張祥民(復旦大學化學系,生物醫學研究院, 上海 200433)
鄒漢法研究員紀念專輯(下)·聚 焦
色譜-質譜技術在生物分析研究中的最新進展
張祥民*
(復旦大學化學系,生物醫學研究院, 上海 200433)
本文對近期色譜-質譜相關技術和方法學研究進展進行簡略評述。由于色譜方法研究和應用領域十分廣泛,涉及方方面面,本文僅簡要介紹色譜、多維色譜及其與質譜聯用技術在生物物質分析領域(主要是人類染色體蛋白質組、糖蛋白、磷酸化蛋白質組)的研究工作,此外還包括體積排阻色譜分離病毒顆粒、量子點、肝素方面的研究和多維氣相色譜分析進展及其他亮點文章。
最近有專輯[1]報道了人類染色體蛋白質組的研究。人類染色體蛋白組計劃(CHPP)的目標瞄準人類基因組編碼的19 467個蛋白質,鑒定其中盡可能多的蛋白質。從過去的4年來看,該蛋白質組計劃獲得的蛋白質數據從2013年的13 664個逐年增加到2016年的16 537個高置信度蛋白質。該數據經過了嚴格的人類蛋白質組計劃質譜數據解析標準(2.14版)的驗證。人類基因組預測的蛋白質中,85%已得到質譜和多重方法的確認,那些還沒有得到驗證的丟失蛋白質(missing proteins)仍然在持續發現之中,其中2 663個丟失蛋白質的線索正在通過國際數據庫PeptidesAtlas重新分析。
糖蛋白有重要作用,例如改變蛋白質功能、調節蛋白質相互作用和蛋白質周轉率,而糖鏈結構與疾病的發生、發展密切相關,其中非正常序列結構是疾病或癌癥的關鍵標志物。Zhou等[2]發展了……