油菜F—BOX蛋白序列特征與生物信息學分析

摘 要 從NCBI數據庫中查詢下載了油菜F-BOX蛋白序列，利用生物信息學技術，對其基本理化性質、電子表達和保守域等方面進行分析和預測。結果表明，油菜F-BOX蛋白序列中20種氨基酸含量差異較大；該蛋白為親水蛋白，無跨膜區，N端不含信號肽，為非分泌蛋白；其基因主要在花和種子中表達。

關鍵詞 油菜；F-BOX蛋白；生物信息學

中圖分類號：S565.4 文獻標志碼：A 文章編號：1673-890X（2016）02-0-03

在真核生物中普遍存在著F-BOX蛋白家族， 該蛋白家族是一類含有F-BOX結構域，最早由Kumar等[1]在1995年發現的，在泛素-蛋白酶體途徑中因具有特異識別蛋白底物的作用，故在細胞的分裂、代謝、發育和免疫等很多復雜的生理過程中都發揮著重要的作用。有關遺傳研究表明，F-BOX蛋白在很多種信號傳導途徑中都發揮作用[2]，如光形態的建成、花器官的發育、生長素信號的傳導以及生物鐘節律的調節等[3]。

F-BOX蛋白有很多種類，在物種進化的過程中F-BOX結構域非常保守。大多時候，F-BOX蛋白對靶蛋白的特異性識別是通過參與形成SCF復合體來實現的。F-BOX蛋白除了構成SCF復合體以外，還可以非復合體的形式發揮作用。F-BOX蛋白主要的功能是對細胞周期的調控；同時，也是眾多生物學過程和細胞生命活動的基礎。本文通過在NCBI數據庫查詢下載油菜F-BOX蛋白序列，對其序列特征和生物信息進行分析，為進一步研究其功能提供理論基礎。

1 材料與方法

1.1 材料來源

在NCBI數據庫中查詢F-BOX蛋白序列，從中選取2條（gi|674950981|；gi|674926928|）下載下來進行序列特征和生物信息分析。

1.2 理化性質分……