摘要:本文通過綜述當歸分子的基因組DNA提取方法及其檢測方法以及其分子鑒定的方法,提供給大家有效提取當歸基因組DNA分子的一些改進思路,有望為當歸分子基因組DNA提取的方法及其分子鑒定方法的完善提供一些理論依據。
關鍵詞:當歸;DNA分子;分子鑒定
1.取樣
當歸作為重要的中草藥成分,經過加工,加入到藥品中,不同相態的藥品中的當歸成分取樣方法各不相同,基因組DNA不同的提取方法也不同。傳統的十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法現在多以這些方式對不同相態中的藥品進行取樣:藥片、散劑和藥丸,稱量后用研磨法取樣;膠囊類藥品脫去外殼后,直接稱量即可;液體藥劑直接用移液槍抽取合適的量即可。
2.DNA分子提取
DNA分子的提取方法較多:十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法,十二烷基磺酸鈉(SDS)法以及磁珠法等,這三種提取方法在中草藥成分的基因組DNA提取中都比較常用。其中CTAB法為經典的DNA提取方法,許多物種的DNA都可以用它來提取,且經濟易得,但其在當歸DNA分子提取中一直難以應用。
最近幾年,當歸基因組DNA分子的提取一直是一個研究熱點,有研究者將中草藥中提取DNA的方法在當歸基因組DNA分子提取中都做了實驗,尤其是對傳統CTAB法進行了深入的研究,研究結果顯示:單一的使用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法提取藥品中當歸基因組DNA分子的方法不可取,提取雜質多甚至于難以提出,但先用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法提取藥品中當歸基因組DNA分子,然后再用試劑盒進行后續提純處理,會大大提高實驗的完成度和準確性,遠勝于其他一些提取藥物中當歸基因組DNA分子的提取方法。
3.DNA分子檢測
3.1設計引物
根據目標基因片段的堿基序列按引物設計的一般原則設計引物,引物設計的好壞直接關系到PCR擴增的結果。
3.2PCR擴增
PCR技術是現代分子生物學的常用的技術,是在體外模擬基因序列擴增的技術,可實現基因組序列短期內的快速擴增,放大特定的基因序列,便于檢測。這項技術大致可分為三個部分:高溫變性,使目的基因的雙鏈在95°C高溫下被打開;低溫退火,使引物與單鏈按照堿基互補配對選擇進行結合,一般需要自己進行溫度梯度,尋找合適的退火溫度,通常退火溫度在60°C左右;適溫延伸,在DNA聚合酶的最適溫度72°C下,DNA聚合酶可以沿著磷酸到五碳糖(5-3)的方向合成互補鏈,最終完成目的基因序列的擴增。
3.3瓊脂糖凝膠電泳與紫外分光光度計測量法
瓊脂糖凝膠電泳技術是檢測DNA完整性和濃度比較好的一項技術,可以通過與PCR技術的結合,完成多種檢測任務,比如:目的基因的鑒定。該方法采用瓊脂糖凝膠作為介質,提供以堿性緩沖液環境來檢測大分子量的核酸,可以用大一點的點樣孔進行電泳檢測。電泳完成后有后續實驗需要可進行目的條帶的切膠回收。同樣,紫外分光光度計也可以檢測微量基因組DNA的濃度,但對特異性DNA的檢測沒有瓊脂糖凝膠電泳效果好,兩者可以結合用于當歸基因組DNA的檢測。
4.當歸分子的鑒定研究
DNA條碼技術是中草藥成分鑒定最為普遍的一項技術,通過對提取的樣本基因組DNA中的線粒體細胞色素C氧化酶亞基1(CO1)基因序列進行PCR擴增,并與其數據庫進行對比分析,從而實現物種的快速、準確的鑒定與分離。這項技術同時涉及到了當歸基因組DNA的提取和其CO1基因序列的擴增,所以能很好的從藥物中提出當歸分子的基因組DNA和進行目的基因的擴增仍是基礎,包括檢測特異性條帶的瓊脂糖凝膠電泳技術。
除了可以快速鑒別與分離出物種的DNA條碼技術之外,有研究者提出,用葉綠體中的trnL-F序列也可以實現當歸的分子鑒定。當歸分子制成藥品的加工過程中,基因組DNA偶有損傷,而葉綠體基因組相對于核基因組來說容易保留,不易被破壞,其基因序列更易得到擴增,從而完成對當歸分子的鑒定。因此,我們可以鑒此思路,從線粒體和葉綠體的基因組中,尋找適合做當歸分子鑒定的基因序列,也就是在藥品加工過程中最不易被破壞的那部分基因序列,提高鑒定效率。
展望
當歸是重要的中草藥成分,在治療方面發揮著重要的作用。因此,從含有當歸成分的藥中成功檢測出當歸DNA分子顯得尤為重要。一方面要綜合現在分子生物學技術:PCR技術,瓊脂糖凝膠電泳技術等,保證DNA分子的完整性和成功鑒定;另一方面利用DNA條碼技術,實現當歸分子的特異性鑒定。本文綜述了當歸DNA分子提取及其分子鑒定中用到的一些技術,希望為藥物中當歸成分的有效鑒定提供一些理論依據。
基金項目:貴州省2017年度黔南州社會發展科技計劃項目“黔南地區當歸道地性相關的遺傳信息研究”(編號:黔南科合社字(2017)1號)
作者簡介:任永超(1989-),男,貴州都勻人,漢族,研究生,工程師,研究方向:生物化學與分子生物學。