構(gòu)建以科研管理為導(dǎo)向的醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫

機(jī)構(gòu)知識庫(Institutional Repository，IR)又稱機(jī)構(gòu)庫、機(jī)構(gòu)倉儲、機(jī)構(gòu)典藏庫，指以學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)為主體建立、搜集及存儲該機(jī)構(gòu)內(nèi)成員創(chuàng)造的包括學(xué)術(shù)論文、會議報告、多媒體資源等各類知識資源，并提供公開檢索及利用的數(shù)字知識庫[1]。在2002年首次提出機(jī)構(gòu)知識庫概念的學(xué)術(shù)出版與學(xué)術(shù)資源聯(lián)盟(Scholarly Publishing and Academic Resources Coalition，SPARC)高級顧問Raym Crow認(rèn)為，機(jī)構(gòu)知識庫是學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)為捕獲并保存本機(jī)構(gòu)的智力成果而建立的數(shù)字資源倉庫[2]；Clifford A．Lynch則認(rèn)為，一個學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的機(jī)構(gòu)知識庫是機(jī)構(gòu)為科研教學(xué)人員所提供的一系列服務(wù)，服務(wù)的目的是管理和發(fā)布由本機(jī)構(gòu)及其成員所創(chuàng)造的數(shù)字資源[3]。不管從資源角度還是從服務(wù)角度來說，機(jī)構(gòu)知識庫都是一個機(jī)構(gòu)重要的知識管理工具。當(dāng)前機(jī)構(gòu)知識庫大多局限于成果保存和展示等方面，與科研管理系統(tǒng)的銜接和協(xié)作方面幾乎是空白的。結(jié)合醫(yī)院科研管理的電子化、系統(tǒng)化需求，機(jī)構(gòu)知識庫可積極融入科研管理的各個階段，通過拓展數(shù)據(jù)庫功能，為研究人員提供科研輔助，為科研管理人員提供數(shù)據(jù)支撐，為醫(yī)院管理者提供決策參考，使其成為醫(yī)院科研管理的重要工具[4]。

1 構(gòu)建廣東省中醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫的必要性與意義

1.1 構(gòu)建醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫的必要性

廣東省中醫(yī)院(下文簡稱“我院”)作為全國最大的中醫(yī)院之一，有著中醫(yī)系統(tǒng)內(nèi)數(shù)量最多的重點(diǎn)專科/學(xué)科，以及一大批名中醫(yī)、專家、學(xué)者，每年有大量論文、基金、專著、專利等，但是醫(yī)院這些寶貴的知識財富尚未得到很好的傳播、推廣和應(yīng)用；同時我院每年也在積極申報各級別重點(diǎn)專科、重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、診療中心等，為廣州中醫(yī)藥大學(xué)“雙一流”建設(shè)添磚加瓦。因此，需要對自己和競爭對手的科研實(shí)力有所掌握和比較。此外，我院科研管理任務(wù)繁重，包括職稱的申報審批，項(xiàng)目的審批和檢查、驗(yàn)收，論文、專著、專利、獎項(xiàng)的收集和獎勵，每年還要根據(jù)自定的評估指標(biāo)體系對各個科室、團(tuán)隊(duì)進(jìn)行科研績效評估，這些工作需要耗費(fèi)大量人力和物力。為了方便獲取、保存、管理、利用本機(jī)構(gòu)的智力成果，為本機(jī)構(gòu)科研人員的績效評估及學(xué)術(shù)交流提供重要參考來源，以科研管理為導(dǎo)向構(gòu)建廣東省中醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫極為必要。

1.2 構(gòu)建醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫的意義

1.2.1 保存和管理數(shù)據(jù)的數(shù)字倉儲

機(jī)構(gòu)知識庫可以長期保存院內(nèi)文章、專著、專利、標(biāo)準(zhǔn)等各項(xiàng)成果，保存名醫(yī)經(jīng)驗(yàn)、手術(shù)視頻、實(shí)驗(yàn)報告和學(xué)者上傳的個人數(shù)據(jù)，如筆記、課件、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、科研進(jìn)展報告、病例報告等。數(shù)據(jù)庫支持多媒體數(shù)據(jù)格式，成果可以是文檔、超鏈接、圖片、視頻等形式。

1.2.2 科研管理和績效評估的工具

機(jī)構(gòu)知識庫包含了項(xiàng)目管理、人員管理、成果管理、獎勵管理等科研管理的功能，可提升科研管理與評價的效率。如院內(nèi)學(xué)者申報職稱、申請項(xiàng)目時及各種需要獎勵成果的列表可以直接從機(jī)構(gòu)知識庫獲取其成果列表，省去多次提交和審核的繁瑣。另外我院每年都要對各科室、團(tuán)隊(duì)進(jìn)行科研績效評估，不同類型和級別的成果按我院自行制定的評分體系有不同的分值和權(quán)重。利用機(jī)構(gòu)知識庫節(jié)省了提交、審核成果的麻煩，讓績效評估工作變得簡單快捷，還能減少遺漏、錯誤和糾紛。實(shí)踐證明，通過機(jī)構(gòu)知識庫進(jìn)行科研服務(wù)可節(jié)省工作量，而且能降低錯誤率[5]。

1.2.3 展示、交流和學(xué)習(xí)的平臺

機(jī)構(gòu)知識庫打破了“信息孤島”，能讓大家了解院內(nèi)各學(xué)科研究的發(fā)展水平、趨勢、重點(diǎn)、熱點(diǎn)、合作作者和機(jī)構(gòu)，為自己的學(xué)習(xí)、研究、合作對象的選取提供一定的參考，大大促進(jìn)了院內(nèi)人員的學(xué)術(shù)交流及人才隊(duì)伍的建設(shè)和學(xué)術(shù)水平的提高。

1.2.4 學(xué)科建設(shè)和“雙一流”建設(shè)的依據(jù)

為振興中醫(yī)藥發(fā)展、推動中醫(yī)藥現(xiàn)代化和信息化，我國加強(qiáng)了對中醫(yī)藥院校及其附屬醫(yī)院的建設(shè)和投入，建立了臨床研究基地，將中醫(yī)藥學(xué)科納入國家“雙一流”建設(shè)，設(shè)立重點(diǎn)學(xué)科和重點(diǎn)專科[6]。機(jī)構(gòu)知識庫在保證學(xué)科團(tuán)隊(duì)和學(xué)者的科研成果得到有效管理和利用的同時，也能準(zhǔn)確地定性、定量評估本機(jī)構(gòu)的學(xué)術(shù)水平，以及與其他競爭對手進(jìn)行比較，為學(xué)科建設(shè)、管理決策提供參考。

2 廣東省中醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫的構(gòu)建設(shè)想

我院機(jī)構(gòu)知識庫的建設(shè)遵循以科研管理為導(dǎo)向，層級結(jié)構(gòu)清晰、功能完備、可擴(kuò)展等原則[7]。在充分進(jìn)行管理和技術(shù)需求評估的前提下，以開發(fā)系統(tǒng)接口方式，將機(jī)構(gòu)知識庫與科研管理信息系統(tǒng)進(jìn)行整合，將原有機(jī)構(gòu)知識庫及科研管理系統(tǒng)下的不同功能模塊定義為服務(wù)；通過網(wǎng)絡(luò)對松散耦合的粗粒度功能服務(wù)模塊進(jìn)行整合、使用；通過將科研管理系統(tǒng)嵌入機(jī)構(gòu)知識庫，實(shí)現(xiàn)圍繞項(xiàng)目工作流、信息內(nèi)容驅(qū)動的機(jī)構(gòu)知識庫管理、科室分析、學(xué)科建設(shè)、知識圖譜、機(jī)構(gòu)學(xué)者、個人知識中心等管理功能。

2.1 系統(tǒng)架構(gòu)

系統(tǒng)架構(gòu)主要包括數(shù)據(jù)采集層、數(shù)據(jù)處理層、數(shù)據(jù)倉儲層、功能應(yīng)用層、界面展示層(圖1)。

圖1 醫(yī)院機(jī)構(gòu)知識庫系統(tǒng)架構(gòu)

2.1.1 數(shù)據(jù)采集層

數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)以《GB/T 25100-2010 信息與文獻(xiàn)、都柏林核心元數(shù)據(jù)元素集》等為基礎(chǔ)，參考科技部、國家圖書館等機(jī)構(gòu)發(fā)布的相關(guān)元數(shù)據(jù)規(guī)范；數(shù)據(jù)采集方式主要包括數(shù)據(jù)庫公司抓取、管理員錄入和作者主動繳存。

2.1.2 數(shù)據(jù)處理層

依托數(shù)據(jù)庫公司的資源，對文獻(xiàn)進(jìn)行回溯與更新，以“自動+人工輔助”的方式對文獻(xiàn)進(jìn)行規(guī)范化的數(shù)據(jù)加工和處理。對元數(shù)據(jù)的收集、清洗、整合與增補(bǔ)包括文獻(xiàn)回溯與更新、數(shù)據(jù)篩選與剔重、不同數(shù)據(jù)庫來源的元數(shù)據(jù)的匹配、字段的增補(bǔ)與二次開發(fā)(對文獻(xiàn)評價的輔助信息進(jìn)行增補(bǔ)以及對文獻(xiàn)內(nèi)容進(jìn)行人工標(biāo)引)，輔助信息及人工標(biāo)引包含全文鏈接、中科院大小分區(qū)、JCR分區(qū)、影響因子及區(qū)間分段、成果評分賦值字段等。系統(tǒng)支持管理員自定義元數(shù)據(jù)的描述，即字段的標(biāo)引。

2.1.3 數(shù)據(jù)存儲層

數(shù)據(jù)倉儲主要保存文獻(xiàn)數(shù)據(jù)(主要提供檢索、統(tǒng)計等服務(wù))、用戶數(shù)據(jù)(主要保存用戶和驗(yàn)證權(quán)限等)和日志數(shù)據(jù)(主要保存系統(tǒng)運(yùn)行日志、用戶糾錯記錄等)3種數(shù)據(jù)。

2.1.4 功能應(yīng)用層

功能應(yīng)用層主要用于界面展示層和數(shù)據(jù)倉儲層的數(shù)據(jù)組織和使用，主要包括機(jī)構(gòu)成果模塊、科室分析模塊、學(xué)科建設(shè)模塊、知識圖譜模塊、機(jī)構(gòu)學(xué)者模塊、個人中心模塊6個功能模塊。

2.1.4.1 機(jī)構(gòu)成果模塊

機(jī)構(gòu)成果模塊展示機(jī)構(gòu)內(nèi)所有員工的各種成果，包括論文、專著、專利、成果、精品課程、新藥、標(biāo)準(zhǔn)(下分標(biāo)準(zhǔn)、指南、診療方案)、科研項(xiàng)目、科研獎項(xiàng)等。建立以題名、作者、關(guān)鍵詞、期刊為檢索字段的快速檢索框，并實(shí)現(xiàn)以成果類型、時間、作者(下分第一作者、通訊作者、全部作者)、語種、期刊名稱、文獻(xiàn)類型、合作作者、合作機(jī)構(gòu)、國家及地區(qū)、重要成果(下分熱點(diǎn)論文、高被引論文)、學(xué)科、中科院分區(qū)、JCR分區(qū)、影響因子分段、收錄情況(SCIE、MEDLINE、CA、SSCI、EI、ESCI、A&HCI、ISR、CPCI(含原ISTP和原ISSHP)、CSCD、北大核心、ESSCI、中國科技核心期刊目錄自然科學(xué)卷和社會科學(xué)卷)等為檢索字段的二次檢索。每項(xiàng)成果后顯示按我院科研績效評估體系給予的分值。檢索結(jié)果可通過點(diǎn)擊字段名按時間、被引頻次、下載數(shù)自動排序，可選中并以題錄形式導(dǎo)出，導(dǎo)出字段可以自由勾選。

2.1.4.2 科室分析模塊

廣東省中醫(yī)院有5個院區(qū)和3個分門診，包括幾百個大小科室、研究團(tuán)隊(duì)。機(jī)構(gòu)知識庫根據(jù)我院實(shí)際情況提供按院區(qū)、大科、小科(包括所有團(tuán)隊(duì))分類的導(dǎo)航，為所有科室建立主頁。首頁顯示科室團(tuán)隊(duì)簡介、人員(名字鏈接到個人主頁)，并由負(fù)責(zé)人進(jìn)行信息維護(hù)；以數(shù)字顯示科室發(fā)文(按收錄情況)、專著、新藥、專利、成果、標(biāo)準(zhǔn)、獲得獎勵和基金情況等，點(diǎn)擊數(shù)字會顯示具體成果列表；在各項(xiàng)成果題名后增加顯示科研評估分值的字段。在統(tǒng)計頁面提供人員職稱統(tǒng)計圖，各個類型成果的產(chǎn)出趨勢圖，成果類型、收錄情況、研究主題和文獻(xiàn)類型的分布統(tǒng)計圖，發(fā)表期刊top10、被引頻次top10、研究人員產(chǎn)出top10的統(tǒng)計圖，關(guān)鍵詞、主題詞云圖，合作機(jī)構(gòu)、合作作者網(wǎng)狀圖等；能夠選擇不同年份進(jìn)行統(tǒng)計，并且圖可以下載。此外還提供院區(qū)、大科、小科(包括所有團(tuán)隊(duì))的對比分析，可對多個同級或者不同級的科室成果進(jìn)行多角度的對比分析。所有科室名稱后設(shè)置匯總分值計算按鈕和對比按鈕，可一鍵計算科研績效分值以及勾選科室后加入對比。

2.1.4.3 學(xué)科建設(shè)模塊

學(xué)科建設(shè)模塊提供了所有學(xué)科的導(dǎo)航，為所有學(xué)科建立的學(xué)科主頁能顯示學(xué)科簡介、人員(名字鏈接到學(xué)者個人主頁)，由學(xué)科負(fù)責(zé)人進(jìn)行信息維護(hù)。學(xué)科建設(shè)模塊以數(shù)字顯示學(xué)科發(fā)文(按收錄情況)、專著、新藥、專利、標(biāo)準(zhǔn)、科研獎項(xiàng)、科研項(xiàng)目、精品課程等，點(diǎn)擊數(shù)字將顯示具體成果列表，在統(tǒng)計頁面提供類似上述科室分析模塊的常用功能。“雙一流”高校建設(shè)的核心是學(xué)科建設(shè)，機(jī)構(gòu)知識庫除了展示學(xué)科技術(shù)、人才、成果等外，還可與對標(biāo)機(jī)構(gòu)進(jìn)行競爭情報分析，實(shí)現(xiàn)學(xué)科動態(tài)預(yù)警[8]。

2.1.4.4 知識圖譜模塊

知識圖譜模塊對機(jī)構(gòu)知識庫中的資源進(jìn)行多維度統(tǒng)計，提供詳盡、直觀的統(tǒng)計結(jié)果，醫(yī)院成果類型分布、語種分布、收錄情況分布、研究主題分布、文獻(xiàn)類型分布的統(tǒng)計圖，各類型成果產(chǎn)出的趨勢圖，機(jī)構(gòu)學(xué)科規(guī)范化的學(xué)術(shù)影響力趨勢圖，論文期刊分布top20、被引頻次top20、下屬機(jī)構(gòu)產(chǎn)出top20、學(xué)科產(chǎn)出top10、研究人員產(chǎn)出top20統(tǒng)計圖，關(guān)鍵詞云圖，主題詞云圖，合作機(jī)構(gòu)網(wǎng)狀圖，合作作者網(wǎng)狀圖，詞頻共現(xiàn)關(guān)系圖譜。機(jī)構(gòu)的知識圖譜能夠選擇不同年份進(jìn)行統(tǒng)計，且圖可以下載；能夠可視化地說明本機(jī)構(gòu)誰在做什么、有無特色、是否重復(fù)、與誰合作等。利用本機(jī)構(gòu)圖譜與全領(lǐng)域知識圖譜、競爭對手知識圖譜等的比較分析，可以找到自己的競爭優(yōu)勢和劣勢、研究空白,發(fā)現(xiàn)潛在的競爭對手和合作機(jī)會，還可利用知識圖譜進(jìn)行科研布局規(guī)劃和提出學(xué)科建設(shè)策略[9]。

2.1.4.5 機(jī)構(gòu)學(xué)者模塊

機(jī)構(gòu)學(xué)者模塊提供以姓名、工號、ORCID為檢索字段的快速檢索框。左側(cè)縱向以科室為分類的導(dǎo)航欄，右側(cè)橫向以姓氏首字母為檢索字段的導(dǎo)航欄。因我院一名學(xué)者可以隸屬于多個科室/團(tuán)隊(duì)，以及存在同名、更換科室的情況，這些字段信息需要對接人事系統(tǒng)并及時更新。為所有學(xué)者建立學(xué)者主頁，包括在職的學(xué)者以及退休的專家，顯示學(xué)者簡介、研究方向、所屬科室或團(tuán)隊(duì)、H指數(shù)，學(xué)者可自行修改個人信息、提交和認(rèn)領(lǐng)成果。以數(shù)字顯示學(xué)者各類成果，點(diǎn)擊數(shù)字將顯示具體成果列表，在各項(xiàng)成果題名后增加顯示科研評估分值的字段。所有學(xué)者名字后設(shè)置匯總分值的計算按鈕和對比按鈕，可一鍵計算科研績效分值以及勾選學(xué)者后加入對比。在統(tǒng)計頁面還提供類似其他模塊的常用統(tǒng)計分析功能。

2.1.4.6 個人中心模塊

個人中心模塊可以修改并保存?zhèn)€人基本信息，上傳、認(rèn)領(lǐng)、撤回個人成果，支持各類型格式的數(shù)字資源；提供存儲空間，支持個人上傳并存儲學(xué)術(shù)論文、科研進(jìn)展報告、技術(shù)報告、碩博士論文、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等其他灰色文獻(xiàn)，以及未發(fā)表的數(shù)據(jù)，如臨床醫(yī)生自己的個人數(shù)據(jù)、手術(shù)視頻、特殊病歷分析等，可以自行設(shè)置不同開放權(quán)限。個人中心模塊設(shè)置有打印報告模板，個人用戶可在個人中心模塊中進(jìn)行文獻(xiàn)的收錄證明、個人論文產(chǎn)出報告、職稱申報報告、部門產(chǎn)出報告、醫(yī)院年度產(chǎn)出報告等的打印。醫(yī)院學(xué)者群體，每年都要向不同職能部門提交各種數(shù)據(jù),是重復(fù)勞動且與科研關(guān)系不大。機(jī)構(gòu)知識庫可以簡化這一工作，實(shí)現(xiàn)“一次提交，數(shù)據(jù)通用”的功能。此外,為了減輕學(xué)者錄入數(shù)據(jù)的工作量,對機(jī)構(gòu)知識庫進(jìn)行數(shù)據(jù)爬取,學(xué)者僅需認(rèn)領(lǐng)少量不確定的疑似數(shù)據(jù)及自行上傳無法收集到的數(shù)據(jù),由管理員進(jìn)行審核[10]。

2.1.5 界面展示層

界面展示層包括機(jī)構(gòu)庫界面、個人界面和科研管理界面以網(wǎng)頁的形式對數(shù)據(jù)進(jìn)行展示。數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)具備可定制化的UI，系統(tǒng)的友好性和功能性強(qiáng)，可根據(jù)用戶需求進(jìn)行調(diào)整修改。

2.2 系統(tǒng)管理

2.2.1 用戶權(quán)限管理

由管理員對系統(tǒng)進(jìn)行平臺信息維護(hù)、用戶權(quán)限認(rèn)證和管理。最高管理員擁有對用戶與所有資源的增刪改權(quán)限，并且可根據(jù)組策略為不同用戶分配不同的權(quán)限。如為圖書館管理員分配成果代認(rèn)領(lǐng)權(quán)限，為科研處管理者分配審核各種提交的報告、評估統(tǒng)計科研績效的權(quán)限等。

2.2.2 數(shù)據(jù)資源管理

系統(tǒng)的每一個子數(shù)據(jù)庫都具備獨(dú)立的存儲、發(fā)布、管理功能。如圖書館管理人員通過定義標(biāo)引和錄入編目，即可對子庫內(nèi)具體成果進(jìn)行字段增補(bǔ)、檢索查找；科研處管理人員通過錄入課題信息，即可對課題人員、經(jīng)費(fèi)、設(shè)備、成果等進(jìn)行管理。

2.2.3 數(shù)據(jù)遷移與安全

數(shù)據(jù)庫支持對數(shù)據(jù)的合并、拆分、批量導(dǎo)入、導(dǎo)出等操作，提供標(biāo)準(zhǔn)OAI數(shù)據(jù)接口和其他數(shù)據(jù)交換的接口，支持與醫(yī)院OA平臺、人事管理平臺進(jìn)行數(shù)據(jù)對接與交換。數(shù)據(jù)庫能實(shí)現(xiàn)自動備份或手動備份功能，可以定期進(jìn)行數(shù)據(jù)對比檢測，及時發(fā)現(xiàn)和處理數(shù)據(jù)錯誤，保證數(shù)據(jù)安全。

3 結(jié)語

機(jī)構(gòu)知識庫在國內(nèi)高校或科研機(jī)構(gòu)中應(yīng)用較普遍，在國內(nèi)醫(yī)院中還沒有被廣泛應(yīng)用，尚處于起步階段。我院機(jī)構(gòu)知識庫的構(gòu)建無論從內(nèi)容建設(shè)、用戶體驗(yàn)還是從知識產(chǎn)權(quán)方面來說，都還有很大的改進(jìn)和完善的空間，在機(jī)構(gòu)知識庫中嵌入的科研管理系統(tǒng)也需要進(jìn)一步完善。

在國際上，機(jī)構(gòu)知識庫發(fā)展的一個重要趨勢便是拓展支撐科研管理方面的服務(wù)功能，包括知識管理、知識審計、科研評價、科研項(xiàng)目管理、科研規(guī)劃等，機(jī)構(gòu)知識庫已經(jīng)成為整個科研管理系統(tǒng)的有機(jī)組成部分[11]。我們在構(gòu)建以科研管理為導(dǎo)向的機(jī)構(gòu)知識庫時，既要學(xué)習(xí)國內(nèi)外已有經(jīng)驗(yàn)，也要結(jié)合自身情況和需求進(jìn)行改革創(chuàng)新。建設(shè)功能完善的、有特色的、與時俱進(jìn)的機(jī)構(gòu)知識庫，是一項(xiàng)長期而艱巨的任務(wù)，還有待深入研究。