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基于機器學習的視網膜圖像識別模型設計

2020-11-10 04:38:45張貴英張俊飛
電腦知識與技術 2020年27期
關鍵詞:自動識別

張貴英 張俊飛

摘要:早產兒視網膜病變是小兒致盲的主要原因之一,發病率在我國呈持續上升的趨勢。人工診斷存在費時費力,依靠醫生經驗等不足。針對此,提出了基于機器學習的視網膜圖像識別模型,首先基于原始圖像,借助圖像處理、傳統機器學習方法和對抗生成網絡技術得到生成圖像,然后基于這些圖像和原始圖像,提取其特征,最后對級聯后的特征進行分類。該模型有望為早產兒視網膜病變的自動篩查系統提供技術支持。

關鍵詞:視網膜圖像;自動識別;模型設計

中圖分類號:TP181 文獻標識碼:A

文章編號:1009-3044(2020)28-0176-02

開放科學(資源服務)標a碼(OSID):

1 引言

早產兒視網膜病變( Retinopathy of Prematurity,ROP)曾稱為Terry綜合征或晶狀體后纖維增生癥,最早由Terry在1942年發現[1]。孕期34周以下,出生體重小于1500、出生后吸氧史,發病率約為60%,孕期更短或更低出生體重者,發生率可達66%- 82%。由于ROP可致盲,早在1984年到1987年,由國際組織ROP專家建立了詳細的病變分類標準,以促進臨床治療。指出了ROP發生的部位分為3個區域,并將病變的嚴重程度分為5期,圖1為正常和ROP3期圖像示例。另外,需要注意的是Plus疾病:即后極部視網膜血管遷曲怒張,表明ROP處于迅速進展期。ROP最早出現在矯正胎齡32周,閾值病變大約出現在矯正胎齡37周,早期篩查和治療可以阻止病變的發展。

目前,眼科醫生通過數字視網膜照相機(如RetCam3)獲取早產兒視網膜眼底圖像,然后人工診斷有無病變及分級,這種方式面臨幾個問題。首先,ROP需要通過開展大規模的眼底普查,對潛在眼底病患者進行定期的眼底視網膜檢查。然而,由于眼底病潛在患者數量較大,眼科專家人工檢查工作開展較為困難,尤其在中國和印度這樣人口眾多的國家。其次,ROP的分類標準是定性而不是定量的,對于同一個患者,不同的眼科專家可能給出不同的診斷結果。再者,通過人工觀察眼底視網膜圖像,專家會存在視覺疲勞等情況,此時可能會誤診疾病。ROP-旦發生,進展很快,可有效治療的時間窗口很窄,早期診斷和及時治療可以有效地減少不良后果和視力喪失。因此,為了提高眼底病診斷效率和精度,應推進大規模眼底病變自動識別技術,以實現眼底病的早期防治。

2 ROP圖像自動識別研究現狀

ROP圖像自動識別可分為兩類。第一類,基于傳統方法的ROP自動診斷。自動或者半自動ROP診斷主要針對Plus疾病,該疾病的診斷依據為血管是否正常,因此很多研究都集中在血管的分割、血管直徑的測量和血管迂曲的測量等方面[2]。基于這三步,計算機輔助診療系統“ROPTooI”[3]恫世,該設備可輔助醫生診斷Plus疾病。另外,“i-ROP,I[4]診斷系統也用來診斷Plus疾病。這些診斷系統的準確性高度依賴于血管的分割,如果血管分割有誤,則會嚴重影響后續的識別工作。由于受圖像本身、光照和對比度等影響,血管的分割是一個困難的任務。第二類,基于深度學習的ROP自動診斷。2016年Worrall等[5]首次提出使用深度神經網絡診斷Plus疾病,對于其他疾病,該研究僅僅診斷是否有病癥存在,而未做具體的病變分類。在預處理時,該研究僅僅使用了旋轉和切割等傳統數據增大方法。隨后,Brown[6]等先對血管進行分割,然后再使用深度神經網絡對Plus疾病進行自動診斷。Hu[7]等提出了基于深度神經網絡的ROP自動分析方法,該方法未使用樣本增大相關算法。除了對Plus疾病診斷外,Mulav[8]等建立了一個基于深度學習技術的ROP圖像中分界線的檢測系統,該系統使用了175張眼底圖像作為訓練集,45張圖像作為測試集。在這些研究中,其主要任務主要集中在Plus疾病的識別上,訓練集數量一般較少,要么未使用數據增大算法,要不僅使用了旋轉等基本數據放大算法。

3 ROP圖像自動模型設計

ROP圖像自動識別模型為有監督學習結構,需要有標注好的數據對網絡進行訓練和測試。首先明確ROP發生部位的分區:I區是以視盤為中心,視盤中心距黃斑中心凹距離2倍為半徑的圓形區域。Ⅱ區以I區以外,以視盤為心,視盤至鼻側鋸齒緣的距離為半徑的環形區域。Ⅲ區:除I區和Ⅱ區外剩余的月牙形區域。其次,明確ROP病變分期,ROP病變根據不同的程度可以分為5期。1期表現為周邊無血管區與后極部視網膜血管末梢之間出現分界線;2期表現為嵴期分界線增寬、增高,呈嵴狀隆起;3期表現為新生血管形成并長人嵴上;4期表現為視網膜部分脫離;5期表現為視網膜全脫離。根據這些信息,需要眼科專家將早產兒視網膜圖像標注為正常、1期、2期、3期、4期和5期等類別。如果出現爭議,則需要討論。若討論后仍未達成一致,則丟棄此圖像。

對于標注好的圖像,使用基于圖像處理方法、傳統機器學習算法和對抗生成網絡模型生成對應的生成圖像。設計卷積神經網絡,分別提取基于原始樣本和生成樣本的特征,將這些特征級聯后,送到分類器中識別分類,然后送到分類器中自動識別分類,模型如圖2所示。每設計一個生成模型,就予以實驗驗證,并借助實驗結果對其進行充分的驗證,從而保證整個課題研究最終的成功。將原始圖像和生成圖像按照多種占比結合,比如0比1或者1比0等。將標注好的數據隨機按照不同比例分成三部分:第一部分占總量的80%,用于網絡的訓練;第二部分占10%,用于網絡的驗證;第三部分占10%,用于網絡的測試,該比例可在一定范圍內進行調整。不斷調整網絡參數,如隱藏層的層數、學習率、batch大小等,其中學習率將使用指數衰減學習率,即先使用較大的學習率來快速得到一個比較優的解,然后逐步減少學習率,使得模型在訓練后期更加穩定。利用驗證數據,對訓練的網絡進行驗證,并根據驗證結果對網絡中的參數做進一步優化。利用測試數據,對網絡進行測試,測試網絡進行識別的準確性,尤其是使用交叉驗證法以充分評估構建網絡的性能。

4 結束語

早產兒視網膜病變疾病是兒童致盲的重要原因之一,占兒童盲的6%到18%左右。一般新生兒胎齡越小,出生體重越低,其發生率越高。建立早產兒視網膜病變自動識別模型,對眼底病進行大規模篩查,以實現早產兒眼底病的早期防治。

參考文獻:

[1] Terry T L.Extreme prematurity and fibroblastic overgrowth ofpersistent vascular sheath behind each crystalline lens fromthe massachusetts eye and ear infirmary.this investigation ismade possible through the special fund for research for pathol-ogy laboratory[J]. American Journal of Ophthalmology, 1942, 25(2):203-204.

[2]Aslam T,Fleck B,Patton N,et al.Digital image analysis of plusdisease in retinopathy of prematurity[J].Acta Ophthalmologica,2009,87(4):368-377.

[3] Wallace D K.Zhao Z E,Freedman S F.A pilot study using“ROP tool" to quantify plus disease in retinopathy of prematu-rity[J].Journal of American Association for Pediatric Ophthal-mology and Strabismus,2007,11(4):3 81-387.

[4] Ataer-Cansizoglu E,Bolon-Canedo V,Campbell JP, et aLComputer-based image analysis for plus disease diagnosis inretinopathy of prematurity: performance of the "i-ROP" sys-tem and image features associated with expert diagnosis[J].Translational Vision Science& Technology,2015,4(6):5.

[5]WorrallD E,Wilson C M, Brostow G J.Automated retinopathyof prematurity case detection with convolutional neural net-works[M]//Deep Leaming and Data Labeling for Medical Appli-cations.Cham:Springer InternationaIPublishing,2016:68-76.

[6] Brown J M,Campbell J P,Beers A,etal. Automated diagnosisof plus disease in retinopathy ofprematurity using deep convo-lutional neural networks[J].JAMA Ophthalmology, 2018, 136(7):803-810.

[7] Hu J J,Chen Y Y,Zhong J,et al.Automated analysis for reti-nopathy of prematurity by deep neural networks[J].IEEE Trans-actions on Medical Imaging,2019,38( 1):269-279.

[8] Mulay S,Ram K,Sivaprakasam M,et al.Early detection of reti-nopathy of prematurity stage using deep learning approach[C]//SPIE Medical Imaging.Proc SPIE10950,Medical Imaging 2019:Computer-Aided Diagnosis, SanDiego, California, USA. 2019,1095:1095022.

[通聯編輯:唐一東]

作者簡介:張貴英,女,甘肅文縣人,博士,副教授,研究方向為圖像處理,計算機輔助診療。

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