來建飛 丁蕾 竇曉兵?
miRNA在結直腸癌中的作用研究進展
來建飛 丁蕾 竇曉兵?
結直腸癌(Colorectal cancer,CRC)是最常見的消化道腫瘤之一,其發病率居世界惡性腫瘤第三位,是全球第四大癌癥死因[1]。引起CRC的危險因素包括吸煙、肥胖、缺乏運動等。2015年的研究數據顯示[2],早期診斷出結直腸癌的患者存活率約為60%,高于2005年至2009年的平均數據[3]。結直腸癌發生是多基因參與、多步驟發生的過程,其生物過程及分子機制尚不明確。1993年科學家首次在線蟲發現微小RNA(microRNA,miRNA)lin-4[4]后,越來越多關于miRNA的問題引起關注,其在人體多種疾病中扮演重要角色,包括各種癌癥。對miRNA的相關研究將有助于闡明其功能及分子機制。研究發現,多種miRNA在結直腸癌患者中表達失衡,參與癌癥發生與發展過程。miRNA是一類非編碼小分子單鏈RNA,是一類重要的基因表達調控因子,可靶向結合mRNA,通過沉默癌細胞生長相關基因的表達[5],促進或抑制腫瘤的生長。miRNA可作為結直腸癌早期診斷、治療、預后的新的分子生物學標志物,也可作為體內CRC治療的靶點[6]。
miRNA是一類在多種真核細胞和病毒中發現的進化上保守、長度為19~22個核苷酸的非編碼單鏈RNA,目前已經發現上千種miRNA。miRNA的產生過程及生物功能各不相同,其核內生成過程如下[7]:編碼miRNA的基因片段通過RNA聚合酶Ⅱ或聚合酶Ⅲ轉錄合成初級miRNA(primiRNA),pri-miRNA包含一個DROSHA蛋白和兩個DGCR8蛋白,經過DROSHA酶切后,形成發夾狀前體miRNA(pre-miRNA),長度為70~100nt;pre-miRNA在轉運蛋白Exportin-5和GTP酶共同作用下從核內轉運至細胞質,被核酸酶Dicer切割成21~25個堿基的雙鏈miRNA;該雙鏈解旋為兩條miRNA,其中一條為成熟的miRNA,另一條通常被降解。成熟miRNA分子可與其他蛋白質組成RNA-誘導沉默復合體(RNA-induced silencing complex,RISC)。成熟miRNA 5' 端高度保守的種子序列(seed region)可與mRNA 3'端非編碼區域(3'UTR)完全或不完全識別結合,對其進行剪切、降解或去腺苷酸化調控,影響mRNA 完整性,誘導靶分子mRNA降解或遏制其翻譯,在轉錄后水平影響基因或蛋白的表達。
2.1 miRNA與腫瘤的作用機制 不同種類的miRNA生物學功能取決于其所結合的mRNA功能[8]。miRNA參與體內多種調控機制和細胞信號轉導通路,一條單鏈miRNA可作用于多條mRNA,同時一條mRNA可被多條miRNA作用[9];而同一miRNA在不同的腫瘤中作用不同,多種miRNA也可以作用于同一靶基因發揮作用。miRNA與腫瘤的作用方式主要包括[10]:(1)miRNA與靶mRNA 的3'-UTR不完全配對,阻斷其翻譯過程,從而下調靶mRNA的表達。(2)miRNA與靶mRNA的3'-UTR完全配對,引起靶基因互補區特異性斷裂,從而將基因沉默,使其無法表達。(3) miRNA可通過加速靶mRNA 3' 端polyA的脫腺苷酸化,從而迅速降解靶mRNA。miRNA家族中,部分為癌性基因,部分為抑癌基因,通過其下游基因或某些信號通路控制腫瘤細胞生長[11],參與調節細胞遷移與侵襲[12]。
2.2 miRNA參與腫瘤的發生、轉移和預后 近兩年又發現有多種miRNA參與腫瘤的發生、轉移和預后過程。2015年Cell上一篇文章表明[13],一些miRNA在基因組上成簇存在,以多順反子形式轉錄。miR-17-92基因簇是一個高度保守的基因簇,編碼miRNA-17、miRNA-18a、miRNA-19a、miRNA-20a、miRNA-19b-1和miRNA-92a這6個成熟miRNA,參與哺乳動物多個器官發育,與多種腫瘤的發生密切相關。miRNA-17-92基因簇在結直腸癌、胃癌、肝癌等多種腫瘤細胞中高度表達。因此精確調控這一miRNA基因簇,以及基因簇中各個miRNA的相對表達對于發育和腫瘤相關疾病有重大作用。
例如,Zhang G等研究發現[14],miRNA-92a在淋巴結轉移CRC患者中表達顯著升高,PTEN基因是其下游靶基因之一;miRNA-92a誘導上皮細胞至間葉細胞的轉化(EMT),通過下調PTEN表達調節細胞生長、遷移和入侵。臨床病理特點表明,miRNA-92a超表達與臨床晚期、淋巴結轉移、遠距離轉移以及低氧化應激水平(OS)密切相關,推測miRNA-92a可作為CRC預后標志[15]。2015年,Chang C等[16]發現,miRNA-339-5p可靶向結合mRNA PRL-1的3'UTR從而抑制腫瘤細胞增殖和遷移。體外實驗證明miRNA-339-3p過度表達會抑制腫瘤生長和轉移,而PRL-1表達不受miRNA- 339-3p調控。表明miRNA-339-5p和miRNA-339-3p作用的目標mRNA可能不同,miRNA-339-3p的目標基因仍有待確定。因此,研究不同miRNA在腫瘤發生發展過程中的作用機制具有重要意義。
目前CRC的篩選方法包括結腸鏡檢查和糞便隱血試驗等常用的方法,但是這些方法受限于低特異性、敏感性、高侵襲性、高成本和高風險[17]。越來越多研究報道,miRNA作為潛在CRC診斷和預后的生物標志物,廣泛存在于CRC患者糞便、血清、血漿和組織中。
3.1 miRNA在結腸癌組織中的表達 2015年,Raheleh A等[18]根據關于熒光素酶報告基因文獻,總結近10年發表的77篇文獻制訂出一份關于結直腸癌患者異常表達的不同miRNA及其靶基因信息表,列舉了多種miRNA靶基因及其在結直腸癌發生發展中的調控作用。一篇Oncology 文獻報道[19],miRNA-143靶向作用于MACC1的3'UTR,下調MACC1表達;提示miRNA-143可能直接作用于其靶分子MACC1,抑制癌細胞侵襲。2016年,Zhou B等[20]發現miRNA-382在結直腸癌組織中表達異常下調,經熒光素酶報告基因分析證實miRNA-382直接作用于NR2F2的3'UTR;NR2F2在CRC組織中相對表達水平明顯高于癌旁正常組織;敲除NR2F2可抑制CRC細胞生長、遷移、和入侵。因此,miRNA-382/ NR2F2可作為一個潛在機制調控CRC的發生發展。最近,Bo L等[21]發現在CRC細胞系和組織樣本中miRNA-152表達下調;恢復CRC細胞中miRNA-152表達后,CRC細胞增殖、遷移和入侵顯著減少;PIK3R3是miRNA-152直接和功能性下游靶目標,PIK3R3表達和miRNA-152表達呈負相關;下調PIK3R3表達使miRNA-152超表達,抑制腫瘤細胞生長。
3.2 miRNA在結腸癌患者血清中的表達 目前miRNA在結腸癌患者外周血中表達水平研究較少,但其在結直腸癌早期的診斷治療中具有重要意義。2015年,Fang Z等[22]研究發現,CRC患者血清中miRNA-24、miRNA-320a和miRNA-423-5p表達水平明顯低于正常組標本;手術后這三個分子濃度明顯增加。因此血清中miRNA-24,miRNA-320a和miRNA-423-5p表達水平有潛力作為CRC早期階段的新型生物標志物檢測,且優于目前臨床生物標志物。2016年,Hu J等[23]表明在CRC細胞中miRNA-1914和miRNA-1915作用于NFIX RNA的3'UTR,下調NFIX RNA的表達;其過度表達會減弱5-FU和Oxaliplatin的抗腫瘤作用,降低CRC細胞的化學抵抗能力。因此miRNA-1914和miRNA-1915可能在結直腸癌治療和診斷中發揮重大作用。
3.3 miRNA在結腸癌患者糞便中的表達 為了在CRC初期進行切除腫瘤,降低結直腸癌的發病率和病死率,進行結直腸癌早期篩查非常必要。Lee JK等[24]發現,miRNA具有高度穩定性,能夠抵抗核酸酶(Rnases)的消化,適合在血清/血漿等體液,甚至糞便樣本中進行檢測。因此可以通過檢測糞便中miRNA表達來作為篩查結直腸癌的一種新方法。2015年,Zhu Y等[25]表明,與正常健康人比較,CRC患者糞便中miRNA-29a(P<0.001),miRNA-223(P<0.001)和miRNA-224(P<0.001)表達水平均顯著降低;miR-29a水平在直腸癌患者糞便中的表達也顯著高于結腸癌患者(P<0.001)。因此miRNA可以成為一個CRC的篩查和早期診斷的生物標志物。
4.1 miRNA與CRC的早期診斷 CRC傳統化療主要基于5氟尿嘧啶(5-FU)。與目前廣泛應用的腫瘤標記物不同,miRNA表達譜具有高度特異性,通過其特征對腫瘤進行早期診斷[26]。Lekun F等[27]在295位CRC患者樣本中發現,化療抵抗患者中,miRNA-17-5p表達水平比化療敏感患者高,miR-17-5p高表達的CRC患者預后效果較差,推測miRNA-17-5p可以作為對化療反應的預測生物標志物。2016年,Ghanbari R等[28]證實,CRC患者血清和糞便中let-7a-5p和let-7f-5p miRNA表達顯著降低,這可能是CRC早期檢測潛在分子生物標志物。通過人為改變miRNA表達量控制癌細胞增殖、轉移、浸潤等,miRNA表達譜可用于評估腫瘤治療效果。
4.2 miRNA與CRC的靶向治療 隨著CRC研究不斷深入,個性化靶向治療得到發展,人類腫瘤發生過程中miRNA成為一個新型特異性分子靶標[29-30]。Min-Bin C等發現[31],miRNA-451在結腸癌組織中過度表達,抑制AMPK活化機制,導致哺乳動物雷帕霉素靶蛋白復合體(mTORC1)過度活化和肌動蛋白束蛋白(FSCN1)上調,增強癌細胞遷移和增殖能力;若敲除miRNA-451基因或使用miRNA-451抑制劑,結直腸癌細胞的遷移和增殖被抑制。2015年,YANG等[32]發現,miRNA-499在結直腸癌組織中異常表達,miRNA-499-5p靶向結合FOXO4和PDCD4,促進大腸癌細胞侵襲和腫瘤轉移。由此可見miRNA-499-5p在結直腸癌的侵襲和生長中起著重要的調控作用,有望成為CRC臨床診斷治療的潛在靶點。這些研究表明有多種miRNA促進或抑制結直腸腫瘤入侵與轉移過程,通過調整相關基因為抗轉移策略提供潛在治療靶點,為CRC的靶向治療提供重要線索。
miRNA在腫瘤發生發展過程中具有重要作用,是目前研究的前沿。今后,若能在正常人、結直腸癌癌前病變患者及不同階段結直腸癌患者中建立系統完善的miRNA差異表達譜,將有助于闡明結直腸癌發病機制,為結直腸癌的診斷治療帶來新的研究方向和思路。如何特異性地將miRNA的激活劑及抑制劑引入腫瘤細胞,以及如何利用miRNA的表達譜為早期結直腸癌提供診斷依據,都是未來的研究方向。miRNA或許可成為結直腸癌早期診斷、特異性治療及評估預后的小分子標志物。因此,miRNA在結直腸癌診療中具有重要意義。
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310053浙江中醫藥大學生命科學學院
*通信作者