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RNA干擾技術的原理與應用研究

2018-01-11 22:08:07劉敏楠
科學家 2017年23期
關鍵詞:檢測研究

目的:探究RNA干擾技術的原理與應用。方法:選擇Acclaim SEC-300及MAbPac SEC-1色譜柱,直徑分別為4.6×300mm、2.1×30mm,流速分別為≤0.35mL/min、0.05~0.075mL/min,柱溫分別為<60℃、20℃~25℃,pH范圍分別為2~12、2.5~7.5,流量參數分別0.3mL/min、0.075mL/min,分子退出系數為170 200,樣品總體積500μl,鹽酸小檗堿濃度10、15、20、30、40pmol/μL;給予HPLC級乙腈、HPLC梯度級水以及P4417SIGMA磷酸鹽緩沖鹽水(0.01M),檢測波長260nm,經由體積排阻色譜法分析檢測。結果:不同濃度下,濃度與峰高之間呈正比關系,R2=0.9302,方程y=5.069x-14.172。結論:采用不同色譜柱及鹽酸小檗堿用于評估RNA干擾技術的應用效果較好。

RNA技術在制藥產業應用范圍較廣泛,比如乳腺癌、腦部膠質瘤等惡性腫瘤、以及遺傳性疾病等。由于制藥涉及的原理及機制比較復雜,類型較多,比如反義寡核苷酸、小干擾RNA等,但由于RNA藥物修飾、傳遞及免疫激活等方面尚未完全研究清楚,因此需進一步研究[1-2]。鹽酸小檗堿是一種生物堿,具有抑菌作用,能夠有效清除毒素,作為寡核苷酸修飾后產物,屬于臨床常用藥,可單用,也可作為添加于其他藥物,作為一種藥物成分[3-4]。本次研究選擇Dionex Ultimate3000型色譜儀,分別選擇Acclaim SEC-300及MAbPac SEC-1色譜柱,經由體積排阻色譜法進行檢測,分析檢測結果,獲得一定研究成果,現報告如下。

資料與方法

設備與試劑

本次研究選擇Dionex Ultimate3000(Thermo Scientific制造)型色譜儀,分別選擇Acclaim SEC-300(5μm,分析范圍4.6×300mm,由Thermo Scientific制造)及MAbPac SEC-1色譜柱(5μm,分析范圍2.1×300mm,由Thermo Scientific制造),濃度測量儀器為Nanodrop2000(Thermo Scientific制造),離心機為Thermo Legend Micro17離心機,20μL環形Nano Viper/彩色PEEK管(內部直徑為0.18mm),震蕩攪拌機,Mettler toledo 320 pH計;主要化學試劑如下:HPLC梯度級水(Fisher Scientific制造,英國),HPLC級乙腈(Fisher Scientific制造,英國),P4417 SIGMA磷酸鹽緩沖鹽水(片劑,一片溶于200mlHPLC水中,得到0.01M磷酸鹽緩沖液);鹽酸小檗堿(產品編號GZDD-0060,CAS號633-65-8,質地純度≥98.837%,來自貴州迪大科技有限責任公司,常規包裝30mg)。

方法

本次研究選擇Acclaim SEC-300及MAbPac SEC-1色譜柱,其直徑分別為4.6×300mm、2.1×30mm,流速分別為≤0.35mL/min、0.05~0.075mL/min,柱溫分別為<60℃、20℃~25℃,pH范圍分別為2~12、2.5~7.5,流量參數分別0.3mL/min、0.075mL/min,平衡時間分別為50min、42min;給予HPLC級乙腈、HPLC梯度級水以及P4417SIGMA磷酸鹽緩沖鹽水(0.01M),檢測波長260nm,經由體積排阻色譜法進行檢測,分析檢測結果。檢測方法如下:1)吸取HPLC梯度級水(5μL)轉移至設備頂部,合上裝置臂,再次打開后,擦拭頂部HPLC梯度級水,重復2~5次,保證設備頂部足夠干凈;2)進入系統設置后,選擇計算機系統中的寡核苷酸計算模式,輸入序列后,得到分子量及分子退出系數等實驗基礎參數;3)鹽酸小檗堿檢測樣品濃度10、15、20、30、40pmol/μL;測試鹽酸小檗堿樣品前,以2μL HPLC梯度水作為實驗的空白對照組,開始樣品濃度測試,每次吸取樣品2μL;實驗結束后,儀器頂部同樣使用HPLC梯度級水清洗;準備好樣品(單個樣品總體積500μl,最大濃度400pmol/μl)、制備緩沖液,設定濃度為5pmol/μl;-20℃條件下保存于冰凍箱內;檢測時,將樣本取出后放置于室溫下,直至樣品完全融化后,經渦旋混合器混合、經離心5min后,去除氣泡,再繼續其余實驗步驟;層析寡核苷酸樣品,自動取樣針依次吸取PBS緩沖液、鹽酸小檗堿樣品、PBS緩沖液;每個緩沖液均需在脫氣15min后再與色譜系統相連,在實驗中持續關注PBS緩沖液情況,PBS緩沖液需及時更換,但不得中斷,保證色譜柱不干燥[5-7]。

結果

鹽酸小檗堿在40.371~215.109pmol/μL濃度范圍內與峰高之間存在線性關系,R2=0.9302,方程y=5.069x-14.172,詳見表1-表5。

結論

20世紀初,國外學者初次提出dsRNA能夠對mRNA產生具有特異性作用的講解作用,能夠特異……

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