鳳凰單叢茶樹資源遺傳多樣性的ISSR分析

吳清等

摘 要 采用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)48份鳳凰單叢茶品種（系）進(jìn)行了遺傳多樣性分析。選用10個(gè)多態(tài)性高、分辨力強(qiáng)的ISSR引物分別對(duì)供試材料基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增，共獲得121個(gè)位點(diǎn)，其中多態(tài)位點(diǎn)帶98個(gè)，多態(tài)位點(diǎn)比率（PPB）為81.0%。品種（系）之間的遺傳相似系數(shù)變化范圍在0.590 9～0.967 4之間。UPGMA聚類分析結(jié)果表明，在GS值為0.792的水平上供試材料可劃分為7大類，其親緣關(guān)系遠(yuǎn)近與地理來源關(guān)系不大且與香味類型沒有必然的聯(lián)系。

關(guān)鍵詞 ISSR分子標(biāo)記；鳳凰單叢茶；遺傳多樣性

中圖分類號(hào) S571.1 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

Abstract ISSR molecular markers were used to analyze the genetic polymorphism of 48 Fenghuang-Dancong tea plant germplasms. Using 10 primers， we amplified 121 bands， of which 98 bands are polymorphic， and the average percentage of polymorphic bands was 81.0%. The genetic similarity among all the tested tea plant germplasms ranged from 0.590 9 to 0.967 4. Based on the genetic similarity and the UPGMA cluster， all the 48 accessions were clustered to 7 groups on the genetic similarity level of 0.792. The dengrogram indicated that the genetic of 48 tested tea plant germplasms had no certain relation with the geographical origin and aroma type.

Key words ISSR markers； Fenghuang-Dancong Tea； Genetic diversity

doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.03.009

鳳凰單叢茶屬烏龍茶類，產(chǎn)于“中國烏龍茶之鄉(xiāng)”的廣東省潮安縣鳳凰鎮(zhèn)，由茶農(nóng)歷代沿習(xí)單株優(yōu)選、單株培育、單株采制的傳統(tǒng)栽培方式和獨(dú)特的加工工藝制作而成的具有天然花香和特殊韻味品質(zhì)的烏龍茶，現(xiàn)已形成了具有區(qū)域特色的品種（系）體系，享有“中國的國寶”之美譽(yù)[1]。茶業(yè)產(chǎn)量及品質(zhì)提高依賴于茶樹優(yōu)良品種的選育，而鳳凰單叢品種（系）資源繁多，且主要以香型為主線將其歸類，存在同一香型中包含多個(gè)品種（系），同型品種（系）間的品質(zhì)參差不齊的現(xiàn)象，加之茶樹通常是通過雜交育種，從而使各品種（系）之間的親緣關(guān)系混亂，本底不清，遺傳背景不明確，極大地妨礙了品種（系）之間的親緣歸類、育種親本的選配和種質(zhì)資源的創(chuàng)新和利用。

ISSR（Inter-Simple Sequence Repeat）是一種以基因組中常出現(xiàn)的SSR本身設(shè)計(jì)成錨定引物為單引物并基于PCR技術(shù)的簡單序列重復(fù)區(qū)間擴(kuò)增多態(tài)性分子標(biāo)記，具有無需預(yù)先知道基因組序列信息、快速、穩(wěn)定、多態(tài)性豐富、重復(fù)性強(qiáng)及成本低等優(yōu)點(diǎn)[2]。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于植物的種質(zhì)資源鑒定和親緣關(guān)系分析，在茶樹種質(zhì)資源上的應(yīng)用也有相關(guān)報(bào)道[3-8]。本研究利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)，從DNA分子水平對(duì)所收集的48份鳳凰單叢茶樹品種（系）進(jìn)行遺傳多樣性及親緣關(guān)系研究，為鳳凰單叢茶樹品種（系）的親緣歸類、保護(hù)及利用提供參考依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

供試的48份鳳凰單叢茶樹樣品及來源詳見表1。取一芽兩葉置于盛有硅膠的封口袋中，-20 ℃保存?zhèn)溆谩SSR引物由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成，Taq聚合酶、dNTPs等購自大連寶生物TaKaRa公司。

1.2 方法

1.2.1 DNA的提取 參照Sue Porebski[9]、陳昆松[10]的方法，采用改良的CTAB（2% β-巰基乙醇、3%聚乙烯吡咯烷酮）法進(jìn)行基因組DNA提取。

1.2.2 ISSR-PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物檢測 ISSR-PCR擴(kuò)增反應(yīng)在TaKaRa TP600梯度PCR儀上進(jìn)行，經(jīng)過比較和優(yōu)化，確定反應(yīng)體積為20 μL，PCR組分如下：2 μL 10×PCR buffer、40 ng/μL模板DNA、150 μmol/L dNTPs、1.5 mmol/L MgCl2、引物0.3 μmol/L、1.0 U Taq酶。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性7 min；94 ℃變性1 min，特定溫度退火45 s，72 ℃延伸120 s，38個(gè)循環(huán)；最后72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物用含有0.5 μg/mL EB的1.8%瓊脂糖凝膠（1×TAE緩沖液）以5 V/cm電泳3 h，電泳結(jié)束用VILBER LOURMAT公司凝膠成像系統(tǒng)照相并保存。

1.3 數(shù)據(jù)處理

對(duì)保存的圖片進(jìn)行人工方法讀帶，將電泳圖上可重復(fù)的、清晰的條帶賦值為“1”，同一電泳遷移位置無帶或不易分辨的弱帶賦值為“0”，建立原始數(shù)據(jù)矩陣。使用NTSYspc2.10e軟件，根據(jù)Nei等[11]采用DICE系數(shù)計(jì)算供試材料間的遺傳相似系數(shù)，并按SAHN鄰接法對(duì)供試材料進(jìn)行UPGMA遺傳相似性聚類分析，并繪制樹狀聚類圖[5]。

2 結(jié)果與分析

2.1 ISSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性

從103條ISSR引物中篩選出10條能在特定的退火溫度下擴(kuò)增條帶具有多態(tài)性高、重復(fù)性強(qiáng)、背景清晰的引物用于ISSR-PCR反應(yīng)，10條引物共擴(kuò)增出121個(gè)位點(diǎn)，其中多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)為98個(gè)，平均多態(tài)性位點(diǎn)百分率（PPB）為81.0%（表2）。不同引物擴(kuò)增的位點(diǎn)數(shù)7～15個(gè)不等，平均每個(gè)引物擴(kuò)增12.1個(gè)位點(diǎn)和9.8個(gè)多態(tài)位點(diǎn)，多態(tài)位點(diǎn)百分率最高為92.3%，最低為70%（表2）。擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小介于250～2 000 bp之間，圖1為引物UBC880擴(kuò)增的結(jié)果。

2.2 品種（系）間親緣關(guān)系和聚類分析

根據(jù)條帶統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)矩陣，分析供試材料間的遺傳相似性系數(shù)，結(jié)果表明，48份鳳凰單叢茶樹資源品種（系）之間的遺傳相似性系數(shù)范圍介于0.590 9～0.967 4之間，平均遺傳相似性系數(shù)為0.795 0。其中南馥通天香（45號(hào)）與兄弟茶（46號(hào)）之間的相似系數(shù)最高（0.967 4），親緣關(guān)系最近。而玉蘭香（23號(hào)）與鴨屎香（38號(hào)）之間的相似系數(shù)最低（0.590 9），親緣關(guān)系最遠(yuǎn)，顯示它們彼此存在較大的遺傳差異。

依據(jù)種質(zhì)間的Neis遺傳相似性系數(shù)對(duì)48份鳳凰單叢茶樣品進(jìn)行UPGMA聚類分析，結(jié)果（圖2）顯示，在相似性系數(shù)閾值為0.792時(shí)，可將48份樣品分為7大類群，第Ⅰ類群包括宋種蜜蘭香等33份品種（系），第Ⅱ類群包括蓋山香、夜來香、大紅、石古坪烏龍、毛尖5個(gè)品種（系），第Ⅲ類群包括鋸剁仔、石古坪杏仁香2個(gè)品種（系），第Ⅳ類群包括石古坪黃梔香、官目石芝蘭香、油茶3個(gè)品種（系），第Ⅴ類群包括宋種1號(hào)、田料埔長葉黃梔香2個(gè)品種（系），第Ⅵ類群包括玉蘭香、官目石玉蘭香2個(gè)品種（系），第Ⅶ類群包括鴨屎香1個(gè)品種（系）。其中第Ⅰ類群還可以分為兩個(gè)亞類群，第Ⅰ亞類群包括宋種蜜蘭香、佚名、大庵玉蘭、南馥通天香、兄弟茶、竹葉、大烏葉、大烏葉2號(hào)、原種水仙、南馥蜜蘭香、桂花香、白葉、鳥嘴1號(hào)、鳥嘴2號(hào)、田料埔圓葉黃梔香、貢香、黃金葉和柚花香18個(gè)品種（系），第Ⅱ亞類群包括仙豆葉、區(qū)山塘八仙過海、花香單叢、清泉香、大坪芝蘭香、通天香、柚葉、宋種黃梔香、楊梅葉、大庵芝蘭香、蛤蛄螻、大庵肉桂、官目石肉桂香、雞籠刊和茉莉香15個(gè)品種（系）。根據(jù)聚類樹狀圖結(jié)果表明，供試的鳳凰單叢茶種質(zhì)之間的親緣關(guān)系與地理來源、海拔高度及香味類型沒有必然的對(duì)應(yīng)關(guān)系，例如同一香型、命名相似的大坪芝蘭香、大庵芝蘭香、官目石芝蘭香3個(gè)種質(zhì)并不完全聚為同一類群，大庵玉蘭、玉蘭香、官目石玉蘭香3個(gè)種質(zhì)也并不完全聚為同一類群，田料埔圓葉黃梔香、田料埔長葉黃梔香、宋種黃梔香、石古坪黃梔香4個(gè)種質(zhì)分別聚類于不同類群中。

3 討論與結(jié)論

本研究選用10條多態(tài)性高、分辨力強(qiáng)的ISSR引物對(duì)收集到的48份鳳凰單叢茶種質(zhì)DNA進(jìn)行擴(kuò)增，得到鳳凰單叢茶ISSR帶型表現(xiàn)出較高的多態(tài)性，多態(tài)性帶型占81.0%，遺傳相似系數(shù)介于0.590 9～0.967 4間，遺傳相似性變幅為0.376 5，而蕭力爭[12]等采用AFLP標(biāo)記法分析34份鳳凰單叢古茶樹資源遺傳多樣性得出的多態(tài)性比率為79.3%，遺傳相似性系數(shù)變化范圍在0.13～0.49之間，遺傳相似性變幅為0.36，這表明ISSR分子標(biāo)記是評(píng)估鳳凰單叢茶遺傳多樣性的有效方法，同時(shí)也驗(yàn)證了ISSR分子標(biāo)記具有快速、穩(wěn)定、多態(tài)性豐富、重復(fù)性強(qiáng)等特點(diǎn)[13-15]。Liu[3]等采用ISSR標(biāo)記分析134云南茶樹資源遺傳多樣性，分析得出其相似系數(shù)范圍為0.445～0.819，變幅為0.374，說明潮州鳳凰鎮(zhèn)鳳凰單叢茶樹資源之間具有較寬的遺傳基礎(chǔ)，但也存在品種（系）間的遺傳距離較小、親緣關(guān)系較近，只有少數(shù)品種（系）表現(xiàn)出較為顯著的遺傳分化，如采摘于南馥茶園的南馥通天香與兄弟茶之間的遺傳相似性最高，可能是種植時(shí)品種（系）弄混，可將這兩個(gè)品種（系）作為復(fù)份材料保存，而在聚類上，鴨屎香與其他品種（系）單獨(dú)分開，則有待于進(jìn)一步鑒定分析。造成這種現(xiàn)象的原因可能是因?yàn)殚L期以來，鳳凰單叢茶主要以香型歸類，茶農(nóng)藉此在不同地域之間經(jīng)常相互引種栽培，出現(xiàn)許多同名異物或同物異名的現(xiàn)象，最終導(dǎo)致品種（系）的名稱和分類十分混亂。然而本研究采用ISSR標(biāo)記方法分析得出，鳳凰單叢茶種質(zhì)間的親緣關(guān)系與其地理來源及香味類型沒有必然的聯(lián)系，此研究結(jié)果跟蕭力爭等[12]采用AFLP標(biāo)記方法分析得出來結(jié)果一致。在類聚上，大烏葉和大烏葉2號(hào)，鳥嘴1號(hào)和鳥嘴2號(hào)，這種遺傳相似性高，卻體現(xiàn)出微小的遺傳分化，這可能是因?yàn)槭遣铇浔旧頌楦叨入s合體且是異花授粉，在長期雜交演化過程中能產(chǎn)生很多不連續(xù)的變異，加上茶樹芽葉本身具有突變的可能，同時(shí)長時(shí)間移植后新環(huán)境對(duì)品種（系）的遺傳信息也可能發(fā)生一定的影響[3，16]。

因此，為了保證鳳凰單叢茶種質(zhì)的優(yōu)良品質(zhì)，必須明確鳳凰單叢茶種質(zhì)間的遺傳背景，避開原來香型歸類的影響，根據(jù)ISSR分子標(biāo)記分析結(jié)果有助于指導(dǎo)選配工作，選擇親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的品種（系），增加其子代的遺傳變異，選育出具有雜種優(yōu)勢、綜合性狀好的優(yōu)良品種（系）。

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