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來源于Laceyella sp.的α-淀粉酶基因克隆、重組表達及酶學性質研究

2020-08-28 16:36:12趙海燕宋晨斌劉正亞馬興榮尚會會李安華關現軍王建設
生物技術通報 2020年8期

趙海燕 宋晨斌,2 劉正亞 馬興榮 尚會會 李安華 關現軍 王建設

(1. 安陽工學院生物與食品工程學院 安陽市微生物工程重點實驗室,安陽 455000;2. 天水師范學院生物工程與技術學院,天水 741001)

淀粉是普遍存在于植物體內,用于植物貯存能量的一種多糖[1]。目前生產淀粉的原料主要是玉米、小麥、薯類、稻谷等作物[2-3]。我國作為農業大國,根據中國農業統計資料顯示截止到2017年,上述四類作物的產量已占我國糧食總產量的90%以上[4]。淀粉是以葡萄糖為單位通過α-1,4糖苷鍵連接的高分子碳水化合物。依據單糖連接方式,淀粉可分為直鏈淀粉和支鏈淀粉[5]。淀粉是人類的重要食物來源,也是多種工業生產的原料[6]。淀粉加工工藝主要有酸法、酶酸法、全酶法和雙酶法等。其中,酶法在國內外加工淀粉中已廣泛應用[7]。α-淀粉酶(EC 3.2.1.1)是指通過水解淀粉分子內部中的α-1,4-糖苷鍵,將淀粉水解為糊精、單糖、少量麥芽糖和葡萄糖的一類酶[8]。來源于細菌和真菌的α-淀粉酶被廣泛應用于食品、生物燃料、造紙、醫藥、紡織、洗滌劑、動物飼料等行業,占整個酶制劑市場的25%-30%[9-10]。在面團發酵過程中,淀粉酶通過對淀粉的水解作用提高面團的糖含量,進而增大面包的體積,改善色澤[11-12]。在超聲波作用下對織物進行酶退漿,不僅可以提高退漿效率,還縮短退漿時間[13]。在生物乙醇的生產過程中,淀粉酶發揮著將原料醪液液化的作用[14]。淀粉酶還可以將含淀粉的食物顆粒水解成小分子的水溶性寡糖,用水沖洗后可去除污漬。當前90%的液體除垢劑中含有α-淀粉酶[15]。將淀粉酶添加到動物飼料中,可有效提高飼料中淀粉的消化率,有利于動物的生長發育[16]。

在不同的應用領域,對淀粉酶性能的要求不同。特別是工業化生產中的高溫、低溫、高鹽、堿性、酸性等苛刻條件制約著淀粉酶產業的發展[17-18]。因此,隨著全球資源環境壓力的持續增大和綠色合成產業的需求,酶的應用和需求量迅速增加,酶基因資源的挖掘和開發顯得非常迫切。目前,熱穩定性的α-淀粉酶主要來源于細菌(特別是芽孢桿菌),而放線菌和真菌來源的報道較少[19]。高溫放線菌類群是一類能夠在極端環境下生長代謝的革蘭氏陽性、化能異養菌。微生物學界認為它是介于細菌和放線菌之間的一類微生物。高溫放線菌具有代謝產物豐富,很多具有重要的工業價值,其中蛋白酶、淀粉酶、脂酶、纖維素酶等應用廣泛[20]。2005年,Yoon等[21]報道高溫放線菌-萊斯氏屬(Laceyella)。其主要分布于大曲[22-23]、溫泉[24]、海洋[25]、土壤[26]、堆肥[27]等。朱國東等[28]從云南騰沖熱泉中篩選到一株嗜熱放線菌Laceyellasp.RHA1,淀粉酶的最適溫度為60℃。來源于Laceyella sacchari5-氨基乙酰丙酸合成酶LS-ALAS不僅具有良好的熱穩定性,還有較高的酶活力[29]。研究還發現,高溫放線菌Laceyella sacchari有一定的降解纖維素的能力[30]。Singh[31]研究了Laceyella sacchariB42的木聚糖酶活性,其研究表明,最適反應溫度和pH分別為9.0和60℃。在60℃處理6 h后還保存90%的活性。Dolashki等[32]研究了Laceyella sacchari酪氨酸酶的性質。Laceyella sacchari嗜熱蛋白酶在乳酸乳球菌表達系統中成功表達,且重組酶的熱穩定性好,還在pH 6.0-11.0范圍內具有較高的活性[33]。來源于Laceyella putida葡聚糖酶LpGluA的最適反應pH和最適反應溫度分別為4.2和60℃[34]。Laceyella sacchari亮氨酸脫氫酶Ls-LeuDH也具有較好的熱穩定性[25]。在50℃處理72 h時,Laceyella sacchariLP175菌株聚乙丙交酯降解酶的粗酶對PLLA的分解效率達到91%[26]。另外,其還具有高效的生淀粉降解能力,生物乙醇的產量高達90.9 g/L[35]。Laceyellasp. DS3 α-淀粉酶AmyLa最適反應溫度和pH分別為55℃和7.0,其固定化酶的最適反應溫度沒有變化,但是提高了在pH4.0-7.0范圍內的酶活性[36-37]。來源于Laceyella sacchariTSI-2的α-淀粉酶在70℃和pH7.0時表現出最高活性,能夠高效去除棉布上的淀粉污漬,其固定化酶的穩定性增強[19,38]。四甲基吡嗪作為Laceyella sacchari產生的大量代謝物,還被認為是醬香白酒風味的主體成分之一[23]。因此,積極開展嗜熱放線菌Laceyellasp.的相關研究十分重要。

本研究從安陽面粉廠附近土壤里分離篩選產α-淀粉酶的Laceyellasp.菌株,采用同源克隆技術獲取α-淀粉酶基因。其次,在大腸桿菌表達系統中進行功能研究。最后,基于同源建模方法的蛋白質三維結構,分析差異氨基酸位點與酶學性質上的差異,為進一步的分子改良提供基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 樣品、菌株及質粒 樣品:采集自安陽市面粉廠附近的土壤。

菌株:E.coli Trans1-T1、E.coliBL21(DE3)購自北京全式金生物技術有限公司。

質粒:pET-22b(+)表達載體由本實驗室保存。

1.1.2 培養基 固體淀粉篩選培養基(g/L):可溶性淀粉5 g,牛肉膏3 g,蛋白胨10 g,NaCl 5 g,瓊脂20 g。

高氏一號培養基(g/L):可溶性淀粉20 g,KNO31 g,K2HPO40.5 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,NaCl 0.5 g,FeSO4·7H2O 0.01 g,瓊脂20 g。

1.1.3 主要儀器設備 PCR儀:伯樂生命醫學產品有限公司;HVE-50高壓蒸汽滅菌鍋:日本HIRAYAMA公司;SPECOOD S600分光光度計:德國耶拿分析儀器有限公司;HNY-ⅢB搖床:天津歐諾儀器股份有限公司;CF16RN高速離心機:株式會社日立制作所;電泳儀:伯樂生命醫學產品(上海)有限公司;?KTA蛋白純化儀:通用電氣醫療集團。

1.2 方法

1.2.1 產淀粉酶菌株的篩選及鑒定 取適量土樣加入到50 mL無菌水中制成土壤懸液,37℃,180 r/min培養20 min,作為原液。取原液進行梯度稀釋,分別取10-4、10-5、10-6的稀釋菌懸液100 μL涂布于固體淀粉篩選培養基上,37℃培養12 h。在固體淀粉篩選培養基上滴加碘液,選取能產生無色透明圈的菌落,且透明圈直徑與菌落直徑之比較大者進行菌株鑒定。

依據細菌基因組提取試劑盒說明書進行提取DNA操作。以細菌通用鑒定引物27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3'、1492R:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3',擴增菌株的16S rDNA序列。PCR擴增完成后,取適量產物于1%瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,以TAE緩沖液作為電泳緩沖液,電壓150 V,20 min。條帶大小驗證正確后,取PCR擴增產物送至公司測序。在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)網站上,選用BLASTn程序對菌株的16S rDNA序列與GenBank數據庫進行比對分析。最后,依據LPSN(http://www.bacterio.net/)公布的Laceyellasp.屬標準菌株,通過MEGA7.0軟件[39]的鄰位相連法[40],構建系統發育樹。

1.2.2 α-淀粉酶基因AmyL的克隆 以Laceyellasp.DS3(GenBank號:LN901326)基因組序列中的α-淀粉酶基因序列為依據,設計正向引物MF-8-1 F:5'-GAAGTGACCCAGCTACGAGATGAGC-3'以 及反向引物MF-8-1 R:5'-GACCCCAACTATATCAAGC CAGAATTCGG-3',通過PCR擴增得到α-淀粉酶基因AmyL全長。

1.2.3 pET-22b-AmyL重組質粒的構建 以重疊延伸PCR[41](Overlap-PCR)構建重組表達載體。根據α-淀粉酶基因AmyL以及質粒pET-22b(+)的序列設計引物Amy MF-8-1 F1:5'-GGATATCGGAATT AATTCGGATCCGAATTCGCTTTCTCCTGCGGATTGGC AAG-3'、Amy MF-8-1 R1:5'-GTGGTGGTGGTGGTGC TCGAGTTTGGTGAATATCTTTACTTCTTTGGGGC-3'、Amy MF-8-1 F2:5'-GCCCCAAAGAAGTAAAGATAT TCACCAAACTCGAGCACCACCACCACCAC-3'、Amy MF-8-1 R2:5'-CTTGCCAATCCGCAGGAGAAAGCG AATTCGGATCCGAATTAATTCCGATATCC-3'。其中Amy MF-8-1 F1與Amy MF-8-1 R2反 向 互 補,Amy MF-8-1 R1與Amy MF-8-1 F2反向互補。

通過上述引物對基因以及質粒進行PCR擴增,引入同源臂。再以質粒擴增產物為模板、基因擴增產物為大引物,兩者按照質量比為1∶10構建反應體系進行PCR擴增,吸取部分PCR產物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測。將經由PCR擴增后構建成功的重組表達載體命名為pET22b-AmyL,并轉化至E.coli Trans1-T1,同時選取菌液PCR驗證正確的單克隆進行測序驗證。

1.2.4 重組α-淀粉酶AmyL的表達及純化 將測序正確的重組表達載體轉化到E.coliBL21(DE3)中表達,然后以1%的接菌量轉接于200 mL LB液體培養基(氨芐霉素濃度:100 μg/mL)中,37℃、180 r/min培養2 h至OD600達到0.6-0.8之間,加入400 μL 0.5 mol/L IPTG,30℃、180 r/min誘導4 h。

通過?KTA蛋白純化系統純化胞內總蛋白溶液[42]:(1)將胞內總蛋白溶液經0.22 μm濾膜過濾;(2)用結合緩沖液平衡層析柱;(3)取經過濾膜過濾的樣品上樣;(4)用洗脫緩沖液進行線性洗脫;(5)收集洗脫峰進行酶活性的測定。對純化后的蛋白質進行SDS-PAGE以及HPLC-MS/MS質譜分析鑒定。

1.2.5 重組α-淀粉酶AmyL活性測定及性質研究 采用二硝基水楊酸(DNS)法[43]進行α-淀粉酶的酶活力測定。將900 μL 1%淀粉酶底物在45℃預熱5 min,加入100 μL稀釋的酶液反應10 min后,用DNS溶液終止反應,沸水浴5 min。反應液冷卻至室溫后,測定540 nm的吸光值。淀粉酶的酶活單位定義為:在最適溫度和最適pH下,每毫升反應體系每分鐘分解淀粉生成1 μmol還原糖所需的酶量為一個酶活單位。

1.2.5.1 最適反應溫度的測定 在pH6.0反應體系下,分別測定溫度在25-60℃時的酶活力,反應時間為10 min。酶活力最高點即為酶的最適反應溫度,同時計算不同溫度下的相對酶活力。

1.2.5.2 最適反應pH的測定 在45℃反應條件下,以檸檬酸緩沖液和磷酸緩沖液配制,分別測定pH為4.8、5.2、5.6、6.0、6.4、6.8、7.2、7.6、8.0時的酶活力,反應時間為10 min。酶活力最高點即為酶的最適反應pH,同時計算其他pH下的相對酶活力。

1.2.5.3 溫度穩定性的測定 取適當酶液,分別放置在40、45、50、60℃下水浴保溫10、20、30、50 min,測定殘余的酶活力,以未處理的酶液作對照,計算處理不同時間后殘余的相對酶活力。

1.2.5.4 pH穩定性的測定 取適當酶液在溫度為45℃下,分 別 在pH為5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0下保溫1 h后,以未處理的酶液作對照,測定不同pH下處理后殘余的相對酶活力。

1.2.5.5 酶促反應動力學研究 以經過蛋白質純化后的目的蛋白,對淀粉酶的動力學參數進行測定。配制不同濃度的淀粉底物,基于淀粉酶的最適反應溫度、最適反應pH,測定酶的活力,同時測定蛋白濃度,計算出酶的比活力。比活力定義:每毫克酶蛋白所含的酶活力單位。以1/[S]為橫坐標,1/比活為縱坐標,作Lineweaver-Burk雙倒數圖[44]。

1.2.5.6 金屬離子及化學試劑對酶活力的影響 在酶學性質測定反應體系中加入終濃度分別為1、5和10 mmol/L的不同離子及化學試劑,測定酶活力,以不加化學試劑的反應體系作為對照。探究不同金屬離子及化學試劑對淀粉酶活力的影響。

1.2.5.7 底物特異性研究 將可溶性淀粉、支鏈淀粉、馬鈴薯淀粉、普魯蘭多糖、α-環糊精、β-環糊精、γ-環糊精等底物分別溶解于0.1 mmol/L pH 6.0的檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖溶液,終濃度為 5 mg/mL。加入適當稀釋倍數的重組淀粉酶AmyL,在45℃下反應10 min。以可溶性淀粉為底物時的酶活力為100%,分別計算其他底物的相對酶活力。

1.2.6 重組酶的同源建模 從PDB數據庫中檢索與AmyL序列相似且功能已知的α-淀粉酶,以來源于Anoxybacillus的α-淀粉酶(PDB ID號:5A2B;序列一致性:56%)為模板,利用 Discovery Studio 2018軟件對淀粉酶AmyL進行三維結構的建模。然后使用相關模塊對構建好的模型進行能量最小化和結構優化,并采用Ramanchandran Plot和Profile-3D評估模型。Deepview軟件也應用于部分結構功能分析。

2 結果

2.1 產淀粉酶菌株的篩選及鑒定

土壤樣品經稀釋涂布后,在固體淀粉篩選培養基上,選取具有較大透明圈的菌落作為候選菌株。在多次分離、純化的基礎上,獲得目的菌株,編號為MF-8-1。菌株MF-8-1在固體淀粉篩選培養基上的菌落特征為純白色、干燥、多皺、邊緣不規則,能產生明顯的透明圈。

提取MF-8-1的基因組,利用引物27F和1492R擴增其16S rDNA序列后進行測序。經序列比對后發現其與Laceyellasp.屬的16S rDNA序列(GenBank號:EU430566.1)的一致性最高,序列相似性為99%。依據高溫放線菌科及Laceyellasp.屬的不同種16S rDNA序列,構建系統發育樹(圖1)。結果表明MF-8-1與Laceyella sediminis(GenBank號:FJ422144)的進化距離最小。

2.2 α-淀粉酶基因AmyL的克隆及序列分析

以MF-8-1基因組DNA為模板,MF-8-1 F、MF-8-1 R為引物,在KOD-Plus-Neo高保真聚合酶的作用下,擴增出一條2.2 Kb左右的片段,與預期DNA片段大小符合。測序結果表明該基因全長為1467 bp,編碼488個氨基酸和一個終止密碼子,將該基因命名為AmyL。利用SignalP 4.1 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)對AmyL編 碼 蛋 白 進行信號肽預測。結果表明AmyL編碼蛋白具有一個由35個氨基酸殘基組成的信號肽,剪切位點介于Leu35和Ser36之間。

圖1 菌株MF-8-1的16S rDNA系統發育樹

2.3 重組α-淀粉酶AmyL的誘導表達及純化

將構建的重組表達載體轉化到BL21,通過PCR方法驗證,獲得重組表達菌株。經IPTG誘導后,重組菌的細胞破碎液具有很高的淀粉酶活性,而空白對照無法檢測出淀粉酶活性。同時,對培養兩種重組菌的上清液進行淀粉酶活性的檢測后,結果顯示上清液均無活性,表明淀粉酶基因AmyL在周質中表達。

圖2 重組α-淀粉酶AmyL的SDS-PAGE分析

對重組菌的胞內總蛋白進行蛋白純化,并對純化后蛋白進行SDS-PAGE電泳檢測。結果表明AmyL基因在E.coliBL21(DE3)中得到了較好的表達(圖2),在55 kD附近出現了較為明顯的條帶,且與預期大小相符。經質譜鑒定,有32個肽段與理論上的肽段相匹配,其肽段覆蓋率為73%,說明重組子表達的蛋白質為AmyL。

2.4 重組α-淀粉酶AmyL的酶學性質

2.4.1 重組α-淀粉酶AmyL的最適反應溫度及溫度穩定性 重組α-淀粉酶AmyL的最適反應溫度為45℃,在40-50℃下可保持較高酶活力,在60℃下酶活力全部損失(圖3)。在40-50℃下,酶的穩定性較好,保溫50 min后酶活力仍能維持在80%左右。但在60℃下處理50 min后,酶活力全部損失(圖4)。

圖3 溫度對重組α-淀粉酶AmyL酶活力的影響

圖4 重組α-淀粉酶AmyL的溫度穩定性

2.4.2 重組α-淀粉酶AmyL的最適反應pH及pH穩定性 重組α-淀粉酶AmyL的最適反應pH值為6.0,在pH 5.6-6.8下具有較高的酶活性,其相對酶活在80%以上。pH<5.6后,酶活力急劇下降。在pH 4.8、8.0處,酶活力完全損失(圖5)。在pH 6.0-10.0時,酶活力均無下降且有些許上升,說明該酶能耐受偏堿性環境(圖6)。

圖5 pH對重組α-淀粉酶AmyL酶活力的影響

圖6 重組α-淀粉酶AmyL的pH穩定性

2.4.3 重組α-淀粉酶AmyL的動力學參數 以0.1、0.4、0.7、1.0、2.0、3.0和5.0 mg/mL濃 度 的可溶性淀粉作底物,測定酶的活力;做Lineweaver-Burk雙倒數圖(圖7),數據分析后得出酶的比活、Km和Vmax分別為185.39 U/mg、0.95 mg/mL、343.12 μmol/(min·mg)。進一步計算得出,AmyL的Kcat為315.28 s-1,催化效率Kcat/Km為331.13 mL/(s·mg)。

圖7 重組α-淀粉酶AmyL的Lineweaver-Burk雙倒數圖

2.4.4 金屬離子及化學試劑對重組α-淀粉酶AmyL的影響 以未加化學試劑的反應體系作為對照,得到不同濃度的金屬離子及化學試劑對重組酶活力的影響如表1所示。當體系中Na+、K+、Ca2+濃度達到10 mmol/L濃度時,對酶活力有一定的保護作用,而較低濃度下會使酶活力損失;Mn2+、Mg2+、EDTA對重組α-淀粉酶AmyL均存在抑制作用,但Mn2+的抑制作用比Mg2+、EDTA略強;SDS對重組α-淀粉酶AmyL具有強抑制作用,即使只有1 mmol/L,也能使酶活力全部喪失,說明重組α-淀粉酶AmyL對SDS敏感。

表1 金屬離子及化學試劑對酶活力的影響

2.4.5 重組α-淀粉酶AmyL的底物特異性 重組α-淀粉酶AmyL不僅可以高效地催化可溶性淀粉的水解,對其他底物也表現出較高的水解活性。將重組α-淀粉酶AmyL對可溶性淀粉的酶活定義為100%時,AmyL對于支鏈淀粉和馬鈴薯淀粉的相對酶活力分別為180.3%和111.6%,對β-環糊精和普魯蘭多糖的相對酶活力分別為2.5%和0.8%,而以α-環糊精和γ-環糊精為底物時,未檢測到活性。

2.5 α-淀粉酶AmyL同源建模及結構分析

AmyL與 來 源 于Laceyella sacchari的α-淀 粉酶(TCW41560)的序列一致性為99%,與晶體結構已知的Anoxybacillusα-淀粉酶5A2B的一致性為56%。以5A2B作為模板,對AmyL進行同源建模。從結構上可以看出(圖8),AmyL由3個結構域組成,即結構域A、B、C。結構域A由8個α-螺旋和8個β-折疊交替組成的TIM桶構成;結構域B是TIM桶的第3個α-螺旋和β-折疊之間形成的不規則β-like結構;結構域C由位于蛋白質C端的8個反平行β-折疊以及一些無規則卷曲構成。通過分析發現,結構域A的β3、β4、β5和β7折疊C端附近存在GH13家族的4個CSR:CSR I(152DVVANH157)、CSR II(228DGLRVDTVKHVPKWFWREF246)、CSR III(256GEVFHG261)和CSR IV(317FIDNHD322)。

圖8 AmyL的三維結構

3 討論

淀粉酶廣泛存在于動植物及微生物中,其中微生物來源的淀粉酶具有各種不同的性質,在淀粉酶的開發研究中具有相當重要的地位。國內外報道產淀粉酶的微生物[29-35]主要有:枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)[45]、地衣芽孢桿菌(Bacillus licheniformis)[46]、蠟狀芽孢桿菌(Bacillus cereus)[47]、巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)[48]、多粘類芽孢桿菌(Bacillus polymyxa)[49]、高溫放線菌(Thermoactinomyces)[50]等。

本研究根據Laceyellasp.DS3基因組序列中的α-淀粉酶基因序列,采用同源克隆從Laceyellasp.中克隆出α-淀粉酶基因AmyL并在大腸桿菌中表達。其最適反應溫度為45℃,最適反應pH值為6.0,高濃度的Na+、K+、Ca2+能提高該淀粉酶的穩定性。朱國東等[28]從云南騰沖熱泉中篩選到一株嗜熱放線菌Laceyellasp.RHA1,經過硫酸銨沉淀和分子篩層析,獲得低分子量的淀粉酶(11.2 kD)。其最適溫度為60℃,最適pH值為6.0,Ca2+能夠提高野生酶的最適反應溫度。Lomthong等[35]利用發酵條件優化方法,研究了Laceyella sacchariLP175的分解酶對木薯生淀粉的降解能力;且生物乙醇的產量高達90.9 g/L(理論產量的88%)。來源于溫泉的Laceyella sacchariTSI-2α-淀粉酶的最適反應溫度為70℃,在37-100℃都具有酶活性,100℃處理1 h還保留70%以上的活性。其最適反應pH值為7.0,在pH 4.0-9.0內有酶活性;在pH 4.0條件下處理3 h,還保留60%以上的相對酶活力;在pH9.0條件下處理6 h,還保留70%以上的相對酶活力;固定化酶提高了在有機溶劑中的穩定性;表面活性劑還可提高相對酶活力;能夠高效去除棉布上的淀粉污漬[19,38]。嗜熱微生物Thermomyces dupontiiL18的TdAmy A的最適反應溫度和pH值分別為50℃和6.5[51]。

Laceyellasp.DS3的α-淀粉酶的野生酶的最適溫度為50℃,在E.coli中表達的重組AmyLa最適溫度為55℃,最適pH為7.0;游離酶在pH3-5時的相對酶活力小于20%,在pH 6-7時的相對酶活力在80%以上;而固定化酶在pH3-8時相對酶活力保持在80%以上[36-37]。本研究的AmyL與α-淀粉酶AmyLa以及來源于Thermoactinomyces的α-淀粉酶AmyTV1[52]的酶學性質存在較大差異(表2)。但通過氨基酸序列比對發現三者的序列一致性極高,只存在4個位點的差異,分別是261、342、361、420位氨基酸。

為了從分子層面探究其酶學性質產生差異的原因,通過Discovery Studio 2018軟件構建了AmyL、AmyLa、AmyTV1的三維結構,發現三者的整體三維結構基本保持一致,其中261、361位點位于結構域A的α-螺旋上、342位點位于結構域A的loop結構上、420位點位于結構域C的反平行β-折疊上(圖8)。以AmyL作為參照,利用Deepview軟件分析AmyLa、AmyTV1在上述4個氨基酸位點的氫鍵數目變化。結果顯示,當361位氨基酸由組氨酸(AmyL)變 為 酪 氨 酸(AmyLa、AmyTV1)時,Tyr361與Thr365之間會形成一個新的氫鍵,該位點的氫鍵由4個變為5個。在蛋白質內部形成一個氫鍵所獲得平均能量約為0.6 kcal/mol[53]。Suvd等[54]通過比較來源于嗜中溫微生物Bacillus licheniformis的α-淀粉酶(Bacillus licheniformisα-amylase,BLA)以及來源于嗜熱微生物Bacillus stearothermophilus的α-淀粉酶(Bacillus stearothermophilusα-amylase,BSTA)的 結構發現,BSTA較BLA在三維結構上增加了9個氫鍵,使得BSTA獲得了更好的熱穩定性。因此,氫鍵數量是重組酶AmyL的最適反應溫度低于AmyLa、AmyTV1的最適反應溫度的因素之一。此外,α-淀粉酶AmyL具有典型的(α/β)8桶狀結構(TIM桶),該結構是α-淀粉酶具有催化活性的關鍵因素[55]。α-淀粉酶AmyL的361位點位于TIM桶的第8個α-螺旋C端上,氫鍵數量的增加使其在折疊成螺旋結構時易產生較大的構象張力[56],進而引起熵變的增加使得AmyL的最適溫度較AmyLa、AmyTV1有所下降。因此,361位點對AmyL的最適反應溫度及最適反應pH具有重要影響。

表2 α-淀粉酶AmyL、AmyLa、AmyTV1的最適反應溫度及pH比較

4 結論

本研究從安陽面粉廠附近土壤中篩選到一株具有淀粉酶活性的菌株,經過分子生物學鑒定,確定為Laceyellasp.。將其α-淀粉酶基因克隆,并在E.coliBL21(DE3)中成功表達。α-淀粉酶基因AmyL全長1 467 bp,編碼488個氨基酸和一個終止密碼子,在Leu35和Ser36之間存在信號肽酶切割位點。重組酶AmyL的最適反應溫度為45℃,最適反應pH值為6.0,在溫度為40-50℃、pH值為6.0-10.0的范圍內具有較穩定的酶活力,其Km和Vmax分別為0.95 mg/mL和343.12 μmol/(min·mg),高 濃 度 的Na+、K+、Ca2+對重組酶AmyL酶活力有保護作用。

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