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水環境下羥自由基致布洛芬分子損傷的機理

2019-10-14 05:07:22姜春旭王佐成高峰佟華楊曉翠叢建民

姜春旭,王佐成,高峰,佟華,楊曉翠,叢建民

(1. 白城師范學院理論計算中心,吉林 白城137000;2. 白城師范學院傳媒學院,吉林 白城 137000;3. 白城師范學院物理學院,吉林 白城 137000;4. 白城師范學院生命科學學院,吉林 白城 137000)

布洛芬(IBU)具有抗炎、止痛和解熱等作用,可治療強直性脊椎炎、風濕性關節炎等疾病[1-2]。由于IBU的重要應用,人們對其進行了廣泛的研究。代衛國等[3]的研究表明,布洛芬對映體在人工光電催化劑表面可以手性識別。郭慧卿等[4]的研究表明,布洛芬的熱分解可通過脫水、C—C鍵斷裂和分子鍵斷裂三個過程實現。文獻[5-7]的研究表明,氣相IBU分子具有穩定性,水分子簇的催化可使IBU緩慢地消旋。文獻[8]研究表明,水與MOR分子篩的共催化也可使布洛芬緩慢地旋光異構。

生命體內有羥自由基存在,羥自由基具有較強的氧化能力,它可通過抽氫和加成反應等多種方式與多種分子作用,造成氨基酸、蛋白質和DNA等物質氧化性損傷[9]。文獻[10-11]的研究表明,羥自由基抽取α-H可致丙氨酸和纈氨酸損傷,文獻[12-13]的研究表明,羥自由基的進攻可使腺嘌呤和鳥嘌呤損傷。紫外線照射可導致空氣中的水電離產生自由基,這是否會導致暴露在外的布洛芬損傷失效?;颊咝膽B和情緒不佳、不健康飲食和手機輻射等多種因素都會導致體內產生自由基,自由基是否會導致布洛芬損傷,相關研究目前未見報道?;诖瞬⒖紤]到生命體內的水溶劑環境,本工作對水汽相及水液相環境下羥自由基抽取IBU分子的α-H和羥自由基與IBU分子苯環上的C加成反應機理進行了研究,說明了水汽相和水液相環境下羥自由基如何誘導布洛芬損傷,為安全儲存和較好地發揮IBU的療效給予理論指導。

1 研究與計算方法

用密度泛函的B3LYP[14]方法,采用6-31+G(d, p)基組對水汽環境下標題反應的駐點進行優化,通過對過渡態[15]進行IRC[16]計算來確認過渡態的可靠性。為獲得高水平的勢能面,用從頭算的MP2[17]方法,采用6-311++G(2df, pd)基組計算駐點的單點能。計算水溶劑化效應時,吉布斯自由能熱校正采用水汽環境下的數據,高水平的單點能采用自洽反應場理論的SMD模型[18]計算,用Gtotal=Gtc+ESP計算各駐點的總能(Gtc和ESP分別為吉布斯自由能熱校正和高水平的單點能)。IBU分子的構象1與羥自由基水分子簇通過氫鍵作用形成氫鍵絡合物,記作IBU_1·[(·OH)·H2O],羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的過渡態記作S-TS_1·(·OH)_C3,其余體系用相似的方法表示。文中計算均由Gaussian09[19]軟件包完成。

2 結果與討論

研究表明,羥自由基致S-IBU和R-IBU的損傷機理相同,本工作只對羥自由基致S-IBU的損傷進行討論。圖1是S-IBU分子的兩種穩定構象,以S-IBU_1的能量為勢能零點計算的S-IBU_2的相對能量是-0.71 kJ/mol ,S-IBU_1比S-IBU_2的穩定性微差。下面對羥自由基通過抽氫和加成方式致S-IBU_1和S-IBU_2的損傷分別進行討論。

圖1 兩種S型布洛芬分子的幾何構象Fig.1 Geometric conformation of two S-type ibuprofen molecules

2.1 羥自由基(水分子簇)抽氫致S-IBU的損傷

由于無論是水汽相還是水液相,羥自由基都可以獨自存或與水分子形成羥自由基水分子簇,因此羥自由基抽氫致S-IBU_1和S-IBU_2損傷都有羥自由基抽α-H和水分子輔助羥自由基抽α-H兩種機理,分別進行討論。

2.1.1 羥自由基(水分子簇)抽氫致S-IBU_1損傷S-IBU_1在羥自由基(水分子簇)作用下的損傷歷程,見圖2,反應勢能剖面見圖3(@water線為水溶劑化的勢能剖面)。

1)對于羥自由基抽α-H致S-IBU_1損傷。

首先,羥自由基34O—35H與S-IBU_1的α-氫32H和羰基氧30O通過氫鍵作用,形成絡合物S-IBU_1·(·OH)。然后,S-IBU_1·(·OH)經·OH抽α-氫的過渡態TS1_1·(·OH),形成IBU_1*·H2O。水分子是由32H與羥自由基形成,IBU_1*的C12失去了手性,是損傷的S-IBU_1。此基元反應是·OH抽取了α-碳上的氫原子32H與之形成水分子,IBU_1*電荷仍然為零。從S-IBU_1·(·OH)到TS1_1·(·OH)過程,鍵長12C-32H從0.109 3 nm拉伸到0.114 8 nm斷裂,拉伸幅度是0.005 5 nm;骨架二面角16C—12C—4C—17C從126.74°增加到130.20°。一個化學鍵很小的伸長和骨架很小的形變需要的能量不多,TS1_1·(·OH)產生的能壘只有40.30 kJ/mol 。TS1_1·(·OH)產生的能壘遠遠小于2個水分子簇催化的此基元反應的能壘152.5 kJ·mol-1[6],原因是·OH的氧化性比(H2O)2分子強。二面角3C—4C—5C—12C、16C—12C—4C—17C和12C—17C—30O—31O分別是178.59°、-177.72°和-179.00°,IBU_1*·H2O的苯環骨架碳原子、α-碳12C及羧基的骨架原子形成了共軛離域大π鍵,35H與羰基氧30O的距離是0.198 4 nm,IBU_1*分子與H2O分子形成了較強的分子間氫鍵,因此IBU_1*·H2O極其穩定,處在勢能面較低的位置。

從圖3可以看出,羥自由基抽α-H致S-IBU_1損傷的逆反應能壘是168.71 kJ/mol,此能壘太高,難以越過,此損傷過程不可逆,說明損傷產物IBU_1*難以修復。

從圖3還看出,S-IBU_1·(·OH)→TS1_1·(·OH)→IBU_1*·H2O反應在水溶劑環境下的能壘是39.00 kJ/mol ,說明水溶劑效應對·OH抽α-H致S-IBU_1損傷的反應基本沒有影響。IBU_1*·H2O相對于S-IBU_1·(·OH)的溶劑化能量有所降低,是因為IBU_1*·H2O的偶極矩是5.129 D,大于前者的偶極矩4.097 D,導致在極性溶劑水中IBU_1*·H2O構象相對更穩定。

計算表明,IBU_1*與紙面里的1個水分子形成的氫鍵絡合物,經α-碳12C抽取水分子的氫原子的過渡態,可以形成R-IBU_1。此基元反應相似于S-IBU_1·(·OH)→TS1_1·(·OH)→IBU_1*·H2O的逆過程,需要越過的能壘在160.00 kJ/mol 以上,因此,IBU_1*→R-IBU_1只是在理論上存在。

2)對于H2O輔助·OH抽α-H致S-IBU_1損傷。

首先,·OH和H2O與S-IBU_1的32H和30O通過氫鍵作用,形成絡合物S-IBU_1·[(·OH)·H2O]。然后,S-IBU_1·[(·OH)·H2O]經·OH抽α-H的過渡態TS1_1·[(·OH)·H2O],形成IBU_1*·2H2O(計算表明,這時的損傷布洛芬分子構象同于前面的IBU_1*,所以都用IBU_1*表示)。此基元反應是·OH抽取了α-C上的氫原子32H形成H2O,IBU_1*電荷數仍然為零。IBU_1*已經失去了手性,是損傷的S-IBU_1。從S-IBU_1·[(·OH)·H2O]到TS1_1·[(·OH)·H2O]過程,鍵長12C—32H從0.109 3 nm拉伸到0.116 4 nm斷裂,拉伸幅度是0.007 1 nm;反應活性中心骨架二面角16C—12C—4C—17C從126.26°增加到133.38°,一個化學鍵很小的伸長和骨架很小的形變需要的能量不多,TS1_1·[(·OH)·H2O]產生的能壘是34.68 kJ/mol 。TS1_1·[(·OH)·H2O]產生的能壘小于TS1_1·(·OH)產生的能壘,原因是它們的氫鍵角12C—32H—34O分別是176.92°和163.41°,因此,前者比后者氫鍵強,結構穩定。結構分析表明,相似于IBU_1*·1H2O,IBU_1*·2H2O的苯環上的碳原子、α-碳以及羧基的骨架原子也形成了共軛離域的大π鍵,38H與羰基氧30O的距離是0.188 3 nm、35H與36O的距離是0.189 1 nm、24H與34O的距離是0.294 2 nm,IBU_1*·2H2O形成了2個較強的和1個較弱的分子間氫鍵,因此IBU_1*·2H2O極其穩定。

從圖3可以看出,相似于羥自由基抽α-H致S-IBU_1損傷,水分子輔助羥自由基抽α-H致S-IBU_1損傷的逆反應能壘是163.88 kJ/mol ,難以逾越,此過程的損傷產物IBU_1*也難以修復。

從圖3還可以看出,S-IBU_1·[(·OH)·H2O]→TS1_1·[(·OH)·H2O]→IBU_1*·2H2O反應在水溶劑環境下的能壘是34.02 kJ/mol ,說明水溶劑效應對羥自由基水分子簇抽α-H致S-IBU_1損傷反應也基本沒有影響。IBU_1*·2H2O相對于S-IBU_1·[(·OH)·H2O]的溶劑化能量有所降低,是因為IBU_1*·2H2O的偶極矩是4.249 D,略大于前者的偶極矩3.938 D,導致在極性溶劑水中IBU_1*·2H2O構象相對更穩定。

計算表明,IBU_1*與紙面里的2個水分子形成的氫鍵絡合物,經α-碳12C抽取水分子的氫原子的過渡態,可以形成R-IBU_1。但需要越過的能壘在163.00 kJ/mol 以上,因此,S-IBU_1的消旋也只是在理論上存在。

圖2 羥自由基(水分子簇)抽α-氫致S-IBU_1損傷的反應歷程Fig.2 S-IBU_1 damage mechanism induced by α-H abstraction of hydroxyl radicals(water clusters)

圖3 羥自由基(水分子簇)抽α-氫致S-IBU_1損傷的反應勢能面Fig.3 Potential energy surfaces of S-IBU_1 damage induced by byα-H abstraction of hydroxyl radicals(water clusters)

從圖3可以看出,無論是在水汽相還是在水溶劑相,羥自由基水分子簇抽氫比只是羥自由基抽氫致S-IBU_1損傷都具有優勢。

2.1.2 羥自由基(水分子簇)抽氫致S-IBU_2損傷S-IBU_2在羥自由基(水分子簇)作用下的損傷歷程,見圖4,反應勢能剖面見圖5(@water線為水溶劑化的勢能剖面)。反應機理基本同于2.1節的S-IBU_2在羥自由基和水分子作用下的損傷,為節省篇幅,這里只做一般討論。

圖4 羥自由基(水分子簇)抽α-氫致S-IBU_2損傷的反應歷程Fig.4 S-IBU_2 damage mechanism induced by α-H abstraction of hydroxyl radicals(water clusters)

圖5 羥自由基(水分子簇)抽α-氫致S-IBU_2損傷的反應的勢能面Fig.5 Potential energy surfaces of S-IBU_2 damage induced by α-H abstraction of hydroxyl radicals(water clusters)

1)對于羥自由基抽α-H致S-IBU_2損傷。

S-IBU_2·(·OH)經·OH抽α-H的過渡態TS1_2·(·OH),形成IBU_2*·H2O。IBU_2*是損傷的S-IBU_2。從S-IBU_2·(·OH)到TS1_2·(·OH),鍵長12C—32H從0.109 4 nm拉伸到0.116 1 nm斷裂,拉伸0.006 7 nm;反應活性中心骨架二面角16C—12C—4C—17C從123.28°增加到127.73°,TS1_2·(·OH)產生的能壘是34.81 kJ/mol 。此能壘小于TS1_1·(·OH)產生的能壘,原因是TS1_2·(·OH)的鍵角12C—32H—34O為171.65°,比TS1_2·(·OH)的163.41°大,前者的氫鍵強;S-IBU_2·(·OH)的34O—32H小于S-IBU_2·(·OH)的34O—32H,前者的·OH對α-H的庫侖引力強。結構分析表明,相似于IBU_1*·H2O,IBU_2*·H2O也存在離域的共軛大π鍵和1個中等強度的分子間氫鍵,構象極穩定,處在勢能面較低的位置。

從圖5可以看出,羥自由基抽α-H致S-IBU_2損傷的逆反應能壘是155.69 kJ/mol ,此能壘難以逾越,說明IBU_2*難以修復。從圖5還可以看出,S-IBU_2·(·OH)→TS1_2·(·OH)→IBU_2*·H2O反應在水溶劑環境下的能壘是33.94 kJ/mol ,水溶劑效應對此反應基本無影響。

2)對于水分子輔助羥自由基抽α-H致S-IBU_2損傷。

S-IBU_2·[(·OH)·H2O]經羥自由基抽α-氫的過渡態TS1_1·[(·OH)·H2O],形成IBU_2*·2H2O。IBU_2*失去了手性,是損傷的S-IBU_2,鍵長12C—32H從0.109 3 nm拉伸到0.115 8 nm斷裂,拉伸幅度是0.006 5 nm;反應活性中心骨架二面角16C—12C—4C—17C和16C—12C—17C—31O分別從125.66°和-14.25°增加到130.28°和54.99°,TS1_2·[(·OH)·H2O]產生的能壘是38.27 kJ/mol 。TS1_2·[(·OH)·H2O]產生的能壘大于TS1_2·(·OH)產生的能壘,原因是S-IBU_2·[(·OH)·H2O]的羥自由基與α-氫距離比S-IBU_2·(·OH)的羥自由基與α-氫距離遠,并且從S-IBU_2·[(·OH)·H2O]到TS1_2·[(·OH)·H2O]過程,羧基旋轉了較大的幅度。結構分析表明,相似于IBU_1*·2H2O,IBU_2*·2H2O也存在離域的共軛大π鍵以及2個較強的和1個中等強度的分子間氫鍵,構象極其穩定。

從圖5可以看出,水分子輔助羥自由基抽α-H致S-IBU_2損傷的逆反應能壘是159.94 kJ/mol ,難以逾越,損傷產物IBU_2*難以修復。從圖5還可以看出,水溶劑效應使水分子輔助羥自由基抽α-H致S-IBU_2損傷的能壘微降到37.09 kJ/mol ,水溶劑效應的影響可以不予考慮。

從圖5可以看出,無論是在水汽相還是在水溶劑相,羥自由基抽氫比羥自由基水分子簇抽氫致S-IBU_2損傷具有優勢。

2.2 羥自由基的加成致S-IBU損傷

羥自由基與S-IBU加成,羥自由基可攻擊苯環上的每個碳,為節省篇幅,攻擊S-IBU_1選取了一個代表性的位點C3,攻擊S-IBU_2,選取了兩個代表性的位點C3和C4,下面分別進行討論。

2.2.1 羥自由基的加成致S-IBU_1損傷 羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的反應歷程見圖6,反應勢能剖面見圖7的S-IBU_1線(@water線為水溶劑化的勢能剖面)。

圖6 羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的反應歷程Fig.6 Reaction mechanism of hydroxyl radicals attacking C3 site of benzene ring in S-IBU_1

圖7 羥自由基攻擊S-IBU_1和S-IBU_2的苯環C位點的反應勢能面Fig.7 Potential energy surfaces of hydroxyl radicals attacking C site of benzene ring in S-IBU_1 and S-IBU_2

首先,羥自由基在S-IBU_1的苯環C3位點的上方與S-IBU_1通過范德華作用形成前驅配合物S-IBU_1·(·OH)_C3,而后S-IBU_1·(·OH)_C3經·OH攻擊C3的過渡態TS1_1 (·OH)_C3,得到加成產物P_1*_C3,P_1*_C3比S-IBU_1多一個手性中心C3,已經不具有S-IBU_1的性質,是損傷的S-IBU_1。

從S-IBU_1·(·OH)_C3到TS1_1 (·OH)_C3過程,二面角6C—5C—4C—3C、5C—4C—3C—2C和2C—3C—4C—12C分別從0.11°、0.09°和-179.50°增加到-1.92°、4.43°和-177.14°,沒有鍵的斷裂,只是骨架苯環C和α-C發生了不大的形變,所以TS1_1 (·OH)_C3產生的能壘較低,只有26.42 kJ/mol 。S-IBU_1·(·OH)_C3與P_1*_C3相比較,C3從sp2雜化變成了sp3雜化,34O—35H與C3的距離從0.240 3 nm減小到0.147 2 nm,34O—35H與C3(或說與S-IBU_1)的作用從弱相互作用變為化學鍵作用,因此,P_1*_C3體系十分穩定。從圖7的S-IBU_1線可以看出,S-IBU_1損傷的逆反應能壘是113.86 kJ/mol ,說明羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的損傷產物很難修復。

NBO電荷計算表明,羥自由基34O—35H從孤立狀態到其與S-IBU_1絡合物成S-IBU_1·(·OH)_C3,再到過渡態TS1_1 (·OH)_C3,最后到P_1*_C3,凈電荷從0.000到 -0.159,再到-0.247,最后到 -0.270;34O的電荷從 -0.431到 -0.603,再到 -0.702,最后到 -0.756?!H在攻擊C3的過程中不斷地奪取S-IBU_1的負電荷,說明其具有較強的氧化性,誘導了S-IBU_1損傷。

從圖7中S-IBU_1的水溶劑效應的勢能剖面可以看出,水溶劑環境下羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的能壘是25.43 kJ/mol ,說明水溶劑的助催化作用微弱,可以說基本沒有作用;逆反應能壘是113.24 kJ/mol ,說明水溶劑環境下P_1*_C3也難以修復。

2.2.2 羥自由基的加成致S-IBU_2損傷 羥自由基攻擊S-IBU_2的苯環C3和C4位點的反應歷程,見圖8,反應勢能剖面見圖7的S-IBU_2線(@water線為水溶劑化的勢能剖面)。羥自由基攻擊S-IBU_2的C3位點的機理相似于2.2.1的羥自由基攻擊S-IBU_1的C3位點,這里只做一般討論。

圖8 羥自由基攻擊S-IBU_2的苯環C3和C4位點的反應歷程Fig.8 Reaction mechanism of hydroxyl radicals attacking C3 and C4 sites of benzene ring in S-IBU_2

羥自由基在S-IBU_2的C3位點的上方與C3通過范德華作用形成前驅配合物S-IBU_2·(·OH)_C3,經·OH攻擊C3的過渡態TS1_2 (·OH)_C3,得到損傷產物P_2*_C3。結構分析表明,從S-IBU_2·(·OH)_C3到TS1_2 (·OH)_C3過程,也是骨架苯環C和α-C發生了不大的形變,因此TS1_2 (·OH)_C3產生的能壘較低,只有25.83 kJ/mol 。從圖7的S-IBU_2線可以看出,此基元逆反應能壘是113.55 kJ/mol ,說明羥自由基攻擊S-IBU_1的苯環C3位點的損傷產物很難修復。從圖7中S-IBU_2的水溶劑效應的勢能剖面可以看出,水溶劑環境下羥自由基攻擊S-IBU_2的苯環C3位點的能壘是24.91 kJ/mol ,說明水溶劑的助催化作用極微弱,可以認為沒起作用;逆反應能壘是109.94 kJ/mol ,說明水溶劑環境下P_2*_C3也難以修復。

羥自由基攻擊S-IBU_2的C4位點時,IRC計算表明,反應的前驅配合物仍然是S-IBU_2·(·OH)_C3,而過渡態則是圖8的TS1_2 (·OH)_C4,產物是P_2*_C4。勢能面圖7的S-IBU_2線說明P_2*_C4也難以修復。

結構分析表明,從S-IBU_2·(·OH)_C3到TS1_2 (·OH)_C4過程,骨架苯環C和α-C的形變略大于從S-IBU_2·(·OH)_C3到TS1_2(·OH)_C3過程,因此TS1_2 (·OH)_C4產生的能壘是27.81 kJ/mol ,略高于TS1_2 (·OH)_C3產生的能壘。圖7 中S-IBU_2的溶劑效應勢能面表明,溶劑環境下此基元反應的能壘是28.73 kJ/mol ,升高的幅度微小,可以認為沒變;溶劑環境下的損傷產物P_2*_C4也難以修復。

3 結 論

1)羥自由基致布洛芬損傷有羥自由基(水分子簇)抽氫和羥自由基加成到苯環兩種機理。

2)羥自由基(水分子簇)抽氫反應:對于S-IBU_1,水分子輔助羥自由基抽α-H的反應通道具有優勢,抽氫反應能壘是34.68 kJ/mol ;對于S-IBU_2,羥自由基抽α-H的反應通道具有優勢,抽氫反應能壘是34.81 kJ/mol 。羥自由基加成到苯環的反應:對于S-IBU_1,加成到C3位點的能壘是26.42 kJ/mol ;對于S-IBU_2,加成到C3位點的能壘是25.83 kJ/mol ,加成到C4位點的能壘是27.81 kJ/mol ,后者略具優勢。在抽氫和加成兩種反應的競爭中,后者具有優勢。

3)水溶劑化效應對羥自由基(水分子簇)抽氫和加成到苯環致布洛芬損傷反應基本沒有影響。

4)羥自由基(水分子簇)抽氫和羥自由基加成導致的布洛芬損傷難以修復。

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