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RT-PCR技術(shù)檢測豬瘟病毒應(yīng)用淺析

2020-12-16 05:48:13陳隆全
中國畜禽種業(yè) 2020年3期
關(guān)鍵詞:檢測

陳隆全

(重慶市綦江區(qū)東溪鎮(zhèn)畜牧獸醫(yī)站 401434)

豬瘟是由豬瘟病毒引發(fā)的接觸性傳染病,病死率高,傳染速度快,一旦大范圍傳播,必然給養(yǎng)殖戶造成巨大經(jīng)濟損失,威脅我國養(yǎng)殖行業(yè)的發(fā)展。由于豬瘟病毒臨床表現(xiàn)朝向非典型發(fā)展,在臨床診斷病豬時受到多種因素感染,很難快速準確地提供診斷結(jié)果,延誤早期隔離,增加了豬瘟傳播的風(fēng)險。

1 材料和方法

由重慶市動物疫病防控中心提供豬瘟病毒陽性對照材料,將病死豬扁桃體和淋巴結(jié)進行取樣備用。準備RT-PCR 試劑盒、RNA 試劑盒。

2 設(shè)計合成引物

使用RT-PCR 合成特異性引物,設(shè)計擴增片段為682bp。

3 制備樣品

對病死豬進行剖檢,在無菌環(huán)境下采集扁桃體和淋巴結(jié),研磨后添加生理鹽水進行稀釋處理。設(shè)定5000r/s 經(jīng)過5min 離心處理,取上層清液為樣品。

4 提取病毒基因組總RNA

按照試劑盒說明,取 100μL 上層清液,添加至 1.5mlEP 管中,加入 SolutionR1 100μL。混合后振蕩 30s,放在室溫環(huán)境中靜置 60s。經(jīng)過處理后,添加 SolutionR2 600μL,經(jīng)過充分混合顛倒后,在室溫環(huán)境下靜置3~5min。添加上層清液后套離心管,再次進行30s 離心處理。將外套管內(nèi)部液體倒出,添加Wash Buffer 600μL,經(jīng)過 30s 離心處理后,將接液管內(nèi)部液體倒出,要進行兩次洗滌處理。將空柱放在10000r/min 離心處理,1min 后轉(zhuǎn)移至新離心管中。在新離心管中轉(zhuǎn)入Spin column,膜中央添加 20~50μL Elution Buffer,在室溫環(huán)境中靜置60s,經(jīng)過 30s 離心處理后,可以得到 RNA,可以在-70℃下保存或者直接擴增處理。

5 擴增處理

將總 RNA 為模板擴增,取 0.4μL 上下游引物,設(shè)定 45℃,經(jīng)過 30min 反轉(zhuǎn)錄后,升高至 94℃進行 5min 預(yù)變。在 94℃下經(jīng)過 30s 變性,設(shè)定 52℃進行 45s 退火。在 72℃下進行 45s 的延伸,重復(fù)35 個循環(huán)。在72℃下進行10min 延伸。

6 熒光定量擴增

以總 RNA 為模板擴增,取 0.4μL 上下游引物,0.4μL 探針 ,0.4μL Passive Reference Dye,1μLRNA 模 板 。并 使 用RNase-free Water,添加至 20μL。設(shè)定擴增程序,設(shè)定 45℃,經(jīng)過 25min 反轉(zhuǎn)錄后,升高至 95℃進行 2min 預(yù)變[1]。在 95℃下經(jīng)過 10s 變性,設(shè)定 55℃進行 30s 退火。在 72℃下進行 30s的延伸,重復(fù) 5 個循環(huán)。在 95℃下進行 10s 變性,在 55℃下進行30s 退火,經(jīng)過40 個循環(huán),結(jié)束后對熒光進行收集。

7 檢測結(jié)果

7.1 判定標準

檢測Ct 值不超過35,擴增曲線表現(xiàn)出明顯指數(shù)增長期,可以判斷樣本為陽性。若Ct 值處于35~40 之間,需要進行重復(fù)檢驗,Ct 值仍然處于這一范圍,擴增曲線出現(xiàn)指數(shù)增長期,可以判斷為陽性,否則樣本為陰性。若沒有檢測到Ct 值,或者樣本Ct 值超過了40,可以判斷樣本為陰性。

7.2 擴增結(jié)果

提取樣本總RNA 進行RT-PCR 擴增處理,使用1%瓊脂糖凝膠對產(chǎn)物電泳,對照陽性片段。在682bp 附近,樣品有帶則可以確定樣本為豬瘟病毒陽性。

7.3 熒光定量擴增結(jié)果

應(yīng)用熒光定量RT-PCR 方法檢測豬瘟病毒,檢測結(jié)果為陽性。和RT-PCR 一致,代表病豬已感染豬瘟病毒。

8 討論

早期診斷對控制豬瘟的擴散十分關(guān)鍵,需要根據(jù)病豬發(fā)病情況,及早采取先進技術(shù),診斷豬瘟,才能有效控制豬瘟,避免豬瘟蔓延。PCR 技術(shù)得到深入研究,逐漸在動物疫病檢測中得到廣泛應(yīng)用,同時可以取代傳統(tǒng)血清學(xué)和病原分離鑒定方法[2]。檢測試驗通過借鑒成熟檢測技術(shù),在獸醫(yī)診斷中得到廣泛應(yīng)用,有效減少檢測時間,讓檢測結(jié)果特異性和精準性得到顯著提高,降低豬瘟給養(yǎng)殖行業(yè)造成的經(jīng)濟損失。RT-PCR 技術(shù)的應(yīng)用顯著提高了檢測效率,規(guī)避樣本污染及假陽性結(jié)果的問題。借助于熒光定量PCT 檢測的高特異性和高靈敏性,讓豬瘟病原體檢測快捷準確。

9 結(jié)語

綜上所述,使用RT-PCR 檢測技術(shù)檢測豬瘟病毒,可快速靈敏的完成豬瘟檢測,指導(dǎo)病豬臨床診斷,提高診斷效率。快速獲得診斷結(jié)果后,能將豬瘟病豬快速隔離,采取科學(xué)合理的防治手段,避免豬瘟病毒的傳播,減少養(yǎng)殖戶經(jīng)濟損失。

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