李林



摘要 通過計算引物的數量、選擇引物的種類及設計引物的序列等幾類試題的分析,加深對PCR技術過程及應用的理解,提高學生解題能力及高考備考水平。
關鍵詞 例析 分類 PCR引物
中圖分類號C633. 91
文獻標志碼B
PCR技術是高考考查的重點難點內容之一,試題種類多,難度大,給學生的學習及備考帶來一定的困難。統計近幾年江蘇高考及江蘇各大市模擬考試卷發現,主要考查與PCR引物相關的知識,現歸納分類及例析如下(題目來源原題節選或整理)。
1 計算引物的數量
【例1】目標片段的DNA分子經PCR反應循環n次,共需要消耗引物的數量為
個。
分析:PCR反應的原理是利用DNA雙鏈復制原理,PCR反應循環n次就是DNA分子擴增(復制)n次,產生DNA分子片段為2n個,單鏈為2n+1,其中每條子鏈的合成均需要1個引物,而2條母鏈不需消耗引物,故共需要消耗引物的數量為2n+1-2個。
參考答案:2n+1-2。
【例2】運用PCR技術擴增DNA分子時,需經過變性一復性一延伸一重復過程,經過4輪循環后,得到的子代DNA分子中,不同時含有兩種引物的DNA分子占____。
分析:經過4輪循環擴增后,得到的子代DNA分子數目為24(或16)個,由于PCR過程中每條子鏈的合成均需要1個引物,且每一輪產生的子鏈均可成為下一輪的模板,所以不含引物的鏈為母鏈,始終2條,并且分布在2個DNA分子中,其余DNA分子均由兩條方向相反(含有兩種引物)子鏈組成,故不同時含有兩種引物的DNA分子占1/8。
參考答案:1/8。
2選擇引物的種類
【例3】利用PCR技術可以擴增目的基因,PCR反應體系中除含緩沖液、模板DNA、dNrIP(包含dATP、dCTP、dCIP、dTTP)、引物以外,還應含有Taq酶。引物應選用圖l中的
(填圖中標號)。
分析:引物是利用PCR技術擴增目的基因的前提,合成的依據是目的基因兩端的核苷酸序列,PCR過程中兩個引物分別與目的基因兩端結合,延伸方向相反,結果擴增出兩個引物間的DNA片段。
參考答案:AD。
[例4]為了篩選出轉入了重組質粒的大腸桿菌,應在篩選平板培養基中添加四環素,平板上長出的菌落,常用PCR鑒定,所用的引物組成為圖2中
。
分析:PCR鑒定目的基因的原理就是利用引物的特異性,添加特異性引物后看能否擴增出目的基因產物,故選引物甲和引物丙。
參考答案:引物甲 引物丙
【例5】為鑒定篩選出的菌落中是否含有正確插入目的基因的重組質粒,擬設計引物進行PCR鑒定。圖3所示為甲、乙、丙3條引物在正確重組質粒中的相應位置,PCR鑒定時應選擇的一對引物是 ____ 。某學生嘗試用圖中另外一對引物從某一菌落的質粒中擴增出了400 bp片段,原因是____。
分析:如果利用一個擴增目的基因的引物和一個擴增質粒的引物,這兩個引物位于重組質粒兩側且方向相反,就能擴增出正確插入的目的基因,如果插入方向相反,則沒有產物,故選擇乙丙。據圖3,若擴增出的DNA片段為400 bp,則正好是選擇甲、乙作為引物后目的基因反向連接的結果,故原因是目的基因的反向連接。
參考答案:乙丙 目的基因的反向連接
3 設計引物的序列
【例6]為了便于擴增的DNA片段與表達載體連接,需在引物的_____端加上限制性酶切位點,且常在兩條引物上設計加入不同的限制性酶切位點,使DNA片段能定向插入表達載體,減少自連。
分析:在PCR技術中,引物的3'末端必須與目的片段完全相配,引物的5'末端可以不與目的片段互補。在耐高溫的DNA聚合酶的作用下,從引物的3 '端延伸DNA鏈,故限制性酶切位點相關序列應加在引物的5'端。
參考答案:5。
[例7]定點突變技術是指通過聚合酶鏈式反應(PCR)向目的基因片段中引入所需變化。GFP(綠色熒光蛋白)的發光基團是第65至67位的三個氨基酸(絲氨酸一酪氨酸一甘氨酸),該發光基團可利用定點突變技術使第66位酪氨酸換成組氨酸,即可發出更明亮的藍光,成為藍色熒光蛋白(圖4)。
(1)定點突變第一步得把突變位點設計在引物上,據圖中信息人工合成短DNA引物應包含的序列是________。
分析:定點突變一般設計在引物的中間位置,突變位點堿基不能與模板鏈互補配對,但兩側序列可以互補配對,在Taq酶的作用下完成PCR擴增。由于第一輪產生的子鏈可以成為下一輪的模板,所以可以擴增出含定點突變的DNA片段。據題意可知,使第66位酪氨酸換成組氨酸,只要將其對應DNA模板鏈中的ATC變成GTG即可實現,故人工合成短DNA引物應包含的序列是AGACTGCTC。
參考答案:ACACTGCTC。
【例8】如圖5是科研人員利用重組PCR技術將A基因和B基因連接在一起的過程,先分別對兩個基因進行擴增,除去多余引物后,將產物混合,再對產物進行PCR擴增,得到融合基因。本實驗PCR1和PCR2選擇的引物分別是 _____ 和____ ,圖中引物2或引物3設計的要求是
分析:PCR技術能擴增出方向相反的兩個引物間的片段,據圖可知PCRI應選擇引物1和引物2,PCR2應選擇引物3和引物4。圖中顯示PCRI和PCR2得到的產物可以通過堿基互補配對形成重疊區段,由此可知引物2和引物3是具有互補末端的引物,同時既能與基因A末端配對又能與基因B末端配對,故引物2或引物3設計的要求是將兩個基因的末端序列設計在同一引物中。
參考答案:引物1 引物2 引物3 引物4將兩個基因的未端序列設計在同一引物中