一種新的氨基酸描述符及其在肽QSAR中的應用

仝建波，李康楠，吳英紀，占 培，李玲霄

(陜西科技大學 化學與化工學院，陜西 西安 710021)

一種新的氨基酸描述符及其在肽QSAR中的應用

仝建波*，李康楠，吳英紀，占 培，李玲霄

(陜西科技大學 化學與化工學院，陜西 西安 710021)

定量構效關系；氨基酸描述符；多元線性回歸；肽

多肽類藥物在治療癌癥、代謝類疾病、心血管疾病、傳染性疾病、內分泌類疾病、血液病和疼痛緩解等眾多方向均有顯著的療效和廣泛的應用前途。與小分子化學藥物相比，多肽類藥物更為安全、副作用更小、特異性更強，很少引起嚴重的免疫反應[1]。隨著化學和生命科學的進步，近年來多肽類藥物的研發和上市出現了逐步加速的趨勢。

肽類藥物定量構效關系(Quantitative structure activity relationship，QSAR)是應用數學統計學方法來定量描述肽類藥物或其類似物的化學結構與特定的肽藥物活性之間的關系[2]。采取實驗測量評估肽類藥物活性的方法極大地耗費人力和時間[3]，因此肽類藥物定量構效關系在肽類藥物的研發中具有重要意義。在肽類藥物定量構效關系中，最為重要的是肽藥物結構的表征[4]。Sneath等[5]最先使用幾個半定量實驗參數對20種天然氨基酸分子結構進行表征，并成功用于后葉催產素類似物活性的預測。Kidera等[6]用因子分析法分析了20種天然氨基酸的188種結構參數，得到10個正交因子，并將其運用到肽類藥物活性預測，取得較好結果。其后，Hellberge等[7-11]用主成分分析法分析了20種天然氨基酸的29個物理化學性質，得到3個顯著主成分，將其作為氨基酸描述符成功建立了一些肽的定量構效關系模型。……