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球孢白僵菌基因組候選效應子的預測與分析

2019-04-18 09:12:34董章勇林進添林桂文
核農學報 2019年4期
關鍵詞:效應分析

羅 梅 董章勇,* 林進添 林桂文

(仲愷農業工程學院農業與生物學院,廣東 廣州 510225)

球孢白僵菌(Beauveriabassiana)是一種廣泛應用的生防菌,據報道已有超過700個物種是其適合的寄主[1-3]。目前我國主要利用球孢白僵菌對馬尾松毛蟲(DendrolimuspunctatusWalker)、玉米螟(Ostriniafurnacalis)等林業及大田害蟲進行防治[4-8]。盡管球孢白僵菌應用廣泛,但生產上仍存在球孢白僵菌防治效果慢、不同菌株胞外水解酶的種類和表達水平的差異、易受環境影響等缺點[3-4]。因此,研究球孢白僵菌的致病機理有助于進一步挖掘其應用潛能。

效應子(effector)也稱效應因子或效應蛋白,廣義上是指能夠選擇性地結合其他目標蛋白及調節其生物活性的一類小分子蛋白[9-11]。隨著對植物病原菌的深入研究,效應子已經成為研究病原菌與寄主互作的重要內容[9-12]。根據病原菌效應分子保守基序(motif)的特點,大部分效應分子都屬于分泌蛋白[13]。諸多研究者綜合已有的效應子的特征總結出以下具體分析指標[14-16]:含有N-端信號肽;無跨膜結構域;無糖基磷脂酰肌醇錨定位點;沒有將蛋白輸送至線粒體或其他胞內細胞器的預測定位信號;氨基酸殘基數量大約為50~300個氨基酸;富含半胱氨酸;序列具有高度特異性。隨著生物信息學和基因組學的快速發展,也有研究者應用生物信息學軟件的方法對效應子的結果進行了預測[17-26]。通過高通量的方法篩選,雖然可能會遺漏部分效應子,但可以極大地縮小研究范圍。如Dong等[27]對球孢白僵菌激活埃及伊蚊(Aedesaegypti)的Toll和JAK-STAT信號通路以調制效應蛋白和抵抗登革熱;……

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