通信作者:王喜艷,男,主任醫師,博士生導師,研究方向:胰腺腫瘤的基礎和臨床,E-mail: wangxiyan2415@163.com。
新疆特高發腫瘤資源庫管理系統的開發與應用
郭文佳, 朱琳, 舒曉敏, 張園, 董翔, 王喜艷
(新疆醫科大學附屬腫瘤醫院新疆腫瘤防治研究所, 烏魯木齊830011)
摘要:目的建立新疆特高發腫瘤資源庫信息管理系統。方法開發“腫瘤資源庫管理系統”軟件,以醫院內網為操作平臺,對庫存的標本進行信息管理。 結果該系統具有信息錄入、儲存、瀏覽、檢索及數據維護、導出、保密等功能。可以提供標本信息的查詢,還可通過醫院信息系統獲得電子病歷、病理結果、病案和隨訪等信息。結論該系統具有高效、安全、操作方便等優點,可以為科學研究提供高水平的信息研究平臺。
關鍵詞:腫瘤資源庫; 信息; 管理系統
基金項目:國家自然科學基金(81460361); 新疆科技基礎條件平臺建設項目(PT1107)
作者簡介:郭文佳(1984-),女,碩士,助理研究員,研究方向:哈薩克族食管癌發病機理。
中圖分類號:R197.324
doi:10.3969/j.issn.1009-5551.2015.03.004
[收稿日期:2014-11-19]
Development and application of Xinjiang tumor resource bank management system
GUO Wenjia, ZHU Lin, SHU Xaomin, ZHANG Yuan, DONG Xiang, WANG Xiyan
(TumorResearchInstitute,TumorAffiliatedHospitalofXinjiangMedicalUniversity,
Urumqi830011,China)
Abstract:ObjectiveTo establish Xinjiang tumor resource bank management system for better managing tumor specimens and scientific research. MethodsWe developed the tumor resource bank management system with local area network of hospital as the operating platform. ResultsThe management system has the functions of recording, bowing, storing, searching of information and maintenance, administration of data, the advantages of efficient, safe and easy to be used, as well as directly getting diagnosis and treatment information of the patient from Hospital Information System. ConclusionWith the functions of reflecting the sample information accurately and dynamically, the system would provide a good platform for scientific research.
Key words: tumor resource bank; information; management system
目前在世界范圍內開始進行腫瘤分子分型和個體化診治的研究,這項研究能否獲得實質性進展取決于一個最基本的問題,即研究用生物樣本的質量和數量,包括符合臨床診治規范的臨床研究隊列,高質量、嚴格按照標準操作程序收集組織樣本和詳細的臨床、病理、治療和隨訪等資料。從這個意義上講現代腫瘤研究是以獲得高質量腫瘤樣本和系統的信息資料為核心[1]。
新疆特高發腫瘤資源庫日常工作可歸納為2個重點環節:一是腫瘤標本的收集、處理、保存和使用;二是腫瘤標本相關信息的儲存、管理、統計和檢索[2]。為了使腫瘤資源庫各項工作能夠取得實質性進展和持續發展,有必要在一開始的基礎性工作中突出課題研究所用腫瘤標本的規范化信息管理。由于標本信息量大,而且處于動態變化之中,利用計算機技術處理資料和管理腫瘤資源庫標本是方便、高效的方法[3]。因此,本研究結合新疆特高發腫瘤資源庫現狀,設計一套功能完善、安全可靠、使用高效的腫瘤資源庫信息管理系統,對腫瘤資源庫標本的所有信息進行信息化管理,旨在建立新疆特高發腫瘤資源庫的信息管理系統。
1材料與方法
1.1材料新疆醫科大學附屬腫瘤醫院使用醫院信息系統(hospital information Ssystem,HIS),包括實驗室信息系統(laboratory information system, LIS)、醫生工作站、門診管理系統、手術管理系統、隨訪管理系統、病案管理系統等和患者的臨床資料。
1.2方法以HIS為載體,將腫瘤資源庫管理系統納入其中,成為HIS子系統,將腫瘤資源庫的標本作為醫院資料的一部分加以保存,實現標本資料高效管理,方便工作人員對腫瘤資源庫庫存標本進行查詢。
新疆特高發腫瘤資源庫收集的標本來源于入院的不同患者或者患者不同病程階段的血液、手術切取的組織;病種包括食管癌、肺癌、宮頸癌、卵巢癌、肝癌、胰腺癌、腎癌、前列腺癌、腦腫瘤、骨腫瘤等,數量可達數萬份;血液和組織標本儲存于多臺-80℃冰箱。要求腫瘤資源管理系統兼具信息錄入、儲存、瀏覽、檢索、導出、數據維護、管理等功能,并具有操作安全、方便等特點。同時,腫瘤標本管理系統能夠與醫院HIS有機結合在一起,HIS為腫瘤資源庫管理系統提供患者一般資料、歷次住院情況、手術安排情況、隨訪資料,根據患者一般資料、診斷等條件,查詢和篩選目標腫瘤標本。
2結果
2.1新疆特高發腫瘤資源庫使用和構建的數據庫(1)患者資料庫,包括患者的診治時間、病理資料、預后資料;(2)標本使用資料庫,包括標本的使用數量、標本質量、研究者使用情況;(3)研究資料庫,包括研究結果等。
2.2腫瘤資源庫管理系統的功能(1)錄入功能:錄入患者住院號,腫瘤資源庫管理系統給出標本唯一標本編號,并且自動從HIS調出患者基本信息(患者姓名、民族、年齡、性別、籍貫、就診日期、臨床診斷、通訊方式、臨床信息、治療摘要、手術信息等)。腫瘤資源庫管理系統提供標本信息(標本編號、入庫編號、入庫時間、標本類別、標本詳細描述等);患者病理信息(腫瘤的體積、組織類型、分級、浸潤深度、切緣情況、免疫表型等);標本存放信息(存放的位置、存放標本的數量等);標本的使用情況(出庫編號、出庫時間、申請人、申請單位、相關項目、審批人、操作者等);標本的質控信息(實驗內容、實驗結果、實驗人、實驗日期等);標本廢除信息(廢除編號、入庫編號、標本原始位置、廢除日期、廢除原因、經手人等)。工作人員可以根據患者的一般資料、診斷和隨訪資料等條件,查詢標本庫存和使用情況。(2)標本儲存功能:腫瘤資源庫管理系統能夠儲存工作人員每日收集的組織、血液標本信息,并且自動提取HIS中的病歷信息,儲存到資源庫管理系統中。(3)標本和患者信息瀏覽功能:腫瘤資源庫管理系統中,工作人員能夠根據自行設定的多種條件查看腫瘤資源庫中所有標本的各種詳細信息以及患者的信息。(4)標本的檢索功能:腫瘤資源庫管理系統可按照工作人員需求設定查找范圍,如入庫時間、標本類別、標本來源、姓名、性別、住院號以及備注等條件進行查找,并可以將查詢的結果導出至Excel文件。(5)數據維護功能:腫瘤資源庫管理系統中,工作人員可以通過獲得的權限,將已錄入的各項數據,如“標本編碼”、“標本類別”等進行修改。(6)標本的導出功能:腫瘤資源庫標本管理系統可以通過條件查找功能導出所需要的標本信息,以Excel文件形式保存,方便使用者統計、總結。(7)標本的保密功能:為了對病人資料進行保密,必須確保數據的安全性。軟件開發時對登陸本系統的工作人員設置了多級管理權限,即獲取權限的工作人員才能對數據進行修改,而不知道密碼或者非操作人員無權進入系統。
2.3腫瘤資源庫管理系統的特點(1)專業性強:腫瘤資源庫管理系統作為專業的定制標本管理系統,所有標本資源的存儲都是根據專業的需求來收集,在此基礎上系統保存和收集的信息專業程度更高,針對性更強。(2)準確性高:腫瘤資源庫管理系統作為專業的信息系統,對所收集的各種組織和血液標本的信息做到準確及時地儲存、整理和分析。(3)實用性廣:腫瘤資源庫管理系統能根據研究工作的需求,利用計算機所建立數據庫及時更新信息,及時地為醫藥科學研究提供多種必需的信息服務。(4)便捷的服務:能夠幫助腫瘤資源庫管理者從復雜繁瑣又無序的狀態下解放出來,以實驗室綜合信息管理的核心部分,滿足各大實驗機構在信息管理上的迫切需求。實現對各類型庫存資源的有效管理,為工作人員和研究人員服務。
3討論
設計一套計算機管理軟件對腫瘤資源庫庫存標本進行信息化管理,腫瘤資源庫管理系統在工作中發揮了極大的優勢,有利于全面了解庫存標本的情況,更加簡明、全面和準確地反映庫存標本數量、質量和使用情況。進一步完善腫瘤資源庫的管理系統,利用計算機更加準確地核算采集、存儲標本的成本,更加具體化地評價庫存標本的質量,腫瘤資源庫成本控制更有效[4]。通過腫瘤資源庫管理系統界面直接得知醫院每天手術的安排情況,腫瘤資源庫取材人員能夠靈活安排采集手術標本的時間,保證取材不遺漏。腫瘤資源庫管理人員可以通過授權直接獲得患者的歷次住院和門診臨床所有診治情況及隨訪資料[5]。
今后新疆特高發腫瘤資源庫的工作重點是采集標本,除手術冰凍標本、血液標本外,還將包括石蠟標本,以及對入組的臨床樣本和數據進行科學實驗鑒定和系統分析。在此基礎上建立并完善腫瘤分子標志譜臨床研究專用的樣本采集和應用體系,包括技術規范、資源庫和實驗分析數據庫,這些都必須以腫瘤資源庫的信息化管理作為基礎,建立高質量的腫瘤標本和系統臨床隨訪資料庫,建立規范化診治的多中心臨床隊列。我們應從面臨的實際問題出發,對腫瘤資源庫庫存標本的管理在實際工作中逐步加以完善,形成良好的運行和使用機制。科學研究與腫瘤資源庫的發展離不開多方合作[6]。有了現在規范的技術平臺,腫瘤資源庫預計今后在各地州下設腫瘤衛星組織庫,推廣建庫的經驗和標準化操作流程,加強區域共享資源,構建良好的科技合作機制,形成完備的生物信息網絡,以利于全區醫療衛生從業人員共享資源,協作進行腫瘤科研工作。
參考文獻:
[1]Cahane M, van Baare J. European association of tissue banks [J]. Dev Ophthalmol, 2009, 43:1-31.
[2]葉鐵真,鄭錦濤,張曉紅.兒童腫瘤標本庫標本信息管理系統的建立和應用[J].中國醫院管理,2003,11(23):33-35.
[3]Mager SR, Oomen MH, Morente MM, et al. Standard operating procedure for the collect ion of fresh frozen tissue samples[J]. Eur J Cancer, 2007, 43(5):828.
[4]Mishra A, Pandey A, Shaw R. Initiating tumor banking for translational research:MD Anderson and Liverpool experience[J]. Indian J Cancer, 2007, 44(1):17.
[5]Hwang RF, Wang H, Lara A, et al. Development of an integrated bio-specimen bank and multidisciplinary clinical database for pancreatic cancer[J] . Ann Surg Oncol, 2008, 15(5):1356.
[6]鄧軍衛,施小六,許毅,等.綜合醫院組織細胞庫信息系統的建立及意義[J].中國現代醫學雜志,2010,11(20):3512-3515.
(本文編輯周芳)
