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制造前所未有的生命

2019-08-16 02:15:40岑夫子

岑夫子

地球上的生命可謂一個(gè)奇跡。

可是,什么是制造這個(gè)奇跡必不可少的呢?隨著人們對(duì)生命一步步地深入認(rèn)識(shí),原先認(rèn)為必不可少的東西(比如說蛋白質(zhì))都被一一拋棄了,最后只剩下一樣?xùn)|西——DNA。生物學(xué)家發(fā)現(xiàn),所有的細(xì)胞生命都離不開DNA。

但現(xiàn)在他們又發(fā)現(xiàn),連DNA也不是生命所必需的。

天然的DNA有哪些特征?

細(xì)胞生命的最重要特征之一是遺傳,遺傳是通過DNA上的基因復(fù)制來實(shí)現(xiàn)的。這些基因不僅告訴我們的身體該怎么長(zhǎng),還把父母親的特征傳給我們。DNA被稱為“生命密碼”就是這個(gè)道理。每個(gè)人身上都有這樣一套“密碼”。

DNA的構(gòu)造是1953年由沃森和克里克破譯的。他們發(fā)現(xiàn),它由兩條以雙螺旋的形式互相纏繞的脫氧核苷酸長(zhǎng)鏈組成,中間通過一對(duì)對(duì)堿基相連。如果把DNA看成一架雙螺旋狀的梯子,兩條長(zhǎng)鏈就相當(dāng)于兩邊的扶欄,而堿基對(duì)相當(dāng)于中間踏腳的橫木。每條“橫木”都由兩個(gè)堿基組成,每邊各出一個(gè),堿基之間則通過氫鍵(一種分子間作用力)相連。

堿基有4種類型,它們只能以特定的方式配對(duì):腺嘌呤(A)配胸腺嘧啶(T),鳥嘌呤(G)配胞嘧啶(C)。堿基的序列就編碼著我們基因中的信息。

這些堿基的大小還不一樣,嘌呤要比嘧啶大,所以每對(duì)堿基事實(shí)上是以大對(duì)小,或小對(duì)大的方式配對(duì)的。

這一切構(gòu)成了我們對(duì)DNA的基本認(rèn)識(shí)。自然界中存在的DNA都符合這些特征。

天然DNA的特征被一一打破

但是,近年來越來越多的研究表明,這些特征并不是DNA的遺傳功能所必需的,改變其中的一些特征,DNA照樣能工作。如果我們狹義地只把天然的DNA認(rèn)作DNA,那么修改后的DNA就不能算是真正的DNA了,我們完全可以給它取個(gè)另外的名字。

對(duì)DNA的第一個(gè)重要修改是擴(kuò)大了堿基的數(shù)量。2014年,一位美國(guó)生物學(xué)家制造了具有6種堿基的DNA:原始的4種堿基加上2種人工堿基。

后來,英國(guó)劍橋大學(xué)的一位分子生物學(xué)家又進(jìn)行了另一項(xiàng)嘗試。他保持堿基不變,但把DNA長(zhǎng)鏈上原先的脫氧核糖替換成其他分子,制造出“XNA”(DNA中的“D”代表的就是脫氧核糖)。他發(fā)現(xiàn),非天然的XNA也能行使遺傳物質(zhì)復(fù)制的功能。

最近,美國(guó)生物學(xué)家斯蒂芬·本納和他的同事又對(duì)DNA花樣翻新。他們用4個(gè)分子團(tuán)替代標(biāo)準(zhǔn)堿基,制造出一種人工DNA,因這些分子團(tuán)比堿基小,所以這個(gè)人工DNA比天然DNA要瘦;此后,他們?nèi)绶ㄅ谥疲昧?個(gè)大分子團(tuán),制造出另一種胖DNA。

不管瘦還是胖,它們都發(fā)揮了DNA的關(guān)鍵功能:如果兩個(gè)堿基配對(duì)不正確,錯(cuò)放的一個(gè)就會(huì)被迅速清除,并被正確的堿基取代。天然DNA就是這樣確保我們的基因不會(huì)被弄亂的,而修正版的DNA也能做到這一點(diǎn)。

更值得一提的是,這樣的人工DNA還打破了一項(xiàng)規(guī)則。我們前面提到,在天然DNA上,堿基是以“大對(duì)小”或“小對(duì)大”的方式配對(duì)的。但在瘦DNA上,配對(duì)方式是“小對(duì)小”;在胖DNA上,是“大對(duì)大”;而兩者都一樣能工作。

目前的人工DNA主要在非細(xì)胞生命環(huán)境中(比如病毒)工作,有個(gè)別是在細(xì)菌中工作。前面提到的有6種堿基的人工DNA,科學(xué)家將其植入大腸桿菌后,制造出152種自然界并不存在的氨基酸。做這種實(shí)驗(yàn),先要把細(xì)菌的天然DNA用人工DNA替換掉,但既然DNA都改變了,細(xì)菌當(dāng)然嚴(yán)格來說都不是原先的天然細(xì)菌,只能算人工細(xì)菌了。但這些人工細(xì)菌在實(shí)驗(yàn)室只要給予必要的資源,都能自我復(fù)制和繁衍。

還是大自然更勝一籌

既然這么多人工DNA也能工作,這就引出一個(gè)問題:DNA是生命進(jìn)化過程中大自然鬼斧神工的杰作,還是只是眾多設(shè)計(jì)方案中再普通不過的一種呢?

最初,科學(xué)家對(duì)天然DNA很不以為然,認(rèn)為它的設(shè)計(jì)很多地方顯得十分“笨拙”。以那兩條脫氧核苷酸長(zhǎng)鏈為例,它們富含負(fù)電荷,這是多么愚蠢的一項(xiàng)設(shè)計(jì)。我們知道負(fù)電荷之間會(huì)互相排斥,所以兩條DNA鏈很難聚集在一起形成雙螺旋結(jié)構(gòu),于是才有了堿基配對(duì)這種方式,幫助DNA鏈形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。

再有,配對(duì)堿基之間是通過氫鍵結(jié)合在一起的,但是氫鍵的結(jié)合力是非常弱的,很容易被水分子破壞,可細(xì)胞里含量最豐富的恰恰就是水。如果換作你,你會(huì)放心用這么脆弱的一種方式將重要的遺傳信息遺傳下去嗎?

但當(dāng)科學(xué)家們自己去設(shè)計(jì)人造DNA的時(shí)候,通過一次次失敗,他們才參悟到,天然DNA的這些“缺陷”恰恰是它的獨(dú)到之處。還是以帶負(fù)電荷的兩條長(zhǎng)鏈為例,當(dāng)科學(xué)家用電中性的分子替代之后,他們發(fā)現(xiàn)這樣的長(zhǎng)鏈根本伸展不開,稍長(zhǎng)一點(diǎn)就擰在一起。所以,大自然在DNA鏈中設(shè)置這些負(fù)電荷,讓兩條長(zhǎng)鏈相斥,可能就是為了讓DNA長(zhǎng)鏈保持一種伸展的狀態(tài)。

之后的研究又發(fā)現(xiàn),連接兩個(gè)堿基的氫鍵雖然很弱,容易被水分子破壞,但也因此比較容易拆下來替換。這提高了DNA自身的修復(fù)能力。

此外,盡管科學(xué)家已經(jīng)研制出這么多能工作的人工DNA,但它們?cè)诿看螐?fù)制中,保真率(即正確復(fù)制的概率)還是不如天然DNA。人類目前能夠達(dá)到的最好成績(jī),卻是大自然的最差表現(xiàn)。尤其是一些人工堿基,在復(fù)制中很容易被天然堿基替換掉。看來,細(xì)胞生命雖然也被迫接受了人工的東西,但似乎還得不到它們的真正認(rèn)可。

現(xiàn)在,科學(xué)家也已經(jīng)意識(shí)到,不能把這些人工的東西塞進(jìn)細(xì)胞就算完事了,如何讓細(xì)胞接納這些人工堿基才是今后工作的重頭戲。

DNA并不是生命所必需的

不過,我們也要看到,雖然人工DNA目前還存在種種令人不滿意之處,但通過不斷改進(jìn),也許有一天會(huì)工作得跟天然DNA一樣出色。如果真做到了這一點(diǎn),也就證明了一點(diǎn):DNA(特指天然的DNA)并不是生命所必需的。

科學(xué)家對(duì)此似乎很有信心。比如,為什么天然DNA上只有4種堿基?為什么不是6種或10種?他們說:我們的生命祖先可能由于條件的限制(比如化學(xué)原料缺乏等),只簡(jiǎn)單地設(shè)計(jì)出了4種堿基。一旦生命體擁有了足夠使用的堿基,它們就不再需要新的堿基了。我們只能承認(rèn)這是“歷史的選擇”,但絕不是唯一可能的選擇。大自然以它自己的方式設(shè)計(jì)了生命,但是肯定還有其他的途徑也能夠達(dá)到同樣的目的。

這個(gè)觀點(diǎn)對(duì)于尋找外星生命是很有啟發(fā)意義的。我們現(xiàn)在在外星球?qū)ふ业亩际俏⑸镏惖脑忌@些東西肉眼不可見,只能通過儀器來分析。但我們的儀器設(shè)計(jì)起來是用來發(fā)現(xiàn)類似地球上的天然DNA的。萬一外星生命的DNA跟我們不一樣,我們可能就錯(cuò)過了。

可是,我們憑什么認(rèn)為它們的DNA跟我們的一樣呢?考慮到我們的DNA是地球歷史環(huán)境的產(chǎn)物,那外星生命會(huì)使用和我們一樣的堿基嗎?難道類型也只限于4種,而不是2種或6種?我們實(shí)在不敢打這樣的包票。在這情況下,我們尋找外星生命就不應(yīng)該限于尋找天然DNA,還應(yīng)該再找找其他形式的遺傳分子。

另外,人工DNA的出現(xiàn),意味我們又多了一種制造自然界不存在的生命的辦法。

在此我們不妨回憶一下:從零開始創(chuàng)造生命,最早是由美國(guó)著名遺傳學(xué)家克雷格·文特爾于2010年取得突破的。他和他的團(tuán)隊(duì)在實(shí)驗(yàn)室參照一種細(xì)菌的天然DNA,利用化學(xué)物質(zhì),像玩積木一樣一個(gè)堿基一個(gè)堿基地拼湊出整條相同的DNA。然后把這條人工DNA植入被挖掉細(xì)胞核的單細(xì)胞生物里,讓它復(fù)制、繁衍。這是第一個(gè)人造生命。但這個(gè)人造DNA,除了是人造的,與天然DNA并沒有本質(zhì)區(qū)別。

但現(xiàn)在,堿基可以人為增加,甚至堿基和DNA長(zhǎng)鏈都可以用別的材料替代。這樣的人造生命可以說改造得更為徹底。甚至可以說,我們制造出了地球上前所未有的生命!

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