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miR-499 rs3746444 位點多態性與肝細胞癌發病風險的關系

2021-04-15 06:51:04韋琴黃冰余紅平秦林原于祥遠
山東醫藥 2021年10期
關鍵詞:模型研究

韋琴,黃冰,余紅平,秦林原,于祥遠

1 桂林醫學院公共衛生學院,廣西桂林541100;2 廣西醫科大學附屬腫瘤醫院

2018 年全球腫瘤流行病統計數據顯示,全球肝癌新發病例約84.1 萬例、死亡約78.1 萬例,其中約50%的新發病例和死亡病例發生在中國[1]。肝細胞癌(HCC)是原發性肝癌中最常見的類型。HCC 的病因復雜,除了與病毒性肝炎、肝硬化、酗酒、黃曲霉毒素等因素有關外,還與個體的遺傳背景有關。微小RNA(miRNA)是一類無編碼蛋白功能的內源性單鏈小分子RNA,長度18~23 nt,能夠通過與靶mRNA 的3′端非翻譯區特異性結合,引起靶mRNA降解或翻譯抑制,從而參與惡性腫瘤的發生、發展[2]。miR-499 為miRNA 家族成員之一,可通過負調控功能性靶基因表達而參與HCC 細胞增殖、侵襲和遷移等惡性生物學行為。單核苷酸多態性是人類基因組中最常見的遺傳變異,可決定個體罹患腫瘤的風險。目前,miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 遺傳易感性的關系尚不明確。為此,本研究系統評價了miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 遺傳易感性的關系。現報告如下。

1 材料與方法

1.1 檢索策略 計算機檢索Web of Science、PubMed、中國知網、萬方數據庫,檢索時限為建庫至2020 年6 月。中文檢索詞:microRNA-499、miR-499或miRNA-499,單核苷酸多態性,肝細胞癌或肝癌,發病風險或遺傳易感性;英文檢索詞:microRNA-499 or miR-499 or miRNA-499,rs3746444,Hepatocel?lular carcinoma or HCC or liver cancer,polymorphism,genetic variation。根據數據庫特點,采取主題詞或自由詞的方式檢索。為提高查全率和查準率,追溯納入文獻的參考文獻。

1.2 納入標準與排除標準 納入標準:①研究類型:關于miR-499 rs3746444位點多態性與HCC發病關系的病例對照研究,語種僅限中文和英文;②研究對象:病例組為經組織病理學檢查確診的HCC 患者,對照組為健康志愿者;③干預措施:病例組與對照組均行基因分型;④結局指標:miR-499 rs3746444位點基因型。排除標準:①未公開發表的文獻;②綜述、文摘、會議報告等非病例對照研究;③重復發表的文獻;④病例組或對照組有不確定基因型或等位基因的文獻。

1.3 文獻篩選與資料提取 由兩名專業研究人員分別閱讀全文,嚴格按照文獻納入標準和排除標準篩選文獻,并對納入文獻進行交叉核對。若出現分歧,討論決定或由第三人裁定。

采用統一表格提取納入文獻的相關資料,包括第一作者、發表時間、第一作者國家、研究人群、基因分型方法、對照來源、樣本量、哈迪—溫伯格平衡(HWE)等。

1.4 文獻質量評價 采用NOS 量表從3 個方面評價納入文獻質量,即病例組與對照組的選擇方法、病例組與對照組的可比性、接觸暴露[3]。病例組與對照組的選擇方法包括4 個評價條目,即病例的定義和診斷是否恰當、病例的代表性、對照的選擇、對照的定義,每個評價條目1 分,共4 分。病例組與對照組的可比性僅有1 個評價條目,共2分。接觸暴露包括3 個評價條目,即暴露的調查和評估方法(2 分)、病例和對照的調查方法是否相同(1 分)、無應答率(1 分),共4 分。NOS 評分≥7 分為高質量文獻,4~6 分為中等質量文獻,<4分為低質量文獻。

1.5 分析方法 采用Stata12.0 統計軟件進行Meta分析。采用合并的優勢比(OR)及其95%CI評估miR-499 rs3746444 位點不同遺傳模型(等位基因模型、顯性遺傳模型和雜合子模型)與HCC遺傳易感性的關系。采用Cochran′sQ檢驗進行異質性分析,當P<0.1且I2>50%認為各研究間存在異質性,采用隨機效應模型進行分析;當P≥0.1 且I2≤50%認為各研究間不存在異質性,采用固定效應模型進行分析。采用Begg′s檢驗和Egger′s檢驗評估發表偏倚,并采用敏感性分析評價結果的穩健性。P<0.05 為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 納入文獻基本情況 根據檢索策略共獲取相關文獻175 篇,經閱讀文獻題目、摘要和全文,嚴格按照納入標準和排除標準篩選、剔除,最終納入文獻18 篇[4-21],見表1。經NOS 量表評估納入文獻質量,其中高質量文獻11篇、中等質量文獻7篇。

2.2 Meta分析結果

2.2.1 整組分析 Meta 分析結果顯示,miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 遺傳易感性無明顯相關性(P均>0.05),其中等位基因模型、顯性遺傳模型、雜合子模型合并的OR分別為1.14(95%CI:0.97~1.33)、1.16(95%CI:0.99~1.38)、0.87(95%CI:0.74~1.02)。

2.2.2 亞組分析 本研究按基因分型方法(PCRRFLP[4-8,10-11,13-21]、其他[9,12])、病例組樣本量(n>200[4,8-9,12-14,17,19]、n≤200[5-7,10-11,15-16,18,20-21])以及是否符合HWE(符合[5,9-10,13-16,20]、不符合[4,6-8,11-12,17-19,21])進 行 亞組分析,結果發現miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 遺傳易感性顯著相關(P均<0.05)。在等位基因模型下,與A 等位基因比較,G 等位基因可顯著增加病例組n>200、其他基因分型方法以及符合HWE亞組個體罹患HCC的風險(P均<0.05);在顯性遺傳模型下,與AA基因型比較,GG+AG基因型可顯著增加病例組n>200、其他基因分型方法亞組個體罹患HCC的風險(P均<0.05);在雜合子模型下,與AA基因型比較,AG 基因型可顯著增加病例組n>200、其他基因分型方法亞組個體罹患HCC的風險(P均<0.05)。具體結果見表2。

2.3 發表偏倚分析 Begg′s檢驗顯示,在等位基因模型、顯性遺傳模型、雜合子模型下納入文獻的漏斗圖基本呈對稱分布(Z分別為1.06、0.83、0.83,P均>0.05)。Egger′s檢驗顯示,在等位基因模型、顯性遺傳模型、雜合子模型下未發現存在發表偏倚(t分別為-0.51、-0.60、1.03,P均>0.05)。

2.4 敏感性分析 采用逐一剔除文獻法,將納入文獻逐一剔除,以評估OR的穩定性,結果未發現總體效應的OR及其95%CI因單篇文獻剔除而出現明顯波動,研究結果的穩健性較好。

表2 miR-499 rs374644位點不同遺傳模型與HCC遺傳易感性的關系

3 討論

HCC 是消化系統常見的惡性腫瘤之一,具有惡性程度高、病情進展快、早期診斷困難、患者預后差等特點。目前已經明確病毒性肝炎、黃曲霉毒素、酗酒等是引起HCC 的重要危險因素。除上述危險因素外,遺傳背景差異與HCC 的遺傳易感性亦存在一定關系。因此,深入研究與HCC 遺傳易感性有關的功能性遺傳變異,將為HCC 診斷和個體化治療提供新的策略。

miRNA 是一類無編碼蛋白功能的內源性單鏈小分子RNA,能夠通過與靶mRNA 的3′端非翻譯區特異性序列完全或部分互補結合,在轉錄后水平負調控靶基因表達,從而參與細胞增殖、分化、凋亡等生物學過程。近年研究發現,多種實體瘤中存在miRNA 異常表達現象,這些差異表達的miRNA 能夠在轉錄或翻譯后水平調控靶基因表達,從而參與腫瘤細胞的增殖、分化、侵襲和遷移等生物學過程。因此,miRNA重要功能區域的多態性可能會影響miRNA生成及其成熟,進而改變個體對特定腫瘤的易感性。前期本課題組研究發現,miR-122 rs1135519 位點多態性與HCC 的遺傳易感性顯著相關[22];miR-199a rs74723057 位點多態性與其靶基因間質表皮轉化因子3′端非翻譯區rs1621 位點存在交互作用,從而影響個體對HCC 的遺傳易感性[23]。miR-499為miRNA 家族成員之一,能夠通過負調控靶基因的表達而參與HCC 細胞增殖、侵襲和遷移等惡性生物學行為。如miR-499 能夠通過負調控功能性靶基因星形膠質細胞上調基因1 表達,抑制HCC 細胞增殖。有研究報道,miR-499 rs3746444 位點A>G 多態性與HCC 的遺傳易感性顯著相關[9,15,21],但也有研究認為該位點多態性與HCC 的發病無關[16-19]。為進一步明確miR-499 rs3746444 位點A>G 多態性與HCC 遺傳易感性的關系,本研究采用Meta 分析方法系統評價了miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 遺傳易感性的關系。

本研究Meta 整組分析顯示,miR-499 rs3746444位點多態性與HCC 遺傳易感性無明顯相關性。本研究按基因分型方法、病例組樣本量以及是否符合HWE 進行亞組分析,結果發現miR-499 rs3746444位點多態性與HCC 遺傳易感性顯著相關。其中,病例組大樣本量亞組miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 的發病顯著相關,而在小樣本量亞組中無明顯相關性,這可能是由于研究設計和研究樣本量導致的統計檢驗效能差異所致。基因分型方法PCRRFLP 亞組miR-499 rs3746444位點多態性與HCC 的發病無關,可能是因為該基因分型方法會受限制性內切酶特異性、凝膠酶成像清晰度等因素影響,從而導致基因分型結果讀取偏差。在不符合HWE 亞組中未發現miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 的發病有關,推測可能與納入研究對象的人群代表性有關。本研究納入文獻的漏斗圖基本呈對稱分布,未發現存在發表偏倚,表明納入文獻的整體代表性較好。本研究采用逐一剔除文獻法,將納入的文獻逐一剔除進行各遺傳模型下的敏感性分析,結果均未發現總體結果因單篇文獻的剔除而出現明顯波動,表明研究結果的穩健性較好。但本研究亦存在一定局限性,如納入的文獻僅為公開發表的中英文文獻,未能對納入患者的性別、年齡、吸煙、飲酒等信息進行校正,可能會影響miR-499 rs3746444 位點多態性對HCC遺傳易感性客觀效應的評估。

綜上所述,miR-499 rs3746444 位點多態性與HCC 發病風險顯著相關,此關聯僅存在于病例組較大樣本量、其他基因分型方法和符合HWE 亞組中。但本研究結論仍需進一步驗證。

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