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蜜蜂所研究揭示蜜蜂殘翅病毒來源

近日，中國農業科學院蜜蜂研究所蜜蜂病蟲害生物學創新團隊，聯合德國烏爾姆大學和英國埃克塞特大學相關人員，采用大尺度取樣對我國22個省近200個蜂場的意大利蜜蜂和中華蜜蜂，進行了蜜蜂殘翅病毒的流行、群體遺傳和進化重構分析，厘清了我國蜜蜂殘翅病毒的主要流行基因型和季節性變化特點。該研究有助于揭示蜜蜂殘翅病毒的來源與進化歷史，更有助于理解病毒動力學變化及對生態中其他授粉昆蟲潛在的感染風險。相關研究成果在線發表在《科學報告（Scientific Reports）》上。

國際上主要流行的觀點認為，蜜蜂殘翅病毒的流行與蜜蜂寄生性病害——狄斯瓦螨最相關，而狄斯瓦螨被認為最原始寄主為我國中華蜜蜂，而后傳入意大利蜜蜂，從而因蜜蜂殘翅病毒較強的傳播能力成為意大利蜜蜂健康發展的最重要威脅之一。然而該病毒在我國的流行情況及是否與國際最主要流行毒株基因型一致仍不清楚。研究結果表明，我國意大利蜜蜂流行的主要蜜蜂殘翅病毒基因型與歐洲主要流行型相一致；而我國中華蜜蜂對該病毒的整體感染率并不高，更不是歐洲主要流行基因型；另外，相比較意大利蜜蜂，中華蜜蜂的蜜蜂殘翅病毒具有更高的遺傳多樣性，表明我國意大利蜜蜂流行的蜜蜂殘翅病毒可能來源于歐洲，而中華蜜蜂具有更強的進化手段抵抗該病毒。

我國科學家發布地方豬 “超清” 基因組圖譜

近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊，發布了中國優良地方豬——陸川豬的高質量基因組序列。該基因組序列的發表，不僅填補了亞洲家豬缺少高質量參考基因組的空白，更為基因組組裝提供了新的方向。相關研究成果在線發表在《BioRxiv》上。

我國是世界上最大的生豬養殖和豬肉消費國，擁有全球最豐富的豬種資源。我國地方豬群具有豐富的遺傳多樣性，是深入挖掘豬種肉質品質和抗病力等重要性狀優質基因的遺傳寶庫。然而，隨著西方商業豬種的普及，本地豬種受到了較大的沖擊，有些著名地方品種的數量比大熊貓還要稀少，部分品種甚至已經滅絕。地方豬種質資源的保護刻不容緩具有重要的戰略意義。

該項研究公布的豬基因組序列采用了目前最新的Pacbio，Bionano DLS和ProximoHi-C等多項測序技術，以及Falcon Phase組裝算法，首次獲得了染色體級別的定相（Phased ）基因組。這標志著來自親本的等位基因可以完整區分，具有重要的理論和應用價值。經過不懈的努力與技術攻關，研究團隊最終獲得了染色體級別的豬基因組序列，contigN50超過了18兆，ScaffoldN50超過了140兆。并且利用最新的組裝算法和Hi-C技術，獲得了完整的兩套基因組序列。這是基因組研究領域的重大突破，為研究等位基因的功能互作提供了寶貴的數據和技術基礎。