生產安全優質的學生飲用奶的前提,是要有優質的新鮮奶源,從源頭上保證安全優質。國家“學生飲用奶計劃”從啟動之初便非常重視對奶源的要求。在2003—2013年實施了“學生奶奶源升級計劃”,參照奶業發達國家的標準,結合我國奶牛養殖實際,制訂了《學生飲用奶奶源示范基地升級指南》,建立200余家奶源示范基地,以輻射帶動學生飲用奶奶源基地提高原料奶質量。
中國奶業協會承接國家“學生飲用奶計劃”推廣工作后,同樣高度重視奶源基地建設,堅持新鮮優質奶源作為學生飲用奶原料奶的原則,把奶源基地作為考核評估學生飲用奶生產企業的主要內容之一。為了保障學生飲用奶奶源質量安全,根據目前我國奶牛規模養殖水平,提出實施奶源基地第二輪升級:

—從第一輪創建示范基地到第二輪覆蓋全部學生飲用奶奶源基地;
—從奶牛場、養殖小區皆可到奶牛場才可作為奶源基地;
—從單體奶牛場全群存欄300頭以上到泌乳牛存欄200頭以上;
—從奶源基地認定前指導到全程動態管理;
—從每月一批生牛乳4項指標牛場自檢到進廠原料奶批批檢測,即菌落總數≤20萬CFU/mL,嗜冷菌≤1萬CFU/mL,耐熱芽孢菌≤100 CFU/mL,體細胞≤50萬個/mL,高于國家標準;
—從未規定原料奶主要營養成分到規定乳脂率≥3.6%,乳蛋白≥3.0%,高于國家標準;
—從菌落總數≤20萬CFU/mL再提高到菌落總數≤10萬CFU/mL,從體細胞≤50萬個/mL再提高到體細胞≤40萬個/mL,與歐盟標準相同。
為了使學生飲用奶奶源基地管理規范化、制度化,中國奶業協會頒布了《學生飲用奶奶源基地建設與管理規范(試行)》,后又以團體標準《學生飲用奶 奶源基地管理規范》發布。學生飲用奶奶源基地在執行《乳品質量安全監督管理條例》規定的基礎上,實施《學生飲用奶 奶源基地管理規范》。該規范對學生飲用奶奶源基地的場址與布局、奶牛繁育管理、日糧與飼養管理、疾病防控、擠奶管理、環境管理、從業人員管理、檔案管理、養殖規模及生產水平,提出了具體操作要求。這些要求的目的就是保持奶牛健康和生牛乳質量安全。
通過學生飲用奶奶源基地的第二輪升級,促使向學生飲用奶生產企業提供原料奶的養殖場更加高標準、嚴要求,提高管理水平,提升原料奶質量。中國奶業協會組織專家按照《學生飲用奶奶源基地管理規范(試行)》逐一開展對學生飲用奶奶源基地的評估。經評估認定的奶源基地在中國奶業協會備案,實施動態管理,有效期為三年,同時建立退出機制。是否有合格的奶源基地是能否作為學生飲用奶生產企業的重要前提條件。
截至2017年年底,共有253家學生飲用奶奶源基地在中國奶業協會備案。這些奶源基地分布在除了福建、西藏和海南之外的28個省、自治區、直轄市。全群總存欄奶牛65.4萬頭,其中泌乳牛29萬頭,日平均大約生產生牛乳8200噸。泌乳牛存欄200~999頭的占61%,1000頭及以上的占39%。這些奶源基地能夠滿足目前學生飲用奶原料奶的需求。