蛋白質的核酸適配體篩選的研究進展

楊　歌,　魏　強,　趙新穎,　屈　鋒

(1. 北京理工大學生命學院, 北京 100081; 2. 北京市理化分析測試中心, 北京 100089)

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蛋白質的核酸適配體篩選的研究進展

楊歌1,魏強1,趙新穎2,屈鋒*

(1. 北京理工大學生命學院, 北京 100081; 2. 北京市理化分析測試中心, 北京 100089)

摘要:核酸適配體是通過指數富集系統配體進化(SELEX)篩選獲得的,與靶標具有高親和力和特異性結合的單鏈DNA或RNA。蛋白質是生命進程中的關鍵功能分子。近年來,以蛋白質為靶標的適配體篩選在蛋白質相關的基礎及應用研究領域受到廣泛關注。核酸適配體應用性能的優劣取決于其親和力、特異性與穩定性。目前,適配體篩選方法的優化主要是提高篩選效率、提升適配體性能及降低篩選成本。適配體主要篩選步驟包括復合物分離、核酸庫優化、次級庫的富集、適配體序列分析以及親和力表征等。迄今為止,以蛋白質-核酸復合物的分離為核心步驟的適配體篩選方法有20余種。本文歸納總結了2005年以來以蛋白質為靶標的適配體篩選技術,討論了各方法的缺陷與局限。介紹了核酸庫的設計優化方法、適配體的序列特征,以及常用的親和力表征方法。

關鍵詞:核酸適配體;蛋白質;篩選;指數富集系統配體進化;綜述

核酸是生物遺傳信息的載體,其線性信息通過轉錄、翻譯、合成等過程最終形成在生物體及生物過程中行使重要功能的具有復雜結構的蛋白質。此外,生物體內普遍存在核酸與蛋白質間的相互作用,如DNA復制[1]與重組[2]、基因表達調控[3]、限制酶內切[4]等過程中均涉及DNA或RNA與蛋白質的相互作用。……