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基于DR胸片的肺結(jié)核計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)

2016-10-21 03:41:11趙霏霏
電子技術(shù)與軟件工程 2016年5期

摘 要 肺結(jié)核是一種在全世界范圍內(nèi)具有高發(fā)病率和死亡率的疾病,而DR胸片在肺結(jié)核初步篩選過程中扮演了重要角色。利用計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)可以提高醫(yī)生在肺結(jié)核胸片檢測和診斷上的準(zhǔn)確率,減少漏診率,減輕醫(yī)生的工作負(fù)擔(dān),優(yōu)化診斷流程。本文主要介紹計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)的構(gòu)成部分及關(guān)鍵技術(shù),并進(jìn)行實(shí)驗識別異常胸片。

【關(guān)鍵詞】肺結(jié)核 DR胸片 計算機(jī)輔助診斷

盡管存在著有效且可負(fù)擔(dān)的治療方法,肺結(jié)核仍然是世界上主要的醫(yī)學(xué)挑戰(zhàn)之一。其死亡率和發(fā)病率仍然很高,尤其是在非洲地區(qū)和亞洲不發(fā)達(dá)地區(qū)。目前為止,我國中西部地區(qū)仍然保持著相當(dāng)高的肺結(jié)核感染率,但其獲得的媒體和公眾關(guān)注度相比于艾滋病、乙肝等傳染病低很多。在臨床診斷中,肺結(jié)核主要由胸片和痰檢測組合診斷,但由于肺結(jié)核多發(fā)生在不發(fā)達(dá)地區(qū),因為成本和時間的原因,在結(jié)核篩查中仍以DR胸片為主。在不發(fā)達(dá)地區(qū),訓(xùn)練有素的放射科閱片人員十分稀缺,隨著醫(yī)學(xué)圖像和計算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,計算機(jī)輔助診斷DR胸片技術(shù)得到了廣泛關(guān)注,該技術(shù)可以讓放射科醫(yī)師從繁重的DR胸片篩查中解放出來,并且很大程度上提高了肺結(jié)核診斷的準(zhǔn)確率,使利用DR胸片進(jìn)行肺結(jié)核大規(guī)模人群篩查變得行之有效。

1 相關(guān)研究

計算機(jī)輔助診斷技術(shù)首次由芝加哥大學(xué)Kurt等人于1985年提出,利用計算機(jī)技術(shù)輔助檢測疑似病灶區(qū)域,分析并給出診斷結(jié)果。隨后,很多學(xué)者針對計算機(jī)輔助檢測醫(yī)學(xué)影像技術(shù)進(jìn)行了深入研究,但大量的研究主要是基于CT圖像的肺癌和基于X光的乳腺疾病。DR胸片由于其輻射劑量小、廉價且存儲方便等優(yōu)點(diǎn)廣泛應(yīng)用于肺結(jié)核人群篩查中,所以研究基于DR胸片的計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)尤為重要。

2 基于DR胸片的計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)的搭建

計算機(jī)輔助診斷(CAD)可以分為五個基本階段:數(shù)據(jù)獲取,預(yù)處理,肺實(shí)質(zhì)分割,肺結(jié)節(jié)檢測和去除假陽。對DR胸片進(jìn)行上述處理,即可向放射科醫(yī)生提供“第二意見”。

2.1 數(shù)據(jù)獲取

DR胸片數(shù)據(jù)由日本JSRT公開數(shù)據(jù)集和華西數(shù)據(jù)集。JSRT收集了247張后前位(PA)胸片,其中154張包含肺結(jié)節(jié),93張為正常胸片。華西數(shù)據(jù)集是由我們從綿陽地區(qū)健康體檢篩查中采集到的真實(shí)DR胸片組成,標(biāo)注信息由華西放射科專家提供,共完成標(biāo)注200張DR胸片,包含正常和異常胸片。

2.2 預(yù)處理

對DR胸片進(jìn)行預(yù)處理是為了減少不同DR胸片之間的差異性,這些差異性不是由于具體的病人不同,而是由于不同品牌的成像裝置、不同的操作技術(shù)、不同的設(shè)置造成的。通過高斯高頻強(qiáng)調(diào)濾波和直方圖均衡化結(jié)合增強(qiáng)圖像對比度,清楚的顯示出DR圖像中的骨骼結(jié)構(gòu)和紋理細(xì)節(jié),減少圖像噪聲。這兩種方法的結(jié)合使用,結(jié)果比單獨(dú)使用一種方法更為優(yōu)秀。

預(yù)處理結(jié)果如圖1所示,a為原始圖像,b為原始圖像的直方圖,c為預(yù)處理后的圖像,d為預(yù)處理后圖像的直方圖。

2.3 肺實(shí)質(zhì)的分割

肺實(shí)質(zhì)的分割是CAD處理過程中的重點(diǎn)和難點(diǎn),迄今為止,醫(yī)學(xué)圖像的分割一直是國內(nèi)外研究的重點(diǎn),雖然很多方法被提出,但是針對肺部輪廓的特定部位,仍沒有十分行之有效的方法實(shí)現(xiàn)肺實(shí)質(zhì)的精確分割。而肺實(shí)質(zhì)分割可以明確肺野區(qū)域,排除冗余部分,有效加快CAD后續(xù)處理速度,提高病變區(qū)域的檢出精度,所以是研究的重點(diǎn)之一。目前的方法中,三種有監(jiān)督的分割方法表現(xiàn)最佳,分別為主動形狀模型(ASM),主動外觀模型(AAM)和多分辨率像素分類器。ASM是一種基于點(diǎn)分布模型的算法,可以通過若干特征點(diǎn)的坐標(biāo)一次,串聯(lián)形成一個形狀向量來表示肺部模型。該方法在實(shí)際分割肺部輪廓的過程中,包括建立形狀模型,為每個特征點(diǎn)構(gòu)建局部特征,ASM搜索進(jìn)行模型匹配。AAM是對紋理進(jìn)行統(tǒng)計建模,將紋理和形狀模型融合為表觀模型,PC是早已存在的一種圖像分割技術(shù),在很多領(lǐng)域都受到廣泛歡迎,該方法一般分為訓(xùn)練階段和測試階段。考慮這三種不同的分割方法,三種方法可以分別提供互補(bǔ)的有效信息,若將這些信息結(jié)合起來,形成混合的分割方案,可以出現(xiàn)更精確的分割結(jié)果。按照以上思路,我們提出基于支持向量機(jī)(SVM)的主動形狀模型。在ASM的處理過程中,尋找模型中特征點(diǎn)的新位置是影響結(jié)果的重點(diǎn)之一。利用SVM將尋找特征點(diǎn)新位置的問題轉(zhuǎn)化為分類問題,即為每個特征點(diǎn)訓(xùn)練一個支持向量機(jī)分類器,利用此分類器尋找該特征點(diǎn)的新位置。

肺實(shí)質(zhì)分割結(jié)果如圖2所示,其中藍(lán)線表示使用ASM的處理結(jié)果,紅線表示使用ASM-SVM混合方法的處理結(jié)果,可以看出混合結(jié)果更為精確。

2.4 肺結(jié)節(jié)檢測和去除假陽

肺結(jié)節(jié)是肺結(jié)核在DR胸片中的直接表現(xiàn),因此,提取肺結(jié)節(jié)是CAD系統(tǒng)的核心。在肺結(jié)節(jié)檢測中,特征提取是研究的重點(diǎn)。從肺結(jié)節(jié)的形態(tài)、灰度、紋理、全局以及局部上下文特征入手進(jìn)行分析,全面、客觀的提取肺結(jié)節(jié)特征信息,可以更準(zhǔn)確的檢測肺結(jié)節(jié)。隨后使用經(jīng)驗規(guī)則,對存在的假陽性結(jié)節(jié)進(jìn)行剔除。典型假陽性結(jié)節(jié)主要分為四類,分別為尺寸異常區(qū)域、邊緣區(qū)域、重疊區(qū)域和非類結(jié)節(jié)區(qū)域。分別剔除這四類假陽結(jié)節(jié)即可得到較為準(zhǔn)確的結(jié)果。

3 結(jié)論

基于DR胸片的計算機(jī)輔助診斷系統(tǒng)是未來影像診斷學(xué)發(fā)展的重要方向之一,是計算機(jī)和醫(yī)學(xué)跨學(xué)科融合的創(chuàng)舉,目前預(yù)期的用途是將CAD用于大規(guī)模人群肺結(jié)核檢測的初篩,然后應(yīng)用痰培養(yǎng)等技術(shù)確診結(jié)核。但迄今為止,CAD系統(tǒng)仍存在一些問題,如運(yùn)行時間、檢測假陽率以及敏感性,CAD技術(shù)還有很大的發(fā)展空間,仍需繼續(xù)進(jìn)行研究,以期望于更好的輔助醫(yī)生進(jìn)行肺結(jié)核檢測。

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作者簡介

趙霏霏(1990-),女,河北省邯鄲市人。現(xiàn)為四川大學(xué)計算機(jī)學(xué)院碩士在讀學(xué)生。研究方向為數(shù)據(jù)挖掘與醫(yī)學(xué)圖像處理。

作者單位

四川大學(xué)計算機(jī)學(xué)院 四川省成都市 610041

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