根據學校中醫藥類專業為主體,醫、管、文、理、法等專業協調發展的原則,在保證中醫學、中藥學專業主體地位的基礎上,根據社會發展需要,積極發展與中醫藥事業發展及健康產業密切相關的其他專業,使學校專業結構更加科學合理。學校現設有中醫學、中藥學、中藥制藥、藥學、針灸推拿學、康復治療學、公共事業管理、藥事管理、信息管理與信息系統、護理學、英語、法學12個本科專業,涵蓋醫學、理學、文學、管理學、法學5大學科門類。
1988年,在只有中醫學專業五年制、不能滿足高層次人才培養需求的情況下,學校在專家研究論證基礎上,先后3次提請設置七年制;1991年,經國家教委批準,正式舉辦中醫學專業七年制,首批招生20人,開始探索中醫拔尖人才內涵與培養模式,并不斷豐富完善;在總結20年拔尖人才培養的基礎上,順應時代需求,2011年,首創中醫學專業9年制(岐黃國醫班),攀教改高峰;2012年,率先開辦中醫學“5+3”一體化,為國家奏響醫教協同序曲。在長期的辦學實踐中,學校凝練總結了一系列教育教學思想。首創中醫“院校—師承—家傳”教育相結合模式,最早提出“早臨床、多臨床、反復臨床”中醫臨床教學理念,提出并實施“厚基礎、寬口徑”的人才培養方式,提出并踐行“讀經典、做臨床、跟名師、悟妙道”的中醫人才成長模式,建立健全“五維一體,一以貫通,多途徑培養”的中醫拔尖創新人才培養模式。