型的PFS為6.2個月,野生型為10.6個月,P>0.05。BRAF基因突變型的PFS為10個月,野生型為8個月,P >0.05。

3 討論

KRAS是大鼠肉瘤原癌基因家族(RAS)的成員之一,在抑制腫瘤細胞凋亡及加速其增殖方面起著重要的作用。BRAF通過激活MAPK通路和抑制促凋亡因子 BIM,導致細胞異常增殖和分化。當KRAS或BRAF基因發生突變時導致EGFR下游通路的激活,從而產生抗EGFR耐藥。結合目前關于KRAS、BRAF基因突變狀態的研究結果,雖然證實KRAS野生型患者能從抗EGFR治療中獲益,但仍有相當數量患者對抗EGFR治療無效。KRAS基因狀態并不能篩選出所有抗EGFR治療有效人群,而BRAF基因突變檢測目前均與KRAS基因檢測同時進行,參考價值仍依賴于KRAS基因突變狀態,尚不能單獨作為預測因子。因此需要更有效、更多預測因子來確定更加精確地靶向治療有效人群,目前已有 TP53、PTEN 與 PIK3CA、E-cadherin、NRAS 等相關因子的研究,但均未得出定論,希望更多的學者能在此研究方向得出更加精確的結論。

目前研究報道,KRAS突變率為20% ~45%[4~8],BRAF 突變率為 4%~ 15%[9~15],與本研究中KRAS(24.5%)和BRAF基因突變率(11.4%)基本一致。目前研究表明,KRAS、BRAF基因突變在女性、高級別腫瘤、右側腫瘤、老年患者中多見,并有報道顯示二者突變率在結腸癌中明顯高于直腸癌[8]。而本研究顯示,KRAS基因突變與老年顯著相關,BRAF基因突變則在男性中多見,以上差異可能是由于地域性、研究樣本量和基因檢測方法不同等導致的。此前報道中未曾發現KRAS基因同時多個密碼子突變,因此認為KRAS基因各密碼子突變為獨立事件。而本研究中觀察到1例KRAS基因同時發生G12D、G12V密碼子突變,可能系檢測誤差所致,但亦不能排除KRAS基因存在多種密碼子突變形式共存的可能性,有待后續觀察證實。本研究分析KRAS、BRAF基因突變狀態與患者預后之間的關系,認為基因突變患者肝轉移率較高;但未發現基因突變與PFS之間存在明顯關聯,表明KRAS與BRAF基因狀態并不能預測以奧沙利鉑/伊立替康為基礎治療的療效。

綜上所述,KRAS基因突變與結直腸癌患者的年齡、發病部位及肝轉移有關,BRAF基因突變與性別、分化程度、腫瘤TNM分期有關;檢測兩基因突變情況有助于判斷結直腸癌患者的病情。由于本研究患者均未行抗EGFR治療,所以未能觀察到兩基因突變對抗EGFR靶向治療的預測作用及其對預后的影響,有待進一步研究。

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