郝豆豆,田志華,雷鳴,武俊喜,拉多,張勇群
(1.西藏大學(xué),西藏 拉薩850000;2.中國(guó)科學(xué)院地理科學(xué)與資源研究所,西藏 拉薩850000;3.西藏自治區(qū)人民政府駐成都辦事處醫(yī)院,四川 成都610000)
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白草種子基因組DNA五種提取方法的比較*
郝豆豆1,田志華1,雷鳴1,武俊喜2,拉多1,張勇群3
(1.西藏大學(xué),西藏拉薩850000;2.中國(guó)科學(xué)院地理科學(xué)與資源研究所,西藏拉薩850000;3.西藏自治區(qū)人民政府駐成都辦事處醫(yī)院,四川成都610000)
用5種方法(傳統(tǒng)CTAB法、改良CTAB法、高鹽低pH法、改良SDS法、試劑盒法)對(duì)白草種子基因組DNA進(jìn)行提取,分別用紫外分光光度計(jì)法、瓊脂糖凝膠電泳法、PCR擴(kuò)增檢測(cè)提取的DNA的質(zhì)量。結(jié)果表明,傳統(tǒng)CTAB法提取的DNA濃度低,含有較多雜質(zhì),抑制PCR反應(yīng);改良SDS法和改良CTAB法提取的DNA純度低,不符合檢測(cè)要求;高鹽低pH法和試劑盒法提取的DNA純度高、完整性好,但試劑盒法成本高、DNA得率低。所以高鹽低pH法為5種方法中最經(jīng)濟(jì)、效果最好的白草種子DNA提取方法。
白草;基因組DNA;DNA提取方法;高鹽低pH法
白草(Pennisetumflaccidum)屬禾本科(Gramineae)狼尾草屬(Pennisetum),多年生沙生草本植物,多生長(zhǎng)于道路兩旁、固定半固定沙地、沙丘間荒地、農(nóng)田落荒地及林緣等地,海拔2 900~4 500m[1]。為沙質(zhì)草地的優(yōu)勢(shì)種,具有很強(qiáng)的固沙作用,也是牲畜喜食的優(yōu)良牧草,在農(nóng)田和苗圃是常見的雜草,廣泛分布于中國(guó)西北部各省區(qū)[2~4]。
白草因固沙作用而具有極高的生態(tài)價(jià)值,隨著分子生物學(xué)的飛速發(fā)展,從基因方面來研究白草的各種優(yōu)良性狀很有發(fā)展前景,提取高質(zhì)量的基因組DNA是開展一系列分子生物實(shí)驗(yàn)的前提。……