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豬瘟脾淋毒活疫苗中兔瘟外源病毒檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用

2015-04-17 00:58:40于新友李天芝沈志強(qiáng)
今日畜牧獸醫(yī) 2015年3期
關(guān)鍵詞:污染檢測(cè)方法

于新友,李天芝,唐 娜,沈志強(qiáng),

(1.山東綠都生物科技有限公司,山東濱州256600;2.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東濱州256600)

豬瘟脾淋毒活疫苗中兔瘟外源病毒檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用

于新友1,李天芝1,唐 娜2,沈志強(qiáng)1,2

(1.山東綠都生物科技有限公司,山東濱州256600;2.山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院,山東濱州256600)

為檢測(cè)商品化豬瘟脾淋毒活疫苗中RHDV污染,根據(jù)兔出血癥病毒VP60基因保守序列設(shè)計(jì)引物,建立了檢測(cè)兔出血癥病毒一步法反轉(zhuǎn)錄一聚合酶鏈(RT-PCR)方法,并對(duì)其特異性、敏感性進(jìn)行了研究。該一步法RT-PCR對(duì)RHDV擴(kuò)增結(jié)果為陽(yáng)性,對(duì)照毒株擴(kuò)增結(jié)果均為陰性;對(duì)兔出血癥病毒檢測(cè)的靈敏性為10皮克總RNA量,應(yīng)用該方法,檢測(cè)了20批豬瘟脾淋源活疫苗樣品,以上結(jié)果表明該一步法RT-PCR方法檢測(cè)速度快、特異性強(qiáng)、敏感性高,可用于豬瘟脾淋毒活疫苗中污染的RHDV外源病毒檢測(cè)。

豬瘟(Classical swine fever,CSF)又稱(chēng)“爛腸瘟”,是由豬瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)引起的一種嚴(yán)重危害全世界養(yǎng)豬業(yè)高度傳染、致死性疾病,我國(guó)1984年將豬瘟列為一類(lèi)動(dòng)物疫病,兔瘟是由兔出血癥病毒(rabbit hemorrhagic disease virus,RHDV)引起的一種兔傳染病,該病于1984年在中國(guó)江蘇部分縣市首次暴發(fā),現(xiàn)已擴(kuò)散到世界各地。疫苗成品出現(xiàn)污染外源性病毒現(xiàn)象常常是因?yàn)橐呙缟a(chǎn)原材料的污染所引起的,豬瘟脾淋毒活疫苗是以接種豬瘟兔化弱毒的家兔脾臟、淋巴結(jié)為原材料制成的,所以豬瘟脾淋毒活疫苗存在污染RHDV的可能性。RHDV發(fā)病的家兔死前一般無(wú)明顯臨床癥狀,不易被發(fā)現(xiàn),一旦感染RHDV家兔的脾淋組織毒混入制備豬瘟脾淋毒活疫苗的抗原中,就會(huì)導(dǎo)致疫苗成品污染。筆者在進(jìn)行豬瘟脾淋毒活疫苗效力檢驗(yàn)時(shí),發(fā)現(xiàn)其中1批次疫苗注射家兔2日后,家兔突然死亡,診斷為兔瘟病毒感染,于是對(duì)疫苗進(jìn)行各種檢驗(yàn),結(jié)果發(fā)現(xiàn)疫苗中污染了兔瘟病毒。雖然藥典中規(guī)定豬瘟脾淋毒活疫苗中RHDV污染的檢測(cè)方法為家兔注射法,但是我國(guó)目前還沒(méi)有SPF家兔,因此,檢測(cè)結(jié)果可能會(huì)受家兔的來(lái)源、品種和易感性等影響,且檢驗(yàn)成本較高、耗時(shí)長(zhǎng),常規(guī)的兔瘟病毒檢測(cè)方法如電鏡觀察、血凝(血凝抑制)試驗(yàn)等方法存在操作復(fù)雜、敏感性低、費(fèi)時(shí)費(fèi)力等缺點(diǎn),不能滿足豬瘟中RHDV的檢測(cè)。

本研究根據(jù)GenBank公布RHDV基因序列(JF438967),針對(duì)具有很高保守性的VP60基因設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,建立了一種特異、敏感的RHD檢測(cè)方法,以確保疫苗的安全、有效,為商品化豬瘟脾淋毒活疫苗中RHDV污染提供一種有效的分子生物學(xué)檢測(cè)方法。

1 材料和方法

1.1 病毒株與病料

兔出血癥病毒(RHDV)、兔水皰性口炎病毒(RVSTV)、輪狀病毒(RRV)、豬藍(lán)耳病毒(PRRSV)、豬瘟病毒(CSFV)、豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、牛病毒性腹瀉病毒(BVDV)由本實(shí)驗(yàn)室保存,20批豬瘟脾淋源活疫苗樣品購(gòu)買(mǎi)自不同廠家。

1.2 工具酶及試劑盒

AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量試劑盒購(gòu)自愛(ài)思進(jìn)生物技術(shù)(杭州)有限公司、DNA Marker、PCR相關(guān)試劑、限制性內(nèi)切酶、MD18-T載體、DNA凝膠回收試劑盒購(gòu)自大連寶生物公司。

1.3 RT-PCR引物設(shè)計(jì)與合成

參照GenBank中登錄的RHDV基因序列(JF438967),采用Primer Premier5.0引物設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)1對(duì)引物,上游引物:5′-GGAACTTGAATGGCAGCAC-3′,下游引物:5′-TAAAGGGCACGAACGACA-3′,擴(kuò)增RHDV VP60基因部分片段201堿基對(duì),引物由上海生工生物工程股份有限公司合成。

1.4 病毒基因組RNA的提取

按AxyPrep體液病毒DNA/RNA小量試劑盒使用說(shuō)明書(shū)提取RHDV的RNA,并提取其他幾種病毒的RNA。

1.5 RHD VP60基因的一步法RT-PCR擴(kuò)增及條件優(yōu)化

以RNA為模板進(jìn)行一步法RT-PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系為20微毫升。各參數(shù)為50℃逆轉(zhuǎn)錄30分鐘,95℃預(yù)變性2分鐘,然后進(jìn)入95℃20秒、55℃20秒、72℃20秒,共30個(gè)循環(huán),最后72℃延伸8分鐘。取4微毫升產(chǎn)物,1.5%瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果。同時(shí)對(duì)各擴(kuò)增條件進(jìn)行優(yōu)化,包括退火溫度(49℃~59℃梯度溫度,每2℃為1個(gè)梯度)、引物濃度(0.1~1.1微摩爾/升,每0.2微摩爾/升為1個(gè)梯度)等,反應(yīng)體系均為20微毫升。

1.6 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定

首先取擴(kuò)增產(chǎn)物5微毫升在1.5%的瓊脂糖凝膠上電泳,用DNA凝膠回收試劑盒回收目的片段。將目的片段與pMD18-T克隆載體在16℃恒溫金屬浴中過(guò)夜連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)菌株DH5α。挑取單個(gè)的轉(zhuǎn)化菌落,加LB溶液培養(yǎng)18小時(shí)后用質(zhì)粒提取試劑盒抽提質(zhì)粒,用PCR方法進(jìn)行鑒定,將陽(yáng)性克隆送上海生工生物工程股份有限公司進(jìn)行測(cè)序鑒定,將測(cè)序結(jié)果與參照的RHDV序列同源性比較。

1.7 特異性試驗(yàn)

分別提取RHDV、RVSTV、RRV、PRRSV、CSFV、PEDV、BVDV的RNA,用已建立的方法進(jìn)行擴(kuò)增。

1.8 敏感性試驗(yàn)

RHDV病毒提取RNA后定量,然后10倍梯度稀釋提取的病毒基因組RNA,使其分別相當(dāng)于含有100納克RNA、10納克RNA、1納克RNA、100皮克RNA、10皮克RNA、1皮克RNA的含量,分別進(jìn)行一步法RT-PCR檢測(cè),確定其敏感性。

1.9 重復(fù)性試驗(yàn)

用建立的一步法RT-PCR檢測(cè)方法,檢測(cè)兔出血癥、兔水皰性口炎、輪狀病毒、豬藍(lán)耳病、豬瘟、豬流行性腹瀉、牛病毒性腹瀉各3份病料和3份陰性病料,重復(fù)檢測(cè)3次,以驗(yàn)證本方法的重復(fù)性和穩(wěn)定性。

1.10 豬瘟脾淋源活疫苗中兔瘟外源病毒的檢測(cè)

將購(gòu)買(mǎi)的20批豬瘟脾淋源活疫苗樣品稀釋為含有1頭份/200微升作為檢測(cè)樣品進(jìn)行一步法RT-PCR擴(kuò)增,同時(shí)設(shè)立陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照。

2 結(jié)果與分析

2.1 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)及鑒定

2.1.1 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過(guò)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,擴(kuò)增產(chǎn)物在201堿基對(duì)處可見(jiàn)特異性擴(kuò)增帶,與預(yù)期大小相符。

2.1.2 擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序鑒定

挑取PCR鑒定陽(yáng)性的菌液送上海生工生物工程股份有限公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果顯示,插入到T載體的基因片段的核苷酸序列與RHDV(登錄號(hào):(JF438967)的序列相似性為100%。

2.2 特異性試驗(yàn)

利用設(shè)計(jì)的引物和確定的最佳擴(kuò)增條件分別對(duì)RHDV、RVSTV、RRV、PRRSV、CSFV、BVDV的RNA進(jìn)行一步法RT-PCR。結(jié)果7個(gè)毒株中只有RHDV RNA能擴(kuò)增出大小為201堿基對(duì)目的片段,而其他均未擴(kuò)增出相應(yīng)的片段,表明本試驗(yàn)建立的方法有很好的特異性。

2.3 敏感性試驗(yàn)

取5微升PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析,分別在約201堿基對(duì)附近出現(xiàn)特異性條帶,與預(yù)期產(chǎn)物大小相符。從結(jié)果可以看出,引物的一步法RT-PCR檢測(cè)靈敏度可以達(dá)到10皮克RNA。

2.4 重復(fù)性試驗(yàn)

經(jīng)過(guò)3次重復(fù)操作,結(jié)果一致,說(shuō)明建立的方法是穩(wěn)定、可靠的。

2.5 豬瘟脾淋源活疫苗中RHDV外源病毒的檢測(cè)

用建立的RHDV一步法RT-PCR檢測(cè)方法,共檢測(cè)了20批商品化豬瘟脾淋源活疫苗樣品,其中有2批有RHDV污染。

3 討論

傳統(tǒng)RHDV檢測(cè)方法具有各種弊端,如病毒分離鑒定操作繁瑣、鑒定時(shí)間長(zhǎng),酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)結(jié)果重復(fù)性不好,血凝試驗(yàn)敏感性低,檢驗(yàn)受人為影響因素多,而且對(duì)于沒(méi)有或缺乏血凝活性的RHDV毒株,在生產(chǎn)應(yīng)用中受到限制。而新發(fā)展的熒光定量PCR檢測(cè)方法雖然有很多優(yōu)勢(shì),但所需儀器比較昂貴,且對(duì)操作人員要求較高,不適合大規(guī)模推廣應(yīng)用,傳統(tǒng)的兩部法RT-PCR檢測(cè)方法時(shí)間長(zhǎng),操作繁瑣,需要先反轉(zhuǎn)錄成cDNA再進(jìn)行PCR擴(kuò)增,本試驗(yàn)建立的RHDV一步法RT-PCR檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)單,不需要單獨(dú)做反轉(zhuǎn)錄,反轉(zhuǎn)錄與PCR擴(kuò)增一步完成,能在3小時(shí)內(nèi)檢出RHDV,本試驗(yàn)對(duì)擴(kuò)增的退火溫度和引物濃度進(jìn)行優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)只有當(dāng)退火溫度值為56℃時(shí),才能獲得較為理想的產(chǎn)物,在引物濃度為0.1~1.1微摩爾/升對(duì)PCR擴(kuò)增效率的影響不大,在0.7微摩爾/升時(shí)擴(kuò)增效率相對(duì)較高,而在1.1微摩爾/升時(shí)擴(kuò)增效率低。特異性好,而對(duì)常見(jiàn)的兔、豬病毒如RHDV、RVSTV、RRV、PRRSV、JEV、PEDV、BVDV擴(kuò)增結(jié)果為陰性,檢測(cè)的靈敏度可以達(dá)到10皮克RHDV RNA。用建立的RHDV一步法RT-PCR檢測(cè)方法,共檢測(cè)了20批商品化豬瘟脾淋源活疫苗樣品,其中有2批有RHDV污染。因此,商品化豬瘟脾淋源活兔瘟外源病毒還是很有必要檢測(cè)的,本試驗(yàn)所建立的方法為豬場(chǎng)基層獸醫(yī)工作者開(kāi)展豬瘟活疫苗樣品RHDV污染的檢測(cè)提供了一種簡(jiǎn)單、有效的分子生物學(xué)檢測(cè)方法。

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