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基于近紅外光譜與多元模型的小麥氮含量估算

2016-11-28 16:22:33張兵范澤華姚江河陳杰
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2016年9期

張兵+范澤華+姚江河+陳杰

摘要:采用頻譜測量的谷物氮元素估算方法易受作物水分等因素的影響,對此提出了采用近紅外光譜與最小二乘法(PLS)的小麥氮素與水分預測方案。采用光譜傳感器獲得的光譜反射率數(shù)據(jù)(光譜范圍是400~950 nm),在植物生長階段(BBCH 32)測試了是否可以估算春小麥中的氮與水分。2014—2015年,在甘肅地區(qū)進行小麥的田地試驗,試驗場共包含36個小區(qū),在播種期間主小區(qū)使用氮施肥(N 70 kg/hm2或100 kg/hm2),子塊則使用水灌溉。在BBCH 32,對所有的小區(qū)使用便攜式光譜儀測量其冠層反射率,然后,每個小區(qū)選擇0.25 m2樣方作為地表小麥作物量的采樣,并分析總氮量。首先通過對數(shù)線性比對光譜數(shù)據(jù)進行預處理,然后使用Savitzky-Golay方法與均值化對其進行第一階導數(shù)濾波,然后,通過偏最小二乘法(PPLS)結(jié)合光譜信息與正定數(shù)據(jù)對模型進行校準。結(jié)果表明,本方法優(yōu)于基于指標的方法,其最優(yōu)模型的氮、水分性能分別為RPD=2.26、RPD=1.49。

關(guān)鍵詞:春小麥;近紅外光譜;最小二乘法;主成分分析;氮含量估算;水含量估算

中圖分類號: S127;S512.106 文獻標志碼: A

文章編號:1002-1302(2016)09-0374-05

氮是決定作物成長情況的重要養(yǎng)分,因為異質(zhì)型土壤的質(zhì)量在空間上有所變化,所以氮的使用效率也呈現(xiàn)空間性變化[1-2]。為了優(yōu)化農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)的經(jīng)濟效益,應當使用均勻的氮施肥比例[3]。

采用電磁頻譜[4]中可視與近紅外頻譜范圍的電磁能光譜反射可實現(xiàn)氮含量的估算,電磁頻譜的可視范圍(400~700 nm)會被葉片組織的葉綠素影響,電磁頻譜的近紅外頻譜為700~2 500 nm[5-6]。可見近紅外光譜法具有分析簡便快速、低成本、無污染及樣品的非破壞性和多組分同時測定等優(yōu)點[7~12]。本研究基于近紅外技術(shù)的廣泛使用對小麥的含氮量與含水量進行無損檢測。

1 材料與方法

1.1 農(nóng)田試驗

在甘肅地區(qū)合作農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)的幫助下進行農(nóng)田試驗,試驗區(qū)域的經(jīng)緯度為(103.73°E,36.03°N,海拔1 537 m),年平均降水量為310 mm,年平均溫度為10 ℃,平均生長季溫度約15 ℃,試驗地的地形平坦。

農(nóng)田試驗占地22.5 m×45 m,將其劃分為若干個2 m×7.5 m 大小的小區(qū),每個小區(qū)的兩邊均設(shè)置1.5 m×7.5 m的邊界區(qū)來防止邊緣效果,如圖1所示。

對主小區(qū)注入氮養(yǎng)分(分別為70或100 kg N /hm2),對子區(qū)域則使用水灌溉[分為3個灌溉級別:少量水灌溉(W-),自然水灌溉(W0),額外的水灌溉(W+)]。具體處理方法為W-:在小區(qū)內(nèi)放置2.5 m×4 m的塑料與鋁合金框架遮雨;W0:僅有自然雨水灌溉,無外部水灌溉;W+:除降水以外,額外采用外部水灌溉。W+小區(qū)則采用便攜式滴灌設(shè)備對其進行額外水灌溉(覆蓋面積為2 m×4 m),按照不規(guī)則的時間間隔共進行40 mm水灌溉。在2014年與2015年分別進行了4、5次額外的水灌溉,如圖2所示。

在2014年與2015年相同的試驗田位置進行田地試驗,每年同一季節(jié)進行春小麥的播種與施肥。

1.2 環(huán)境條件與土壤含水量

距離試驗田約100 m處設(shè)置了1個小型氣象站,每隔1 h測量降水量與大氣環(huán)境參數(shù)。在2014年,每星期在每個處理小區(qū)中,通過頻域反射儀對4個深度(10、20、30、40 cm)監(jiān)控土壤的體積含水量。為了增加測量的頻率,本試驗采用ECH2O介電常數(shù)傳感器在9個選擇的塊中(10、20 cm深度)分別連續(xù)地測量土壤環(huán)境(圖2)。使用文獻[13]的轉(zhuǎn)換函數(shù)與土壤的紋理數(shù)據(jù),計算土壤凋蔫點(-1 500 kPa)等級等重要土壤環(huán)境參數(shù)。

在2014年,測量之前的兩星期相對較干燥,僅有12 mm降水量, 而發(fā)芽期間的降水量為[KG*5]72mm; 2015年同一時間的降水量則分別是31、162 mm。2014年從發(fā)芽直到測量時的平均空氣溫度為10.4 ℃;2015年的相應溫度為12.0 ℃。2014年發(fā)芽到測量時間點土壤上部(0~20厘米)的含水量平均值是15%,2015年對應的平均值為25%。

1.3 頻譜測量

在冠層生長期(BBCH32)測量了冠層反射率,測量方法為采用便攜式田地光譜儀(Carl-Zeiss光譜儀與Hamamatsu傳感器相連,并通過PCI-USB操作控制器),傳感器記錄太陽輻射與小麥冠層反射的輻射。將輸入輻射反射分割以獲得反射率數(shù)據(jù),在作物冠層之上1.5 m處使用離最低點60°的視角操作儀器。

1.4 參考測量

頻譜測量之后,選擇地上小麥生物量作為樣本并作為參考,樣本選擇方式為:在每個試驗中劃分1個0.25 m2的樣方(圖1)。采樣后每隔30 min進行以此采樣,并更新各統(tǒng)計參數(shù)值。然后將樣本置于60 ℃的環(huán)境下做干燥處理(持續(xù)48 h),然后稱作物的干質(zhì)量。通過提取水元素來計算作物的水含量,通過比色法(使用FIAstar 5000流動注射分析儀)分析氮含量。

1.5 數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計

每年對新鮮(干燥)的作物量、植物水分以及氮含量使用分塊模型進行方差分析,分塊模型中將氮處理作為主小區(qū),水處理作為子小區(qū)。將氮、水含量作為固定因子,將其他因子作為隨機因素。所有測試中假設(shè)顯著性值為P<0.05,圖3所示是平均數(shù)據(jù)的箱線圖。

Wis-NIR波譜的預處理過程如下。初步測試之后,選擇3個方法來獲得最優(yōu)的校準結(jié)果:(1)對數(shù)線性化;(2)Savitzky-Golay方法的一階濾波;(3)平均歸一化方法。使用主成分分析法(PCA)對多光譜數(shù)據(jù)進行降維處理,在2年的數(shù)據(jù)集分析中,因為析因模型的不確定性,成分分數(shù)的分配與加載是一個矩陣旋轉(zhuǎn)的任意結(jié)果,所以本研究改變PC1與PC3分數(shù)的分配來確保單年數(shù)據(jù)集的分組準確性。使用PLS與PPLS回歸從輻射度數(shù)據(jù)估算出冠層的特征。因為相關(guān)的樣本較小(單年n=36,2年為n=72),本研究采用leave-one-out交叉驗證方法。

為了評估模型的性能,本研究計算交叉驗證模型統(tǒng)計的集合,其中包括根均方誤差(RMSE)、決定系數(shù)(R2)、一致性相關(guān)系數(shù)(定義為數(shù)據(jù)集的標準偏差與對應數(shù)據(jù)集模型預測RMSE的比例)。如果估算的RMSE與種群傳播相比較大,RPD相對較小且校準模型是非魯棒的,那么RPD與R2之間具有確定的函數(shù)關(guān)系:RPD值越高,則模型的估算能力越強。本研究結(jié)論的模型性能主要基于RPD值,其中測試過程參考文獻[14]:狀態(tài)為RPD<1.4的模型無法用于預測;狀態(tài)為1.4≤RPD≤2的模型具有預測潛力;RPD>2的模型具有預測能力。然后使用Akiake信息準則選擇模型分量的最優(yōu)數(shù)量[15]。

PPLS與PLS之間最大的差異是控制參數(shù)g,通過該參數(shù)可直接調(diào)節(jié)PPLS算法,g=0.5時PPLS模型則變換為普通的PLS模型。使用PPLS算法建模,調(diào)節(jié)g參數(shù)以獲得RPD最大值,校準的PPLS模型包含1個回歸系數(shù)的集合,其中每個系數(shù)對應1個測量的頻帶。本研究為植物的氮、水含量均建立了3個模型的校準程序。

除了多元建模,本研究測試所選擇指標的預測能力最終將對應VI的計算值作為獨立的變量,采用線性回歸方法實現(xiàn)回歸處理(代替PPLS)。

2 結(jié)果與分析

2.1 參考數(shù)據(jù)

首先為主要效果:水灌溉對測量的生物量與植物水含量產(chǎn)生了明顯的影響,但是并不影響氮含量。地表小麥植物中施氮肥100 kg/hm2的小區(qū)比70 kg/hm2的小區(qū)生物量、含水量以及氮含量多,2015年新鮮生物量的差異較為明顯。

在處理層,氮含量較高的小區(qū)生物量越多(W+N100),而2種不同水含量供給模式的生物量接近,其中,W-小區(qū)的生物量最少(圖3)。

2.2 光譜數(shù)據(jù)

原始反射率數(shù)據(jù)的方差在NIR范圍中高于頻譜的可視部分,如圖4所示,W+小區(qū)的冠層比W-小區(qū)多反射10%以上的NIR輻射能量。在NIR區(qū)域與綠色頻帶中(540~550 nm),反射數(shù)據(jù)中氮含量的影響較低,但隨著氮含量的升高,反射率升高;而在其他頻帶中則具有最小的方差,例如,低含氮量小區(qū)(藍色、紅色頻帶)的反射率較低。對原反射率數(shù)據(jù)預處理以防止早熟并且消除頻譜方差之間的差異。在頻譜區(qū)域400~420、510~530、620~660、690~710 nm(圖4),方差有所變化。

2.3 分類

在多元化分析的第一步,測試頻譜數(shù)據(jù)是否包含在不同的處理條件下足夠區(qū)分氮含量與水元素的信息。使用PCA為相關(guān)頻帶融入新的變量,在每個分析的頻譜數(shù)據(jù)集中,前3個主成分的數(shù)量高于總方差的98%,如圖5所示。

第1個主成分(PC1)包含植物水含量的信息,圖5中可看出,沿著PC1坐標上,W-小區(qū)與W+小區(qū)之間具有明顯的差異。分別分析2014年與2015年數(shù)據(jù),W-小區(qū)的所有分數(shù)為負值,W+的所有小區(qū)分數(shù)是正值。在2014年相對干燥的季節(jié),W0分數(shù)最高與W-分數(shù)為同一級別,在2015的潮濕季節(jié),W0的分數(shù)與W+分數(shù)相當。

第2個主成分(PC2)包含的主要信息與植物氮含量相關(guān),分別分析每年的情況,氮比例最高的小區(qū)趨向于負的,氮比例最低的小區(qū)總體為正的。

在2年總數(shù)據(jù)集的PCA分數(shù)小區(qū)中,最相關(guān)信息包含于PC1與PC3中。這說明PC2數(shù)據(jù)中包含額外的重要變化,大約為總方差的28.5%,本研究將變化歸因于2年之間數(shù)據(jù)集的差異性。

2.4 校準

在PCA分類步驟中,分別處理各小區(qū)獲得了較好的質(zhì)量結(jié)果,本研究從氮與水含量的冠層光譜分析量化的信息。表1所示是多元PLS與PPLS的水與氮含量結(jié)果,其中對頻譜反射數(shù)據(jù)進行預處理,并使用選擇的窄帶植被指數(shù)完成線性回歸。

比較2個測試的多元校準方法,本研究發(fā)現(xiàn)一個總體輕度較好的性能PPLS方法比PLS。水含量被最優(yōu)估計使用PPLS模型,將g值設(shè)為0.9,然而氮含量被最優(yōu)估算,將g值設(shè)為0.8。PPLS與PLS模型之間RMSE的差異可忽略不計,但是更多信息的策略RPD顯示估算的提高當是使用PPLS建模的時候。

考慮單年數(shù)據(jù)集的多元校準,證明水含量與頻譜數(shù)據(jù)的相關(guān)性(R2=0.87)優(yōu)于氮含量(R2=0.59),綜合2年數(shù)據(jù)集則對2個特征分析均可獲得較好的分析效果。因為R2增加到0.86的級別,所以氮含量的預測效果提高明顯;多元模型對于2年綜合的水含量估算僅略差于2013年的數(shù)據(jù)集。2年綜合數(shù)據(jù)集的PPLS模型RPD值高于2,說明在量化模型中使用2個模型的有效性。

作為比較,本研究也測試了線性模型對水與葉綠素狀態(tài)指標的有效性。對于估算氮與水含量的效果,多元模型優(yōu)于基于指標的模型。對于2季的數(shù)據(jù)集,氮含量數(shù)據(jù)都可建立較好的模型,因為綜合數(shù)據(jù)集的所有測試指標獲得的RPD值均大于2,而單年數(shù)據(jù)集獲得了較差的校準效果,其RPD值低于1.4,所以對于定量的氮估算,不可采用NDVI的結(jié)果。

通過比較可看出,所有的指標中基于NDVI的方法給出了水分估算的最優(yōu)結(jié)果,一致性系數(shù)低于NDVI,說明其模型可能過度估算了極值。當從2年中遍歷水分數(shù)據(jù),基于指標的模型性能較差。

以下部分提出氮、水含量最適應的校準模型,如圖6所示。模型使用PPLS,其g值分別為0.8與0.9。深度分析線性模型使用X-Y孤立點,Q-Q分布與Cook距離指出幾個對應的孤立點。從圖6的分布可看出,通過刪除孤立點可明顯地改進模型的適應度。

3 討論

在Vis-NIR區(qū)域(400~950 nm)使用冠層反射的頻譜信息,本方法在BBCH 32階段可在地表區(qū)分小麥的水分與氮含量。在處理層,通過PCA分開定量處理,使用PPLS模型定量地估算氮、水含量,并基于參考數(shù)據(jù)校準。此外,本研究檢測了不同的頻帶間隔(對于水模型尤其重要),在頻譜中減小近紅外區(qū)域(400~950 nm)。假設(shè)傳感器具有有效的頻譜范圍來區(qū)分谷物中的水與氮含量,該假設(shè)對于施肥的優(yōu)化極為重要。

4 結(jié)論

Vis-NIR區(qū)域的頻譜信息(400~950 nm)可用于小麥中氮與水含量的估算,該信息對于氮含量的優(yōu)化極為重要。本方法融入了反射數(shù)據(jù)的多元化分析,并采用數(shù)據(jù)預處理技術(shù)來估算田地異質(zhì)性等因素所引起的方差。而基于指標的方法則不具備足夠的信息來估算氮、水含量。

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