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淺談生物學(xué)和生態(tài)學(xué)中的信息

2021-03-18 09:27:13李冉周長發(fā)
中學(xué)生物學(xué) 2021年11期
關(guān)鍵詞:生物學(xué)信息

李冉 周長發(fā)

摘要 通過對熵、信息等概念原義、起源與內(nèi)在邏輯的梳理和淺顯化解釋,發(fā)現(xiàn)生物學(xué)中的熵既可抽象、定性地描述生物有機(jī)體各層次的有序性存在狀態(tài),也可定量計(jì)算和表述有機(jī)體各系統(tǒng)組成成分的多樣性與數(shù)量比率,因而它可顯示和表達(dá)有機(jī)體內(nèi)穩(wěn)態(tài)、生態(tài)平衡以及生物多樣性指數(shù)。對信息與香農(nóng)熵的準(zhǔn)確理解與把握,是在宏觀層面理解和表述生物及其存在狀態(tài)的基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞 熵 信息 香農(nóng)多樣性指數(shù) 生物學(xué) 生態(tài)學(xué)

中圖分類號 Q-49

文獻(xiàn)標(biāo)志碼 E

信息是生物學(xué)、生態(tài)學(xué)中的重要概念,常與“物質(zhì)、能量”相提并論,如在介紹生態(tài)系統(tǒng)定義、生態(tài)平衡以及生物體內(nèi)穩(wěn)態(tài)時用到的“信息(負(fù))反饋”等。然而,對于“信息”這一抽象概念,許多文獻(xiàn)將其具體化或泛化、甚至公式化,從而給理解與講授帶來一定的困難。下面試圖從其起源、本質(zhì)含義的角度,對“信息”概念以及它在生物學(xué)、生態(tài)學(xué)的應(yīng)用作一淺顯介紹,以幫助理解、方便教學(xué)、加深記憶。

1熵與信息的含義

1.1物理學(xué)中的熵

基本的物理定律認(rèn)為,在一個孤立或封閉系統(tǒng)中,即與外界沒有能量與物質(zhì)交換的系統(tǒng)中,如果給予足夠長的時間,這一系統(tǒng)空間中的分子最終將是均衡的或均一的。例如,向一個盒子中注入兩種顏色的氣體,或向一瓶水中放入一粒糖塊,時間足夠長后,這一盒子中任一空間位置的空氣顏色都是一樣的、瓶中任何一點(diǎn)的水都是同樣甜的。假如把任一空間中的分子混亂程度或均一程度看作一個量,稱為熵(entro?py),就可以認(rèn)為,在一封閉系統(tǒng)中,其熵值最終會變得最大,即其組成分子會變得極其均勻或均一。

由此可見,物理學(xué)中的熵可看作是一個封閉系統(tǒng)混亂程度或均一程度的宏觀衡量指標(biāo)或定性表述。那么,它能否被定量描述呢?

1.2統(tǒng)計(jì)學(xué)上的熵

假定有一個盒子,其被中間一個帶有很多小孔的極薄隔板分為左右兩半,盒子中有4個可以隨意漂移的小球,隔板幾乎不能限制任一小球的移動。那么,這四個小球(可以想象為是4個空氣分子)在盒子中的分布就有5類16種可能(表1)。這五類狀況的數(shù)量占比分別為1/16、4/16、6/16、4/16、1/16。可以稱這五類分布中的任一類為盒子中分子分布的宏觀態(tài),而它對應(yīng)的每一種可能為一種微觀態(tài),如第二種宏觀態(tài)(3個小球在左、1個小球在右)就有4種微觀態(tài),它出現(xiàn)的可能為4/16。

出現(xiàn)概率越小的宏觀態(tài)事件,表明系統(tǒng)的分子數(shù)量越多,總體宏觀態(tài)越多樣,系統(tǒng)也越混亂。若將本例中的4個分子變成8個,出現(xiàn)1個分子在左、7個分子在右這一宏觀態(tài)的概率為8/256,它明顯小于4個分子時1個在左、3個在右的概率(4/16)。而將0~1之間的數(shù)值取對數(shù)后,也是數(shù)值越小其對數(shù)越大。因而可用公式S=KlogW來表示熵(宏觀態(tài))及其概率(微觀態(tài)比率)之間的關(guān)系。式中S為熵,K為常數(shù),W為概率。例如,本例第二種宏觀態(tài)4個分子的混亂程度可設(shè)為S2,它的熵值就可表示為S2=Klog4/16。當(dāng)然,也可令常數(shù)K等于1,它不會改變公式的本來意義,只會涉及到系數(shù)或數(shù)值大小的調(diào)整。

在此假設(shè)下,上述5種宏觀態(tài)出現(xiàn)的總體概率=

1/16×4/16×6/16×4/16×1/16。它們總體熵值為:S總=lo(g1/16×4/16×6/16×4/16×1/16)

=log1/16+log4/16+log6/16+log4/16+log1/16=S1+S2+S3+S4+S5.

可見,熵值總和等于各成分概率之積。

總之,從統(tǒng)計(jì)學(xué)的角度可以看到,熵是可以衡量和計(jì)算的,只要知道密閉空間中所有分子的可能分布或分布概率。

然而,由于任一空間中的空氣分子數(shù)量極大,要想知道它們所有的概率或分布狀況幾乎不可能。因而,從無限可能的統(tǒng)計(jì)學(xué)角度來衡量熵值在現(xiàn)實(shí)中幾乎沒有應(yīng)用價值。那么,在有限可能中是否可以呢?

1.3信息學(xué)上的熵

香農(nóng)(Shannon,1948)提出,在一個有限多樣概率事件中,當(dāng)所有事件發(fā)生的概率均等時,其總體不確定性最大。這相當(dāng)于上例盒子中只有有限數(shù)量的空氣分子,它們分布的最大可能性是在盒子中均勻分布(因此種分布的概率最大)。這時盒子中的空氣最混亂,熵值也最大;而對每個空氣分子而言,它們在所有空間中出現(xiàn)的概率也是均等的。因而,各事件發(fā)生的概率乘以該概率的對數(shù)之和,其數(shù)值也最大。即可用下式來表達(dá)系統(tǒng)的總體不確定性:

式中的H代表多樣性指數(shù)或不確定性指數(shù),pi為i事件的發(fā)生概率或i成分的數(shù)量比率,s為事件或成分總數(shù)。

例如,從4個不同顏色的球中隨機(jī)選取一個,其概率為1/4。選取4次,每次選取小球的事件都相互獨(dú)立,那么H=-(4×1/4×log21/4)=2。這里由于是在選取小球,事件肯定會發(fā)生。而在統(tǒng)計(jì)學(xué)或信息學(xué)上,某一事件除了有選取的概率(如這里的1/4),還有發(fā)生的概率(這里是1)。還可換種選取辦法:當(dāng)選擇一個小球后,就將其移走而不再放入盒中。那么選取4次特定顏色小球的概率分別為1/4、1/3、1/2、1。用香農(nóng)的理論或從統(tǒng)計(jì)學(xué)角度看,這些事件之間是有聯(lián)系的,上一個事件發(fā)生后會影響下一個事件的發(fā)生概率。這時,本次選取過程的總體不確定性變?yōu)椋?/p>

H=-(1/4×log21/4+1/3×log21/3+1/2×log21/2+1×log21)=1.53.

可見,這時系統(tǒng)總不確定性降低了0.47。在香農(nóng)看來,系統(tǒng)的不確定性之所以能夠降低,是因?yàn)樗樟恕靶畔ⅰ保ㄒ驗(yàn)橥ㄟ^第一次的選擇,就可提高對下一次選擇的猜測準(zhǔn)確率,以致最后一次就可確認(rèn)所選擇小球的顏色,就是因?yàn)橛辛饲懊嫒芜x擇后的信息,從這個角度看,信息就是消除系統(tǒng)不確定性的東西或因子)。而其減少的0.47就可看作是信息或信息大小。

結(jié)合統(tǒng)計(jì)學(xué)的熵及其計(jì)算公式,可以看出,香農(nóng)所謂的系統(tǒng)不確定性就相當(dāng)于有限概率、有限數(shù)據(jù)條件下的“熵”,因而可將信息學(xué)上的熵稱為“信息熵”或

“香農(nóng)熵”。在本質(zhì)上,它與統(tǒng)計(jì)學(xué)上的熵、物理學(xué)上的熵是相同的。不過,物理學(xué)中的熵是從小往大看的(即認(rèn)為系統(tǒng)的熵總是增加的),而信息學(xué)中的熵是由大往小看的(即認(rèn)為在沒有信息時,熵最大;而具備或輸入信息后,系統(tǒng)的熵就變小)。因而,物理學(xué)上的熵指示或衡量的是系統(tǒng)的混亂無序程度,而信息學(xué)上的熵指示或衡量系統(tǒng)的有序規(guī)律程度(因?yàn)樗偸切∮谠嫉男畔㈧兀?當(dāng)信息熵最大時(這時系統(tǒng)最混亂),其與物理學(xué)上的熵意義相同。

另外,當(dāng)一個系統(tǒng)變得有序時,它就需要從外界獲得信息并減少信息熵。因而,它獲得的信息或減少的信息熵就相當(dāng)于它減少了的混亂程度或熵值。故從這個角度看,信息就可看作是“負(fù)熵”,其值就等于改變的信息量。Wiene(r1948)明確提出:“正如一個系統(tǒng)中的信息量是它的組織化程度的度量,一個系統(tǒng)的熵就是它無組織程度的度量;前者正好是后者的負(fù)數(shù)。”

以上是對物理學(xué)中的熱熵、統(tǒng)計(jì)學(xué)上的概率熵以及信息學(xué)上的香農(nóng)熵所作的淺顯介紹。實(shí)際上,它們的表達(dá)式都為數(shù)學(xué)公式且是可相互推導(dǎo)的。

2香農(nóng)熵引入到生物學(xué)中的過程

前文已述,孤立系統(tǒng)的熵總是趨于最大。然而,生物卻是開放系統(tǒng),其內(nèi)部是高度有序的,并且在生長發(fā)育過程中會變得更加有序,因而可以認(rèn)為生物體的熵是逐漸變小的。這是因?yàn)樯矬w不斷從外界吸入能量與物質(zhì)。從宏觀上看,也就是生物體從外界吸收進(jìn)熵值較低的物質(zhì),在消化吸收的過程中,讓它們變得更無序,增加它們的熵值,從而減少或保持自身的低熵狀況。或者,有機(jī)體需要從外界不斷吸收“負(fù)熵”以降低自身的熵值。薛定鍔(Schr?dinger,1944)在《生命是什么》一書中就明確提出:有機(jī)體以負(fù)熵為生。或者不那么悖謬地說,新陳代謝的本質(zhì)是使有機(jī)體成功消除了它活著時不得不產(chǎn)生的所有熵。Rosenblueth等(1943)、Wiene(r1948)在提出反饋以及控制論時,都認(rèn)為生物在不同水平上也可看作是一個可自我調(diào)節(jié)的穩(wěn)定系統(tǒng)。而有機(jī)體的穩(wěn)定狀態(tài)必須要不斷通過吸收信息(或稱為“負(fù)熵”)才能得以實(shí)現(xiàn)。

以上的研究或文獻(xiàn)就將信息熵或香農(nóng)熵引入了生物學(xué)。

3香農(nóng)熵引入到生態(tài)學(xué)中的過程

3.1香農(nóng)熵引入生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學(xué)

Odum(1953)提到,在一個自然生態(tài)系統(tǒng)或群落中,由于能量與無機(jī)物(如水和各種元素)在其內(nèi)部經(jīng)食物鏈、食物網(wǎng)的不斷傳遞,最終會形成一種穩(wěn)定狀況,即生態(tài)平衡。MacArthu(r1955)認(rèn)識到生態(tài)系統(tǒng)中的能量在傳遞時,因有損耗,故它通過不同的食物鏈流動會對群落穩(wěn)定性產(chǎn)生不同的結(jié)果,即能量流動時的“選擇”會對結(jié)果有影響。也就是如果食物網(wǎng)越復(fù)雜,能量傳遞的可能性與路徑就越多樣,每條路徑傳遞的能量或物質(zhì)就越少、所占比例也越小,能量在生態(tài)系統(tǒng)中傳遞的復(fù)雜程度或不確定性就越高,其熵值也就越大。如果某條食物鏈?zhǔn)軗p,生態(tài)系統(tǒng)用以修復(fù)的代價也越小,系統(tǒng)越穩(wěn)定。反之,如果生態(tài)系統(tǒng)中的食物鏈路徑越少,系統(tǒng)的有序性就越高、組織程度也越大,其熵值也就越小。可見,生態(tài)系統(tǒng)中能量傳遞的多樣性或復(fù)雜性與香農(nóng)理論上的不確定性有內(nèi)在的聯(lián)系,故可將香農(nóng)提出的數(shù)學(xué)公式或香農(nóng)熵引入到生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定性研究中。這就將信息概念以及信息論引入到生態(tài)學(xué)。

不過,由于生態(tài)系統(tǒng)的復(fù)雜性、食物鏈與食物網(wǎng)的多重性和交叉性,想準(zhǔn)確研究生態(tài)系統(tǒng)能量流動的“選擇性”或“路徑多樣性”是十分困難的,詳細(xì)測量能量在不同食物鏈中的傳遞過程及其數(shù)值也是不可能的。故可以認(rèn)為,MacArthur提出了一個很好但應(yīng)用價值很小的觀點(diǎn)。不過,假如把生態(tài)系統(tǒng)分為無機(jī)環(huán)境、生產(chǎn)者、消費(fèi)者和分解者,用信息量表達(dá)它們各自的有序狀態(tài)(借用香農(nóng)對于信息量的定義和公式),就可從宏觀上把握生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)部各成分之間的相互影響過程,即各成分的“信息量”或“香農(nóng)熵”會相互影響或相互反饋。由于能量與物質(zhì)在生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)部不同營養(yǎng)級之間傳遞時,它們的路徑是單向的,不能雙向傳遞或影響,因而香農(nóng)熵或信息量的引入,可明確生態(tài)系統(tǒng)負(fù)反饋機(jī)制的作用規(guī)律與模式。

3.2香農(nóng)熵作為生物多樣性指數(shù)

從純數(shù)學(xué)的角度看,香農(nóng)熵公式說明,如果一個統(tǒng)有多種成分、且各成分出現(xiàn)的機(jī)率一致或每種成分所占的數(shù)量比率完全相同,則此系統(tǒng)的香農(nóng)熵值最大,任何改變(成分?jǐn)?shù)量減少、或各成分比率改變)都會使香農(nóng)熵值變小。一個生物群落是由多個物種組成的(物種數(shù)量可稱為多度),當(dāng)它們數(shù)量比率(稱為均度)均等時,該群落由于包含多個物種且它們的數(shù)量分布較接近,也即群落的多度與均度都相對較好,這一群落的物種多樣性或生物多樣性較高,反之就較低。基于此,群落的生物多樣性與香農(nóng)公式也有內(nèi)在的聯(lián)系性與相關(guān)性。Margalef(1957)認(rèn)識到此點(diǎn),建立了群落生態(tài)學(xué)中的香農(nóng)多樣性指數(shù)(或稱為香農(nóng)-威納多樣性指數(shù))。目前,它是生態(tài)學(xué)中應(yīng)用最廣的指數(shù)之一。

4引入香農(nóng)熵對于生物學(xué)和生態(tài)學(xué)的意義生態(tài)學(xué)由于研究對象的多樣性、研究課題的復(fù)雜性,往往缺少定量的描述工具。而香農(nóng)熵與香農(nóng)公式的提出與推廣,使得生態(tài)學(xué)在群落、生態(tài)系統(tǒng)較宏觀的層面上有了可以借助的數(shù)學(xué)工具。它大大提高和加深了生態(tài)學(xué)對機(jī)制、過程、狀態(tài)的描述能力和預(yù)測能力,從而使生態(tài)學(xué)成為了一門較為精細(xì)的獨(dú)立學(xué)科。

根據(jù)控制論和系統(tǒng)論,任何具調(diào)節(jié)能力、平衡能力的系統(tǒng)都可用“熵變”來描述它們組成成分之間的相互作用。生物活細(xì)胞、生物體、種群、群落以及生態(tài)系統(tǒng)都具有調(diào)節(jié)與平衡能力,因而也可用熵來描述它們組成成分之間的、成分狀態(tài)改變所造成的雙向影響與相互作用,這比使用能量或物質(zhì)更加合理與明確,因?yàn)樗鼈兺菃蜗蜉斔偷模豢呻p向傳遞。同時,信息量往往指代了某成分、系統(tǒng)的有序狀態(tài),它可隨著營養(yǎng)級的提高而提高,而能量、物質(zhì)在從低級向高級流動、傳輸時往往都是逐級減少的。故相比于它們,信息可更好地描述負(fù)反饋機(jī)制、自平衡的實(shí)現(xiàn)。

能量和物質(zhì)都可精確測量,且與生物個體的生物量密切相關(guān);而信息為抽象的宏觀概念,與生物種類、個體數(shù)量、出現(xiàn)機(jī)率相關(guān),故將信息概念和信息理論引入到生物學(xué)、生態(tài)學(xué)研究中,不僅多了一個有用的描述術(shù)語,更可以將研究的課題從較為靜態(tài)固定的質(zhì)量、能量角度深化到較為動態(tài)的概率、頻率層面,從較為確定的物質(zhì)稱量層面提高到較為不確定的數(shù)量統(tǒng)計(jì)層面,從而使生物學(xué)、生態(tài)學(xué)跟上了信息學(xué)步伐,也將它們從主要定性描述的古老學(xué)科逐漸發(fā)展成為可以定量計(jì)算的現(xiàn)代學(xué)科。

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