石油降解菌的篩選、鑒定及降解石油研究

劉永江 解蕾 劉書慧（青島大港海關，山東 青島

266011）

石油產品廣泛應用于生產生活各方面，包括工農業，交通運輸業等各行業，石油被稱為黑色的金子，隨著經濟發展，石油產量不斷提高，世界產油國家地區有150多個，年產石油總量超30億噸。隨著石油工業發展，大量含石油物質廢水排入土壤，石油帶來的環境污染問題日益突出，對石油污染土壤修復治理，對保護生態環境具有重要意義。污染土壤治理中，微生物修復由于具有費用低等優點受到人們重視，為污染土壤修復帶來技術革命。

1 已有研究綜述

通常所稱石油是從地下開采未提煉的原油，經提煉加工可制成多種燃料，包括天然氣，煤油等。石油顏色多為黑色，少數為暗綠色。常溫下呈流體狀態，粘度范圍寬，沸點范圍為常溫到500℃以上，石油物理性質差異原因是化學組成不同。石油化學組分復雜，隨產地不同有差異。碳氫元素為烴類化合物存在，石油中含有幾十種微量元素。石油主要由烷烴等烴類化合物組成，烴類化合物相對分子質量范圍很大，石油烴以固液氣三態存在于石油中。烷烴是組成石油的主要成分，石油非烴組分有6種[1]。

石油污染土壤對生態環境產生嚴重危害，荷蘭在80年代花費15 億美元進行土壤修復工作，美國在2005 年用于石油烴污染場地修復資金棕色土地基金達2200萬美元。石油污染土壤處理方法可分為理化處理與生物處理。80年代前，污染土壤治理僅限于理化處理，化學處理主要有土壤洗滌法等，物理處理包括隔離法等，理化處理法能快速凈化土壤中石油污染，但其固有缺陷限制了應用范圍，物理方法去除污染物時破壞土壤結構，化學方法試劑造成土壤二次污染。生物修復是利用生物生命代謝減少土壤有毒物質濃度，使污染土壤環境恢復到原始狀態，生物修復類型可分為微生物修復，動植物修復。生物修復具有費用低，對環境影響小等有點，美國EPA 修訂法案將生物修復定為原有污染土壤修復首選措施，我國環保局提出重點研究微生物處理技術[2]。

國外開展微生物質量石油污染研究較早，發達國家發展較為成熟，歐美土壤生物修復技術已得到應用。我國自70年代開始有學者關注相關研究，但實際研究較少，90年代發展快速，綜合運用微生物學，生態學等方法，開展生物毒理學，生物工程技術研究。研究主要集中于降解石油微生物研究，石油理化特性對微生物降解作用的影響，環境因素對微生物降解作用的影響。目前對石油污染微生物修復技術研究取得了很多的進展，但仍存在一些問題，如修復技術工藝有待完善，復合菌群協同作用降解機制不清楚。本文研究勝利油田石油土壤修復技術，通過實驗篩選復合菌群，利用氣相色譜法對復合菌群降解后殘余石油組分分析。獲得針對油田地區石油污染土壤修復的微生物菌群資源，對菌群菌株增殖培養進程初步研究，利用氣相色譜對組成菌株降解后石油組分分析，解釋復合菌群對石油烴降解率提高的原因。

2 石油降解篩選鑒定實驗

3 種不同的土壤樣品均采自山東勝利油田，原油與市售0#柴油按1∶4的比例混合均勻。

富集培養基：K2HPO4·3H2O 1.0g， MgSO4·7H2O 0.5g， Ca?Cl2 0.02 g，FeCl3 痕量，蒸餾水1 000 ml，121℃滅菌20 min，加入5 g石油。種子液培養基采用牛肉膏蛋白胨培養基。

篩 選 培 養 基：NaNO3 1.5 g ，K2HPO4 1g KCl 0.5 g， Ca?Cl2 0.002 g，蒸餾水1 000 mL，加入2.5 g石油。加入1.2%的瓊脂制成相應的固體培養基。

稱取5g污染土壤加入富集培養基的三角瓶中，恒溫搖床條件下培養。轉接至新鮮培養基，連續富集培養25 d，經梯度稀釋后涂布在固體PDA培養基上，待平板長出菌落后，采用劃線分離法反復進行分離純化，純化后的菌株保存于牛肉膏蛋白胨培養基斜面。

將菌株接種到降解用液體培養基的三角瓶中180 r·min-1的條件下培養5 d，稀釋后涂布在固體培養基上，觀察各菌株生長情況，篩選出生長較快的菌株。挑取單菌落接種到液體牛肉膏蛋白胨培養基三角瓶中，恒溫搖床中培養24 h，用牛肉膏蛋白胨培養基調節其質量濃度。吸取5 ml 準備好的種子液接種到篩選培養基三角瓶中，恒溫搖床中培養4d后測定石油含量，計算平均降解率。

采用試劑盒提取并純化石油降解菌總DNA，對16S rDNA保守序列進行擴增。PCR 反應體系如下：反向引物與正向引物各1 μl， ddH2O 補足至50 μl。PCR 反應條件：94℃預變性5 min，50℃退火1 min，此步驟共進行35個循環，。PCR產物用1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢驗并進行測序[3]。

通過BLAST 程序的序列進行對比分析查找相似的核苷酸序列，利用軟件構建系統進化樹。構建系統進化樹的方法使用Neighbor-Joining法，進化樹可靠性檢驗選用自展檢驗DNA 序列變異中的轉換賦于相同的加權值。

4 結語

從勝利油田采集的石油污染土樣，分離到50株細菌，將純化的細菌單菌落接種到培養基中培養。經梯度稀釋后涂布在固體培養基上，結果初步篩選出生長較好的33株細菌。

對菌株進行石油降解能力的測定。石油降解率超過30%的細菌共16株。不同菌株對石油的降解能力不同，菌株PU-34的降解率達到58.38%，其余4 株菌分別為PU-15、PU-4。選取降解率高的菌株做鑒定。

對篩選出的石油降解率較高的菌株進行形態觀察。從PU-34、PU-2的16S rDNA 中擴增得到基因片段，將PCR產物純化后測序得到目的基因序列。與核酸序列進行比較，找出同源性較高的序列進行對比分析構建系統發育樹。

PU-34 和黃單胞菌屬的11 個種的模式株序列同源性在96%～99%范圍內，PU-34 與Pseudoxanthomonas mexicana 聚為一簇。PU-34為好氧的革蘭氏陰性桿菌，不能水解淀粉和尿素，不產生吲哚，結合生理生化特性確定PU-34屬于P.japonensis。

PU-15 與戈登氏菌屬很多種的模式株16S rDNA 序列同源性，挑選同源性較高的模式種構建系統進化樹，PU-15 與食烷烴戈登氏菌的Gordonia alkalivorans DSM 44369T 位于同一分支PU-2與友好戈登氏菌的模式株位于同一分支。

國內外很多研究結果報道從樣品中分離出假單胞菌屬、一些菌株具有較好的石油烴降解能力。假黃單胞菌屬是根據對Pseudoxanthomonas 的描述建立的，對分離自環境的嗜溫細菌進行研究建立了新種。并對假黃單胞菌屬的描述進行了修訂。國際權威雜志報道了4 株污染土壤中分離的假黃單胞菌屬細菌，包括臺灣高雄分離篩選到的生物活性劑的細菌，分離的P.spadix IMMIB AFH-5T，從加油站沉積物中分離的菌株P.spadix BD-a59，以從污染土壤中分離的P.sacheonensis BD-c54T。石油降解菌經鑒定為P.japonensis菌種，假黃單胞菌屬的某些菌株生物修復方面具有研究價值。