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PMCI與醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)的開放存取及數(shù)字化存儲

2015-09-10 10:07:22劉樹春
中國中醫(yī)藥圖書情報 2015年1期

劉樹春

摘要:PMC及其與Europe PMC和PMC Canada共同構(gòu)建的PMCI被公認(rèn)為是生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)開放存取和數(shù)字化存儲的成功典范。本文從PMCI的構(gòu)成、各個鏡像節(jié)點的創(chuàng)建和功能特點加以討論,針對PMC與PubMed以及PMCI各節(jié)點之間在存儲模式和內(nèi)容上的差異等進(jìn)行了比較。并提出了在期刊文獻(xiàn)開放存取與數(shù)字化存儲實踐中的幾點啟示。

關(guān)鍵詞:PMCI:開放存取:數(shù)字化存儲:期刊文獻(xiàn)

隨著生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān)研究的飛速發(fā)展,信息更新日趨頻繁。而生物醫(yī)學(xué)期刊的開放存取和數(shù)字化存儲,順應(yīng)了網(wǎng)絡(luò)時代學(xué)術(shù)文獻(xiàn)信息快速與廣泛交流的需要,促進(jìn)了生物醫(yī)學(xué)科研信息的傳播與國際研究合作,同時也進(jìn)一步擴(kuò)大了學(xué)術(shù)期刊的使用范圍,提高了期刊的使用率和學(xué)術(shù)影響力。

在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,PubMed Central(PMC)以及以PMC為基礎(chǔ)組建的PMC International(PMCI)被公認(rèn)為是醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)開放存取的成功典范,同時也是生物醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)數(shù)字化倉儲國際化合作的先驅(qū)。

1 PMCI及其成員中心

PMCI是由美國國家衛(wèi)生研究院(NationalInstitute of Health,NIH)和國立醫(yī)學(xué)圖書館(National Librarv of Medicine,NLM)、文獻(xiàn)來源期刊的出版社,以及其他國家共享NLM存儲文獻(xiàn)的組織機(jī)構(gòu)共同協(xié)作創(chuàng)建的。NLM目前支持兩個PMCI中心,即Europe PubMed Central(Europe PMC)和PubMedCentral Canada (PMC Canada)。二者與位于美國的PMC共同構(gòu)成PMCI。兩個中心也分別是PMC在英國和加拿大的鏡像站,接受和同步共享PMC的內(nèi)容。

PMCI是NLM的國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenter for Biotechnology Information, NCBI)與PMCI的各個節(jié)點(Europe PMC和PMC Canada)及在PMC存儲期刊論文的出版社之間的合作項目,其長期目標(biāo)是建立數(shù)字文獻(xiàn)存儲網(wǎng)絡(luò),并在網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部共享各自存儲的內(nèi)容,以類似于國際核酸序列數(shù)據(jù)庫合作聯(lián)盟(GenBank/EMBL/DDBJ)的模式對數(shù)據(jù)進(jìn)行存儲和交換。作為一個生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)字倉儲庫,其核心原則是:即使隨著技術(shù)的發(fā)展可能導(dǎo)致數(shù)字文獻(xiàn)的格式發(fā)生變化,但其收錄的全部期刊文獻(xiàn)必須提供永久性的免費訪問。

1.1 PubMed Central

PMC(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/或http://www.pubmedcentral.gov/)創(chuàng)建于2000年2月,是一個由NLM的NCBI開發(fā)與維護(hù)的開放存取式生物醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)期刊文獻(xiàn)檔案庫。在其起步階段,僅有美國的PNAS(《美國國家科學(xué)院匯刊》)等少量期刊加入。經(jīng)過十幾年的發(fā)展,已經(jīng)有超過2000種期刊加入到PMC的開放存取和數(shù)字倉儲行列中,全文文獻(xiàn)超過330萬篇,成為全球生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域規(guī)模最大的開放存取機(jī)構(gòu)倉儲。2009年,美國總統(tǒng)奧巴馬簽署了年度《綜合撥款法案》,使NIH公共存取政策成為一項永久制度。其條款規(guī)定:在遵守版權(quán)法的情況下,NIH要求受NIH資助的所有研究者在研究成果正式發(fā)表后的12個月之內(nèi)將其被期刊接受發(fā)表的經(jīng)同行評議的稿件終稿電子版提交至PMC數(shù)字倉儲中,并向公眾開放訪問。

1.2 Europe PubMed Central

Europe PMC(http://europepmc.org/)原名為UKPubMed Central(UKPMC),是由維康信托基金會(Wellcome Trust)發(fā)起,并由歐洲生物信息學(xué)研究所、曼徹斯特大學(xué)及大英圖書館在PMC的基礎(chǔ)上共同開發(fā)維護(hù)的生物醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)免費數(shù)字文獻(xiàn)存儲庫,現(xiàn)受到包括維康信托基金會在內(nèi)來自于歐洲的24個慈善和政府組織等生命科學(xué)及生物醫(yī)學(xué)基金會的支持。2006年,Wellcome Trust宣布,凡是由其資助的研究論文必須在發(fā)表后的6個月內(nèi)通過UKPMC免費向網(wǎng)絡(luò)開放。2007年1月,UKPMC作為PMCI的一部分和PMC在英國的鏡像站正式上線。

2012年7月13日,歐洲學(xué)術(shù)研究委員會(TheEuropean Research Council,ERC)宣布加入到已經(jīng)有18個英國和歐洲的基金會支持的UKPMC中。正是由于ERC的加入,以及為了擴(kuò)展該存儲庫的服務(wù)范圍,UKPMC在2012年11月1日改為Europe PMC。

1.3 PubMed Central Canada

PMC Canada(http://pubmedcentralcanada.ca/)作為PMC在加拿大的鏡像站點和PMCI數(shù)字存儲網(wǎng)絡(luò)的一部分,是在PMC的基礎(chǔ)上建立的,由加拿大國家科學(xué)圖書館(NRC-CISTI)維護(hù),并與加拿大衛(wèi)生研究所(CIHR)及美國的NLM建立合作伙伴關(guān)系,其目的是基于在加拿大的文獻(xiàn)庫向用戶永久性提供高質(zhì)量的生物醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)研究文獻(xiàn)的全文免費訪問。

PMC Canada全面支持CIHR的開放存取政策,并要求CIHR基金資助者在論文發(fā)表后的6個月內(nèi)通過PMC Canada向網(wǎng)絡(luò)開放。目前,PMC Canada只接受CIHR資助的作者提交的經(jīng)同行評議的期刊論文,以后還要擴(kuò)展接受加拿大其他基金資助機(jī)構(gòu)的研究文獻(xiàn),使位于加拿大的公共開放文獻(xiàn)庫的價值最大化。

2 創(chuàng)建PMCI網(wǎng)絡(luò)的原因

PMCI的創(chuàng)立,是NLM和世界各國與PMC具有共同目標(biāo)的機(jī)構(gòu)建立合作關(guān)系,在其他可信的國際文獻(xiàn)檔案庫以相同的原則維護(hù)PMC的文獻(xiàn),最大限度地避免文獻(xiàn)資料的損壞和遺失。

創(chuàng)建PMCI主要是基于以下原因。第一,如果在世界各地的多個站點上存在活動的檔案副本被用戶正常使用,就可能加大文獻(xiàn)檔案的長期存活可能性。第二,研究文獻(xiàn)的生產(chǎn)者和資助者更習(xí)慣于將其文獻(xiàn)資料存儲于本地或區(qū)域性檔案庫,而不是在世界其他地方的檔案庫。第三,每個站點可以將檔案庫中的期刊論文與其他相關(guān)的資源進(jìn)行整合,如:對用戶具有特殊意義的特定國家或地區(qū)性的臨床指南等。同時,網(wǎng)站的多樣性也可以盡可能達(dá)到更大的創(chuàng)新,確保PMC的長期持久性。

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