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病毒核酸檢測的高效分組方案設計與優化

2020-07-14 06:59:16長沙市中雅培粹學校杜承澤
發明與創新 2020年30期
關鍵詞:檢測

■長沙市中雅培粹學校 杜承澤

在新冠肺炎疫情防控期間,利用熒光RT-PCR 核酸檢測以確診病例并立刻進行進一步治療至關重要。

核酸檢測確診一般需要幾個小時,檢測方案的效率直接關系到確診時間,也是疫情發展時收治確診病人入院的瓶頸環節。因此,尋找高效的檢測方案或優化現有方案,急迫且重要。

一、模型假設

1.檢測試劑的判斷正確率為100%。

2.檢測試劑可以正確檢測出混合血液,均為陰性時顯現陰性特性,否則顯示陽性。實際上,目前醫院單次核酸檢測準確率并非100%,因此,需要兩次確認才能確診。但這個過程對本文分組方案研究沒有本質影響,因此做本模型假設是合理的。

3.由于核酸檢測的原理是先提取核酸,然后進行復制擴殖到一定數量再檢測。因此,檢測試劑所需血液較少,可將抽出的血液分成兩份、四份或多份,不影響最終檢測結果。

采用逐一檢測法,即將所有待檢樣本與試劑逐一混合檢驗,檢測結果即為此樣本結果,檢測次數等于感染總人數。這也是目前醫院采用的常規檢測方案。

二、二人分組法

在需要病毒核酸檢測確診概率較低的疾病時,可采用比逐一檢測法效率更高的檢測方法。我提出了一種二人分組法檢測。

1.方法概述

(1)將所有待檢樣本每2 份分1 組,每1 份分成2 小份。

(2)首先將每份的第1 小份混合。如果檢測結果是陰性,那么2 人均為陰性。

(3)否則,檢測第1 份的第2 小份。如果檢測結果是陰性,那么第1 人為陰性,第2 人為陽性。

(4)否則,第1 人為陽性。檢測第2 份的第2 小份。

(5)檢測結果即為第二人的患病情況。

為方便表述,檢測結果以“0”代表陰性,“1”表示陽性。例如“00”表示1 號、2 號樣本均為陰性。

圖1 二人分組法流程圖

2.分類討論

經過分析,二人分組法檢測情況與檢測次數關系如表1。

從表中可以看出,如果一組內同為陰性的數量不夠多,或確診概率較高,那么不宜運用本方法。

3.檢測次數與確診概率、人數的關系

利用C++編寫程序,根據表1 模擬100 次,表中檢測次數取100 次平均值,得到表2。

表1 二人分組法檢測情況與檢測次數的關系

表2 給定確診概率下二人分組法檢測次數與人數的關系

圖2 給定確診概率下二人分組法檢測次數與人數的關系

圖2 是根據表2 繪制得出。圖中“標準值”指運用逐一檢測法的檢測次數。從圖中可以看出,在確診概率一定時,檢測次數與樣本數正相關;當確診概率大約在38.1%以下時,使用二人分組法更優。

根據國家衛生健康委員會官方通報的數據,可粗略計算1 月26 日確診率p:

據此數據,當日新冠病毒檢測可考慮使用二人分組法。然而,多日來確診概率并不穩定,也有超過40%的情況。

三、四人分組法

在二人分組法的基礎上設四人分組法,預計可應用在確診概率更低的環境中。

1.方法概述

每4 份待測樣本為1 組,每份樣本分為3 小份。將第1 小份血液混合檢測。如果檢測結果為陰性,則4 人均為陰性。否則,將4 份樣本平均分成2 小組,具體操作方法參見二人分組法。基于此,編寫相應C++程序進行模擬。

2.與二人分組法的關系

當4 份樣本全為陰性時,每組只需檢測1 次;否則,每組比二人分組法多檢測1 次。

3.四種方法檢測次數與確診概率的關系

在對四種方法、1 000 人、100 次的模擬中,得到如表3 的數據。檢測次數取100次的平均值。

表3 給定確診概率下千人、四種方法的檢測次數對比

如果試劑足量,允許對密切接觸者進行測試,確診率可能較低,可考慮不使用逐一檢測法。

從表3 中可以看出,當確診概率低于38.1%時,可以選用二人分組法。

當社區出現確診病例,需要對社區所有與確診病例密切接觸的居民進行檢測時,一般確診率較低,可考慮選用此類方法以節約時間和材料。根據表3 中的數據繪制出圖3。

圖3 給定確診概率下千人、四種方法的檢測次數對比

4.函數曲線擬合

利用Excel 表格工具對上圖曲線(1 000 人)進行擬合。“嘗試次數”用n表示,確診概率用p表示。檢測次數擬合結果示意圖如圖4。

圖4 給定確診概率下千人、四種方法的檢測次數的函數擬合結果

根據擬合結果,二人分組法的擬合曲線滿足n=-501.1p2+1 500.6p+500.36,四人分組法滿足n=492.53p3-1 921p2+2 929.6p+252.19,八人分組法滿足n=-511.93p4+2 053.1p3-3 811.9p2+4 022.2p+123.99。

按照擬合結果對結論進行修正,當確診率高于38.1 583%時,考慮使用逐一檢測法。

5.關于多人分組法的構想

基于此構思,可以設想八人分組法、十六人分組法等,與二人分組法、四人分組法相似。依照之前的經驗與規律,確診概率越低,分組的檢測樣本就可以越多。

此外,每組的樣本數每增加1 倍,全部為陰性時,只需檢測1 次,大大節省時間。一旦存在陽性患者,則每組樣本數每增加1倍,需要的檢測次數就增加1 次。

此外,我發現,k(k=2n,n是自然數)人分組法中,最少(0%)的檢測次數是,最多(100%)是( 是總人數)。

四、結論

與醫院當前使用的逐一檢驗法相比,本文提出了二人分組法和四人分組法,并通過編程實現,分析了在不同確診概率下,二人分組法、四人分組法與逐一檢測法的優劣,找出不同方案選取的臨界參數值,并進行方案推薦。

隨著確診概率的變化,選用不同的檢測方案有更好的適應性。具體而言,在確診概率一定時,檢測次數與樣本數正相關;當確診概率高于38.2%時,逐一檢測法更優。當確診概率在21.7%~38.2%之間時,使用二人分組法檢測更優。當確診概率在21.7%以下時,可以考慮選擇四人分組法檢測。

除應用于大范圍檢測外,本方法在不同類型病毒核酸檢測(如環境污染病毒核酸檢測)等低概率檢測場合下有很好的應用效果。

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