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基于云環(huán)境的科學(xué)工作流均衡調(diào)度算法

2018-07-03 01:27:16朱亞東陳湘軍江蘇聯(lián)合職業(yè)技術(shù)學(xué)院南京工程分院信息中心南京常州輕工職業(yè)技術(shù)學(xué)院信息工程系江蘇常州000南京大學(xué)電子工程學(xué)院南京0046
實(shí)驗(yàn)室研究與探索 2018年5期
關(guān)鍵詞:資源

朱亞東, 李 忠, 嚴(yán) 莉, 陳湘軍(.江蘇聯(lián)合職業(yè)技術(shù)學(xué)院 南京工程分院信息中心,南京 5;.常州輕工職業(yè)技術(shù)學(xué)院 信息工程系,江蘇 常州 000;.南京大學(xué) 電子工程學(xué)院,南京 0046)

0 引 言

科學(xué)工作流廣泛應(yīng)用于大型復(fù)雜科學(xué)應(yīng)用建模,云計(jì)算環(huán)境提供的即付即用計(jì)算能力及定制式硬件設(shè)施,是調(diào)度科學(xué)工作流應(yīng)用的一種有效方法[1]。與傳統(tǒng)工作流不同,科學(xué)工作流規(guī)模更大,任務(wù)的數(shù)據(jù)計(jì)算與通信代價(jià)更高,其本質(zhì)是實(shí)現(xiàn)相互依賴的任務(wù)至資源間的映射,同時(shí)要求滿足用戶定義的QoS約束(截止時(shí)間或預(yù)算)。傳統(tǒng)工作流調(diào)度算法僅側(cè)重于考慮優(yōu)化執(zhí)行效率(執(zhí)行時(shí)間),未考慮資源代價(jià),而云是商業(yè)化環(huán)境,其資源使用是有償付費(fèi)的,資源能力越高,價(jià)格越高,此時(shí),使用不同資源及不同調(diào)度方案得到的執(zhí)行代價(jià)和時(shí)間是不同的。因此,云環(huán)境下的工作流調(diào)度需要同步考慮用時(shí)間和代價(jià)。

相關(guān)研究中,文獻(xiàn)[2]中提出一種預(yù)算約束異構(gòu)最早完成時(shí)間算法BHEFT,算法引入當(dāng)前任務(wù)預(yù)算因子到未調(diào)度任務(wù)的剩余預(yù)算分配中,與本文不同的是,其任務(wù)預(yù)算與剩余預(yù)算是逐個(gè)任務(wù)分配的。文獻(xiàn)[3,4]中則僅側(cè)重于截止時(shí)間的約束及截止時(shí)間在不同任務(wù)或不同分級間的分割,不適應(yīng)于云環(huán)境。文獻(xiàn)[5]中提出預(yù)算感知回溯調(diào)度算法實(shí)現(xiàn)了多任務(wù)工作流的優(yōu)化調(diào)度,文獻(xiàn)[6-7]中則提出一種預(yù)算約束的最小端到端延遲工作流調(diào)度算法,通過在關(guān)鍵路徑上應(yīng)用貪婪策略尋找調(diào)度方案,然而,以上3個(gè)文獻(xiàn)中的資源代價(jià)模型并不適應(yīng)于商業(yè)云特征。文獻(xiàn)[8]中提出基于自動(dòng)擴(kuò)展方法求解預(yù)算約束下的工作流調(diào)度,而本文將根據(jù)任務(wù)優(yōu)先級采用正比例方式進(jìn)行預(yù)算分割。

不同于以上工作,本文將重點(diǎn)關(guān)注于通過預(yù)算分割的方式優(yōu)化工作流的執(zhí)行代價(jià)與執(zhí)行時(shí)間,在工作流分級及在不同分級上賦予待調(diào)度任務(wù)優(yōu)先級的方式,實(shí)現(xiàn)最優(yōu)目標(biāo)實(shí)例資源的選擇,最終完成科學(xué)工作流的代價(jià)與時(shí)間同步最優(yōu)的均衡調(diào)度。

1 工作流與系統(tǒng)模型

1.1 工作流模型

以有向無循環(huán)圖(Directed Acyclic Graph,DAG)表示工作流模型[9],定義為G=(T,E),其中,T={t0,t1,…,tn}表示圖的頂點(diǎn)代表的任務(wù)集,E={ei,j|ti,tj∈T}表示圖的邊集,代表任務(wù)間的數(shù)據(jù)或控制依賴性。

邊ei,j∈E表示兩個(gè)任務(wù)ti與tj間的有向邊,ti,tj∈T,代表兩個(gè)任務(wù)間的優(yōu)先順序約束,其具體含義是:僅當(dāng)任務(wù)ti執(zhí)行完成后并收到ti的所有數(shù)據(jù)后,任務(wù)tj才可以開始執(zhí)行。換言之,任務(wù)ti是tj的父任務(wù),tj是ti的后繼或子任務(wù)。單個(gè)任務(wù)可擁有一個(gè)或多個(gè)父任務(wù)和子任務(wù)。直到其所有父任務(wù)完成后,子任務(wù)ti才可以開始執(zhí)行。

1.2 系統(tǒng)模型

云資源提供者可提供多種類型的實(shí)例,擁有不同的CPU、內(nèi)存、存儲和帶寬能力,且配置不同的使用價(jià)格。本文使用基于彈性計(jì)算云Amazon EC2(Amazon Elastic Compute Cloud,Amazon)的資源模型,其實(shí)例類型按需提供,其定價(jià)利有即付即用的最小小時(shí)計(jì)費(fèi)模型,即:小于1 h的資源使用,均按1 h支付。表1是本文中所使用的資源代價(jià)與實(shí)例類型的相關(guān)參數(shù)配置,更新于2016年3月的Amazon EC2數(shù)據(jù)。

表1 資源實(shí)例類型

注:ECU:Elastic Compute Unit,彈性計(jì)算單元

假設(shè)云資源提供者可提供無限制異構(gòu)實(shí)例數(shù)量,表示為P={p0,p1,…,ph},其中,h表示實(shí)例類型索引。假設(shè)所有實(shí)例類型和存儲服務(wù)處于同一云數(shù)據(jù)中心內(nèi),則不同實(shí)例間的平均帶寬可視為基本相等的。

2 預(yù)算分割工作流均衡調(diào)度算法

基于預(yù)算分割的均衡工作流調(diào)度算法(Budget Division Workflow Trade-off Scheduling,BDWTS)劃分為以下4個(gè)階段:

(1) 工作流分級。基于工作流任務(wù)的同步需求,將工作流任務(wù)進(jìn)行分級(level)。

(2) 預(yù)算分割。將用戶定義的預(yù)算(Budget)按6種不同的策略在不同的任務(wù)分級間進(jìn)行分割。

(3) 任務(wù)選擇。在任務(wù)就緒隊(duì)列中基于優(yōu)先級原則選擇調(diào)度任務(wù)。

(4) 實(shí)例選擇。選擇最優(yōu)目標(biāo)實(shí)例執(zhí)行任務(wù),滿足可用預(yù)算約束。

2.1 工作流分級

工作流分級的目標(biāo)是通過任務(wù)分級最大化任務(wù)執(zhí)行的并行程度,使得同一分級中的任務(wù)與其它分級中的任務(wù)不具有依賴性。因此,每個(gè)分級可視為包括獨(dú)立任務(wù)的批任務(wù)集(Bag of Tasks,BoTs)。

定義任務(wù)ti的分級為以自頂向下的方式,任務(wù)ti至工作流的出口任務(wù)間的所有路徑的邊的最大值,表示為NL(ti)。對于出口任務(wù),分級為1,對于其他任務(wù):

(1)

式中,succ(ti)表示任務(wù)ti的直接后繼子任務(wù)集合。然后,根據(jù)任務(wù)分級,將所有擁有相同分級的任務(wù)組成任務(wù)分級集合(Task Level Sets,TLS),則:

TLS(l)={ti|NL(ti)=l}

(2)

式中,l表示分級數(shù),且l∈[1,…,NL(tentry)]。

2.2 預(yù)算分割

基于工作流的分級結(jié)果,預(yù)算分割的目標(biāo)是將用戶定義的工作流預(yù)算在不同分級任務(wù)進(jìn)行子劃分。本文設(shè)計(jì)了以下6種預(yù)算分割算法:

(1) 隨機(jī)分割算法Random。預(yù)算隨機(jī)分配于工作流的不同分級上。

(2) 平均分割算法Uniform。每個(gè)工作流分級得到用戶預(yù)算的1/L,其中,L表示工作流總分級數(shù)。

(3) 高度正比例分割算法Height。每個(gè)工作流分級得到的預(yù)算分割正比于工作流分級與入口節(jié)點(diǎn)的距離,則該距離越小,預(yù)算分割越小。

(4) 寬度正比例分割算法Width。每個(gè)工作流分級得到的預(yù)算分割正比于該分級中任務(wù)的數(shù)量。

(5) 區(qū)域正比例分割算法Area。聯(lián)合Width算法和Height算法設(shè)置每個(gè)分級的預(yù)算分割。

(6) 全進(jìn)分割算法All in。將用戶預(yù)算全部分配至入口任務(wù),然后將剩余預(yù)算依次傳遞至下一分級。該算法可視為Height算法的精煉算法。

以下通過一個(gè)算例說明以上6種算法所描述的預(yù)算在不同分級間的分割方法。Random算法是隨機(jī)產(chǎn)生預(yù)算分割,因此不作額外說明。圖1所示是一個(gè)擁有10個(gè)任務(wù)的工作流結(jié)構(gòu),圖中左側(cè)一欄是通過式(1)計(jì)算得到的工作流分級值,右側(cè)一欄是從出口任務(wù)開始對每一級任務(wù)的標(biāo)記。該工作流中,最大分級Nmax=5。同時(shí),設(shè)置用戶預(yù)算Budget=165。

圖1 工作流示例

每種算法得到的預(yù)算分割如下所示(表2給出預(yù)算分割的完整情況):

Uniform算法由于工作流共有5個(gè)分級,故每個(gè)分級獲得165/5的預(yù)算分割。

Height算法每個(gè)分級分配一個(gè)相對于工作流分級的預(yù)算加權(quán)值,表示為:

預(yù)算因子(Budget Factor,BF)為:

例如:level 4包括任務(wù)B和C,則所分配的預(yù)算為

表2 算法的預(yù)算分割情況

4×BF=4×11=44。

Width算法每個(gè)分級得到的預(yù)算分割取決于對應(yīng)分級中的任務(wù)數(shù)量,此時(shí)的預(yù)算因子為:

例如:level 4包括兩個(gè)任務(wù),則所分配的預(yù)算為2×BF=2×16.5=33。

Area算法該算法的預(yù)算分割為Height和Width算法的聯(lián)合,計(jì)算為:

預(yù)算因子BF為:

然后,預(yù)算根據(jù)圖1中右欄中的數(shù)值之和進(jìn)行分割。例如:level 3的預(yù)算分割為(4+5+6+7)×BF=22×3=66。

Allin算法總預(yù)算分配至level 5。調(diào)度該分級上的所有任務(wù)后,剩余預(yù)算傳遞至下一分級中。

2.3 任務(wù)選擇

由于任務(wù)的分級特征,這表明只有前一分級中的所有任務(wù)調(diào)度之后,該任務(wù)才能開始執(zhí)行。而同一分級中的任務(wù)間不存在依賴性,因此,均可以準(zhǔn)備執(zhí)行,置入就緒任務(wù)隊(duì)列中。為了從中選擇調(diào)度任務(wù),需要為就緒隊(duì)列中的任務(wù)分配優(yōu)先級。本文設(shè)計(jì)一種基于最早開始時(shí)間(Earliest Start Time,EST)的優(yōu)先級任務(wù)選擇算法。

如圖2所示的工作流示例,邊上的數(shù)值表示任務(wù)間的數(shù)據(jù)傳輸時(shí)間。根據(jù)任務(wù)A、B、C的執(zhí)行,所有子任務(wù)置入就緒隊(duì)列中。由于任務(wù)A和C在相同實(shí)例上執(zhí)行,兩個(gè)任務(wù)間的數(shù)據(jù)傳輸時(shí)間為0。而任務(wù)B必須等待接收其父任務(wù)的數(shù)據(jù)才能開始。任務(wù)D可以分別在時(shí)間13和9時(shí)在實(shí)例p0和p1上開始執(zhí)行。

(a) 工作流示例(b) 調(diào)度圖

任務(wù)E在實(shí)例p0上的最早開始時(shí)間為13,在實(shí)例p1上為14。因此,任務(wù)D賦予更高優(yōu)先級。

任務(wù)ti在執(zhí)行時(shí)間最短的實(shí)例上的最早開始時(shí)間(EST)定義為:

EST(ti)=

(3)

式中:wtj為任務(wù)tj在最快實(shí)例上的執(zhí)行時(shí)間,pred(ti)為任務(wù)ti的父任務(wù)集合,Ci,j為任務(wù)ti與tj間的傳輸數(shù)據(jù)的通信時(shí)間。

任務(wù)選擇從入口任務(wù)tentry所在的分級開始執(zhí)行,第一分級執(zhí)行之后,下一分級中的所有任務(wù)被置入待調(diào)度的就緒隊(duì)列中。

2.4 實(shí)例選擇

BDWTS的目標(biāo)是在滿足用戶截止時(shí)間的同時(shí)最小化工作流執(zhí)行時(shí)間。每一分級獲得的預(yù)算分割為該分級上任務(wù)所能花費(fèi)的最大預(yù)算。為了選擇執(zhí)行任務(wù)的最優(yōu)目標(biāo)實(shí)例,算法通過以下公式計(jì)算每個(gè)任務(wù)在各個(gè)實(shí)例上的執(zhí)行代價(jià)Cost集和執(zhí)行時(shí)間Time集:

(4)

(5)

式中:subBudget為該分級的預(yù)算分割;Ci為當(dāng)前任務(wù)ti調(diào)度至實(shí)例pj上的代價(jià);Cbest為所有實(shí)例中執(zhí)行當(dāng)前任務(wù)的最小代價(jià);ECT(ti,pj)為當(dāng)前任務(wù)ti在實(shí)例pj上的執(zhí)行時(shí)間;ECT(max)和ECT(min)分別為在所有實(shí)例上執(zhí)行當(dāng)前任務(wù)的最大和最小時(shí)間。

為了尋找最優(yōu)實(shí)例,利用時(shí)間/代價(jià)均衡因子TCTF(Time Cost Trade-off Factor)進(jìn)行度量,則

(6)

3 仿真實(shí)驗(yàn)

3.1 實(shí)驗(yàn)配置

利用CloudSim[10-11]對算法進(jìn)行仿真分析,云環(huán)境配置為一個(gè)數(shù)據(jù)中心,6種不同實(shí)例類型,具體配置見表1所示。實(shí)例帶寬固定設(shè)置為20 MB/s,EC2的處理能力以每秒百萬浮點(diǎn)操作數(shù)(Million Floating Point Operations Per Second,MFLOPS)度量[12-13]。

為了評估BDWTS算法中預(yù)算分割策略對性能的影響,設(shè)置不同的預(yù)算范圍,調(diào)度工作流的最小可能預(yù)算通過下式計(jì)算:

Lowsetcost=∑?ti∈GCosttipj

(7)

式中,pj為價(jià)格最低的實(shí)例。通過將所有任務(wù)調(diào)度至最低代價(jià)的實(shí)例上執(zhí)行即可獲得該值。該方式可以得到執(zhí)行代價(jià)最低的調(diào)度方式。利用該最低代價(jià),可以計(jì)算最小預(yù)算為:

budget=α×Lowsetcost, 1<α<10

(8)

設(shè)置工作流任務(wù)數(shù)量為1 000,利用Pegasus工作流產(chǎn)生器[14]創(chuàng)建與科學(xué)工作流LIGO相似的合成工作流結(jié)構(gòu)[15]作為測試數(shù)據(jù)源,其結(jié)構(gòu)如圖3所示。

圖3 LIGO工作流結(jié)構(gòu)圖

3.2 結(jié)果分析

對于擁有1 000個(gè)任務(wù)LIGO工作流,每一分級中的任務(wù)數(shù)量、預(yù)算分割與剩余預(yù)算如表3所示。例如:利用Height算法調(diào)度第一分級中的所有任務(wù)后,剩余預(yù)算0.15被增加至下一分級的預(yù)算中,導(dǎo)致該分級預(yù)算為1.69。表最后一行表示每種策略的執(zhí)行時(shí)間。

表4為不同預(yù)算分割策略的實(shí)例使用數(shù)量情況。可以看出,All in算法分配了更小數(shù)量的高性能實(shí)例,降低了數(shù)據(jù)傳輸代價(jià),得到了最少的執(zhí)行時(shí)間(見表3)。對于用戶而言,更傾向于尋找滿足預(yù)算且執(zhí)行時(shí)間更少的調(diào)度方案,而對于資源提供方而言,更傾向于最大化資源利用率。盡管不同的預(yù)算分割方法下的BDWTS算法均可以得到可行解,但所使用的實(shí)例類型和數(shù)量是各不相同的。開啟更多實(shí)例并不一定會帶來更低的執(zhí)行時(shí)間,相反,會導(dǎo)致更高的調(diào)度開銷和低利用率。因此,預(yù)算分割策略對資源利用率是有直接影響的。

表3 算法的預(yù)算分割情況

表4 不同預(yù)算分割策略的實(shí)例使用情況

圖4給出了LIGO工作流的執(zhí)行時(shí)間。可以看出,All in策略在兩種性能指標(biāo)均優(yōu)于其他算法,而Random策略則是性能最差的。圖5是本文算法與BHEFT算法在代價(jià)上的比較結(jié)果,此時(shí)BDWTS的預(yù)算分割采取All in策略,顯然,通過不同分級上的預(yù)算分割的BDWTS獲得了更低的代價(jià)。

圖4 執(zhí)行時(shí)間

圖5 執(zhí)行代價(jià)

4 結(jié) 語

為了解決云環(huán)境中科學(xué)工作流的調(diào)度優(yōu)化問題,提出一種工作流均衡調(diào)度算法。算法集中于解決工作流預(yù)算約束下的代價(jià)與時(shí)間優(yōu)化問題,算法通過將尋找最優(yōu)調(diào)度方案劃分為工作流分級、預(yù)算分割、任務(wù)選擇和實(shí)例選擇4個(gè)階段,實(shí)現(xiàn)了預(yù)算約束下的時(shí)間與代價(jià)均衡調(diào)度。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明了算法的有效性。

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