張懷才,丁少成,李佑英
(杭州市公安局刑事科學技術研究所,杭州 310004)
D19S433基因座稀有等位基因4的發現與確認
張懷才,丁少成,李佑英
(杭州市公安局刑事科學技術研究所,杭州 310004)
在檢案過程中發現D19S433基因座有一個超出ladder最小范圍的稀有基因,分別采用Identifiler Plus及AGCU17+1試劑盒對提取產物進行擴增及電泳分析,經測序確認該等位基因為4。查詢STRbase數據庫,等位基因4尚未見報道,為新發現的稀有等位基因。本文對確認類似OL基因提供了參考方案。
法醫遺傳學;STR分型;D19S433基因座;off-ladder等位基因;稀有等位基因
短串聯序列重復序列(short tandem repeat,STR)重復單位僅2~6 bp,其長度多態性來源于重復單位拷貝數的個體差異。PCR-STR分型技術具有高靈敏度、高鑒別能力和標準化自動分型等特征[1]。在STR檢測中,有些樣本的某個等位基因因偏離ladder無法命名,標記為off-ladder(OL),通過重復實驗可排除擴增及檢測過程造成的漂移,確定稀有基因[2]。稀有基因是由于等位基因突變中核酸的缺失、插入或核苷酸的改變所產生的,屬于微變異[3],主要有兩種類型[4]:一是出現在一個基因座內兩個等位基因之間的稀有基因,此類分型可通過漂移校正計算確定分型;二是超出基因座ladder范圍的稀有基因,此類分型確定較為復雜,首先必須確定該稀有基因來源基因座,對偏離ladder相應基因座最小或者最大等位基因較近的稀有基因,可以通過漂移校正得到準確分型,但如果偏離較遠,則常常不能得到準確的分型,需要測序確認。筆者檢案過程中在D19S433基因座發現一個超出ladder最小范圍的稀有基因,經測序檢測,確認該等位基因為4?!?br>