蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在小菜蛾蛋白質(zhì)基因組研究方面獲得突破

蔬菜蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)在小菜蛾蛋白質(zhì)基因組方面取得重要突破，相關(guān)研究成果近期在線發(fā)表在蛋白組學(xué)權(quán)威期刊Molecular & Cellular Proteomics（分子與細(xì)胞蛋白組學(xué)）上。

隨著高通量測序技術(shù)的不斷發(fā)展，上萬種生物的全基因組DNA序列被測序完成。其基因組的注釋主要基于預(yù)測軟件和已知蛋白的同源搜索，不可避免地導(dǎo)致編碼蛋白質(zhì)基因的錯誤注釋和丟失、假基因廣泛存在。另外，由于缺少肽段等信息，大量基因被注釋為未知功能或假設(shè)的蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)基因組（Proteogenomics）是一種利用蛋白質(zhì)組學(xué)的相關(guān)數(shù)據(jù)對基因組進(jìn)行注釋校正的新方法，由于其結(jié)合了大量生物體蛋白質(zhì)氨基酸信息，從而有力地彌補(bǔ)了基因組上基因?qū)ふ液妥⑨尩牟蛔恪Ｐ〔硕晔且环N世界性重要農(nóng)業(yè)害蟲，每年因小菜蛾造成的損失高達(dá)40億～50億美元。小菜蛾幾乎對所有的殺蟲劑均產(chǎn)生了不同程度的抗藥性，包括微生物殺蟲劑Bt。蟲害防控創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)利用shotgun HPLC-ESI-MS/MS對小菜蛾幼蟲中腸蛋白質(zhì)進(jìn)行測定，結(jié)合其基因組數(shù)據(jù)，完成了首個小菜蛾中腸蛋白質(zhì)基因組分析。利用獲得的小菜蛾BBMV蛋白質(zhì)譜圖，鑒定到了大量與小菜蛾殺蟲劑抗性相關(guān)的蛋白質(zhì)，同時，還糾正了小菜蛾的基因注釋，鑒定了大量新基因以及新的基因剪切形式，相關(guān)研究結(jié)果為闡明小菜蛾對Bt殺蟲劑抗性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了重要的遺傳信息。