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生命是物理學(xué)嗎?
——物理學(xué)家尋找描述所有生命體的統(tǒng)一方程

2019-04-29 07:59:46編譯蔡立英
世界科學(xué) 2019年4期
關(guān)鍵詞:生物理論系統(tǒng)

編譯 蔡立英

物理學(xué)家正在尋找一種“生命理論”,來解釋生命為什么可以存在。

生物體兼具復(fù)雜性和有序性,正如上圖這個植物莖的切片。科研人員希望最終發(fā)展出能夠描述所有生命的基本方程

關(guān)于生命,一切都不簡單。每秒鐘,一個細(xì)胞能發(fā)生數(shù)百萬次有序的化學(xué)反應(yīng);數(shù)十億個單細(xì)胞生物會形成群落;數(shù)萬億個細(xì)胞可以精確地黏附在一起,形成組織和器官。盡管生命如此復(fù)雜,卻很容易識別。物理學(xué)家認(rèn)為,這種可識別性可能源自構(gòu)成所有生命基礎(chǔ)的基本物理學(xué)原理。而他們正在尋找一種基于這些物理學(xué)原理的數(shù)學(xué)理論,以期解釋為什么生命可以存在,以及生命的運作機(jī)理。他們認(rèn)為,這樣一種理論可以讓科研人員以目前不可能的方式,控制和操縱生命系統(tǒng)。

物理學(xué)家熱衷統(tǒng)一理論。這些統(tǒng)一理論把復(fù)雜現(xiàn)象歸結(jié)為一組概念,能利用數(shù)學(xué)公式進(jìn)行非常成功的預(yù)測。例如,熱力學(xué)定律是解釋小到原子、大到颶風(fēng)的各種不同尺度的系統(tǒng)中,能量如何轉(zhuǎn)移的理論,能夠精確預(yù)測一壺水煮沸需要多長時間。盡管取得了這樣的成功,科研人員尚未找到通用方程,可以描述與生命相關(guān)的日常現(xiàn)象。這樣的通用方程能夠提供和其他統(tǒng)一理論相同的預(yù)測能力,使科研人員能夠精確地控制生物,從而能夠為細(xì)菌感染提供更好的治療方案,改進(jìn)癌癥療法,并提供防止植物對除草劑產(chǎn)生耐藥性的方法等。

德國馬克斯·普朗克動力學(xué)與自組織研究所所長拉明·戈爾斯塔尼安(Ramin Golestanian)說:“物理學(xué)家研究了很多復(fù)雜系統(tǒng),但是在復(fù)雜性和自由度的數(shù)量方面,生命系統(tǒng)屬于一個完全不同的類別。”

戈爾斯塔尼安研究生命系統(tǒng),比如細(xì)菌群,通過建模,使其成為移動的耗能粒子群,即所謂的“活性物質(zhì)”。他還幫助組織了2018年美國物理學(xué)會“生命體的物理學(xué)”(Physics of Living Matter)會議。科研人員在這個會上討論了找到生命的數(shù)學(xué)理論是否有可能;如果可以實現(xiàn),這樣一個理論應(yīng)該回答哪些問題。

對于這個研究領(lǐng)域的一些科學(xué)家而言,找到一個理論是從顛覆生物學(xué)家對生命系統(tǒng)的描述開始的。美國伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校物理學(xué)家奈杰爾·戈登費爾德(Nigel Goldenfeld)研究演化和生態(tài)學(xué)的相關(guān)問題,他說:“當(dāng)我參加生物學(xué)會議時,總會聽到有人說‘生命是化學(xué)’,然后展示一串假定的化學(xué)反應(yīng),但我并不認(rèn)為生命就是化學(xué)。”例如,化學(xué)提供了創(chuàng)造生命所需分子的信息,但是并沒有提供如何獲得一個正常運作的細(xì)胞的信息。反而,他覺得“生命是物理學(xué)”,科研人員應(yīng)該把生物視為受到熱力學(xué)約束的凝聚態(tài)物質(zhì)系統(tǒng)。

戈爾斯塔尼安和戈登費爾德都認(rèn)為,生命的一些特征,比如復(fù)制、演化、需要能量來運動,都是凝聚態(tài)物理學(xué)家所說的“涌現(xiàn)現(xiàn)象”的例子。涌現(xiàn)現(xiàn)象是指,由大量簡單組分發(fā)生相互作用而產(chǎn)生的復(fù)雜特性。例如,超導(dǎo)電性是一種宏觀的特性,是由金屬中的電子之間相吸作用而產(chǎn)生,從而達(dá)到電阻為零的狀態(tài)。至于生命,涌現(xiàn)行為產(chǎn)生于分子間的相互作用,以及分子如何組合在一起形成結(jié)構(gòu)或發(fā)揮功能。

角馬成群結(jié)隊地遷徙,穿過肯尼亞馬賽馬拉大草原。科研人員使用活性物質(zhì)模型來模擬這種行為,這種模型還可以描述從鳥群到細(xì)菌群等生物群體的行為

果蠅的視覺器官由750多只單眼組成。美國普林斯頓大學(xué)理論物理學(xué)家威廉·比亞萊克已經(jīng)證明,果蠅的這些眼睛協(xié)同工作,創(chuàng)造出一種視覺系統(tǒng),能進(jìn)行精度極高的計算

科研人員希望“生命理論”有助于研發(fā)出防止有害植物對除草劑產(chǎn)生耐藥性的方法

但是,生命的運作方式與金屬或超導(dǎo)體這些常規(guī)的凝聚態(tài)物質(zhì)截然不同,后者是“死的”,其行為是預(yù)先決定的。活的生物對于相同的刺激,可以用看似完全不同的方式做出反應(yīng)。戈登費爾德說:“生物系統(tǒng)具有這種反饋回路,使得我們很難運用標(biāo)準(zhǔn)的微分方程對其進(jìn)行分析。”他表示,他還不知道如何解決這個問題。

美國加州大學(xué)圣巴巴拉分校克里斯蒂娜·馬爾凱蒂(Cristina Marchetti)也贊同戈登費爾德的觀點。馬爾凱蒂和戈爾斯塔尼安一樣,通過建模來研究生命體。馬爾凱蒂說:“生命系統(tǒng)會因為與其他系統(tǒng)發(fā)生相互作用或信息交換而演化、適應(yīng)和改變。”但是,目前她和其他人為描述特定生物系統(tǒng)的行為(比如,細(xì)菌群的運動或是腫瘤細(xì)胞的聚簇)發(fā)展出來的理論還缺少對上述基本過程的闡釋。馬爾凱蒂說:“解釋生命系統(tǒng)演化狀態(tài)的理論研究實際上還處于起步階段。”

發(fā)展出一個解釋生命為何能存在的普遍理論的另一個挑戰(zhàn)在于極少人研究這個問題。戈登費爾德表示,大多數(shù)研究生命內(nèi)部運作的生物學(xué)家和物理學(xué)家,都聚焦于針對某些生物的一些特定過程(比如,某個特定種屬的果蠅的視覺工作機(jī)理)進(jìn)行建模,而不關(guān)心更廣范圍的研究圖景。

美國普林斯頓大學(xué)理論物理學(xué)家威廉·比亞萊克(William Bialek)同意這一觀點,卻也看到研究特定生物的積極一面。他指出,理論物理學(xué)家如果“脫離對細(xì)節(jié)的研究”,可能會在理論探索的道路上失敗。

比亞萊克說:“我們探索這個領(lǐng)域的根本在于——找到探索普遍的理論和參與特定系統(tǒng)的實驗細(xì)節(jié)研究之間的平衡點。”戈爾斯塔尼安認(rèn)同此觀點,并補(bǔ)充說,任何致力于構(gòu)建一個具有普遍性的生命理論的人,將“必須培養(yǎng)研究一系列現(xiàn)象的欲望和能力,對各種現(xiàn)象分門別類,進(jìn)而尋找并發(fā)展出一種全面描述的模式。”

美國埃默里大學(xué)伊利亞·內(nèi)門曼(Ilya Nemenman)是采取這種研究方法的一位物理學(xué)家。他研究從蠕蟲到鳥類的各種生物如何處理周圍環(huán)境信息,旨在找到規(guī)律并推導(dǎo)出適用于多個系統(tǒng)的通用方程。內(nèi)門曼說:“發(fā)展出生物系統(tǒng)的統(tǒng)一理論的最大障礙之一,是確定哪些參量是重要的,哪些參量無關(guān)緊要。”

在傳統(tǒng)的凝聚態(tài)物理中,系統(tǒng)的對稱性(是指坐標(biāo)系變換后保持不變的參量)決定了關(guān)鍵的參量。比如,在晶體中,對稱性是指原子的有序排列模式,如果把坐標(biāo)軸從一個晶胞移動到另一個晶胞,一切看起來完全一樣。但是,在生物系統(tǒng)中,這種對稱性是不存在的,或者至少目前看不出來,這就給寫出正確方程的過程又增加了額外的復(fù)雜性。內(nèi)門曼認(rèn)為,機(jī)器學(xué)習(xí)可能有助于實現(xiàn)這一目標(biāo),他的研究團(tuán)隊最近利用機(jī)器學(xué)習(xí)這一工具,揭示了描述蠕蟲如何對熱量做出反應(yīng)的方程。

既然幾個世紀(jì)以來,生物學(xué)領(lǐng)域一直沒有這樣一個統(tǒng)一理論也發(fā)展得很快,為什么還要致力于尋找這樣一個統(tǒng)一理論呢?對戈登費爾德而言,支撐他探索的驅(qū)動力是因為統(tǒng)一理論具有潛在的預(yù)測能力,以及它可以對生物系統(tǒng)的行為進(jìn)行控制,例如治療細(xì)菌感染。現(xiàn)有的治療方案并沒有合理解釋,當(dāng)抗生素殺死一些不想要的細(xì)菌時,它們卻發(fā)生演化并存活下來,進(jìn)而成為耐抗生素的超級細(xì)菌,如耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)。戈登費爾德說:“如果我們知道如何控制一個活的、不斷演化的系統(tǒng),那么,我們就能找到既能殺死所有細(xì)菌又不會使問題惡化的治療方案。”不過戈爾斯塔尼安指出:“在現(xiàn)階段作具體的預(yù)測顯然還為時過早,但我絕對相信,人類如果掌握這種統(tǒng)一理論,將會大有裨益。”

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