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基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的冠狀動脈造影圖像血管分割和節(jié)段識別

2020-12-02 02:23:36謝麗華史曉彤王筱斐黃云飛趙森祥杜天明管常東張洪剛徐波
中國循環(huán)雜志 2020年11期
關(guān)鍵詞:模型

謝麗華,史曉彤,王筱斐,黃云飛,趙森祥,杜天明,管常東,張洪剛,徐波

心血管疾病是我國居民的首位死亡原因,其發(fā)病率和死亡率呈逐年上升趨勢[1],其中冠心病是最常見的心血管疾病。冠狀動脈造影是冠心病診斷和指導(dǎo)治療的重要工具[2],中國近90%的經(jīng)皮冠狀動脈介入治療(PCI)在冠狀動脈造影診斷當(dāng)時完成[3],因此快速而準(zhǔn)確的冠狀動脈造影影像診斷十分重要。隨著我國冠心病患者逐年增加,大量的冠狀動脈造影給臨床醫(yī)生造成了沉重的負(fù)擔(dān)。并且,冠狀動脈造影診斷依賴于醫(yī)生的臨床經(jīng)驗,不同醫(yī)生對同一影像的解讀往往存在一定的主觀差異性,從而影響治療決策。隨著技術(shù)的進(jìn)步,人工智能已在多個醫(yī)學(xué)影像領(lǐng)域證明其應(yīng)用潛力,如皮膚癌、糖尿病視網(wǎng)膜病變的分類診斷等[4-5]。深度學(xué)習(xí)作為人工智能強(qiáng)大算法之一,其自身可學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)的內(nèi)在規(guī)律和表示層次,在圖像識別方面具有較強(qiáng)的能力。在既往研究中,深度學(xué)習(xí)在冠心病圖像領(lǐng)域研究多集中于冠狀動脈CT,比如冠狀動脈中心線提取[6]、圖像的噪聲抑制[7]、病變狹窄程度測量及鈣化檢測[8]等。深度學(xué)習(xí)用于冠狀動脈造影影像診斷的研究比較缺乏,Nasr-Esfahani 等[9]利用深度學(xué)習(xí)技術(shù)進(jìn)行冠狀動脈造影血管分割,即從圖像中自動提取血管結(jié)構(gòu)信息,研究使用圖片處理方法對圖像進(jìn)行對比度調(diào)整,但這一措施耗費時間長,且將背景中與血管相似的結(jié)構(gòu)同步增強(qiáng),引入干擾項。此外,要實現(xiàn)冠狀動脈造影的人工智能診斷,模型還需具備節(jié)段識別能力,即在分割的冠狀動脈結(jié)構(gòu)上識別各冠狀動脈血管節(jié)段的解剖定位,以確定病變位置。本研究結(jié)合深度學(xué)習(xí)技術(shù),旨在研發(fā)用于冠狀動脈血管分割和節(jié)段識別的人工智能網(wǎng)絡(luò)。

1 資料與方法

研究對象:連續(xù)納入2018 年7 月于中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院行冠狀動脈造影檢查的患者2 834 例。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)既往行冠狀動脈旁路移植術(shù);(2)冠狀動脈造影質(zhì)量差,血管輪廓顯示不清。標(biāo)注用于血管分割和節(jié)段識別任務(wù)的圖像12 900 張。圖像經(jīng)過隱私保護(hù)處理后,以512×512 像素的醫(yī)學(xué)數(shù)字成像和通信(DICOM)格式保存。冠狀動脈造影多采用標(biāo)準(zhǔn)造影體位,以最好地展示血管和病變,標(biāo)注圖像信息如圖1A所示。其中11 900張圖像用于網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練,其余1 000 張圖像用于網(wǎng)絡(luò)測試。

圖像標(biāo)注:冠狀動脈血管及節(jié)段的標(biāo)注由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院心血管介入診療影像分析核心實驗室專業(yè)的影像分析師完成,當(dāng)標(biāo)注結(jié)果存在疑問時,需至少3 名分析師一起討論,直到達(dá)成共識。標(biāo)注過程如下(圖1B):(1)獲取原始數(shù)據(jù):圖像以512×512 像素保存;(2)數(shù)據(jù)粗標(biāo)注:影像分析師將冠狀動脈各節(jié)段用不同顏色的線條標(biāo)記(圖1C);(3)數(shù)據(jù)精標(biāo)注:經(jīng)過培訓(xùn)和考核的技術(shù)人員根據(jù)粗標(biāo)注圖像進(jìn)行像素級別的精確標(biāo)注,包含完整的血管輪廓及冠狀動脈節(jié)段信息,用于血管節(jié)段識別任務(wù);(4)制作血管二值圖:將精標(biāo)注的血管所對應(yīng)像素點更改為白色像素值,用于血管分割任務(wù)。

網(wǎng)絡(luò)模型:本研究提出了一種由人工神經(jīng)元組成的基于反向傳播算法的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(DNN)。該模型結(jié)合冠狀動脈造影的特點,完善了用于圖像分割的金字塔場景解析網(wǎng)絡(luò)[10](pyramid scene parsing network,PSPNet,圖1D)。模型針對特定的目標(biāo)功能提取輸入影像的不同語義信息,包括血管邊緣和背景紋理在內(nèi)的低級特征,以及整體形狀在內(nèi)的高級特征。DNN 包含兩個任務(wù):(1)血管分割任務(wù):輸入造影圖像,輸出血管二值分割圖;(2)血管節(jié)段識別任務(wù):輸入造影圖像,輸出標(biāo)記不同血管節(jié)段語義分割圖。

圖1 冠狀動脈造影圖像標(biāo)注和網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)

統(tǒng)計學(xué)方法:統(tǒng)計模型分割的真陽性像素點(TP)、假陽性像素點(FP)、真陰性像素點(TN)和假陰性像素點(FN)。在此基礎(chǔ)上,計算血管分割及節(jié)段識別的準(zhǔn)確度[(TP+TN)/(TP+FP+TN+FN)]、敏感度或召回率[TP/(TP+FN)]、特異度[TN/(TN+FP)]、陽性預(yù)測值或精確率[TP/(TP+FP)]、陰性預(yù)測值[TN/(TN+FN)]、F1 分?jǐn)?shù)[ 2×精確率×召回率/(精確率+召回率)]等指標(biāo)來評價DNN 的檢測性能。同時根據(jù)結(jié)果繪制ROC 曲線,計算AUC。所有數(shù)據(jù)采用SPSS 18.0 進(jìn)行分析,其中分類變量用百分比進(jìn)行描述,連續(xù)變量用均值±標(biāo)準(zhǔn)差描述,采用t 檢驗進(jìn)行比較。假設(shè)檢驗均為雙邊,P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管分割的效果

DNN 血管分割網(wǎng)絡(luò)能夠?qū)⒀芡暾貜脑煊皥D像中分割出來,并保證血管的完整性和連續(xù)性(圖2)。整體血管分割的準(zhǔn)確度達(dá)99.2%(95% CI:99.1%~99.2%),敏感度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為94.8%(95% CI:94.6%~95.0%)、99.4%(95% CI:99.3%~99.4%)、87.1%(95% CI:86.8%~87.4%)、99.8%(95% CI:99.7%~99.8%),見表1,精確率、召回率、F1 分?jǐn)?shù)分別為0.87±0.05、0.95±0.03、0.91±0.03(表2)。冠狀動脈造影圖像血管分割網(wǎng)絡(luò)的ROC 曲線見圖3,整體血管分割的AUC 為0.987(95% CI:0.987~0.987)。

DNN 對冠狀動脈各節(jié)段血管的分割效果(表2):主支血管,包括左主干(LM)、左前降支(LAD)主支、左回旋支(LCX)主支、右冠狀動脈(RCA)主支,DNN模型分割的F1 分?jǐn)?shù)分別為0.95±0.06、0.92±0.04、0.91±0.06、0.96±0.02;其對應(yīng)的分支,包括對角支、LCX 分支(鈍緣支、左心室后側(cè)支、中間支)、RCA分支(后降支、后側(cè)支),F(xiàn)1 分?jǐn)?shù)分別為0.87±0.06、0.87±0.06、0.85±0.07;主支血管的分割效果(F1 分?jǐn)?shù))明顯優(yōu)于分支血管(P均<0.05)。

圖2 冠狀動脈造影圖像血管分割結(jié)果

表1 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管分割的效果[%(95%CI)]

表2 DNN 對冠狀動脈造影圖像各節(jié)段血管分割的精確率、召回率及F1 分?jǐn)?shù)()

表2 DNN 對冠狀動脈造影圖像各節(jié)段血管分割的精確率、召回率及F1 分?jǐn)?shù)()

注: DNN:深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);LM:左主干;LAD:左前降支;LCX:左回旋支;RCA:右冠狀動脈。F1分?jǐn)?shù)=2×精確率×召回率/ (精確率+召回率)。與對應(yīng)一級分支血管比較*P<0.05

圖3 深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對冠狀動脈造影圖像血管分割結(jié)果的ROC 曲線

2.2 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管節(jié)段的識別效果

在冠狀動脈造影圖像血管分割基礎(chǔ)上,本研究進(jìn)一步開發(fā)了血管節(jié)段識別的算法。冠狀動脈節(jié)段識別的準(zhǔn)確度為98.6%(95%CI:98.6%~98.7%),敏感度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為85.3%(95%CI:84.9%~85.7%)、99.1%(95%CI:99.1%~99.1%)、76.0%(95%CI:75.5%~76.4%)、99.5%(95%CI:99.5%~99.5%),見表3;精確率、召回率、F1分?jǐn)?shù)分別為0.76±0.08、0.85±0.06、0.80±0.05,見表4。圖4 展示了DNN 對冠狀動脈血管節(jié)段的識別效果,輸出結(jié)果與專家標(biāo)注圖像具有較高的一致性。

DNN 對冠狀動脈各節(jié)段的識別效果比較(表4):LM、LAD、LCX、RCA 節(jié)段識別F1 分?jǐn)?shù)分別為0.85±0.12、0.83±0.06、0.81±0.08、0.84±0.06,而對應(yīng)的一級分支血管,包括對角支、LCX 分支、RCA 分支的F1 分?jǐn)?shù)分別為0.65±0.16、0.72±0.14、0.73±0.12。DNN 對冠狀動脈主支血管、近段血管的識別能力(F1 分?jǐn)?shù))分別優(yōu)于分支血管和遠(yuǎn)段血管(P均<0.05)。

表3 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管節(jié)段的識別效果[%(95% CI)]

表4 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管節(jié)段識別的精確率、召回率及F1 分?jǐn)?shù)()

表4 DNN 對冠狀動脈造影圖像血管節(jié)段識別的精確率、召回率及F1 分?jǐn)?shù)()

注: DNN:深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);LM:左主干;LAD:左前降支;LCX:左回旋支;RCA:右冠狀動脈。F1分?jǐn)?shù)=2×精確率×召回率/ (精確率+召回率)。與對應(yīng)一級分支血管比較*P<0.05,與對應(yīng)遠(yuǎn)段血管比較△P<0.05

圖4 冠狀動脈造影圖像血管節(jié)段識別結(jié)果

2.3 訓(xùn)練數(shù)據(jù)量對DNN 血管分割效果的影響

DNN 血管分割效果與訓(xùn)練數(shù)據(jù)量呈正相關(guān)。當(dāng)訓(xùn)練數(shù)據(jù)量從1 000 張增加到11 900 張時,對應(yīng)的分割準(zhǔn)確度由74.9%上升至99.2%。而且,隨著訓(xùn)練數(shù)據(jù)量增加,網(wǎng)絡(luò)分割的血管具有更好的連續(xù)性和完整性(圖5)。

圖5 深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對冠狀動脈造影圖像血管分割的準(zhǔn)確度與訓(xùn)練數(shù)據(jù)量呈正相關(guān)

3 討論

本研究利用DNN 實現(xiàn)了對冠狀動脈造影圖像中血管的分割及節(jié)段識別,最終DNN 的整體血管分割準(zhǔn)確度達(dá)99.2%,節(jié)段識別準(zhǔn)確度達(dá)98.6%。由于冠狀動脈造影圖像的陰性背景象素點明顯多于陽性血管點,大量真陰性象素點的存在可能使單純的準(zhǔn)確度不能真正反映DNN 的識別效果。因此,研究進(jìn)一步采用F1 分?jǐn)?shù)來評價模型,DNN 對冠狀動脈造影圖像血管分割及節(jié)段識別的F1 分?jǐn)?shù)分別為0.91和0.80。以上結(jié)果說明,DNN 對冠狀動脈造影圖像具有較好的血管分割及節(jié)段識別能力。

DNN 對不同冠狀動脈的識別效果存在差異,對心外膜主支的識別效果優(yōu)于一級分支血管,對血管近、中段的識別效果優(yōu)于血管遠(yuǎn)段,可能的原因有:(1)主支血管直徑較大且形態(tài)結(jié)構(gòu)更為簡單、穩(wěn)定,網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)難度小;(2)分支血管易出現(xiàn)重疊,對網(wǎng)絡(luò)判斷血管走勢造成干擾;(3)分支和遠(yuǎn)段血管直徑較小,容易與造影背景中的陰影交混。臨床上在進(jìn)行冠狀動脈造影診斷時,往往主要關(guān)注直徑較大的血管,比如SYNTAX 評分只把直徑>1.5 mm 的血管病變納入計算[11]。因此本研究中常見的細(xì)小血管分割錯誤對于冠狀動脈造影的人工智能診斷影響較小。

研究調(diào)研了常用的圖像分割模型。全卷積網(wǎng)絡(luò)[12](fully convolutional network,FCN)能夠?qū)D像進(jìn)行像素級的分類,但其結(jié)構(gòu)簡單,對細(xì)節(jié)信息不敏感;U-Net[13]引入橫向相加的結(jié)構(gòu),將低級特征和高級特征進(jìn)行拼接,提高特征利用率,但該結(jié)構(gòu)也僅在少數(shù)特定數(shù)據(jù)集上有較高準(zhǔn)確度。本研究中的PSPNet 模型,包含了多尺度池化特征向量金字塔和上采樣后拼接,通過池化進(jìn)行維度約減,從而使模型在減少計算量的同時抽取更大范圍的特征。金字塔模型將不同級別的上采樣特征與原始特征融合在一起,形成全局先驗,補(bǔ)充細(xì)節(jié)信息;之后對PSPNet 進(jìn)行適應(yīng)性調(diào)整,使其完成血管分割任務(wù),并在此基礎(chǔ)上完成血管節(jié)段識別任務(wù)。

本研究將人工智能技術(shù)用于冠狀動脈造影圖像血管分割和節(jié)段識別,為最終實現(xiàn)冠狀動脈造影人工智能診斷提供基礎(chǔ)。基于目測的冠狀動脈造影病變及狹窄程度診斷是目前臨床上指導(dǎo)血運重建的主要依據(jù),2017 年美國心臟病學(xué)會/美國心臟協(xié)會(ACC/AHA)關(guān)于穩(wěn)定性心絞痛患者合理血運重建標(biāo)準(zhǔn)為血管直徑狹窄70%以上的病變,或者直徑狹窄40%~70%且血流儲備分?jǐn)?shù)≤0.8[14]。然而,由于醫(yī)生個體經(jīng)驗差異,或因時間限制,臨床醫(yī)生目測診斷的準(zhǔn)確性存在不足。既往研究表明,醫(yī)生目測的血管狹窄程度明顯大于客觀的定量冠狀動脈造影分析(QCA)[15]。但準(zhǔn)確的QCA 需要經(jīng)驗豐富的專業(yè)人員,操作繁瑣也會延長手術(shù)時間,在臨床使用率不高。本研究研發(fā)了智能冠狀動脈血管分割和節(jié)段識別算法,并獲得較高準(zhǔn)確度。在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步開發(fā)管腔直徑測量模型,實現(xiàn)人工智能QCA,可為臨床醫(yī)生制定治療決策提供客觀的參考信息。

中國是人口大國,心血管疾病發(fā)病率逐年上升,診療壓力不斷增加。隨著國家對分級診療制度的推進(jìn),大量冠心病患者就診于基層醫(yī)院,可施行PCI 的醫(yī)療機(jī)構(gòu)及介入醫(yī)師也隨之增加。雖然政府在PCI 標(biāo)準(zhǔn)化方面做了相當(dāng)多的努力,包括對PCI醫(yī)療機(jī)構(gòu)及介入醫(yī)師的資質(zhì)認(rèn)定、規(guī)范化培訓(xùn)及質(zhì)量控制等[16],但醫(yī)院的介入醫(yī)療水平仍存在地域差異[17]。因此,開發(fā)一個能推廣使用的冠狀動脈造影智能診斷系統(tǒng)有利于實現(xiàn)基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)和三甲醫(yī)院冠狀動脈介入水平的同質(zhì)化。

本研究存在局限性。首先,DNN 在訓(xùn)練過程中輸入的是單幀靜態(tài)冠狀動脈造影圖像,其提供的信息有限,尤其是在血管連續(xù)性和血管重疊問題上,單幀圖像不易區(qū)分,造成血管分割錯誤。后期將繼續(xù)研發(fā)冠狀動脈造影視頻的血管分割模型、血管樹三維重建方法,充分利用前后幀之間的信息及三維信息,解決血管不連續(xù)和重疊的問題。此外,DNN訓(xùn)練需要大量的訓(xùn)練數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)的缺乏會影響DNN的性能,研究將繼續(xù)開發(fā)數(shù)據(jù)的半自動標(biāo)注算法,提高訓(xùn)練數(shù)據(jù)生成的效率。

總之,本研究顯示了DNN 用于冠狀動脈造影圖像血管分割及節(jié)段識別的可行性,并獲得了較高的準(zhǔn)確度,為將來實現(xiàn)客觀、高效的冠狀造影人工智能病變診斷提供了基礎(chǔ)。

利益沖突:所有作者均聲明不存在利益沖突

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