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基于分子對(duì)接和表面等離子體共振技術(shù)的大承氣湯治療急性胰腺炎的作用機(jī)制研究

2021-09-14 07:36:46陳穎曹伊媛陸杰張慧倩岳華梁琨王新宏

陳穎, 曹伊媛, 陸杰, 張慧倩, 岳華, 梁琨, 王新宏

(1.上海中醫(yī)藥大學(xué),上海 201203;2.上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬上海市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院,上海 200082)

急性胰腺炎是一種病情險(xiǎn)惡、并發(fā)癥多、病死率較高的急腹癥,基本病機(jī)為腑氣不通,中醫(yī)學(xué)治療應(yīng)始終貫徹“通里攻下”的思想[1]。大承氣湯是經(jīng)典的“通里攻下”方劑,出自張仲景的《傷寒論》,由大黃、厚樸、枳實(shí)、芒硝4味中藥組成。方中:大黃蕩滌腸胃,泄熱瀉結(jié)為君;芒硝軟堅(jiān)潤燥,瀉熱通便為臣;厚樸、枳實(shí)行氣破結(jié),消痞除滿為佐。四藥相和,綜瀉下、軟堅(jiān)、消痞、除滿之用,可用于治療“痞滿燥實(shí)”為主要表現(xiàn)的腸梗阻、胰腺膽道疾病等多種疾病[2]。在臨床上,加用大承氣湯優(yōu)于單獨(dú)常規(guī)西藥治療急性重癥胰腺炎,具有良好的臨床應(yīng)用前景[3]。本課題組前期采用膽胰管注射?;悄懰徕c法建立急性胰腺炎大鼠模型,發(fā)現(xiàn)大承氣湯可明顯改善模型大鼠的胰腺損傷。同時(shí),本課題組運(yùn)用超高效液相色譜-線性離子阱-靜電場軌道阱高分辨質(zhì)譜(UPLC-LTQ-Orbitrap-MS)技術(shù)對(duì)大承氣湯主要化學(xué)成分進(jìn)行了快速的分析和鑒定[4]。

分子對(duì)接(molecular docking)根據(jù)“鎖-鑰原理”通過化學(xué)計(jì)量學(xué)方法來模擬和預(yù)測蛋白質(zhì)受體與藥物小分子之間的結(jié)合力,是一種高效快速的藥物篩選手段,對(duì)藥效物質(zhì)與作用機(jī)制研究具有重要意義[5-6]。表面等離子共振(surface plasmon resonance,SPR)技術(shù)是一種無標(biāo)記型光學(xué)檢測手段,通過測定共振角的變化檢測生物分子間的相互作用,可為中藥的活性成分分析以及對(duì)應(yīng)蛋白靶點(diǎn)的鑒定提供有力支撐[7]。

為進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)大承氣湯治療急性胰腺炎的潛在分子機(jī)制,本研究立足于中醫(yī)藥整體觀和系統(tǒng)論,通過分子對(duì)接與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究,篩選主要活性化合物和關(guān)鍵靶蛋白,以SPR 技術(shù)驗(yàn)證活性成分及潛在靶標(biāo)親和力并評(píng)估其抵抗疾病的活性[8],現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)道如下。

1 材料

1.1 試藥胡蘿卜苷(批號(hào):B20517)、和厚樸酚(批號(hào):B20498)、柚皮素(批號(hào):B21596)、大黃素-1-O-葡萄糖苷(批號(hào):B27009)購自于上海源葉生物科技有限公司;厚樸酚(批號(hào):AB0682-0020)、歐前胡素(批號(hào):AB0831-0020)、柚皮苷(批號(hào):AB1848-0020)、橙皮苷(批號(hào):AB0714-0020)購自于成都埃法生物科技有限公司。

1.2 儀器Biacore T200 生物分子相互作用分析系統(tǒng)(GE Healthcare 公司);CM-5 芯片購自于GE Healthcare公司。

2 方法

2.1 大承氣湯活性成分篩選通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)(http://sm.nwsuaf.edu.cn/lsp/tcmsp.php/)搜集大承氣湯中4 味中藥的化學(xué)成分。篩選類藥性(DL)≥0.18、口服利用度(OB)≥30%的化學(xué)成分結(jié)合已發(fā)表文獻(xiàn)中報(bào)道過的重要活性成分,共同組成主要活性成分庫。通過PubChem 數(shù)據(jù)庫(www.ncbi.nlm.nih.gov/pccompound/)查找化合物的 SMILES 結(jié)構(gòu),導(dǎo)入 Discovery Studio 2016(DS)軟件,轉(zhuǎn)化成3D結(jié)構(gòu),保存其mol2格式。

2.2 急性胰腺炎靶點(diǎn)預(yù)測及篩選在DrugBank 數(shù)據(jù) 庫(https://www.drugbank.ca/)和 TTD 數(shù) 據(jù) 庫(http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/)中搜索與急性胰腺炎相關(guān)的靶點(diǎn),并使用UniProt 數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)對(duì)檢索到的靶點(diǎn)進(jìn)行命名規(guī)范化處理。PDB 數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org/)提供靶點(diǎn)的x-ray 晶體結(jié)構(gòu),優(yōu)先選擇Resolution 值小、配體不是金屬離子,且有小分子與蛋白結(jié)合示意圖的靶點(diǎn)結(jié)構(gòu),作為分子對(duì)接的受體。

2.3 化合物與疾病靶點(diǎn)的分子對(duì)接將靶點(diǎn)蛋白導(dǎo)入DS 軟件,去除蛋白中水分子,準(zhǔn)備蛋白,使其易與小分子化合物對(duì)接。最后,選擇Libdock 模式,對(duì)接公差設(shè)置為0.25,進(jìn)行靶點(diǎn)和化合物的分子對(duì)接,把原配體與蛋白靶點(diǎn)對(duì)接所得的分?jǐn)?shù)作為基礎(chǔ)值,篩選出比之前分?jǐn)?shù)高的化合物,即說明兩者之間親和力更高,結(jié)合較好。若對(duì)接失敗,則上調(diào)對(duì)接公差至0.5。

2.4 成分-靶點(diǎn)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建根據(jù)分子對(duì)接結(jié)果,通過Cytoscape 3.6.2 軟件“File”“Import”“Import Network from File System”構(gòu)建大承氣湯化學(xué)成分和疾病靶點(diǎn)的互作網(wǎng)絡(luò)圖來分析成分與靶點(diǎn)之間的相互作用關(guān)系。

2.5 生物功能及通路的富集分析將篩選出的疾病靶點(diǎn)基因名輸入STRING 數(shù)據(jù)庫(https://stringdb.org/)“Multiple proteins”,物種設(shè)置為“Homosapiens”,其余參數(shù)設(shè)置為保持默認(rèn),進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO)生物學(xué)功能和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信號(hào)通路分析,統(tǒng)計(jì)富集信息。以錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)作為篩選條件。

2.6 SPR技術(shù)測定活性成分與靶點(diǎn)蛋白的親和力

2.6.1 蛋白芯片固定 將蛋白通過1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亞胺(EDC)/N-羥基琥珀酰亞胺(NHS)偶聯(lián)活化固定在CM5 芯片上,然后根據(jù)蛋白的等電點(diǎn)篩選蛋白質(zhì)固定在CM5 芯片的最佳 pH 值(4.0、4.5、5.0、5.5),濃度(20、50、100 μg/mL)摸索,以確保較多的蛋白固定于蛋白芯片上,其蛋白質(zhì)的偶聯(lián)包括3 步:EDC/NHS 的活化;蛋白質(zhì)的偶聯(lián);乙醇胺封閉蛋白質(zhì)多余的結(jié)合位點(diǎn)。

2.6.2 化合物檢測液配制 精密稱定大黃素-1-O-葡萄糖苷、胡蘿卜苷、厚樸酚、和厚樸酚、歐前胡素、柚皮素、柚皮苷、橙皮苷對(duì)照品適量,分別以二甲基亞砜(DMSO)溶液溶解制成適當(dāng)濃度的對(duì)照品貯備液。取各對(duì)照品儲(chǔ)備液適量,再分別加入 DMSO 溶液和 1.05×磷酸緩沖鹽(PBS)溶液,制備成濃度為256 μmol/L 的對(duì)照品溶液,用流動(dòng)相溶液依次稀釋成濃度為128、64、32、16、8、4 μmol/L的對(duì)照品溶液。

2.6.3 親和力檢測 設(shè)定結(jié)合目標(biāo)蛋白的流通池為檢測通道,未結(jié)合目標(biāo)蛋白的流通池為參比通道,流通池的流速為10 μL/min。同時(shí),將待測物注入目標(biāo)蛋白流通池和參比流通池,使結(jié)合反應(yīng)在22~24 ℃的條件下進(jìn)行,分別取上述配制梯度的對(duì)照品溶液進(jìn)行檢測,流動(dòng)相采用含5.0%DMSO的1.05 × PBS 溶液,結(jié)合時(shí)間為60 s,流速為30 μL/min,解離時(shí)間為180 s,同時(shí)配制溶劑校正(solvent correction)曲線的8 個(gè)濃度點(diǎn),范圍為含4.5% ~ 5.5% DMSO 的PBS 溶液,以消除溶劑對(duì)表面折光率的影響。

2.6.4 親和曲線擬合 進(jìn)樣完成后,進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,親和曲線擬合用Biacore T200 軟件進(jìn)行評(píng)估,將穩(wěn)態(tài)親和力模型(1∶1)用于曲線擬合。繪制靶點(diǎn)蛋白與單體化合物的結(jié)合曲線,即SPR 光譜圖,并且計(jì)算獲得動(dòng)力學(xué)參數(shù)如最大結(jié)合濃度(Kd)、最大響應(yīng)值(Rmax)、偏移量(Offset)和卡方檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)(Chi2)。

3 結(jié)果

3.1 大承氣湯活性成分分析由TCMSP 數(shù)據(jù)庫檢索到大黃有92 個(gè)成分,枳實(shí)有65 個(gè)成分,厚樸有139 個(gè)成分。芒硝為硫酸鹽礦物藥,化學(xué)式為Na2SO4·10H2O,不計(jì)入后續(xù)研究。篩選并納入文獻(xiàn)報(bào)道的其他活性成分[9],共收集到37 個(gè)化合物。澤蘭黃醇素、大黃素甲醚二葡糖苷、大黃酸、決明內(nèi)酯、胡蘿卜苷等12 個(gè)成分源自大黃;桉葉醇、和厚樸新酚、厚樸酚、和厚樸酚等4個(gè)成分源自厚樸;異橙黃酮、5,7,4-三甲氧基黃酮、異櫻花素-7-蕓香糖甙、柚皮素、橙皮素、木犀草素、橙皮苷、柚皮苷等21個(gè)成分源自枳實(shí)。

3.2 急性胰腺炎靶點(diǎn)的信息通過搜索DrugBank數(shù)據(jù)庫和TTD 數(shù)據(jù)庫,共獲取430個(gè)與急性胰腺炎相關(guān)的疾病靶點(diǎn)。篩選出文獻(xiàn)報(bào)道較多,且具有配體及X 線晶體結(jié)構(gòu)的疾病蛋白32 個(gè),具體靶點(diǎn)信息見表1。

表1 急性胰腺炎潛在的靶點(diǎn)信息Table 1 Potential targets information for acute pancreatitis

3.3 分子對(duì)接分析將上述篩選出的37個(gè)成分與32個(gè)靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接。結(jié)果顯示:454條對(duì)接良好的信息,每個(gè)成分均可以與一個(gè)或多個(gè)蛋白靶點(diǎn)結(jié)合良好。其中,橙皮苷、柚皮苷、和厚樸酚、大黃素-1-O-葡萄糖苷、歐前胡素、厚樸酚、柚皮素、胡蘿卜苷的親和力較高,其分別與26、22、21、21、20、19、19、19 個(gè)蛋白結(jié)合較好,對(duì)接得分見表2。

表2 8個(gè)化合物與蛋白靶點(diǎn)Docking Score值Table 2 Docking Score values of 8 compounds and targets

其中,厚樸酚和細(xì)胞間黏附分子1(ICAM-1)蛋白之間的對(duì)接相互作用如圖1-A、B 所示,厚樸酚母核中的羥基與ICAM-1 蛋白中的氨基酸GLU87、VAL89 可形成常規(guī)氫鍵,其鍵長范圍為1.0-1.6?,其苯環(huán)與VAL89 具有疏水結(jié)合Pi-Alkyl 作用,該化合物與ICAM-1對(duì)接能量為-8.540 87 KJ/mol。歐前胡素和ICAM-1 的分子相互作用如圖1-C、D 所示,歐前胡素母核結(jié)構(gòu)主要與ICAM-1中的氨基酸殘基VAL1123、ARG88 形成疏水結(jié)合Pi-Alkyl 作用,同時(shí),母核上的羰基與VAL89 形成常規(guī)氫鍵,其鍵長范圍為1.0-1.6?,增加了分子與蛋白的結(jié)合,該化合物與ICAM-1對(duì)接能量為-13.485 6 KJ/mol。

圖1 ICAM-1與厚樸酚(A、B),歐前胡素(C、D)的二維及三維分子對(duì)接模式Figure 1 2D and 3D molecular docking patterns of ICAM-1 with magnolol(A,B),Ammidin(C,D)

歐前胡素-絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)蛋白對(duì)接的相互作用如圖2-A、B 所示,苯環(huán)的中心結(jié)構(gòu)與TRP197 形成了π-π相互作用力,又與氨基酸LYS249、LEU246 形成疏水結(jié)合Pi-Alkyl 作用,母核結(jié)構(gòu)上的羰基與ASN201 形成氫鍵,其鍵長范圍為0.9-1.6 ?。

圖2 MAPK14與歐前胡素的二維及三維分子對(duì)接模式(A、B)Figure 2 2D and 3D molecular docking patterns of MAPK14 with Ammidin(A,B)

3.4 成分-靶點(diǎn)互作分析將成分與疾病靶點(diǎn)通過Cytoscape 3.6.2 軟件構(gòu)建活性成分-靶點(diǎn)蛋白網(wǎng)絡(luò)圖(見圖3)。紅色橢圓形為大黃成分,綠色三角形為厚樸成分,粉色菱形為枳實(shí)成分,該網(wǎng)絡(luò)由66個(gè)節(jié)點(diǎn)(nodes)和454 條邊(edges)組成,只有29 個(gè)蛋白顯示出與大承氣湯成分對(duì)接良好。根據(jù)參數(shù)分析發(fā)現(xiàn),ICAM1、MAPK11、MAPK14、ERN1、RAF1、CASP3度值分別為30、30、29、27、27、26。

圖3 大承氣湯“活性成分-疾病靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖Figure 3 “Active ingredient-disease target”network diagram of Da Chengqi Decoction

3.5 生物功能和信號(hào)通路分析將32個(gè)作用靶點(diǎn)導(dǎo)入SRTING 數(shù)據(jù)庫中,根據(jù)參數(shù)錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)值,篩選出靶點(diǎn)蛋白富集的前10 條富集GO功能,包括生物過程(biological process,BP)、分子 功 能(molecular function, MF)和 細(xì) 胞 組 成(cellular component,CC),結(jié)果如圖4 顯示。這些靶點(diǎn)參與的生物過程有細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞對(duì)化學(xué)刺激的反應(yīng)、分子功能的正調(diào)控、蛋白質(zhì)磷酸化等;分子功能主要與蛋白激酶活性、藥物結(jié)合、ATP 結(jié)合、蛋白質(zhì)絲氨酸/蘇氨酸激酶活性等關(guān)系密切;細(xì)胞組成主要富集在胞漿、胞質(zhì)部分、膜結(jié)合細(xì)胞器等部位。KEGG 富集結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些靶點(diǎn)蛋白主要參與了癌癥信號(hào)通路、AGE-RAGE 信號(hào)通路、FoxO 信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡信號(hào)通路、JAK/STAT 信號(hào)通路等,分別有 15、9、9、9、9 個(gè)蛋白富集在上面,表明這些信號(hào)通路與急性胰腺炎緊密相關(guān)。FDR排名前20條信號(hào)通路,見圖5。

圖4 大承氣湯治療急性胰腺炎的基因本體(GO)分析(A、B、C)Figure 4 GO analysis of Da Chengqi Decoction for treatment of acute pancreatitis(A,B,C)

圖5 大承氣湯治療急性胰腺炎的KEGG通路富集分析Figure 5 KEGG pathway enrichment analysis of Da Chengqi Decoction for treatment of acute pancreatitis

3.6 活性成分與靶點(diǎn)蛋白的親和作用分析采用SPR生物傳感器檢測活性成分橙皮苷、柚皮苷、和厚樸酚、大黃素-1-O-葡萄糖苷、歐前胡素、厚樸酚、柚皮素、胡蘿卜苷與關(guān)鍵靶點(diǎn)ICAM1、MAPK14、過氧化物酶體增殖物活化受體γ(PPAR-γ)之間的親和力。其中,ICAM-1 和MAPK14 為“成分-靶點(diǎn)”圖預(yù)測的關(guān)鍵蛋白,PPAR-γ 為文獻(xiàn)報(bào)道的重要靶點(diǎn)。結(jié)果顯示,8 個(gè)化合物與ICAM-1反應(yīng)作出的擬合曲線中,厚樸酚、歐前胡素與ICAM-1 親和力較好,如圖6 所示。厚樸酚、歐前胡素的解離常數(shù)Kd值較小,各親和力參數(shù)如表3所示。

表3 大承氣湯主要活性成分和ICAM -1之間的親和力動(dòng)力學(xué)參數(shù)Table 3 Affinity kinetic parameters between active compounds and ICAM-1 in Da Chengqi Decoction

圖6 ICAM -1蛋白與大承氣湯主要活性成分結(jié)合SPR分析擬合圖Figure 6 SPR fit plot of ICAM-1 protein and Da Chengqi Decoction active components binding

在對(duì)MAPK14 表現(xiàn)出高響應(yīng)和良好親和力的化合物中,歐前胡素可作出擬合曲線且顯示出較好的親和力,如圖 7 所示。Kd為 19.07 μmol·L-1,Rmax為3.665,Offset為-3.754,Chi2為0.755。

圖7 MAPK14蛋白與歐前胡素結(jié)合SPR分析擬合圖Figure 7 SPR fit plot of MAPK14 protein binding with active component

大黃素-1-O-葡萄糖苷、和厚樸酚、厚樸酚、胡蘿卜苷、歐前胡素與PPAR-γ反應(yīng)可作出擬合曲線,如圖8 所示。其中,大黃素-1-O-葡萄糖苷、和厚樸酚、厚樸酚、胡蘿卜苷、歐前胡素Kd值較小,說明與PPAR-γ親和力較好,各親和力參數(shù)如表4所示。

表4 大承氣湯主要活性成分和PPAR-γ之間的親和力動(dòng)力學(xué)參數(shù)Table 4 Affinity kinetic parameters between Da Chengqi Decoction active compounds and PPAR-γ

4 討論

本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討了大承氣湯治療急性胰腺炎預(yù)測靶點(diǎn)可能參與的生物過程和作用通路。GO 基因功能注釋結(jié)果表明,大承氣湯治療急性胰腺炎的相關(guān)靶點(diǎn)主要在胞漿、胞質(zhì)部分、膜結(jié)合細(xì)胞器等部位發(fā)生蛋白激酶活性、藥物結(jié)合、ATP 結(jié)合、蛋白質(zhì)絲氨酸/蘇氨酸激酶活性等分子反應(yīng),參與細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞對(duì)化學(xué)刺激的反應(yīng)、分子功能的正調(diào)控、蛋白質(zhì)磷酸化等生物過程。KEGG 富集結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些靶點(diǎn)蛋白通過癌癥信號(hào)通路、AGE-RAGE 信號(hào)通路、FoxO 信號(hào)通路、細(xì)胞凋亡信號(hào)通路、JAK/STAT 信號(hào)通路等調(diào)控急性胰腺炎。

此外,通過分子對(duì)接篩選出了大承氣湯治療急性胰腺炎的8個(gè)活性成分,這些化合物來自于不同的中藥且與較多的急性胰腺炎相關(guān)靶點(diǎn)顯示出親和力。大黃素-1-O-葡萄糖苷、胡蘿卜苷是大黃的活性成分;厚樸酚、和厚樸酚為厚樸的活性成分;橙皮苷、柚皮苷、歐前胡素、柚皮素為枳殼的活性成分。ICAM1、MAPK11、MAPK14、ERN1、RAF1、CASP3 為分子對(duì)接結(jié)果中度值較高的蛋白,進(jìn)一步證實(shí)了中藥“多成分-多靶點(diǎn)”干預(yù)疾病的整體觀。

ICAM-1 在腫瘤生長、侵襲和轉(zhuǎn)移中起關(guān)鍵作用,其介導(dǎo)異質(zhì)細(xì)胞和細(xì)胞外基質(zhì)之間的粘附,并參與一系列重要的生理和病理過程,例如免疫、炎癥和腫瘤轉(zhuǎn)移等[10]。在嚴(yán)重急性胰腺炎患者引發(fā)的免疫反應(yīng)中,可見T淋巴細(xì)胞的抑制活性升高,嗜中性粒細(xì)胞的吞噬活性降低,黏附分子ICAM-1 活化異常[11]。Li 等[12]發(fā)現(xiàn)急性胰腺炎大鼠胰腺和肝組織中ICAM-1的表達(dá)較高,并且抗炎作用與ICAM-1 表達(dá)的降低有關(guān)。MAPK 是一種促分裂原活化蛋白激酶,MAPK 通過細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路傳輸體內(nèi)的炎癥反應(yīng),并在急性胰腺炎的形成機(jī)理中起重要作用[13]。已有研究發(fā)現(xiàn),重癥急性胰腺炎早期MAPK14 活性上調(diào),釋放了炎癥細(xì)胞因子,觸發(fā)炎癥級(jí)聯(lián)反應(yīng),加重全身炎癥反應(yīng)綜合征,通過控制MAPK14 活性可能是緩解炎癥反應(yīng)的有效途徑[14]。PPAR-γ與急性胰腺炎嚴(yán)重程度相關(guān),重癥急性胰腺炎大鼠的胰腺及肺臟組織中PPAR-γ表達(dá)上調(diào),有研究發(fā)現(xiàn),高脂血癥通過降低PPAR-γ表達(dá),加重重癥急性胰腺炎炎癥程度[15]。

采用SPR技術(shù)對(duì)ICAM-1、MAPK14和PPAR-γ蛋白與大承氣湯治療急性胰腺炎的8個(gè)化合物進(jìn)行親和力檢測。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),3 個(gè)蛋白均可以與1個(gè)或多個(gè)成分顯示出較好的結(jié)合力。現(xiàn)有的報(bào)道證實(shí)了SPR 的結(jié)果,厚樸酚可抑制NF-κB 信號(hào)通路降低ICAM-1 的表達(dá),發(fā)揮抗炎作用[16]。歐前胡素在人類單核細(xì)胞系U937 泡沫細(xì)胞中對(duì)ICAM-1表達(dá)具有抑制作用[17]。故推測ICAM-1 蛋白在大承氣湯治療急性胰腺炎的過程中發(fā)揮著重要作用。歐前胡素也能抑制MAPK14 的磷酸化,減少膠原沉積和炎癥細(xì)胞滲出[18],這些研究側(cè)面驗(yàn)證了SPR實(shí)驗(yàn)的有效性。PPAR-γ為3 個(gè)蛋白中與化合物結(jié)合力最好的蛋白,然而這一蛋白在分子對(duì)接結(jié)果中并未體現(xiàn)出優(yōu)越性。這一結(jié)果可能與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和SPR技術(shù)的局限性有關(guān)。

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的數(shù)據(jù)信息主要依賴于文獻(xiàn)數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫,收錄的信息可能存在偏倚。目前的網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)仍然有限,虛擬計(jì)算結(jié)果呈現(xiàn)假陰性的可能性較高。SPR技術(shù)計(jì)算主要是在體外動(dòng)態(tài)模擬化合物與蛋白芯片的相互結(jié)合,體外的虛擬計(jì)算無法全面反映出藥物的體內(nèi)作用狀態(tài)?;诖?,本課題組下一步將會(huì)從網(wǎng)絡(luò)分析和體外研究,延伸至分子水平、細(xì)胞水平和整體動(dòng)物水平等不同層面展開研究,以期闡明大承氣湯在體內(nèi)對(duì)靶蛋白的作用情況以及大承氣湯通過調(diào)節(jié)AGERAGE 信號(hào)通路、JAK/STAT 信號(hào)通路等改善急性胰腺炎的分子生物學(xué)機(jī)制。

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