基于氣相色譜-質譜聯(lián)用技術的高通量細胞表型分析方法

王希越, 高 鵬, 連麗麗, 婁大偉*, 許國旺(. 吉林化工學院, 吉林 吉林 30; . 中國科學院大連化學物理研究所, 遼寧 大連 603; 3. 大連醫(yī)科大學附屬大連市第六人民醫(yī)院, 遼寧 大連 60)

鄒漢法研究員紀念專輯(下)·研究論文

基于氣相色譜-質譜聯(lián)用技術的高通量細胞表型分析方法

王希越1,2, 高 鵬2,3*, 連麗麗1, 婁大偉1*, 許國旺2
(1. 吉林化工學院, 吉林 吉林 132022; 2. 中國科學院大連化學物理研究所, 遼寧 大連 116023; 3. 大連醫(yī)科大學附屬大連市第六人民醫(yī)院, 遼寧 大連 116021)

研究開發(fā)了一種基于96孔板培養(yǎng)和氣相色譜-質譜聯(lián)用(GC-MS)技術的高通量細胞表型分析方法。該方法分別以48種物質作為唯一能源對大腸桿菌進行培養(yǎng),利用GC-MS研究野生型和yfcC基因改造大腸桿菌對各物質的分解代謝情況,實現(xiàn)高通量的細胞表型分析。結果顯示,野生型和yfcC基因過表達大腸桿菌對14種物質的代謝能力有顯著差異,yfcC基因過表達大腸桿菌對甘氨酸和檸檬酸的代謝能力明顯強于野生型大腸桿菌,而對其他物質的代謝能力較弱,我們推測可能是由于yfcC基因促進乙醛酸代謝,導致yfcC過表達菌株對甘氨酸的代謝能力較強;野生型和yfcC基因敲除大腸桿菌間分解有顯著差異的共16種物質,其中yfcC基因敲除大腸桿菌對丙氨酸、乳糖、肌醇和檸檬酸的代謝能力較強。該方法簡單、高效,可以為未知基因功能研究提供更多代謝功能相關的參考數(shù)據(jù)。

氣相色譜-質譜;高通量;表型;基因功能

在過去十幾年里,隨著基因測序技術的不斷發(fā)展和……