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牛乳中大腸桿菌O157∶H7 PCR檢測方法的建立

2016-11-21 01:41:27佐兆杭侯婷婷
農(nóng)產(chǎn)品加工 2016年2期
關(guān)鍵詞:檢測方法

劉 鑫,姚 笛,郭 瑜,張 微,佐兆杭,侯婷婷

(黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)食品學(xué)院,黑龍江大慶 163319)

牛乳中大腸桿菌O157∶H7 PCR檢測方法的建立

劉鑫,姚笛,郭瑜,張微,佐兆杭,侯婷婷

(黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)食品學(xué)院,黑龍江大慶163319)

為了建立牛乳中大腸桿菌O157∶H7的PCR快速檢測方法,試驗對大腸桿菌O157∶H7的rfbE基因序列進(jìn)行分析,設(shè)計1對特異性引物,對大腸桿菌O157∶H7的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)合特異性和靈敏性試驗,實現(xiàn)對致病性大腸桿菌O157∶H7的檢測;然后將不同含量的大腸桿菌摻入到牛乳中進(jìn)行實際樣品的檢測。結(jié)果表明,該方法的特異性和靈敏性較好,能夠檢測到0.1 ng/μL的DNA模板,當(dāng)牛乳中含有超過100 CFU/mL的大腸桿菌時,可利用該方法進(jìn)行檢測。

大腸桿菌O157∶H7;PCR技術(shù);檢測

大腸桿菌O157∶H7是一種腸出血性大腸桿菌(Enterohemorrhagic Escherichia coli,EHEC) 的代表菌株,它是能夠引起人的出血性腹瀉和腸炎的一群大腸埃希氏菌[1]。大腸桿菌O157∶H7可產(chǎn)生大量毒素,從而引起出血性結(jié)腸炎等疾病[2]。自美國首次分離出該菌以后,O157∶H7的爆發(fā)和流行相繼出現(xiàn)在全球五大洲的20多個國家[3]。目前,我國還未對由大腸桿菌O157∶H7引起的食物中毒進(jìn)行比較系統(tǒng)的調(diào)查、分析和統(tǒng)計,但是從我國的飲食結(jié)構(gòu)、食品加工、貯藏和運輸條件等方面推測大腸桿菌O157∶H7的污染情況是比較嚴(yán)重的[4]。另外,大腸桿菌O157∶H7主要附著在人或動物的腸道內(nèi),可通過糞便等多種途徑污染食品,為了保障食品的食用安全性,有必要對食品中的大腸桿菌O157∶H7進(jìn)行快速檢測。

目前,大腸桿菌O157∶H7的檢測方法主要是常規(guī)的細(xì)菌學(xué)分離鑒定方法,該方法存在耗時長、過程復(fù)雜、靈敏性不強(qiáng)等缺點。酶聯(lián)免疫法(ELSIA)等免疫學(xué)方法需要進(jìn)行單克隆抗體的制備,建立該方法耗時、費力,且存在非特異性吸附等缺點[5]。PCR檢測方法具有快速、準(zhǔn)確的特點,可實現(xiàn)對致病菌的定性檢測[6]。因此,本研究以大腸桿菌O157∶H7的rfbE基因為靶序列,擬建立一種牛乳中大腸桿菌O157∶H7的PCR檢測方法,該技術(shù)與常規(guī)檢測相比具有更強(qiáng)的特異性和靈敏性。建立的方法能夠使牛乳中大腸桿菌O157∶H7的檢測更為快速和準(zhǔn)確,并為其他致病菌的快速檢測提供參考。

1 材料與方法

1.1試驗材料

1.1.1菌株

大腸桿菌O157∶H7、蠟樣芽孢桿菌、志賀氏菌、沙門氏菌菌種,均由黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)食品生物技術(shù)實驗室保存。

1.1.2試劑

LB培養(yǎng)基,青島海博公司產(chǎn)品;rTaq(5 U/μL)、TaKaRa ExTaqTM(5 U/μL)、MgCl2(25 mmol/L)、DL2000 DNAMarker、dNTPs(10 mmol/L)、6×Loading Buffer等,TaKaRa公司產(chǎn)品。

1.1.3培養(yǎng)基

LB液體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化鈉10 g,蒸餾水1 L,在121℃下滅菌20 min。

LB固體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,氯化鈉10 g,瓊脂粉15~20 g,蒸餾水1 L,在121℃下滅菌20 min。

1.1.4儀器設(shè)備

TGL-16B型臺式離心機(jī),上海安亭科學(xué)儀器制造廠產(chǎn)品;9700型PCR基因擴(kuò)增儀,基因有限公司產(chǎn)品;JY04S-3B型電泳儀,北京君意東方電泳設(shè)備有限公司產(chǎn)品;YJ600+型凝膠成像系統(tǒng),北京君意東方電泳有限公司產(chǎn)品。

1.2試驗方法

1.2.1細(xì)菌的培養(yǎng)

將大腸桿菌O157∶H7接種于LB固體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)24 h,挑取單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基中,37℃轉(zhuǎn)速200 r/min,培養(yǎng)12 h。

1.2.2DNA模板的制備

取上述細(xì)菌培養(yǎng)液,以1%接種于5 mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃轉(zhuǎn)速200 r/min,培養(yǎng)過夜,取細(xì)菌培養(yǎng)液1.0 mL,置于EP管中,以轉(zhuǎn)速12 000 r/min離心2 min,然后用ddH2O洗滌2次,最后加入300 μL ddH2O,隔水煮沸15 min,以轉(zhuǎn)速8 000 r/min離心15 min,取上清液,即為DNA模板。置于-20℃下保存?zhèn)溆谩?/p>

對于PCR特異性檢測所用的蠟樣芽孢桿菌、志賀氏菌、沙門氏菌的DNA模板制備均按照上述方法進(jìn)行,DNA模板置于-20℃下保存。

1.2.3引物的合成

根據(jù)Genebank發(fā)表的大腸桿菌O157∶H7 rfbE基因序列,利用Primer 5軟件設(shè)計特異性引物。上游引物:5'-CATCTTTACTTTCCTTGTGGACTT G-3';下游引物:5'-AAACTATTACTACAGGTGAAGGTGG-3'。擴(kuò)增片段大小為261 bp,引物由上海生工生物技術(shù)有限公司合成。

1.2.4PCR擴(kuò)增

以提取的基因組DNA為模版,使用設(shè)計的引物擴(kuò)增rfbE基因片段,反應(yīng)體系為 10×PCR buffer 2 μL,dNTP Mixture 1.5 μL,DNA模板1 μL,上下游引物各0.5 μL,Taq酶0.2 μL,加ddH2O至20 μL。PCR反應(yīng)條件為95℃預(yù)變性3 min,95℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,共30個循環(huán),最后72℃延伸7 min;獲得的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳。

1.2.5特異性檢測

以提取的大腸桿菌O157∶H7、蠟樣芽孢桿菌、志賀氏菌和沙門氏菌的DNA為模板,利用大腸桿菌rfbE基因的特異性引物進(jìn)行PCR檢測,然后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果。

1.2.6靈敏性檢測

測定大腸桿菌O157∶H7的DNA質(zhì)量濃度,用ddH2O對已知質(zhì)量濃度的DNA進(jìn)行10倍梯度稀釋,分別取100,10,1,0.1,0.01,0.001 ng/μL的DNA樣品1 μL進(jìn)行PCR擴(kuò)增,檢測該方法的靈敏性。

1.2.7PCR用于實際樣品的檢測

將大腸桿菌培養(yǎng)液用無菌生理鹽水進(jìn)行10倍梯度稀釋,進(jìn)行菌數(shù)的測定,然后用生理鹽水進(jìn)行菌體的洗滌,分別將含有1.0×105,1.0×104,1.0×103,1.0×102CFU/mL的大腸桿菌接入10 mL滅菌牛乳中,使牛乳中分別含有1.0×104,1.0×103,1.0×102,10 CFU/mL的大腸桿菌,然后提取牛乳樣品的DNA,以其為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

2 結(jié)果與分析

2.1大腸桿菌O157∶H7的PCR擴(kuò)增結(jié)果

蠟樣芽孢桿菌PCR擴(kuò)增結(jié)果見圖1。

由圖1可知,擴(kuò)增片段的大小在250 bp左右,與預(yù)期結(jié)果相符。

2.2大腸桿菌O157∶H7的特異性檢測結(jié)果

以大腸桿菌O157∶H7、蠟樣芽孢桿菌、志賀氏菌和沙門氏菌的DNA為模板,利用大腸桿菌rfbE基因的特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

特異性檢測結(jié)果見圖2。

由圖2可知,只有大腸桿菌O157∶H7出現(xiàn)目的片段的擴(kuò)增,而其他能夠引起食物中毒的致病菌未見擴(kuò)增,說明該方法的特異性良好。

2.3大腸桿菌O157∶H7的靈敏性檢測結(jié)果

靈敏性檢測結(jié)果見圖3。

由圖3可知,當(dāng)DNA質(zhì)量濃度為0.1 ng/μL以上時可見特異性擴(kuò)增,而DNA質(zhì)量濃度為0.01 ng/μL時未見特異性擴(kuò)增,說明該方法的靈敏度較高,可達(dá)到0.1 ng/μL。

圖1 蠟樣芽孢桿菌PCR擴(kuò)增結(jié)果

圖2 特異性檢測結(jié)果

圖3 靈敏性檢測結(jié)果

2.4摻乳樣品的檢測結(jié)果

對大腸桿菌O157∶H7培養(yǎng)液進(jìn)行菌落計數(shù),測得的菌落總數(shù)為9.0×108CFU/mL。對菌體洗滌稀釋后,分別提取不同摻乳樣品的DNA,以其為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

摻乳樣品的PCR擴(kuò)增結(jié)果見圖4。

由圖4可知,當(dāng)牛乳中分別含有1.0×104,1.0× 103,1.0×102CFU/mL的大腸桿菌時可見特異性擴(kuò)增,目的條帶為100~250bp。而牛乳中含有10 CFU/mL的大腸桿菌時未見特異性擴(kuò)增,說明牛乳中含有超過100 CFU/mL的大腸桿菌時,可利用該PCR方法進(jìn)行檢測。

圖4 摻乳樣品的PCR擴(kuò)增結(jié)果

3 結(jié)論

對大腸桿菌O157∶H7的rfbE基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)合特異性和靈敏性試驗,實現(xiàn)對致病性大腸

桿菌O157∶H7的檢測;然后將不同CFU含量的大腸桿菌摻入到牛乳中進(jìn)行實際樣品的檢測。結(jié)果表明,該方法的特異性和靈敏性較好,能夠檢測到0.1 ng/μL的DNA模板,當(dāng)牛乳中含有超過100 CFU/mL的大腸桿菌時可利用該方法進(jìn)行檢測。因此,該PCR檢測方法可以應(yīng)用到實際樣品中大腸桿菌的檢測,檢測時間3~4 h,檢測速度快、靈敏度高。

[1]王培育.腸出血性大腸桿菌O157∶H7檢測技術(shù)進(jìn)展 [J].國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志,2013,34(19):23-28.

[2]Li Y,F(xiàn)rey E,Mackenzie A M,et al.Human response to Escherichia coli O157:H7 infection:antibodies to secreted virulence factors[J].Infect Immun,2013,68(9):211-219.

[3]徐兆煒.英國(蘇格蘭) O157大腸桿菌干擾爆發(fā)流行 [J].預(yù)防醫(yī)學(xué)情報雜志,1997,13(1):65-69.

[4]林鷺芳,黃健利,鐘凌.漳州市首次檢出E.coli O157∶H7[J].海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志,2002(4):43-47.

[5]陳玲霞,丁洪強(qiáng).食品中大腸桿菌檢測方法研究進(jìn)展 [J].疾病監(jiān)測與控制雜志,2010,4(6):325-326.

[6]宋宏新,李明亮.PCR檢測乳品中大腸桿菌的研究 [J].食品科學(xué),2009,30(4):260-263.◇

Establishment of PCR Method for Detection of Escherichia coli O157∶H7 in Milk

LIU Xin,YAO Di,GUO Yu,ZHANG Wei,ZUO Zhaohang,HOU Tingting
(College of Food Science,Heilongjiang Bayi Agricultural University,Daqing,Heilongjiang 163319,China)

In order to establish PCR rapid detection method on Escherichia coli(E.coli)O157∶H7 of milk.The rfbE gene sequence of E.coli O157∶H7 is analyzed in the experiment and a pair of specific primers are designed.E.coli DNA is amplified by PCR,combined with the specificity and sensitivity experiments,the detection of pathogenic E.coli O157∶H7 is implemented.Then different content of E.coli are added to milk to detect the actual samples.The results show that this method had good specificity and sensitivity,can detected 0.1 ng/μL DNA template,when milk contains more than 100 CFU/mL E.coli,this method can be used for testing.

Escherichia coli O157:H7;PCR technology;detection

TS252.7

A

10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2016.01.043

2015-11-12

劉鑫(1993— ),男,本科,研究方向為微生物檢測。

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