研究豬品種生長激素（pGH）基因的多態(tài)性

趙先萍　曹果清

摘要：本文在對(duì)豬品種生長激素基因多態(tài)性進(jìn)行研究的同時(shí)，借助于PCR和測序技術(shù)，對(duì)11個(gè)豬品種的生長激素基因全序列多態(tài)性進(jìn)行檢測，43個(gè)SNPS和1個(gè)位于內(nèi)含子3的7bp缺少片段被檢測出，結(jié)果表明，豬品種之間的某種遺傳分化在某種程度上不僅僅與地理的分布有關(guān)，同時(shí)和其基因的交流也有著直接性的關(guān)系。

關(guān)鍵詞：豬品種；生長激素；基因；多態(tài)性

豬生長激素主要是豬垂體前葉分泌的單鏈多肽類激素，對(duì)于豬的生長發(fā)育有著重要的調(diào)節(jié)作用。近些年來，豬品種生長激素基因多態(tài)性的研究始終成為科學(xué)界研究的重點(diǎn)之一[1]。

1 材料和方法

樣品來源和提取基因組DNA。選取11個(gè)品種的豬作為研究的對(duì)象，其中4頭成華豬，4頭大河豬，4頭大河烏豬，5頭杜洛克豬，6頭長白豬，9頭內(nèi)江豬，6頭榮昌豬，12頭太湖豬，5頭壓雅南豬，5頭約克夏豬，5頭藏豬，共65個(gè)個(gè)體。基因組DNA的提取采取酚氯仿法。

PCR產(chǎn)物純化、目的基因擴(kuò)增以及序列測定。擴(kuò)增pGH基因全序列和測序的引物采取Olig06.0軟件進(jìn)行，PCR反應(yīng)試劑其反應(yīng)體系的總體積則是50微升，其PCR反應(yīng)的條件中溫度控制為94℃，時(shí)間為10分鐘；PCR產(chǎn)物借助于2.0%低熔點(diǎn)的瓊脂糖凝膠進(jìn)行回收。對(duì)其檢測后的回收產(chǎn)物 采取測序反應(yīng)，反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)過醋酸鈉純化、干燥以及變性后，并借助于全自動(dòng)序列分析儀分析其序列。

數(shù)據(jù)的分析。序列測定的結(jié)果在分析的過程中借助于DNAstar開始BLAST分析[2]。對(duì)豬品種的核苷酸分歧度、凈遺傳距離以及品種內(nèi)核苷酸多樣度及逆行那個(gè)分析，豬品種間固定指數(shù) 和其品種間的變異程度用Areliquin2.0軟件包的分子方差進(jìn)行分析。豬品種間PCH基因樹構(gòu)建的過程中采取Mega version。

2 結(jié)果

豬品種生長激素基因SNPS分析。

豬品種生長激素基因的可靠序列總共有1960bp，含有內(nèi)含子和外顯子。43個(gè)SNPS和1個(gè)位于內(nèi)含子3的7bp缺少片段被檢測出，豬品種生長激素基因序列的變異種存在一定的轉(zhuǎn)換偏倚現(xiàn)象。

豬品種生長激素基因單倍型。結(jié)果顯示，65個(gè)序列中單倍型有55種，同時(shí)單倍型的多樣度為0.997，其中大河烏豬、太湖豬、長白豬、藏豬以及雅南豬品種單倍型多樣度高達(dá)1，而成華豬品種內(nèi)單倍型多樣度最低為0.5。

豬品種生長激素基因分子方差分析。分子方差分析結(jié)果表明，品種內(nèi)方差組分為74%，而品種間方差組分占整個(gè)豬品種生長激素基因全序列總變異的27%，其品種間差異極為顯著，P<0.05。豬品種生長激素基因在豬的品種間存在明顯的遺傳分化，內(nèi)江豬和成華豬、約克夏豬和榮昌豬、長白豬和大河烏豬以及藏豬和大河豬之間的生長激素基因結(jié)構(gòu)差異相對(duì)不顯著，P>0.05，但是其他品種間生長激素基因結(jié)構(gòu)差異較為顯著，P<0.05。

3 討論

豬品種生長激素基因序列的多態(tài)性分析結(jié)果表明，生長激素基因全序列的一級(jí)結(jié)構(gòu)中SNPSs位點(diǎn)較為豐富，同時(shí)PCR過程中，有著較小的錯(cuò)配可能性。pGH基因編碼區(qū)其多肽中含有216個(gè)氨基酸，而其成熟的豬生長激素的蛋白中氨基酸的數(shù)量僅僅為191個(gè)。pGH蛋白的前導(dǎo)肽主要是以后總分子內(nèi)的伴侶，調(diào)控著pGH生物活性在細(xì)胞內(nèi)的轉(zhuǎn)運(yùn)和其定位，進(jìn)而使得不同豬品種生長發(fā)育性能存在差異。豬品種生長激素基因自身進(jìn)化過程和其品種的進(jìn)化在內(nèi)含子區(qū)均有體現(xiàn)，而豬品種之間的某種遺傳分化在某種程度上不僅僅與地理的分布有關(guān)，同時(shí)和其基因的交流也有著直接性的關(guān)系。

4 結(jié)語

本文通過對(duì)豬品種生長激素基因多態(tài)性進(jìn)行研究，研究總結(jié)出豬品種之間的某種遺傳分化在某種程度上不僅僅與地理的分布有關(guān)，同時(shí)和其基因的交流也有著直接性的關(guān)系。

參考文獻(xiàn)：

[1] 張浩，強(qiáng)巴央宗. 藏豬生長激素基因（pGH）多態(tài)性研究 [J]. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)，2010，02：15-19.

[2] 顧陽. 西藏小型豬GH、GHR、IGF-1基因的多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性分析 [D].南方醫(yī)科大學(xué)，2013.