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OPAHs對斑馬魚胚胎的急性毒性預(yù)測

2021-03-25 13:32:18金玲敏徐童喬顯亮
生態(tài)毒理學(xué)報(bào) 2021年6期
關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)能力模型

金玲敏,徐童,喬顯亮

大連理工大學(xué)環(huán)境學(xué)院,工業(yè)生態(tài)與環(huán)境工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,大連 116024

含氧多環(huán)芳烴(oxygenated polycyclic aromatic hydrocarbon, OPAHs)是由化石燃料不完全燃燒,或多環(huán)芳烴(polycyclic aromatic hydrocarbon, PAHs)化學(xué)氧化、光化學(xué)氧化或生物氧化形成的一類新污染物[1-3]。OPAHs表現(xiàn)出致癌性、致突變性和發(fā)育毒性等毒性[4-7]。一些OPAHs產(chǎn)生的毒性效應(yīng)比母體化合物更強(qiáng)。例如,Mattsson等[7]通過人肝癌細(xì)胞實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)一些OPAHs對DNA的損傷顯著強(qiáng)于PAHs。Chibwe等[8]的研究表明,PAHs污染土壤經(jīng)好氧生物修復(fù)后致突變性增強(qiáng),認(rèn)為與OPAHs等轉(zhuǎn)化產(chǎn)物的生成有關(guān)。迄今,越來越多OPAHs在環(huán)境中被檢出[9],但是很多OPAHs的毒性數(shù)據(jù)仍然缺失。

采用實(shí)驗(yàn)方法獲取OPAHs的毒性數(shù)據(jù)需要消耗大量的人力、經(jīng)費(fèi)和時(shí)間。為了減少動(dòng)物實(shí)驗(yàn)和高效地獲取毒性數(shù)據(jù),計(jì)算模擬方法被越來越多地用于化學(xué)品的毒性預(yù)測。其中,定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)方法可以通過揭示有機(jī)化合物分子結(jié)構(gòu)和毒性之間聯(lián)系,已經(jīng)被成功用于多種有機(jī)污染物(如PAHs、呋喃、二噁英以及多氯聯(lián)苯等)的毒性預(yù)測[10-12]。目前,關(guān)于OPAHs急性毒性的預(yù)測模型還鮮有報(bào)道。

本研究參照經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)關(guān)于QSAR模型構(gòu)建和評估的導(dǎo)則[13],基于Knecht等[4]通過斑馬魚胚胎急性毒性實(shí)驗(yàn)得到的32種OPAHs的毒性數(shù)據(jù)(logEC50)(表1),采用多元線性逐步回歸法篩選OPAHs的描述符,建立OPAHs斑馬魚胚胎急性毒性的QSAR模型,驗(yàn)證其預(yù)測能力,表征了模型的應(yīng)用域,為OPAHs的生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評估提供數(shù)據(jù)支持。

1 材料與方法(Materials and methods)

2 結(jié)果(Results)

2.1 模型的建立

本研究分別采用Dragon描述符、量子化學(xué)描述符以及綜合以上2類描述符建立了3個(gè)QSAR模型(表2)。基于2 629種OPAHs Dragon描述符,采用多元線性逐步回歸法篩選出模型(1)的R2為0.524,表明模型的擬合優(yōu)度不高。使用多元線性逐步回歸法篩選量子化學(xué)描述符和logKow,建立了模型(2)的R2為0.436,模型的擬合優(yōu)度也不高。本研究綜合了量子化學(xué)描述符和Dragon描述符,得到模型(3),統(tǒng)計(jì)學(xué)參數(shù)表明,模型(3)的擬合優(yōu)度較好,篩選出4種描述符包括化學(xué)勢(μ)、最大電拓?fù)鋮?shù)(MAXDP)、Moriguchi正辛醇-水分配系數(shù)(MLOGP)和芳香性指數(shù)(AROM),說明量子化學(xué)描述符和Dragon描述符可以從不同的角度表征OPAHs的分子屬性,更有利于揭示分子結(jié)構(gòu)與其毒性的關(guān)聯(lián)。由于模型(1)和(2)不能滿足預(yù)測的參數(shù)要求,下文重點(diǎn)對模型(3)進(jìn)行了詳細(xì)討論。OPAHs的斑馬魚胚胎急性毒性實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)(logEC50)和最優(yōu)模型的預(yù)測數(shù)據(jù)以及篩選出4種描述符的具體數(shù)值分別如表1和表2所示。

表1 OPAHs的logEC50實(shí)驗(yàn)值與預(yù)測值及模型篩選出的分子描述符計(jì)算值Table 1 The experimental and predicted values of logEC50 for OPAHs and molecular descriptors values

2.2 模型的解釋

模型(3)的4個(gè)描述符中,μ與logEC50的相關(guān)性最高,相關(guān)系數(shù)為0.554。μ可以表征分子失電子的能力,μ值越小,分子越不穩(wěn)定,容易失去電子[22-23]。OPAHs是一類含氧的PAHs衍生物,含氧基團(tuán)的存在使得電子密度發(fā)生顯著的變化(圖1),也會(huì)影響其得失電子的能力[24]。OPAHs的μ與logEC50呈正相關(guān),說明OPAHs越不穩(wěn)定,其斑馬魚胚胎急性毒性越大。MAXDP、MLOGP和AROM都為拓?fù)涿枋龇AXDP可以表征分子的親電性[25],OPAHs的親電性越強(qiáng),其毒性越強(qiáng)。MLOGP表征分子的疏水性[20],MLOGP與logEC50表現(xiàn)出負(fù)相關(guān),說明OPAHs疏水性越強(qiáng)毒性也越強(qiáng)。AROM表征了分子的芳香性,其值越大表明OPAHs共軛結(jié)構(gòu)越穩(wěn)定,其毒性越小[26]。綜上所述,OPAHs的得失電子能力和疏水性是影響其毒性的主要因素。

表2 OPAHs的logEC50 QSAR模型參數(shù)Table 2 Parameters of QSAR models for OPAHs logEC50 values

圖1 含氧多環(huán)芳烴(OPAHs)特征化合物的電子密度圖Fig. 1 The electron density maps of typical oxygenated polycyclic aromatic hydrocarbon (OPAHs)

2.3 模型的驗(yàn)證

3 討論(Discussion)

前人開展的QSAR模型研究也表明,PAHs及其衍生物的毒性與其得失電子能力和疏水性有關(guān)。Li等[27]建立了24種羥基PAHs與DNA損傷的QSAR模型(R2=0.751),發(fā)現(xiàn)羥基PAHs與DNA的靜電相互作用影響二者的結(jié)合能力;分子對接分析表明氫鍵、π-π作用會(huì)顯著影響羥基PAHs與DNA的結(jié)合能力。本文所研究的化合物中除了羥基PAHs也存在酮羰基PAHs,化合物的毒性除了與分子的得失電子能力有關(guān),還與分子的疏水性存在一定關(guān)聯(lián)。Gbeddy等[28]建立了30種PAHs及其衍生物致癌性毒性當(dāng)量因子的QSAR模型(R2=0.720),發(fā)現(xiàn)分子量越大、疏水性越強(qiáng),其毒性越強(qiáng)。Chlebowski等[29]通過分子對接研究硝基取代和雜環(huán)結(jié)構(gòu)的PAHs發(fā)育毒性,表明疏水性更強(qiáng)的化合物,如7-硝基苯[k]熒蒽和二硝基芘,發(fā)育毒性更強(qiáng)。這與本研究模型(3)篩選出的表征疏水性的MLOGP值與斑馬魚胚胎急性毒性呈正相關(guān)的結(jié)果一致。

綜上所述,本研究采用B3LYP/6-31G(d,p)方法優(yōu)化OPAHs分子結(jié)構(gòu),計(jì)算了量子化學(xué)描述符和Dragon描述符,使用多元線性逐步回歸法建立了斑馬魚胚胎logEC50的QSAR模型,發(fā)現(xiàn)OPAHs的得失電子能力和疏水性是影響OPAHs斑馬魚胚胎急性毒性的重要原因。所建立最優(yōu)模型的R2為0.781,內(nèi)部驗(yàn)證和外部驗(yàn)證說明該模型具有較好的穩(wěn)健性和預(yù)測能力。采用Williams圖表征了模型的應(yīng)用域,表明模型具有良好的適應(yīng)性和延展性,通過模型預(yù)測的斑馬魚胚胎急性毒性可以為OPAHs的生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)評價(jià)提供毒性數(shù)據(jù)支持。

圖2 OPAHs斑馬魚胚胎logEC50實(shí)驗(yàn)值和預(yù)測值的擬合(a)和Williams圖表征的模型(3)應(yīng)用域(b)Fig. 2 The fitting diagram of the experimental and predicted values of zebrafish embryos logEC50 for OPAHs (a) and the application domain of the model (3) based on Williams diagram (b)

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