科學(xué)家揭示肝癌分子特征全景

中國科學(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)（中山醫(yī)院）肝癌研究所教授樊嘉等借助大規(guī)模的蛋白質(zhì)基因組平臺(tái)，首次實(shí)現(xiàn)了對(duì)乙肝相關(guān)肝癌的系統(tǒng)性分析，為更深入地探索肝癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制及指導(dǎo)肝癌的個(gè)體化精準(zhǔn)診療帶來了新希望。該成果在線發(fā)表于《細(xì)胞》。

樊嘉等通過與中科院上海藥物研究所研究員周虎及中科院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所研究員高大明研究組合作，利用159 例手術(shù)切除的肝癌樣本，全面檢測和分析了基因突變譜、拷貝數(shù)變異、表達(dá)譜、蛋白質(zhì)組及磷酸化蛋白質(zhì)組，通過關(guān)聯(lián)分析與生物學(xué)實(shí)驗(yàn)，全面解析了肝癌分子特征和發(fā)生發(fā)展的機(jī)制，揭示了我國肝癌突變譜與西方肝癌突變譜的不同，提示了基于中國人肝癌數(shù)據(jù)開展臨床轉(zhuǎn)化研究的必要性。

據(jù)樊嘉介紹，我國相當(dāng)一部分乙肝患者曾接受中醫(yī)藥治療，中藥的不當(dāng)使用與肝癌的發(fā)生發(fā)展具有一定的相關(guān)性。研究人員發(fā)現(xiàn)，35%的肝癌樣本中含有馬兜鈴酸誘導(dǎo)的基因突變“指紋”，同時(shí)，蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)也檢測到了由馬兜鈴酸基因突變“指紋”編碼的變異蛋白。馬兜鈴酸的突變“指紋”與腫瘤突變負(fù)荷、腫瘤新抗原、微環(huán)境免疫耐受顯著相關(guān)，提示免疫治療對(duì)該類肝癌患者的潛在臨床價(jià)值。他們還發(fā)現(xiàn)，肝癌mRNA 表達(dá)和蛋白表達(dá)的相關(guān)性僅為0.54，約20%蛋白質(zhì)對(duì)基因拷貝數(shù)變異產(chǎn)生了顯著的對(duì)沖效應(yīng)。

該研究還系統(tǒng)提示了代謝異常在肝癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用，發(fā)現(xiàn)代謝相關(guān)蛋白質(zhì)的變化是肝癌和非肝癌組織最大的差異，并與有無“門靜脈癌栓”這一肝癌特殊的臨床特征密切相關(guān)。