睢金凱,饒國棟,2,張建國,2*
(1 國家林業局林木培育重點實驗室,中國林業科學研究院林業研究所,北京 100091;2 南京林業大學南方現代林業協同創新中心,南京 210037)
柳樹β微管蛋白基因家族的克隆和序列分析
睢金凱1,饒國棟1,2,張建國1,2*
(1 國家林業局林木培育重點實驗室,中國林業科學研究院林業研究所,北京 100091;2 南京林業大學南方現代林業協同創新中心,南京 210037)
摘要:該研究克隆鑒定了旱柳和龍爪柳β微管蛋白基因,并對其進行了序列相似性、系統發育、染色體定位以及表達模式的分析。結果顯示,2種柳樹β微管蛋白基因家族各有20個成員,家族內部成員間核酸和氨基酸序列相似性分別在74.0%和86.6%以上,種間同源蛋白氨基酸序列相似性在85.8%以上,柳樹與其它植物β微管蛋白間的氨基酸序列相似性在81.5%以上。系統發育分析顯示,柳樹β微管蛋白家族被分為4個亞組,結合楊樹β微管蛋白基因染色體定位,推測柳樹β微管蛋白基因家族經歷了楊柳科全基因組重復事件和串聯重復事件,而柳樹TUB11和TUB12可能來源于區段重復或者轉座。基因表達模式分析發現,該家族成員的表達具有一定的組織特異性,并且部分重復基因對在所檢測組織中表達差異較大。柳樹β微管蛋白基因家族成員序列的高度相似性、成員數量的進化擴張、以及表達模式的多樣性可能賦予了細胞分裂與生長更高的靈活性,這對多年生木本植物的生長發育習性意義重大。
關鍵詞:柳樹;β微管蛋白;系統發育;序列相似性;……