細菌群體感應淬滅酶及其病害防治研究進展

范興輝 王惠杉 何杰華 葉田 陽芳 陳少華

（華南農(nóng)業(yè)大學亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室 廣東省微生物信號與作物病害防控重點實驗室 群體微生物研究中心，廣州 510642）

細菌群體感應淬滅酶及其病害防治研究進展

范興輝 王惠杉 何杰華 葉田 陽芳 陳少華

（華南農(nóng)業(yè)大學亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室 廣東省微生物信號與作物病害防控重點實驗室 群體微生物研究中心，廣州 510642）

微生物細胞間通過信號分子進行信息交流的現(xiàn)象即群體感應（Quorum sensing，QS），QS廣泛存在于微生物群體中，且可以調(diào)控特定基因尤其是很多致病基因的表達。群體感應淬滅（Quorum quenching，QQ）是基于群體感應現(xiàn)象提出的新型病害防治策略，即通過抑制信號分子的合成、監(jiān)測或?qū)π盘柗肿舆M行酶降解、修飾的途徑來干擾群體感應以達到防治病害的目的。利用群體感應淬滅酶（Quorum quenching enzymes）降解微生物信號分子，是目前毒性最小、最為有效的群體感應淬滅途徑。迄今為止，多種細菌信號分子的群體感應淬滅酶都已有報道，其中，酰基高絲氨酸內(nèi)酯（N-acyl homoserine lactones，AHLs）和順-11-甲基-2-癸烯酸（cis-11-Methyl-2-dodecenoic acid）群體感應淬滅酶研究最為深入。綜述并分析了群體感應淬滅酶及其病害防治的研究現(xiàn)狀、存在的問題和未來研究方向，為今后發(fā)展新型綠色安全病害防控措施提供關(guān)鍵理論和技術(shù)支撐。

群體感應；群體感應淬滅酶；酰基高絲氨酸內(nèi)酯；順-11-甲基-2-癸烯酸

介導微生物群體感應的化學信號分子主要分為3類：（1）在革蘭氏陰性細菌中，信號分子多為脂肪酸類的衍生物，如酰基高絲氨酸內(nèi)酯類物質(zhì)（N-acyl homoserine lactones，AHLs）、被簡稱為DSF的順式-11-甲基-2-十二碳烯酸（cis-11-Methyl-2-dodecenoic acid）等，其中，AHLs類物質(zhì)的研究最為廣泛且深入。（2）革蘭氏陽性菌的信號分子多為寡肽（Auto inducing peptide，AIP）。（3）除了以上幾種信號分子，介導微生物QS 調(diào)節(jié)的信號分子還包括自誘導劑AI-2、2-庚基-3-羥基-4（1H）-喹諾酮（PQS）、3-羥基-棕櫚酸甲酯（3-OH-PAME）、二烷基間苯二酚（DARs）［5］、α-吡喃酮［6］等。

通過抑制信號分子的合成、積累、監(jiān)測，或?qū)π盘柗肿舆M行酶降解或修飾的機制來干擾群體感應系統(tǒng)，即群體感應淬滅（Quorum quenching，QQ）。群體感應淬滅不僅可以通過相應的降解酶來實現(xiàn)，也可以通過物理條件的改變來實現(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn)，AHLs在堿性條件下會出現(xiàn)高絲氨酸內(nèi)酯環(huán)結(jié)構(gòu)被破壞的現(xiàn)象，失去QS信號分子活性，且隨著pH值的增大和AHLs酰基側(cè)鏈長度的減少，破壞程度加深［7］。能夠降解信號分子，使其濃度低于臨界值，抑制病原菌相關(guān)毒力因子表達的酶，即群體感應淬滅酶（Quorum quenching enzymes）。在不同生物體包括細菌、酵母菌和真核生物中均已發(fā)現(xiàn)群體感應淬滅酶。在肺炎克雷伯桿菌（Klebsiella pneumoniae）中發(fā)現(xiàn)的AHLs降解酶AhlK，能夠?qū)⒏呓z氨酸內(nèi)酯的內(nèi)酯鍵打開，使其失去信號分子活性［8］。邱健等［9］首次篩選到一株具有降解AHLs活性的酵母菌，經(jīng)鑒定為紅冬孢酵母菌（Rhodosporidium toruloides），此菌產(chǎn)生的降解酶對短中長鏈AHLs均具有較好的降解效果，即該酶底物譜較為廣泛，經(jīng)鑒定此酶為AHLs內(nèi)酯酶［10］。但是，關(guān)于編碼此酶的基因，尚未有詳細報道。Bar-Rogovsky等［11］報道，廣泛存在于哺乳動物組織中的對氧磷酶（PONs）能有效水解AHLs。迄今為止，已報道的信號分子降解酶大多是在細菌中發(fā)現(xiàn)。本文重點闡述了微生物群體感應淬滅酶研究現(xiàn)狀，旨為今后發(fā)展新型綠色安全病害防控措施提供關(guān)鍵理論和技術(shù)支撐。

1 細菌信號分子降解酶的研究

1.1 AHLs淬滅酶

20世紀80年代，首次在革蘭氏陰性菌海洋細菌費氏弧菌（Vibrio fischeri）中發(fā)現(xiàn)AHLs信號分子［12］，在此之后，多種不同結(jié)構(gòu)的AHLs陸續(xù)被發(fā)現(xiàn)并報道。作為革蘭氏陰性菌的主要信號分子，大多數(shù)AHLs具有相同的高絲氨酸內(nèi)酯環(huán)結(jié)構(gòu)且都具有酰基側(cè)鏈，但其酰基側(cè)鏈長度、飽和度存在差異。除此之外，還存在幾種結(jié)構(gòu)特殊的AHLs，如N-羧化的 AHLs［13］、肉桂酰基—高絲氨酸內(nèi)酯［14］、支鏈異戊酰基-高絲氨酸內(nèi)酯［15］、香豆酰基-高絲氨酸內(nèi)酯［16］。但是，關(guān)于這幾類特殊結(jié)構(gòu)AHLs降解酶的研究報道較少。

自2000年首次在芽孢桿菌（Bacillus cereus）分離出AHLs內(nèi)酯酶［17］，在爭論貪噬菌（Variovorax paradoxus）分離出AHLs酰胺酶［18］以來，許多關(guān)于AHLs降解酶的報道相繼出現(xiàn)。根據(jù)AHLs淬滅酶催化機制，將其分為3類：AHLs內(nèi)酯酶、AHLs酰胺酶和氧化還原酶。已篩選出的AHLs降解酶大多屬于AHLs內(nèi)酯酶和AHLs酰胺酶。

1.1.1 AHLs內(nèi)酯酶 由aiiA基因編碼的AiiA酶，是第一種被發(fā)現(xiàn)的群體感應淬滅酶，經(jīng)鑒定此酶為AHLs內(nèi)酯酶［17］。除此之外，在其他一些細菌中也發(fā)現(xiàn)了AHLs內(nèi)酯酶。例如，在節(jié)桿菌（Arthrobacter sp.）中發(fā)現(xiàn)的 AhlD 酶［8］，在土壤芽孢桿菌（Geobacillus kaustophilus）中發(fā)現(xiàn)的GKL酶［19］以及近期在動性球菌（Planococcus sp.）中發(fā)現(xiàn)的AidP酶［20］等。各內(nèi)酯酶的系統(tǒng)進化關(guān)系，如圖1所示。

目前發(fā)現(xiàn)的AHLs內(nèi)酯酶有金屬β內(nèi)酰胺酶、α/β水解酶、對氧磷酶（PONs）、糖基水解酶和酰胺水解酶（圖1）。AHLs內(nèi)酯酶大多屬于金屬β內(nèi)酰胺酶，此類酶具有一個高度保守的的Zn2+結(jié)合域HXHXDH，Zn2+對內(nèi)酯酶活性具有決定性作用，但不同內(nèi)酯酶 Zn2+結(jié)合區(qū)域有所不同［17］。α/β 水解酶是一類結(jié)構(gòu)上相關(guān)，具有多種不同催化功能的酶，這類酶有兩個共同特征：一個親核酸性組氨酸催化三分子和一個序列為Gly-X-Nuc-X-Gly 的親核基團，這兩個區(qū)域?qū)HL 降解活性至關(guān)重要［33］。對氧磷酶（PONs）發(fā)現(xiàn)于哺乳動物組織中，對氧磷酶家族具有六葉螺旋槳折疊結(jié)構(gòu)及Ca2+催化位點［36］。

圖1 AHLs內(nèi)酯酶系統(tǒng)進化關(guān)系圖

1.1.2 AHLs酰胺酶 AHLs酰胺酶破壞AHLs酰基鏈的酰胺鍵，使高絲氨酸內(nèi)酯環(huán)和酰基側(cè)鏈分離生成脂肪酸和高絲氨酸內(nèi)酯。2000年Leadbetter &Greenberg［18］在爭論貪噬菌（Variovorax paradoxus）中首次發(fā)現(xiàn)AHLs酰胺酶。除了在細菌中發(fā)現(xiàn)AHL酰胺酶以外，在放線菌和淡水藻類中也有AHLs酰胺酶的發(fā)現(xiàn)，Park等［37］在放線菌鏈霉菌（Streptomyces sp.）中發(fā)現(xiàn)酰胺酶AhlM，Romero等［38］在魚腥藻屬（Anabaena sp.）中發(fā)現(xiàn)由基因all3924 編碼的酰基轉(zhuǎn)移酶AiiC，這種藻類的細胞原液對長鏈AHLs具有較好的降解效果。其他AHLs酰胺酶，見表1。

表1 AHLs酰胺酶

目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的AHLs酰胺酶，絕大部分都屬于N末端親核（Ntn）水解酶。這類酶具有一個保守區(qū)域，該區(qū)域包含一個α亞單位和一個β 亞單位。β亞單位中熟化和催化作用所需要的N末端親核在AHLs酰基轉(zhuǎn)移酶中是高度保守的。定點突變顯示區(qū)域中保守的甘氨酸-絲氨酸對AHLs酰基轉(zhuǎn)移酶活性至關(guān)重要［41］。

研究表明，在制藥工業(yè)中被廣泛利用的青霉素V酰基轉(zhuǎn)移酶（PVAs）表現(xiàn)出降解長鏈AHLs的底物特異性。PVAs屬于Ntn水解酶超家族。外源性添加這些酶到銅綠假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa）中大大減少了彈性蛋白酶和綠膿菌素的生產(chǎn)和生物膜形成，并增加了在急性感染的昆蟲模型中的存活率［49］。

1.1.3 氧化還原酶 來自芽孢桿菌屬（Bacillus sp.）的細胞色素P450單加氧酶CYP102A1（P450BM-3），能夠催化氧化AHLs及其內(nèi)酯分解產(chǎn)物，AHLs氧化產(chǎn)物仍然具有信號分子活性，但是其活性顯著低于母體化合物［50］。在紅串紅球菌（Rhodococcus erythropolis）中發(fā)現(xiàn)氧化還原酶，其催化3-氧代-C（8-14）-HSLs還原成相應的3-羥基-HSL，從而使信號分子失活，此菌也可以還原化合物N-（3-氧代-6-苯基己酰基）高絲氨酸內(nèi)酯（含有芳族酰基鏈取代基）［51］。Chan等［52］從姜根際中分離出的伯克霍爾德桿菌（Burkholderia cepacia）可以將3-氧代-AHL還原成相應的3-羥基化合物。

1.2 DSF淬滅酶

上世紀末，Barber等［53］首次檢測到DSF活性，并分析了rpf基因簇（病原致病因子的調(diào)控）。DSF信號首先在野油菜黃單胞菌中（Xanthomonas.campestris pv. campestris）得到鑒定，信號分子是順-11-甲基-2-癸烯酸［54］。迄今為止，許多DSF降解菌被篩選并鑒定，這些降解菌能夠降解DSF信號從而影響野油菜黃單胞菌毒力因子的表達。Newman等［55］在芽孢桿菌屬（Bacillus）、類芽孢桿菌屬（Paenibacillus）、微桿菌屬（Microbacterium）、葡萄球菌屬（Staphylococcus）、假單胞菌屬（Pseudomonas）細菌中均篩選到能快速降解DSF的菌株，并對這些菌株進行了鑒定。除此之外，Caicedo等［56］在柑橘葉中分離出三株具有DSF降解活性的菌株，分別為Pseudomonas sp. SJ01、Pseudomonas sp. SJ02和Bacillus sp. SJ13。但是，目前還沒有文獻清楚報道DSF信號的淬滅機制。

1.3 其他信號分子降解酶

其他信號分子有2-庚基-3-羥基-4（1H）-喹諾酮（PQS），自誘導劑AI-2，3-羥基-棕櫚酸甲酯（3-OH-PAME）、二烷基間苯二酚（DARs）、α-吡喃酮等。其中二烷基間苯二酚（DARs）和α-吡喃酮為近幾年新發(fā)現(xiàn)的群體感應信號分子，尚未有關(guān)于降解酶的研究報道。

2-庚基 -3-羥基-4（1H）-喹諾酮（PQS）是銅綠假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa）使用的群體感應信號分子。細胞質(zhì)酶Hod酶能夠催化PQS轉(zhuǎn)化為N-辛酰基鄰氨基苯甲酸和一氧化碳，將Hod酶添加到銅綠假單胞菌PAO1培養(yǎng)物中，可以降低PQS生物合成基因pqsA的表達［57］。從木糖氧化無色桿菌（Achromobacter xylosoxidans）菌株Q19分離出來的降解酶可以降解PQS，產(chǎn)生新的熒光化合物2-庚基 -2-羥基 -1，2-二氫喹啉 -3，4-二酮（HHQD），Q19也可氧化PQS同源物，產(chǎn)生相應的2-羥基-1，2-二氫喹啉-3，4-二酮，但不能使PQS前體HHQ失活［58］。 紅 球 菌（Rhodococcus erythropolis）BG43 能夠降解PQS和PQS前體HHQ，進一步研究表明，菌株BG43的環(huán)形質(zhì)粒pRLCBG43有兩個基因簇aqdA1B1C1和aqdA2B2C2，預測編碼水解酶黃素單加氧酶和雙加氧酶［59］。

細菌種間交流信號分子AI-2是衍生自4，5-二羥基 -2，3-戊二酮（4，5-Dihydroxy-2，3-pentanedione，DPD）的一類化合物［60］。研究發(fā)現(xiàn)，在體外條件下，大腸桿菌LsrK酶可以磷酸化AI-2［61］。Weiland-Braeuer等［62］通過構(gòu)建宏基因組文庫篩選出QQ-2蛋白，并發(fā)現(xiàn)QQ-2蛋白可以通過修改信號分子有效抑制Al-2調(diào)節(jié)的生物膜形成，QQ-2蛋白可以將Al-2還原為無QS活性的羥基衍生物。

3-羥基-棕櫚酸甲酯（3-OH-PAME）是由細菌枯萎病菌（Ralstonia solanacearum）產(chǎn)生的信號分子，調(diào)控其毒力因子的表達。Shinohara等［63］在Ideonella sp. 0-0013菌株中發(fā)現(xiàn)的β-羥基棕櫚酸甲酯水解酶（β-HPMEH）可以降解3-OH-PAME，將3-OH-PAME分解為3-羥基-棕櫚酸和甲醇。Achari等［64］在植物體內(nèi)生菌中篩選出3株對3-OHPAME有降解活性的菌株，分別是嗜麥芽寡養(yǎng)單胞菌（Stenotrophomonas maltophilia）、銅綠假單胞菌（Pseudomonas aeruginosa）和類棒菌狀紅球菌（Rhodococcus corynebacterioides），這些菌株可以使青枯菌的致病力顯著下降。

2 結(jié)語

抗生素的濫用使得越來越多的致病菌產(chǎn)生抗藥性，甚至是多重抗藥性。因此，新型的防治策略的提出顯得十分重要。群體感應淬滅是基于群體感應機制提出的一種高效的生物防治策略。在病害防治過程中，不直接作用于致病菌，所以不會使致病菌產(chǎn)生抗藥性。在多種具有群體感應淬滅作用的群體感應抑制劑中，群體感應淬滅酶是毒性最小、最為安全有效的。群體感應淬滅酶的研究與應用對于農(nóng)林業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)、醫(yī)藥行業(yè)的發(fā)展具有重要意義。

研究方向展望：（1）AHLs群體感應淬滅酶的研究較為深入，但是要使群體感應淬滅酶廣泛應用于農(nóng)林牧漁業(yè)生產(chǎn)及醫(yī)療中還存在許多問題要解決，比如淬滅酶的穩(wěn)定性、催化效率、底物特異性、酶遞送和電位問題及是否存在副作用。（2）雖然目前AHLs群體感應淬滅酶研究較為深入，但包括AHLs在內(nèi)的微生物群體感應信號分子的新型淬滅酶基因的篩選和克隆以及淬滅酶作用機理的研究工作仍需進行。（3）群體感應廣泛存在于微生物群體中，但除少數(shù)模式細菌群體感應系統(tǒng)有較為全面的研究外，其他重要病害致病細菌、真菌、放線菌的群體感應系統(tǒng)研究并不深入。為此，應該進一步加深對于細菌、真菌、放線菌群體感應系統(tǒng)的研究，如群體感應系統(tǒng)信號通路、群體感應信號的鑒定、群體感應淬滅酶的篩選和應用等，這將為細菌、真菌、放線菌病害提供新的防治策略，同時，有利于發(fā)展新型生物防治技術(shù)。

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Research Progress on Microbial Quorum Quenching Enzymes and Their Control of Plant Diseases

FAN Xing-hui WANG Hui-shan HE Jie-hua YE Tian YANG Fang CHEN Shao-hua
（State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources，Guangdong Province Key Laboratory of Microbial Signals and Disease Control，Integrative Microbiology Research Centre，South China Agricultural University，Guangzhou 510642）

The phenomenon of information exchanging through signal molecules between microbial cells is the Quorum Sensing（QS）.QS is widely present in microorganisms，and can modulate the expression of specific genes，especially virulence factors in pathogenic microorganisms. Quorum Quenching（QQ）is a new therapeutic strategy of plant diseases based on QS. QQ can be achieved by interfering QS from inhibiting the synthesis or detection of the signal molecules，or by enzyme-catalyzed degradation or modification of the signal molecules.Degrading signal molecules by using QQ enzymes is one of the most effective and nontoxic ways of QQ. So far，QQ enzymes of various microbial signaling molecules have been reported，especially N-acyl homoserine lactones（AHLs）and cis-11-methyl-2-dodecenoic acid were deeply investigated. In this review，we summarize and analyze the research status，deficiencies and the future development of QQ enzymes and their control of plant diseases，for laying a solid foundation for developing new，green and safe measures of disease control.

quorum sensing；quorum quenching enzymes；N-acyl homoserine lactones；cis-11-methyl-2-dodecenoic acid

10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017-0223

微生物通過監(jiān)測胞外信號分子的濃度來感知群體密度的變化，當其達到某一臨界密度值，啟動目標基因的表達，協(xié)調(diào)群體行為，即群體感應（Quorum sensing，QS）。在QS系統(tǒng)中，細菌合成、分泌、監(jiān)測的物質(zhì)，即群體感應信號分子，或稱為自誘導劑（Auto-inducers，AIs）［1］。20 世紀 80 年代研究發(fā)現(xiàn)，海洋細菌費氏弧菌（Vibrio fischeri）可以通過群體感應來調(diào)節(jié)自身發(fā)光現(xiàn)象，這是人們首次發(fā)現(xiàn)的群體感應現(xiàn)象［2］。群體感應與許多微生物生物學功能的實現(xiàn)密切相關(guān)，包括生物發(fā)光、共生現(xiàn)象、生物膜形成、抗生素合成、群體移動性、質(zhì)粒轉(zhuǎn)移、孢子形成及基因交換等［3-4］。

2017-03-21

國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（2015CB150600），廣東省杰出青年科學基金（2015A030306038），廣東省高校青年創(chuàng)新人才項目（2014KQNCX036）

范興輝，女，碩士研究生，研究方向：微生物群體感應；E-mail：347037188@qq.com

陳少華，男，教授，研究方向：微生物降解、微生物群體感應；E-mail：shchen@scau.edu.cn

（責任編輯 狄艷紅）