楊先碧



基因被稱為生命密碼,因為生物的外在特征大多是由基因決定的。曾經,人們認為改變生命密碼的方法只有繁殖和進化兩種。隨著越來越多生物基因圖譜的完成,科學家似乎成了新時代的物種工匠,可以按照規則改變許多生物的基因,其中最重要的方法就是利用被俗稱為“基因剪刀”的基因編輯技術。法國生物學家埃瑪紐埃爾·沙爾龐捷和美國生物學家珍妮弗·杜德納發現了一種特別好用的基因剪刀,她們因此獲得了2020年諾貝爾化學獎。
修改生命天書
科學家常把基因組比喻為一本生命天書,而且是可以修改的。修改基因組的過程也因此被稱為基因編輯,主要包括對某段基因進行剪切、刪除、移動,以及粘貼等,其中最重要的步驟是剪切,因此基因編輯技術又常常被俗稱為基因剪刀。
基因編輯是轉基因之后人類找到的又一種基因工程技術。它在本質上與轉基因并無不同,都是在改寫生命密碼,從而在分子水平上改變生物的遺傳特性。在合成生物和育種技術等領域,兩者可以取長補短;而在醫學領域,基因編輯則更勝一籌。因為對某個物種進行基因編輯時不涉及其他物種的基因,所以基因編輯更容易被人們接受。
古老的基因剪刀
從20世紀90年代以來,科學家開發出多種基因剪刀。沙爾龐捷和杜德納發現的CRISPR-cas,就是一種基因剪刀,如今已廣泛應用于基因研究領域。之所以說她們“發現”而非“發明”了一種基因剪刀,是因為這種9年前發現的基因剪刀是個超級“老古董”,早已存在于自然界中,已經被細菌熟練地運用了數億年。
CRISPR的意思是“成簇的規律間隔短回文重復序列”。這似乎念起來十分拗口,意思也令人迷惑。沒關系!我們只要知道它是細菌防御病毒侵入的免疫系統即可。當細菌遭到病毒入侵后,CRISPR可以產生Cas質粒,并以此作為剪刀,剪切掉病毒DNA中的某些基因片段,從而將其殺滅。Cas質粒是細菌細胞內一種自我復制的環狀雙鏈DNA分子,能穩定地獨立存在于染色體外。現在常用的Cas質粒大多數經過了改造或人工構建,是修改基因的重要工具。
發現基因剪刀
人們第一次知道CRISPR是在1987年,是日本分子生物學家石野良純在大腸桿菌中偶然發現的。但是,限于當時基因科學的發展水平,他沒有意識到這一免疫系統可以作為基因編輯工具。
進入21世紀,改變生物基因的基因工程學成了最熱門的生物學研究領域。起初,沙爾龐捷研究的并不是基因剪刀,而是化膿性鏈球菌的生物特性。在研究這種細菌時,她發現了一種新的RNA分子,即tracrRNA,進而發現它是某些細菌免疫系統的一部分。
接下來,她發現這種免疫系統居然如同病毒切割機,可用一種切割酶去消滅病毒。她把這個系統命名為CRISPR-Cas。
2011年,沙爾龐捷發表了這項研究成果。同年,她與杜德納開始合作,研究如何把這種基因剪刀用到其他研究中。她們在實驗室中順利重建了源自細菌的CRISPR-Cas,成功將天然免疫手段轉化為可以利用的基因剪刀。
她們逐步簡化基因剪刀的分子組成,以便讓生物學家用起來更加趁手。如果善加利用,這把基因剪刀不但可以切割任何生物的基因,而且使用起來得心應手。利用這把基因剪刀,生物學家可以更加便捷地改寫生命密碼。
最好使的基因剪刀
自然界中的CRISPR-Cas類別繁多,其中第9號基因剪刀(CRISPR-Cas9)是科學家研究最深入、應用最成熟的。這種“剪刀”切割精準,速度最快,操作起來比較方便,是科學家手中最為鋒利的基因“手術刀”,用于治療人類遺傳病或是改變其他生物的基因。目前,該技術成果已應用于人類細胞、斑馬魚、小鼠,以及細菌的基因組精確修飾。
在用豬培育人類器官的研究中,科學家發現這種器官具有很大的風險性,因為豬基因組含有大量內源性逆轉錄病毒基因,可能引發未知的人類疾病。中國科學家楊璐菡利用基因剪刀CRISPR-Cas9,成功將豬腎上皮細胞基因組中的全部62個內源性逆轉錄病毒基因剪切失活。將基因編輯后的豬細胞和人類細胞一起培養,豬病毒對人類細胞的侵染率只是未經基因編輯豬細胞的千分之一。
基因剪刀將造福人類
CRISPR-cas9被科學家稱為第三代基因編輯工具。相比前兩代基因編輯工具(鋅指核酸酶和轉錄激活樣效應因子核酸酶),成本低、易上手和效率高是CRISPR-cas9的優勢,因此風靡整個生物學界。科學界普遍認為,這是21世紀以來生物技術方面最重要的突破。
諾貝爾化學獎評選委員會評價沙爾龐捷和杜德納的獲獎成果說:“這個基因編輯工具擁有巨大能量,會影響我們每個人。它不僅在基礎科學領域引發變革,還產生很多創新性成果,并將為癌癥等疑難病癥帶來更加有效的療法。”
人類目前用CRISPR-Cas9治療的疾病主要為血液病和一些惡性腫瘤,而包括先天性失明、艾滋病和精神分裂癥等在內的病癥也得到了針對性的探索。
總之,基因剪刀開啟了生命科學研究的新時代,正在越來越多地造福人類。